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题名绵羊IGFBP-7基因的克隆及序列分析
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作者
周明亮
杨平贵
吴登俊
张翔宇
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机构
四川省草原科学研究院
四川农业大学动物科技学院
四川省畜牧科学研究院
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出处
《湖北农业科学》
2015年第6期1416-1420,1433,共6页
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基金
农业部公益性行业科研专项(201003061)
四川省畜禽育种攻关项目(01NG029-18)
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文摘
试验以凉山半细毛羊为研究对象,采用RT-PCR方法克隆了其IGFBP-7基因的CDS全序列,生物信息学方法深入分析其序列。结果表明,凉山半细毛羊IGFBP-7基因的CDS序列为846 bp,编码282个氨基酸,与牛、人、鼠的CDS同源性分别为99%、95%、90%,氨基酸序列同源性分别为98%、93%、89%,Gen Bank登录号为FJ589640.1;IGFBP-7基因的氨基酸分子质量为29.0 ku,理论等电点(p I)为8.25;进化分析显示其与牛、山羊等哺乳动物关系较近,与斑马鱼、鲍等亲缘关系较远;IGFBP-7基因的蛋白质疏水性区域与亲水性区域间隔较为均匀分布,有1个信号肽、2个跨膜区、16个磷酸化位点、4个N-糖基化位点和1个O-糖基化位点;二级结构分析显示无规卷曲、α-螺旋和β-折叠区域分别为64.89%、19.86%、15.25%;三级结构分析显示存在IGFBP_N和Ig-like功能域。该试验为进一步研究绵羊IGFBP-7基因的功能奠定了基础。
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关键词
绵羊
igfbp-7基因
克隆
序列分析
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Keywords
sheep
insulin growth factor binding protein-7 gene(igfbp-7 gene)
clone
sequence analysis
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分类号
S826
[农业科学—畜牧学]
Q789
[生物学—分子生物学]
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