IS100周围序列多态性分析技术的建立及其在鼠疫耶尔森氏菌分型中的应用

建立鼠疫耶尔森氏菌IS100周围序列多态性(ISCP)分析技术,并探讨其在鼠疫耶尔森氏菌分型中的应用。根据鼠疫杆菌CO92株IS100的基因序列在其两端设计两条向外延伸的引物进行PCR扩增、电泳、获得的指纹图用RAPD、PHYLIP和Treeview软件分析。建立的ISCP分析技术稳定、可靠,利用该技术分析了17个生态型的271株鼠疫耶尔森氏菌,扩增结果表明,指纹图有一定的差异,经RAPD、PHYLIP和Treeview分析可分为3个类型。IS100在鼠疫耶尔森氏菌染色体中虽然分布较广,但其周围序列变异较小,在遗传上较稳定,可作为鼠疫耶尔森氏菌的基因标志,研究该菌的分型与进化。

应用PCR-测序及SSCP技术分析mtDNA序列多态性

mtDNA以其拷贝数多、呈母系遗传、进化速度快等特点,为法医检案提供了一种有效的检测项目,特别是对微量、陈旧降解检材的DNA检验.应用PCR-自动测序和PCR-SSCP检测技术分析58例太原地区无关汉族个体mtDNA nt16081-16546区间(位于HV I)序列多态性,并对其进行统计学分析.

法医DNA序列多态性分析技术的研究进展

自上世纪80年代DNA分析技术应用于法医学实践以来,法医物证学技术从以往只能检测基因编码产物水平（如蛋白质）飞跃到直接检测基因多态性的分子水平,这是法医物证检验分析史上的一场重大革新.法医DNA分析技术对犯罪现场遗留的指纹、毛发、唾液、血迹,甚至一些微量、腐败、污染的生物检材,均能做到快速的法医DNA分析,以进行个人识别和亲子鉴定,使现场生物物证的利用率大大提高,成为认定犯罪的有力证据.目前,法医DNA分析技术已成为法医生物物证检验的常规技术,广泛应用于伤害、性侵犯、交通肇事、亲子鉴定等刑事和民事案件中,为刑事侦查提供线索,为司法审判提供有力地科学证据.

猪肥胖基因(ob)部分序列的克隆与多态性分析

猪肥胖基因（ｏｂ）部分序列的克隆与多态性分析戴茹娟１李宁２吴常信１（１．中国农业大学动物科技学院，北京１０００９４）；（２．中国农业大学农业生物技术重点实验室，北京１０００９４）ＰａｒｔｉａｌＣｌｏｎｉｎｇｏｆＰｏｒｃｉｎｅＯｂｅｓｉｔｙＧｅｎｅａｎ...

CNV结合STR分型技术检测孕早期流产组织潜在葡萄胎效果及风险因素分析

目的:评估基因组拷贝数变异测序(CNV-seq)结合短串联重复序列(STR)多态性分析技术在检测孕早期(≤9周)流产物组织中潜在葡萄胎病例的应用效果.方法:收集2021年1月-2022年12月行孕早期流产组织CNV-seq结合STR多态性检测病例114例,其中部分新鲜绒毛组织进行CNV-seq结合STR多态性检测,部分组织行病理学检测.比较两种检测方法结果,并分析潜在葡萄胎病例的临床特征和影响因素.结果:CNV-seq结合STR多态性检测共检出染色体异常病例28例,阳性率为24.6%,其中单亲二倍体(UPD)8例,占阳性病例28.6%;病理学检出葡萄胎病例12例,阳性率为10.5%,其中完全性葡萄胎(CHM)10例,占阳性病例的83.3%.两种检测方法的结果一致率为89.5%,Kappa值为0.75,两种方法具较好一致性.潜在葡萄胎病例与非葡萄胎病例在年龄、孕次、流产次、β-hCG水平、超声表现等方面有差异,其中年龄、β-hCG水平和超声表现是潜在葡萄胎危险因素(均P<0.05).结论:CNV-seq结合STR多态性分析技术能有效检测孕早期流产物组织中潜在葡萄胎病例,有助于指导临床治疗和避免再次流产.

辽宁汉族人群6个短串联重复序列基因座的遗传多态性

利用多重PCR和4色荧光(5-FAM,JOE,NED和ROX)自动化检测技术调查辽宁地区汉族人群CSF1PO,THO1,D16S539,2S1338,D19S433和TPOX等6个STR基因座多态性分布并计算该6个基因座的基因频率(Pi)、个体识别率(DP)、无偏倚期望杂合度(H)、多态性信息含量(PIC)和非父排除率(PE).结果显示,6个STR基因座的基因型分布符合HardyWeinberg定律.6个STR基因座累积个体识别率(CDP)为0.99999948,累积非父排除率(CPE)为0.98927.6个STR基因座适合作为中国人群的遗传标记,用于人类学、遗传疾病基因连锁分析、法医学亲子鉴定和个体识别等研究领域.

DNA分析技术在法医昆虫学中的应用

在利用尸食性昆虫进行法医学案件分析时,昆虫种类的鉴定是首要的一步[1].在尸体上及其附近发现的昆虫,用形态学方法鉴定常感困难[2].

