成人与儿童急性髓系白血病患者肿瘤免疫相关的差异表达基因分析

目的·分析成人与儿童急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML)患者骨髓中肿瘤免疫相关的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。方法·从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库下载GSE134589数据集,选取初次确诊/复发状态的患者,按年龄分为儿童组(0~16岁,34例)、中青年组(17~59岁,62例)和老年组(60~80岁,62例),用R语言程序包筛选不同组患者骨髓样本中肿瘤免疫相关的DEGs。选取中青年组与儿童组,老年组与儿童组共同的DEGs,与完全缓解状态的成人与儿童患者的DEGs进行比对,并进行功能富集分析。利用Kaplan-Meier法筛选与预后显著相关的基因,通过构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络筛选核心调控基因,将以上2种方法筛选出的基因视为关键基因。用GEPIA服务器对比关键基因在AML、弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B cell lymphoma,DLBCL)和胸腺癌的肿瘤样本与正常人样本的表达量,在GEXC网站分析关键基因在AML患者肿瘤干细胞和健康人的原始造血细胞中mRNA的表达情况。结果·GSE134589数据集中,中青年组与儿童组比,上调的DEGs有51个,下调的有21个;老年组与儿童组比,上调的DEGs有47个,下调的有20个;而中青年组与老年组比,没有发现DEG。筛选了中青年组和老年组共同的肿瘤免疫相关DEGs 57个,其中上调有39个,下调有18个,仅有3个基因的表达水平差异在疾病完全缓解时仍有统计学意义。57个共同DEGs主要富集在白细胞迁移和细胞因子介导的信号通路,其中白细胞介素2受体α亚基(interleukin-2 receptor subunit alpha,IL2RA)、FMS-样酪氨酸激酶3(FMS-like tyrosine kinase 3,FLT3)高表达的患者与低表达的患者相比总体生存期显著缩短(均P<0.05),补体成分3a受体1(complement component 3a receptor 1,C3AR1)是PPI网络的核心调控基因。这3个基因作为关键基因,均在AML肿瘤样本特异性高表达(均P<0.05),IL2RA还在DLBCL患者样本中显著高表达(P<0.05)。IL2RA在AML肿瘤干细胞和健康人的原始造血细胞中均低表达,FLT3均高表达,而C3AR1的表达在AML肿瘤干细胞特异性升高。结论·成人与儿童AML患者预后的差异可能与骨髓中肿瘤免疫相关基因表达的差异有关,其中IL2RA、FLT3和C3AR1可能是发挥重要作用的关键基因。

IL2RA基因多态性与中国汉族人群1型糖尿病的相关性研究

目的探讨中国汉族人群中白细胞介素2受体α(IL2RA)基因单核苷酸多态性(SNP)的分布特征及其与经典1型糖尿病(T1DM)的关系。方法收集2008年1月至2014年12月于南京医科大学第一附属医院和南京医科大学附属儿童医院就诊的T1DM患者和健康对照者。记录患者的血清C肽、锌转运体8抗体(ZnT8A)、谷氨酸脱羧酶抗体(GADA)、蛋白酪氨酸磷酸酶抗体(IA-2A)、IL2RA基因rs3118470和rs2104286位点的基因分型等检测结果。采用t检验、χ²检验和Kruskal-Wallis H检验比较T1DM组和健康对照组的一般资料以及各基因型T1DM患者的临床特征。采用logistic回归比较T1DM患者组和对照组之间等位基因及基因型的频率分布,并校正潜在混杂因素(如年龄和性别)。采用单因素logistic回归分析法分析不同模型(显性、隐性、超显性和加性模型)下各位点多态性与T1DM易感性的关联。结果IL2RA rs3118470位点次要等位基因C为T1DM的风险等位基因(P=0.026),在显性遗传和加性遗传模型下,IL2RA rs3118470位点多态性与T1DM易感性相关[OR(95%CI)分别为0.807(0.666~0.978)和0.880(0.783~0.989),均P<0.05],但其不同基因型组间T1DM患者临床特征差异均无统计学意义(均P>0.05)。IL2RA rs2104286位点不同基因型组间T1DM患者ZnT8A阳性率的差异有统计学意义(P=0.035)。结论IL2RA rs3118470位点多态性与中国汉族人群T1DM易感性相关,其次要等位基因C是T1DM的风险等位基因,IL2RA rs2104286位点多态性与患者ZnT8A阳性率有关。

IL2RA—RBM17基因区域单核苷酸多态性与中国蒙古族白癜风关联研究

目的探讨IL2RA—RBM17基因区域单核苷酸多态性与中国蒙古族白癜风的遗传关联性。方法收集白癜风患者425例，健康对照503例。用AxyPrep（AP—MX—BL—GDNA-25）基因组DNA抽提试剂盒抽提基因组DNA。选择位于IL2RA—RBM17基因区域的9个单核苷酸多态性（rs706779、rs3134883、rs7090530、rs12251307、rs4750005、rs3920615、rs4747887、rs4750012、rs7099083），用连接酶链反应进行基因分型。用PLINK1．07及SPSS11．0进行统计分析，妒检验比较白癜风组及健康对照组等位基因频率及基因型频率。对5个差异有统计学意义的SNP间进行连锁不平衡检验，计算两两间的J2和D’值。用5个具有相关性的SNP构建单倍型，分析每个单倍型频率在白癜风组和健康对照组中的分布。结果5个SNP（rs4750005、rs3920615、rs4747887、rs4750012、rs7099083）的等位基因频率与健康对照组差异有统计学意义（P〈O．05）。5个SNP在显性遗传模式下，白癜风组中的基因型频率均显著低于健康对照组（P〈0．0056）。5个差异有统计学意义的SNP间存在中等至强的连锁不平衡（D，=0．424—1，j2=0．137—0．985）。用5个具有相关性的SNP构建单倍型，分析每个单倍型频率的分布，发现1个单倍型（H2：CGCTA）在白癜风组频率明显低于健康对照组，并达到Bonferroni校正水平（P=0．0016，OR=0．674）。结论IL2RA—RBM17区域基因多态性与蒙古族白癜风具有相关性。

免疫缺陷41型自身免疫性淋巴细胞增生伴胰岛素依赖型糖尿病10型一例并文献复习

目的报道1例白细胞介素2受体α亚基（interleukin 2 receptor-α，IL2RA）基因突变引起的免疫缺陷41型自身免疫性淋巴细胞增生（immunodeficiency 41 with lymphoproliferation and autoimmunity, IMD41）及胰岛素依赖型糖尿病10型（diabetes mellitus, insulin-dependent 10, IDDM10）。 方法临床诊断结合基因测序。 结果本例报道1例7.5岁女童，因＂全身淋巴结肿大5年，乏力2个月，血糖波动20余天＂入院，伴真菌性肺炎、ANCA相关性血管炎。全外显子测序结果显示IL2RA基因复合杂合突变：c.340C〉T（p.Q114X，父系来源，新发突变）、c.64G〉A（p.E22K，母系来源）。经泼尼松、伏立康唑治疗结合糖尿病饮食后自身抗体转阴、血糖恢复正常、肺部病变减轻。文献复习提示国外报道IL2RA基因突变共5例患儿，均表现不同程度的感染（感染部位为肺部、皮肤、胃肠道等）及免疫异常（自身免疫疾病、淋巴结病、肝脾肿大、糖尿病等）。 结论对于临床症状不典型的病例，全外显子测序有助于早期诊断。