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福建三明不同地理种源草珊瑚亲缘关系ISSR分析
被引量:
1
1
作者
邓思珊
刘洪旭
+4 位作者
孟春
梁一池
徐榕青
林文津
张亚敏
《中国中医药信息杂志》
CAS
CSCD
2015年第9期83-86,共4页
目的研究福建草珊瑚基地不同地理种源的草珊瑚遗传多样性,构建亲缘关系图。方法采用CTAB法提取叶子中DNA,ISSR法对45个种源的草珊瑚样品进行DNA分子水平的分析评价,POPgen32软件计算遗传多样性,建立基因树谱,采用NTSYS软件进行聚类分析...
目的研究福建草珊瑚基地不同地理种源的草珊瑚遗传多样性,构建亲缘关系图。方法采用CTAB法提取叶子中DNA,ISSR法对45个种源的草珊瑚样品进行DNA分子水平的分析评价,POPgen32软件计算遗传多样性,建立基因树谱,采用NTSYS软件进行聚类分析。结果 6条ISSR引物共扩增出630条条带,遗传多样性分析表明45个品种平均有效等位基因数为1.620 2,平均Nei's基因多样性指数为0.364 5,平均Shannon信息指数为0.543 2。各位点遗传多样性程度也存在较大差别,Nei's基因多样性指数最大值为0.497 2,最小值为0.107 8;Shannon信息指数最大值为0.690 3,最小值为0.219 2。聚类分析结果显示,以45个品种和14个位点的谱带数据为原始矩阵,共获得630个两两不同品种间的遗传相似系数,不同组之间相似系数最大者为1.0,最小者为0.516。结论福建三明种植的草珊瑚品种间存在丰富的遗传变异,具有丰富品种的分子基础。以0.610为阈值可以把45个不同地理种源的草珊瑚分为6个组。遗传距离与种源地理远近无明显相关。
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关键词
草珊瑚
issr法
遗传多样性
聚类分析
下载PDF
职称材料
甜菜抗根腐病基因ISSR分子标记的初步研究
被引量:
15
2
作者
吴旭红
《齐齐哈尔大学学报(自然科学版)》
2005年第2期30-32,共3页
以感病×抗病的甜菜种间杂交组合KWS9419×ZD204的F1代17个单株及ZD自交一代16个单株为试材,采用BSA法和ISSR技术,通过对155个随机引物的筛选,获得了一个与甜菜抗根腐病基因连锁的ISSR标记OPP0760,可以用作抗根腐病基因的分子...
以感病×抗病的甜菜种间杂交组合KWS9419×ZD204的F1代17个单株及ZD自交一代16个单株为试材,采用BSA法和ISSR技术,通过对155个随机引物的筛选,获得了一个与甜菜抗根腐病基因连锁的ISSR标记OPP0760,可以用作抗根腐病基因的分子辅助选择的依据。
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关键词
甜菜
抗根腐病基因
issr
分子标记
法
病害
核苷酸
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职称材料
孑遗濒危植物蒙古沙冬青ISSR遗传多样性分析
被引量:
3
3
作者
段义忠
王建武
亢福仁
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第15期5008-5014,共7页
本研究以6个不同地理种群的蒙古沙冬青为试验材料,从16条UBC引物中筛选出9条合适的ISSR引物,并对ISSR扩增反应体系及扩增程序进行优化,9个引物扩增出218个条带,多态性条带占73%。试验结果表明石碳沟种群的Nei's多样性指数、Shannon&...
