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山羊IGFBP-5基因克隆及特征分析
被引量:
1
1
作者
李利
李秋
+1 位作者
王林杰
张红平
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2011年第6期132-137,共6页
为探讨山羊IGFBP-5基因的特点,进一步研究其在山羊上的表达及生长发育中的作用机制,以初生南江黄羊肝脏组织为材料抽提RNA进行克隆测序,并利用ExPasy、NetPhos、NetO-Glyc、SignalP等生物软件分析IGFBP-5基因CDS区及其编码氨基酸的理化...
为探讨山羊IGFBP-5基因的特点,进一步研究其在山羊上的表达及生长发育中的作用机制,以初生南江黄羊肝脏组织为材料抽提RNA进行克隆测序,并利用ExPasy、NetPhos、NetO-Glyc、SignalP等生物软件分析IGFBP-5基因CDS区及其编码氨基酸的理化性质、结构特点。结果显示,山羊IGFBP-5基因的CDS全长819 bp,编码272个氨基酸残基,相对分子量为30.392 kD,理论等电点pI=8.56,开始19个氨基酸残基构成信号肽,具有2个疏水区、5个亲水区且总平均疏水性值为-0.619,成熟肽定位于细胞外。二级结构以无规卷曲为主(83.8%),α-螺旋和延伸片段分别为13.6%和2.6%。N-端存在IGFBP信号,C-端有Ⅰ型甲状腺球蛋白结构域,发现3个O-糖基化位点,22个磷酸化位点,主要磷酸化方式有CKⅡ、PKA、PKC、MAPK 4种。山羊与其他物种IGFBP-5基因mRNA及氨基酸序列一致性分别在89%和94%以上,其N-端在几个物种中完全一致。山羊和人IGFBP-5蛋白前体分别有特异性的氨基酸插入(Ala102、Leu3)。山羊IGFBP-5蛋白是位于细胞外且具有信号肽的弱亲水性分泌蛋白,磷酸化是调控其功能的主要因素。
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关键词
南江黄羊
igfbp-5基因
克隆
生物信息学分析
下载PDF
职称材料
哈萨克马和焉耆马不同组织中IGFBP-5基因表达差异研究
2
作者
吐尔逊江.吾木尔艾力
孟军
+8 位作者
王建文
曾亚琦
姚新奎
李林玲
姚芳芳
王欢
任海帆
黄晶晶
阿米娜
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2016年第9期2257-2264,共8页
试验旨在探求胰岛素样生长因子结合蛋白-5(insulin-like growth factor binding protein-5,IGFBP-5)基因在哈萨克马和焉耆马不同组织部位中的mRNA表达规律。采用实时荧光定量PCR技术检测在哈萨克马和焉耆马心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾...
试验旨在探求胰岛素样生长因子结合蛋白-5(insulin-like growth factor binding protein-5,IGFBP-5)基因在哈萨克马和焉耆马不同组织部位中的mRNA表达规律。采用实时荧光定量PCR技术检测在哈萨克马和焉耆马心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、小肠、大肠、盲肠、肋间肌、背最长肌、臂肌和臀肌等不同组织中IGFBP-5基因mRNA表达量,同时比较该基因在哈萨克马和焉耆马相同组织中的表达差异。结果表明,哈萨克马和焉耆马表达量最高的均为背最长肌,其次是臂肌,并显著高于心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、小肠、大肠、盲肠等内脏组织表达量(P<0.05),大肠中的表达量最低;焉耆马的肾脏、小肠、大肠、盲肠、背最长肌和臂肌中表达量高于哈萨克马相同部位的表达量,其中焉耆马背最长肌和大肠中的表达量极显著高于哈萨克马的相同部位(P<0.01),小肠和盲肠中的表达量显著高于哈萨克马的相同部位(P<0.05)。本试验为深入研究IGFBP-5基因的生物学功能,以及对中国马生产性能的遗传改良提供理论依据。
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关键词
igfbp-5基因
哈萨克马
焉耆马
MRNA表达
实时荧光定量PCR
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职称材料
山羊不同组织中IGFBP-5 mRNA的发育表达模式
3
作者
李利
李秋
+2 位作者
欧志国
王林杰
张红平
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011年第21期12914-12915,12994,共3页
[目的]探讨IGFBP-5基因在山羊出生后不同组织的发育性表达模式。[方法]采用荧光定量PCR,分析了出生后0、15、30、60、90和120d36只南江黄羊(公、母羔各18只)的心脏、肝脏、脾、肺、背最长肌、半膜肌、臂三头肌和股二头肌样品中IGFBP-5m...
