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ITGB1在胃癌组织中的表达及其对免疫治疗疗效的影响
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作者 乔洪源 付娟 +1 位作者 赵新程 庞雅琪 《免疫学杂志》 CAS CSCD 2024年第2期188-194,共7页
目的探索ITGB1在胃癌组织中的表达及其对免疫治疗疗效影响,为胃癌的预后判断及免疫治疗疗效预测提供新的标志物。方法通过生物信息学方法对癌症基因图谱(TCGA)数据库中胃癌患者的转录组数据、临床病理特征和生存信息进行分析,评估ITGB1... 目的探索ITGB1在胃癌组织中的表达及其对免疫治疗疗效影响,为胃癌的预后判断及免疫治疗疗效预测提供新的标志物。方法通过生物信息学方法对癌症基因图谱(TCGA)数据库中胃癌患者的转录组数据、临床病理特征和生存信息进行分析,评估ITGB1在胃癌中的表达及其与临床病理特征的相关性,并进一步分析ITGB1表达与免疫浸润、免疫检查点相关基因、免疫亚型及免疫治疗响应的关系。结果ITGB1在胃癌组织中高表达,ITGB1高表达组T分期晚、存活率低,总体生存率明显降低。免疫浸润评分分析显示CD4+T细胞、CD8+T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞的在ITGB1高表达组评分升高,同时免疫检查点相关基因SIGLEC15、TIGIT、CD274、HAVCR2、CTLA4、PDCD1LG2在ITGB1高表达组表达水平升高,且ITGB1的表达与免疫检查点相关基因SIGLEC15、TIGIT、CD274、HAVCR2、CTLA4、LAG3、PDCD1LG2的表达呈正相关。TISIDB数据库分析显示ITGB1在胃癌不同免疫亚型中的表达存在差异,其中C6亚型(TGF-β主导型)中表达水平升高。TIDE算法提示ITGB1高表达组TIDE评分高于低表达组,对免疫检查点阻断治疗疗效差。结论ITGB1在胃癌组织中高表达,是胃癌患者预后差的危险因素,可作为判断胃癌预后及预测免疫治疗疗效的潜在标志物。 展开更多
关键词 itgb1 胃腺癌 免疫治疗 生物信息学
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LncRNA ITGB1在垂体瘤中的表达及对细胞生物学行为的影响
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作者 郑锴 罗秀玲 +3 位作者 张玮豪 刘宇利 李玉明 廖尚高 《沈阳药科大学学报》 CAS CSCD 2024年第10期1361-1368,共8页
目的检测长链非编码RNA(LncRNA)ITGB1在垂体瘤中的表达并探讨其对垂体瘤细胞增殖、凋亡、侵袭、迁移行为的影响.方法选取2018年9月-2021年4月在本院接受手术治疗的48例垂体瘤患者及死于意外的48例组织捐献者,分别收集垂体瘤及正常垂体... 目的检测长链非编码RNA(LncRNA)ITGB1在垂体瘤中的表达并探讨其对垂体瘤细胞增殖、凋亡、侵袭、迁移行为的影响.方法选取2018年9月-2021年4月在本院接受手术治疗的48例垂体瘤患者及死于意外的48例组织捐献者,分别收集垂体瘤及正常垂体前叶组织.取人垂体瘤RC-4BC细胞,分别构建ITGB1敲低(转染LncRNA ITGB1 siRNA)和过表达株(转染pcD-NA3.1 LncRNA ITGB1),qPCR法检测RC-4BC细胞中LncRNA ITGB1表达,Western Blot法检测增殖细胞核抗原(PCNA)、含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶3(Caspase-3)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)蛋白表达.结果垂体瘤组织中LncRNA ITGB1表达水平较正常垂体前叶组织升高;Ln-cRNA ITGB1在不同肿瘤大小、侵袭性患者垂体瘤组织中表达差异具有统计学意义;与siRNA NC组相比,LncRNA ITGB1 siRNA组RC-4BC细胞增殖率、侵袭数、划痕愈合率及细胞中LncRNA IT-GB1水平、PCNA、MMP-9蛋白水平降低,RC-4BC细胞凋亡率及细胞中Caspase-3蛋白水平升高;与pcDNA3.1 NC组相比,pcDNA3.1 LncRNA ITGB1组RC-4BC细胞增殖率、侵袭数、划痕愈合率及细胞中LncRNA ITGB1水平、PCNA、MMP-9蛋白水平升高,RC-4BC细胞凋亡率及细胞中Caspase-3蛋白水平降低.结论LncRNA ITGB1在垂体瘤中表达上调,与垂体瘤患者肿瘤大小、侵袭性有关,可促进垂体瘤RC-4BC细胞的增殖、侵袭、迁移过程,并抑制细胞凋亡. 展开更多