本研究以6个不同地理种群的蒙古沙冬青为试验材料,从16条UBC引物中筛选出9条合适的ISSR引物,并对ISSR扩增反应体系及扩增程序进行优化,9个引物扩增出218个条带,多态性条带占73%。试验结果表明石碳沟种群的Nei's多样性指数、Shannon's信息指数均为6个地理种群中最高,而千里沟的则为最低。这表明蒙古沙冬青的遗传多样性与不同地区的生境条件有很大的关系;6个种群的基因流(Nm)为1.773>1,表明在6个蒙古沙冬青种群间存在基因流,从而阻碍了由遗传漂变所导致的遗传分化;通过聚类分析,将6个不同地理种群的蒙古沙冬青分为三类,种群敖伦布拉格、千里沟和苏木图先聚成一大类,再与红沙砚聚成第二大类,而石碳沟则和扁担沟组成第大三类,表明相近的生境条件影响种群间遗传多样性的相似性。
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关键词
蒙古沙冬青
遗传多样性
issr
分子标记
法
孑遗植物
原文传递
题名
福建三明不同地理种源草珊瑚亲缘关系ISSR分析
被引量:
1
1
作者
邓思珊
刘洪旭
孟春
梁一池
徐榕青
林文津
张亚敏
机构
福建省医学科学研究院福建省医学测试重点实验室
福州大学
福建中医药大学
出处
《中国中医药信息杂志》
CAS
CSCD
2015年第9期83-86,共4页
基金
福建省自然科学基金(2013J01366)
文摘
目的研究福建草珊瑚基地不同地理种源的草珊瑚遗传多样性,构建亲缘关系图。方法采用CTAB法提取叶子中DNA,ISSR法对45个种源的草珊瑚样品进行DNA分子水平的分析评价,POPgen32软件计算遗传多样性,建立基因树谱,采用NTSYS软件进行聚类分析。结果 6条ISSR引物共扩增出630条条带,遗传多样性分析表明45个品种平均有效等位基因数为1.620 2,平均Nei's基因多样性指数为0.364 5,平均Shannon信息指数为0.543 2。各位点遗传多样性程度也存在较大差别,Nei's基因多样性指数最大值为0.497 2,最小值为0.107 8;Shannon信息指数最大值为0.690 3,最小值为0.219 2。聚类分析结果显示,以45个品种和14个位点的谱带数据为原始矩阵,共获得630个两两不同品种间的遗传相似系数,不同组之间相似系数最大者为1.0,最小者为0.516。结论福建三明种植的草珊瑚品种间存在丰富的遗传变异,具有丰富品种的分子基础。以0.610为阈值可以把45个不同地理种源的草珊瑚分为6个组。遗传距离与种源地理远近无明显相关。
关键词
草珊瑚
issr法
遗传多样性
聚类分析
Keywords
Sarcandra Glabra
issr
genetic diversity
cluster analysis
分类号
R282.5 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
甜菜抗根腐病基因ISSR分子标记的初步研究
被引量:
15
2
作者
吴旭红
机构
齐齐哈尔大学生命科学与工程学院
出处
《齐齐哈尔大学学报(自然科学版)》
2005年第2期30-32,共3页
基金
黑龙江省教育厅项目。项目编号:10551332
文摘
以感病×抗病的甜菜种间杂交组合KWS9419×ZD204的F1代17个单株及ZD自交一代16个单株为试材,采用BSA法和ISSR技术,通过对155个随机引物的筛选,获得了一个与甜菜抗根腐病基因连锁的ISSR标记OPP0760,可以用作抗根腐病基因的分子辅助选择的依据。
关键词
甜菜
抗根腐病基因
issr
分子标记
法
病害
核苷酸
Keywords
sugar beet
root rot resistance gene
issr
marker
分类号
S435.663 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
下载PDF
职称材料
题名
孑遗濒危植物蒙古沙冬青ISSR遗传多样性分析
被引量:
3
3
作者
段义忠
王建武
亢福仁
机构
榆林学院生命科学学院
陕西省陕北生态修复重点实验室
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第15期5008-5014,共7页
基金
国家自然科学基金项目(41601059)资助
文摘
本研究以6个不同地理种群的蒙古沙冬青为试验材料,从16条UBC引物中筛选出9条合适的ISSR引物,并对ISSR扩增反应体系及扩增程序进行优化,9个引物扩增出218个条带,多态性条带占73%。试验结果表明石碳沟种群的Nei's多样性指数、Shannon's信息指数均为6个地理种群中最高,而千里沟的则为最低。这表明蒙古沙冬青的遗传多样性与不同地区的生境条件有很大的关系;6个种群的基因流(Nm)为1.773>1,表明在6个蒙古沙冬青种群间存在基因流,从而阻碍了由遗传漂变所导致的遗传分化;通过聚类分析,将6个不同地理种群的蒙古沙冬青分为三类,种群敖伦布拉格、千里沟和苏木图先聚成一大类,再与红沙砚聚成第二大类,而石碳沟则和扁担沟组成第大三类,表明相近的生境条件影响种群间遗传多样性的相似性。
关键词
蒙古沙冬青
遗传多样性
issr
分子标记
法
孑遗植物
Keywords
A mmopiptanthus mongolicus
Genetic diversity
issr
molecular marker
Relict species
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
福建三明不同地理种源草珊瑚亲缘关系ISSR分析
邓思珊
刘洪旭
孟春
梁一池
徐榕青
林文津
张亚敏
《中国中医药信息杂志》
CAS
CSCD
2015
1
下载PDF
职称材料
2
甜菜抗根腐病基因ISSR分子标记的初步研究
吴旭红
《齐齐哈尔大学学报(自然科学版)》
2005
15
下载PDF
职称材料
3
孑遗濒危植物蒙古沙冬青ISSR遗传多样性分析
段义忠
王建武
亢福仁
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2018
3
原文传递
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