[目的]探讨IGFBP-5基因在山羊出生后不同组织的发育性表达模式。[方法]采用荧光定量PCR,分析了出生后0、15、30、60、90和120d36只南江黄羊(公、母羔各18只)的心脏、肝脏、脾、肺、背最长肌、半膜肌、臂三头肌和股二头肌样品中IGFBP-5mRNA水平。[结果]母羔的IGFBP-5mRNA表达丰度显著高于公羔。各组织IGFBP-5mRNA表达量呈现肝脏>肺>脾(心脏)>肌肉的趋势(P<0.01),脾与心脏间差异不显著(P>0.01),肌肉的表达值最低。随着日龄的增加,各组织中IGFBP-5mRNA丰度均呈现下降-上调-下降的发育性表达模式,而肝脏和肺中的表达模式具有明显的性别差异。[结论]IGFBP-5mRNA主要在内脏,尤其是肝脏中合成,但在各组织的发育性表达模式一致,性别是一个重要的影响因素。
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关键词
山羊
igfbp-5基因
组织
RT-PCR
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职称材料
题名
山羊IGFBP-5基因克隆及特征分析
被引量:
1
1
作者
李利
李秋
王林杰
张红平
机构
四川农业大学动物遗传育种研究所
出处
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2011年第6期132-137,共6页
基金
四川省教育厅重点项目(08ZA077)
四川省科技支撑计划项目(2011NZ0003)
文摘
为探讨山羊IGFBP-5基因的特点,进一步研究其在山羊上的表达及生长发育中的作用机制,以初生南江黄羊肝脏组织为材料抽提RNA进行克隆测序,并利用ExPasy、NetPhos、NetO-Glyc、SignalP等生物软件分析IGFBP-5基因CDS区及其编码氨基酸的理化性质、结构特点。结果显示,山羊IGFBP-5基因的CDS全长819 bp,编码272个氨基酸残基,相对分子量为30.392 kD,理论等电点pI=8.56,开始19个氨基酸残基构成信号肽,具有2个疏水区、5个亲水区且总平均疏水性值为-0.619,成熟肽定位于细胞外。二级结构以无规卷曲为主(83.8%),α-螺旋和延伸片段分别为13.6%和2.6%。N-端存在IGFBP信号,C-端有Ⅰ型甲状腺球蛋白结构域,发现3个O-糖基化位点,22个磷酸化位点,主要磷酸化方式有CKⅡ、PKA、PKC、MAPK 4种。山羊与其他物种IGFBP-5基因mRNA及氨基酸序列一致性分别在89%和94%以上,其N-端在几个物种中完全一致。山羊和人IGFBP-5蛋白前体分别有特异性的氨基酸插入(Ala102、Leu3)。山羊IGFBP-5蛋白是位于细胞外且具有信号肽的弱亲水性分泌蛋白,磷酸化是调控其功能的主要因素。
关键词
南江黄羊
igfbp-5基因
克隆
生物信息学分析
Keywords
Nanjiang Mongolian Grazelle
igfbp-
5
gene
Cloning
Bioinformatics analysis
分类号
S827.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
哈萨克马和焉耆马不同组织中IGFBP-5基因表达差异研究
2
作者
吐尔逊江.吾木尔艾力
孟军
王建文
曾亚琦
姚新奎
李林玲
姚芳芳
王欢
任海帆
黄晶晶
阿米娜
机构
新疆农业大学动物科学学院
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2016年第9期2257-2264,共8页
基金
自治区科技厅重大专项<马(运动
肉用
+4 种基金
乳用)生产关键技术研究与示范>(201130101)
国家科技支撑计划项目<优质运动马培育生产关键技术研究与集成示范>(2011BAD28B06)
国家科技支撑计划"速步
乳用
耐力马新品种(系)培育及良种扩繁技术研究与集成示范"(2012BAD44B00)
文摘
