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小麦IQM基因家族鉴定及非生物胁迫下表达分析
被引量:
1
1
作者
梁婷
左静红
+5 位作者
陆青
杨东
唐益苗
郭春曼
汪德州
王伟伟
《中国农业科技导报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期27-37,共11页
IQM基因是钙调素结合蛋白家族中的重要分支,在植物生长发育和应激反应中发挥重要作用。本研究利用生物信息学方法在小麦全基因组中鉴定出23个IQM基因家族成员,对其染色体位置、理化性质、系统进化关系、基因结构、蛋白保守结构域、启动...
IQM基因是钙调素结合蛋白家族中的重要分支,在植物生长发育和应激反应中发挥重要作用。本研究利用生物信息学方法在小麦全基因组中鉴定出23个IQM基因家族成员,对其染色体位置、理化性质、系统进化关系、基因结构、蛋白保守结构域、启动子顺式作用元件和基因表达特性等进行了系统分析。结果表明,TaIQM基因家族成员随机分布在小麦18条染色体上,亚细胞定位结果显示所有基因均位于细胞核中,系统进化分析将其分为3个亚类,同一亚类间基因结构、蛋白保守结构域相似度较高,推测其功能相似;顺式作用元件分析表明,TaIQM基因家族成员启动子中含有多种与逆境胁迫及生长发育相关顺式作用元件;转录组数据分析显示,TaIQM基因家族成员在不同时期的根、茎、叶、穗和籽粒中表达量存在显著性差异;qRT-PCR分析显示,在小麦苗期地上部和地下部,TaIQM基因响应干旱、低温、高温、NaCl、ABA等多种胁迫,显示上调或下调表达。初步推断这些基因可能通过Ca^(2+)信号通路参与非生物胁迫调控,研究结果为全面解析TaIQM基因结构与生物学功能、非生物胁迫响应分子机制提供依据。
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关键词
小麦
iqm家族
基因鉴定
非生物胁迫
下载PDF
职称材料
题名
小麦IQM基因家族鉴定及非生物胁迫下表达分析
被引量:
1
1
作者
梁婷
左静红
陆青
杨东
唐益苗
郭春曼
汪德州
王伟伟
机构
长江大学农学院
北京市农林科学院杂交小麦研究所
出处
《中国农业科技导报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期27-37,共11页
基金
北京市农林科学院协同创新中心资助项目(KJCX201907-2)
北京市自然科学基金项目(6222011)。
文摘
IQM基因是钙调素结合蛋白家族中的重要分支,在植物生长发育和应激反应中发挥重要作用。本研究利用生物信息学方法在小麦全基因组中鉴定出23个IQM基因家族成员,对其染色体位置、理化性质、系统进化关系、基因结构、蛋白保守结构域、启动子顺式作用元件和基因表达特性等进行了系统分析。结果表明,TaIQM基因家族成员随机分布在小麦18条染色体上,亚细胞定位结果显示所有基因均位于细胞核中,系统进化分析将其分为3个亚类,同一亚类间基因结构、蛋白保守结构域相似度较高,推测其功能相似;顺式作用元件分析表明,TaIQM基因家族成员启动子中含有多种与逆境胁迫及生长发育相关顺式作用元件;转录组数据分析显示,TaIQM基因家族成员在不同时期的根、茎、叶、穗和籽粒中表达量存在显著性差异;qRT-PCR分析显示,在小麦苗期地上部和地下部,TaIQM基因响应干旱、低温、高温、NaCl、ABA等多种胁迫,显示上调或下调表达。初步推断这些基因可能通过Ca^(2+)信号通路参与非生物胁迫调控,研究结果为全面解析TaIQM基因结构与生物学功能、非生物胁迫响应分子机制提供依据。
关键词
小麦
iqm家族
基因鉴定
非生物胁迫
Keywords
wheat
iqm
gene family
gene indentification
abiotic stress
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
S512 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
小麦IQM基因家族鉴定及非生物胁迫下表达分析
梁婷
左静红
陆青
杨东
唐益苗
郭春曼
汪德州
王伟伟
《中国农业科技导报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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