西藏小型猪与军牧一号白猪IGFBP-6基因表达差异分析

采用实时荧光定量PCR(Real Time PCR)方法,对不同生长阶段的西藏小型猪和军牧一号白猪的肝脏、脾脏、肾脏及肌肉组织中胰岛素样生长因子结合蛋白6(IGFBP-6)基因mRNA表达水平进行检测,并利用t检验,对相同生长阶段的各组织2个品种猪之间的表达水平进行比较分析。结果表明:西藏小型猪与军牧一号白猪IGFBP-6基因均在肌肉组织中表达量最高,而在肝组织中表达量最低。IGFBP-6基因在1日龄肾脏中,西藏小型猪表达水平高于军牧一号白猪,差异显著(P<0.05);在脾脏组织中,西藏小型猪表达水平低于军牧一号白猪,表达水平差异极显著(P<0.01)。其他生长阶段和组织中,2个品种猪IGFBP-6基因表达水平差异均不显著(P>0.05)。

绵羊IGFBP-6基因的克隆及序列分析

以凉山半细毛羊为研究对象,克隆了其胰岛素样生长因子结合蛋白6基因(IGFBP-6),采用生物信息学方法进行遗传进化分析,对IGFBP-6蛋白的理化性质进行分析,并对其二级和三级结构进行预测。结果表明,绵羊IGFBP-6基因的CDS全长序列为711 bp,编码236个氨基酸,与牛、人、鼠的CDS同源性分别为96%、84%、74%,氨基酸序列同源性分别为95%、80%、69%;IGFBP-6蛋白大小为24.9 ku,理论等电点(p I)为8.83。遗传进化分析结果显示,绵羊IGFBP-6基因与山羊、牛等哺乳动物关系较近,与鱼类的亲缘关系较远。IGFBP-6蛋白存在明显的疏水性区域和亲水性区域,有1个信号肽、14个磷酸化位点、3个N-糖基化位点和7个O-糖基化位点;二级结构分析结果显示,IGFBP-6蛋白无规则卷曲、α-螺旋和β-折叠区域比例分别为77.54%、19.92%、2.54%;三级结构分析结果显示,IGFBP-6蛋白存在IGFBP_N和甲状腺球蛋白-Ⅰ型功能域。