新型分子标记―SRAP技术体系优化及应用前景分析

基于PCR的分子标记技术很多,但均因自身缺点限制了发展和应用。一种新兴的分子标记技术-相关序列扩增多态性SRAP(Sequence-RelatedAmplifiedPolymorphism)以其特有的优点得到日益广泛的应用,显示了良好的发展前景。此技术在国外较多应用,但国内利用较少。以西瓜为材料对技术体系各影响因素进行调整,优化反应体系,比较DNA提取方法,调整银染技术,得到很好的扩增效果,同时对SRAP的原理、特点和应用前景进行了介绍。研究表明,SRAP将成为研究领域一个有力的工具。

中国南方汉族人群STR位点遗传多态性研究及其在亲子鉴定中的应用

目的 调查中国南方汉族人群的 D8S1179、D2 1S11、D18S5 1、D5 S818、v WA、FGA、D3S135 8、D13S317、D7S82 0等 9个短串联重复 (STR)位点多态性 ,探索 STR基因分析在亲子鉴定案例中的应用价值。方法 应用 PCR复合扩增和四色荧光自动化检测技术对 5 74名南方汉族无关个体的 9个 STR位点作基因分型。结果 获得中国南方汉族人群中 9个 STR位点的等位基因频率 ,其基因型分布符合 Hardy- Weinberg平衡。经统计分析 ,D8S1179、D2 1S11、D18S5 1、D13S317、D7S82 0、D5 S818、v WA和 FGA位点属于高鉴别力、高杂合度、高信息含量的 STR位点 ,D3S135 8属于中高度多态性位点。 9个 STR位点的累积个体识别能力 (DP)、多态信息含量 (PIC)、杂合度 (H)和非父排除率 (PE)均为 0 .9999。在 2 10例亲子鉴定案例中 ,否定亲权的 2 8个案例中均至少有 3个位点不符 ;认定亲权的 182例中 ,亲子关系指数 (RCP)大于 99.73%的有 179例 (98.35 % ,179/ 182 ) ,另外 3例 (1.6 5 % ,3/ 182 ) RCP值为 95 .0 0 %～ 99.73%。结论 研究获得了中国南方汉族人群中 9个 STR位点的等位基因频率。应用这 9个 STR位点的等位基因鉴定 ,能成功地开展亲子鉴定 。

代表性差异分析技术及其应用

同一物种不同基因组的表达存在着差别,这些差别有的是通过遗传获得的,有的是某些病原引起的。代表性差异分析技术(representational difference analy-sis,RDA)正是这样一种分析DNA序列差别的有效方法,它能同时分析与某些疾病表型密切相关的基因变化或某些感兴趣的定点基因克隆。 分子生物学技术不断进步的今天。

多样性序列芯片技术（DArT）的原理及应用

多样性序列芯片技术（DART）是一种基于杂交的分子标记技术，利用芯片技术来辨认和检测DNA多态性的分子标记，用于基因组型分析具有高质量、高通量、低成本且不需要已知序列信息等优点。

中国葡萄酒产区酒酒球菌种质资源遗传多样性分析

为了解我国葡萄酒产区酒酒球菌种质资源遗传多样性,对22株筛选自我国不同葡萄酒产区的乳酸细菌进行了种特异性聚合酶链式反应(species-specific polymerase chain reaction,PCR)分析、16S r RNA序列分析和扩增片段长度多态性分析(amplified fragment length polymorphism,AFLP)基因分型。种特异性PCR和16S r RNA序列分析表明22株分离株为酒酒球菌(Oenococcus oeni)。建立了O.oeni基于HindⅢ和MseⅠ为内切酶的AFLP分析体系,对16对引物组合进行了筛选,结果表明HT-MA、HT-MT、HT-MC、HG-MA、HG-MT、HC-MT为O.oeni AFLP分析的最佳引物组合,且实验重复性在98%以上。对O.oeni的AFLP分析结果显示:22株O.oeni分为3个簇群,且簇群间遗传相似性系数较小。所以,以HindⅢ和MseⅠ为内切酶的AFLP技术是研究O.oeni基因分型的有效方法,我国葡萄酒产区的O.oeni具有丰富的遗传多样性,O.oeni菌株间的遗传相似性系数不仅仅与其生态地理分布有关,可能还与其所处的微生态和其他因素有关。

焦磷酸测序技术及其应用进展

焦磷酸测序技术是一种新的依靠生物发光进行DNA序列分析的技术。在DNA聚合酶、ATP硫酸化酶、荧光素酶和双磷酸酶的协同作用下,将引物上每一个dNTP聚合与一次荧光信号释放偶联起来,通过检测荧光的释放和强度,达到实时测定DNA序列的目的。此技术不需要荧光标记的引物或核酸探针,也无需进行电泳,具有分析结果快速、准确、灵敏度高和自动化的特点。在遗传多态性分析、重要微生物的鉴定与分型研究、克隆检测和等位基因频率分析等方面具有广泛的应用。

深圳地区人群苯丙酮尿症患者基因分析

目的 探讨深圳地区苯丙酮尿症 (PKU)患者血苯丙氨酸羟化酶 (phenylalaninehydroxylase ,PAH)基因单核苷酸多态性位点。方法 设计 7对引物 ,应用多聚酶链反应 -单链构像多态 (PCR -SSCP)银染技术和DNA序列分析了 3个PKU家族共 13个成员的PAH基因。结果 PCR -SSCP分析发现 ,其中 2个家族的子女及其父母有电泳条带异常 ,测序结果示两多态性位点均在内含子 10上。结论

结核分枝杆菌基因分型技术研究进展

结核分枝杆菌（Mvcobacterial tuberculosis，MTB）足结核病的病原体，可累及全身多种组织器官，以肺组织受累最常见。近几年由于流动人口的增加和HIV病毒感染的流行，结核病再次成为严亘危害世界公共卫生的传染病之一。结核病再度肆虐，其主要原因之一就是结核分支杆菌的变异。