关键词 长链非编码RNA itgb1 垂体瘤 增殖 凋亡
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Numb调控ITGB1促进胃癌细胞对多柔比星敏感性的机制研究
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作者 陈勇 何冬雷 +2 位作者 周江浩 梁月祥 杨丞 《河北医药》 CAS 2023年第15期2256-2260,共5页
目的探究细胞命运决定子Numb调控胃癌细胞对多柔比星(ADR)敏感性的作用,并明确Numb介导胃癌细胞化疗敏感性的分子机制。方法将SGC-7901随机分为对照组、ADR组、pLVX-Numb组、pLVX-Numb+ADR组,经过对应的ADR处理与转染处理后,Hoechst 33... 目的探究细胞命运决定子Numb调控胃癌细胞对多柔比星(ADR)敏感性的作用,并明确Numb介导胃癌细胞化疗敏感性的分子机制。方法将SGC-7901随机分为对照组、ADR组、pLVX-Numb组、pLVX-Numb+ADR组,经过对应的ADR处理与转染处理后,Hoechst 33258染色观察细胞凋亡形态,流式细胞术检测细胞凋亡率,Western blot法测定细胞内耐药蛋白(P-gp)、多聚ADP核糖聚合酶(PARP)、裂解的半胱氨酸天冬氨酸特异性蛋白酶3(Cleaved-caspase3)、Cleaved-caspase9的蛋白表达水平。再使用Numb过表达及其对照慢病毒感染SGC-7901细胞,qRT-PCR和Western blot检测细胞内ITGB1表达变化,免疫共沉淀实验分析细胞内源性Numb与ITGB1结合情况。结果与ADR组比较,pLVX-Numb+ADR组细胞内浓缩、碎裂的蓝色凋亡体增多,细胞凋亡率升高,且细胞内P-gp和PARP蛋白相对表达量下调、Cleaved-caspase3和Cleaved-caspase9蛋白相对表达量上调(P<0.05)。此外,SGC-7901细胞中内源性Numb与ITGB1能够形成复合物,pLVX-Numb组细胞中ITGB1蛋白相对表达量显著低于对照组(P<0.05),且ITGB1蛋白泛素链明显强于对照组。结论Numb能够促进胃癌细胞对多柔比星的敏感性,该作用机制可能与其调控ITGB1蛋白表达相关。 展开更多
关键词 胃癌 多柔比星 NUMB itgb1 细胞凋亡 化疗敏感性
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LncRNA H19介导TSPAN9/ITGB1基因对食管癌细胞生物活性的作用机制 被引量:2
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作者 彭钦 潘桂华 +1 位作者 刘化科 钟妮 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2023年第10期2517-2522,共6页
目的探讨长链非编码RNA(LncRNA)H19介导TSPAN9/ITGB1基因对食管癌细胞生物活性的作用机制。方法检测不同食管鳞癌细胞株中LncRNA H19水平。将食管癌KYSE30细胞分为EC组(无转染食管癌细胞株),NC组(食管癌细胞转染si-NC),干扰组(食管癌细... 目的探讨长链非编码RNA(LncRNA)H19介导TSPAN9/ITGB1基因对食管癌细胞生物活性的作用机制。方法检测不同食管鳞癌细胞株中LncRNA H19水平。将食管癌KYSE30细胞分为EC组(无转染食管癌细胞株),NC组(食管癌细胞转染si-NC),干扰组(食管癌细胞转染LncRNA H19-siRNA)。聚合酶链反应(PCR)检测证实LncRNA H19转染成功后,采用噻唑蓝(MTT)、流式细胞仪、Transwell小室及划痕实验检测KYSE30生物活性,采用Western印迹及PCR检测时增加干扰Ⅱ组(干扰组上+TSPAN9模拟物+ITGB1-siRNA),检测TSPAN9/ITGB1蛋白及mRNA相对表达。