试验旨在探求胰岛素样生长因子结合蛋白-5(insulin-like growth factor binding protein-5,IGFBP-5)基因在哈萨克马和焉耆马不同组织部位中的mRNA表达规律。采用实时荧光定量PCR技术检测在哈萨克马和焉耆马心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、小肠、大肠、盲肠、肋间肌、背最长肌、臂肌和臀肌等不同组织中IGFBP-5基因mRNA表达量,同时比较该基因在哈萨克马和焉耆马相同组织中的表达差异。结果表明,哈萨克马和焉耆马表达量最高的均为背最长肌,其次是臂肌,并显著高于心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、小肠、大肠、盲肠等内脏组织表达量(P<0.05),大肠中的表达量最低;焉耆马的肾脏、小肠、大肠、盲肠、背最长肌和臂肌中表达量高于哈萨克马相同部位的表达量,其中焉耆马背最长肌和大肠中的表达量极显著高于哈萨克马的相同部位(P<0.01),小肠和盲肠中的表达量显著高于哈萨克马的相同部位(P<0.05)。本试验为深入研究IGFBP-5基因的生物学功能,以及对中国马生产性能的遗传改良提供理论依据。
关键词
igfbp-5基因
哈萨克马
焉耆马
MRNA表达
实时荧光定量PCR
Keywords
igfbp-
5
gene
Kazakh horse
Yanqi horse
mRNA expression
Real-time quantitative PCR
分类号
Q786 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
山羊不同组织中IGFBP-5 mRNA的发育表达模式
3
作者
李利
李秋
欧志国
王林杰
张红平
机构
四川农业大学动物遗传育种研究所
四川省眉山市畜牧局
出处
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011年第21期12914-12915,12994,共3页
基金
四川省教育厅重点项目(08ZA077)
四川省科技创新产业链示范工程项目(2011NZ0003)
文摘
[目的]探讨IGFBP-5基因在山羊出生后不同组织的发育性表达模式。[方法]采用荧光定量PCR,分析了出生后0、15、30、60、90和120d36只南江黄羊(公、母羔各18只)的心脏、肝脏、脾、肺、背最长肌、半膜肌、臂三头肌和股二头肌样品中IGFBP-5mRNA水平。[结果]母羔的IGFBP-5mRNA表达丰度显著高于公羔。各组织IGFBP-5mRNA表达量呈现肝脏>肺>脾(心脏)>肌肉的趋势(P<0.01),脾与心脏间差异不显著(P>0.01),肌肉的表达值最低。随着日龄的增加,各组织中IGFBP-5mRNA丰度均呈现下降-上调-下降的发育性表达模式,而肝脏和肺中的表达模式具有明显的性别差异。[结论]IGFBP-5mRNA主要在内脏,尤其是肝脏中合成,但在各组织的发育性表达模式一致,性别是一个重要的影响因素。
关键词
山羊
igfbp-5基因
组织
RT-PCR
Keywords
Goat
igfbp-
5
gene
Tissues
RT-PCR
分类号
S827 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
山羊IGFBP-5基因克隆及特征分析
李利
李秋
王林杰
张红平
《河南农业科学》
CSCD
北大核心
2011
1
下载PDF
职称材料
2
哈萨克马和焉耆马不同组织中IGFBP-5基因表达差异研究
吐尔逊江.吾木尔艾力
孟军
王建文
曾亚琦
姚新奎
李林玲
姚芳芳
王欢
任海帆
黄晶晶
阿米娜
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2016
0
下载PDF
职称材料
3
山羊不同组织中IGFBP-5 mRNA的发育表达模式
李利
李秋
欧志国
王林杰
张红平
《安徽农业科学》
CAS
北大核心
2011
0
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职称材料
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