结果在不同食管癌细胞株中均能够检测出LncRNA H19相对表达,在KYSE30食管癌细胞株中表达最高,选择KYSE30细胞进行后续实验;NC组和EC组KYSE30中LncRNA H19表达比较无显著差异(P>0.05),干扰组明显低于EC组、NC组(P<0.05);各组KYSE30在0 h及24 h时细胞增殖比较无显著差异(P>0.05),从48 h时起干扰组增殖抑制逐渐升高,与EC组、NC组比较,增值明显降低(P<0.05);NC组和EC组KYSE30细胞凋亡率比较无显著差异(P>0.05),干扰组凋亡率明显高于EC组、NC组(P<0.05);NC组和EC组KYSE30细胞侵袭、迁移数目比较无显著差异(P>0.05),干扰组细胞侵袭、迁移数目明显低于EC组、NC组(P<0.05);EC组和NC组TSPAN9/ITGB1蛋白及mRNA比较均无显著差异(P>0.05),干扰组与NC组比较存在显著差异(P<0.05),干扰Ⅱ组与干扰组比较存在显著差异(P<0.05)。结论LncRNA H19在食管癌KYSE30细胞中表达较高,转染LncRNA H19-siRNA后KYSE30细胞生物活性降低,作用机制与激活TSPAN9、抑制ITGB1表达相关。 展开更多
关键词 食管癌 长链非编码RNA(LncRNA)H19 TSPAN9/itgb1 生物活性
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EFEMP1通过肿瘤微环境促进胃癌的生长与转移
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作者 马俊 邓士杰 《诊断病理学杂志》 2024年第7期609-613,618,共6页
目的基于生物信息学分析EFEMP1在胃癌组织中表达及意义。方法利用GEO数据库胃癌数据集采用CIBERSORT和ESTIMATE计算方法计算374例胃癌病人肿瘤组织Immune Score,Stormal Score和ESTIMATEScore,通过生存分析,蛋白互作网络(PPI)构建寻找... 目的基于生物信息学分析EFEMP1在胃癌组织中表达及意义。方法利用GEO数据库胃癌数据集采用CIBERSORT和ESTIMATE计算方法计算374例胃癌病人肿瘤组织Immune Score,Stormal Score和ESTIMATEScore,通过生存分析,蛋白互作网络(PPI)构建寻找与预后相关的核心基因,并利用TCGA胃癌数据库和免疫组化染色验证核心基因表达。结果GEO和TCGA数据库中EFEMP1在正常组织和肿瘤组织中表达无差异性,与胃癌的生存时间和临床分期相关(T和Stage)。GSEA显示EFEMP1高表达主要富集于钙信号通路、细胞黏附和细胞外基质受体相互作用通路。EFEMP1表达与ITGB1在肿瘤直径、组织学分级、TNM分期均相关(P<0.05)。结论EFEMP1参与胃癌的发生、发展,在侵袭和转移中可能和ITBG1表达存在协同作用。 展开更多
关键词 生物信息学 胃癌 EFEMP1 itgb1 肿瘤微环境
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miR-29通过ITGB1抑制胃癌侵袭、转移的分子机制 被引量:11
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作者 何兵 余松涛 +3 位作者 吕沐瀚 吴玉云 胡长江 杨仕明 《第三军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1037-1042,共6页
目的观察miR-29对胃癌细胞体外侵袭力的影响,探讨miR-29通过ITGB1调节胃癌侵袭和转移的具体机制。方法通过基因芯片筛选胃癌与癌旁组织中差异性表达的miRNA;采用生物信息学预测ITGB1调控相关miRNA,通过比对上述2个结果,筛选出miR-29;进... 目的观察miR-29对胃癌细胞体外侵袭力的影响,探讨miR-29通过ITGB1调节胃癌侵袭和转移的具体机制。方法通过基因芯片筛选胃癌与癌旁组织中差异性表达的miRNA;采用生物信息学预测ITGB1调控相关miRNA,通过比对上述2个结果,筛选出miR-29;进一步以miR-29慢病毒及miR-29mimics过表达miR-29后,用Western blot检测胃癌细胞中ITGB1的表达变化;采用双荧光素酶实验分析miR-29与ITGB1的作用机制;采用Transwell侵袭实验及划痕实验检测miR-29慢病毒感染后细胞体外侵袭能力的变化;qRT-PCR检测60例胃癌患者癌组织和癌旁组织中miR-29的表达差异,并分析miR-29的表达与肝癌患者临床病理之间的关系。结果基因芯片及生物信息学预测发现miR-29在胃癌组织里高表达,同时又可能调控ITGB1;双荧光素酶实验证实miR-29可以结合在ITGB13'UTR,miR-29慢病毒及miR-29mimics过表达miR-29都能在蛋白水平下调ITGB1;qRT-PCR结果显示miR-29家族3条miRNA在胃癌组织中的相对含量均低于癌旁组织[miR-29a:癌旁(32.01±10.38),癌(14.16±6.25);miR-29b:癌旁(26.95±5.05),癌(9.82±1.86);miR-29c:癌旁(53.56±8.05),癌(16.79±1.97),P<0.01];进一步统计学分析表明,miR-29a与淋巴结转移有关(P<0.05),miR-29b在具有远处转移的病例组织中C/P比值较无远处转移的病例组织明显降低(P<0.05)。结论miR-29可以在转录后水平调控ITGB1的表达,从而抑制胃癌细胞的侵袭和转移。 展开更多
关键词 itgb1 MIR-29 胃肿瘤 肿瘤转移
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高表达ITGB1促进人乳腺上皮MCF10A细胞EMT及迁移 被引量:2
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作者 郎磊 周明莉 +3 位作者 杨佳佳 杜燕娥 文思阳 柳满然 《基础医学与临床》 CSCD 2016年第11期1511-1516,共6页
目的探讨ITGB1基因过表达对人乳腺上皮MCF10A细胞迁移和侵袭的影响。方法构建重组质粒p BABEpuro-myc-ITGB1,在人胚肾上皮细胞系293T细胞中包装反转录病毒,转染人乳腺上皮MCF10A细胞系,构建ITGB1基因过表达的稳定细胞系;实验设空白对照... 目的探讨ITGB1基因过表达对人乳腺上皮MCF10A细胞迁移和侵袭的影响。方法构建重组质粒p BABEpuro-myc-ITGB1,在人胚肾上皮细胞系293T细胞中包装反转录病毒,转染人乳腺上皮MCF10A细胞系,构建ITGB1基因过表达的稳定细胞系;实验设空白对照组(MCF10A)、阴性对照组(MCF10A-vector)和ITGB1基因过表达组(MCF10A-ITGB1);经嘌呤霉素筛选后,实时荧光定量PCR和蛋白质印迹法检测ITGB1 mRNA及蛋白的表达;Transwell迁移和侵袭实验分别检测细胞株迁移和侵袭能力;蛋白质印迹法进一步检测上皮间质转换(EMT)相关蛋白E-cadherin、vimentin、fibronectin、N-cadherin以及ITGB1下游ILK、p-FAK和FAK蛋白的表达。结果成功构建ITGB1基因稳定过表达人乳腺上皮MCF10A细胞系;ITGB1基因过表达组(MCF10A-ITGB1)与空白对照组(MCF10A)和阴性对照组(MCF10A-vector)细胞相比,迁移能力(P<0.05)和侵袭能力(P<0.01)显著增强;EMT相关蛋白E-cadherin显著下调(P<0.05),vimentin、fibronectin、N-cadherin以及ITGB1下游ILK,p-FAK蛋白显著上调(P<0.05)。结论在人乳腺上皮MCF10A细胞中,过表达ITGB1基因诱导细胞EMT并促进其迁移和侵袭。 展开更多
关键词 itgb1 上皮间质转换 细胞迁移 细胞侵袭
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FSHβ和ITGB1基因多态性与母猪繁殖性状的关联性分析 被引量:3
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作者 李梦寻 胡九英 +5 位作者 谢苏 邱梅玉 鲁慧文 公红斌 来红霞 黄涛 《石河子大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2018年第1期39-44,共6页
为探讨FSHβ和ITGB1基因多态性与母猪繁殖性状的相关性,本研究采用PCR-RFLP技术对939头大白猪群体中进行FSHβ和ITGB1基因的多态性检测,并对不同胎次不同基因型的总产仔数、产活仔数、健仔数、木乃伊数、死胎数、窝重等繁殖性状进行关... 为探讨FSHβ和ITGB1基因多态性与母猪繁殖性状的相关性,本研究采用PCR-RFLP技术对939头大白猪群体中进行FSHβ和ITGB1基因的多态性检测,并对不同胎次不同基因型的总产仔数、产活仔数、健仔数、木乃伊数、死胎数、窝重等繁殖性状进行关联性分析。结果显示:在试验大白猪群体中,FSHβ和ITGB1均具有中度多态性,FSHβ基因型频率为AB>BB>AA,优势基因为B等位基因。ITGB1基因型频率在大白猪中为CT>CC>TT,优势基因为C基因。FSHβ基因在头胎的死胎性状上AB基因型显著低于BB型0.15头/胎(P<0.05),而在窝重性状上AB基因型显著高于BB基因型0.69kg/胎(P<0.05),在其他胎次中各繁殖性状在不同基因型间差异不显著(P>0.05)。ITGB1基因在头胎的死胎性状中TT基因型显著低于CC型,在二胎的窝重性状上CC型显著高于CT和TT型,分别高出0.88和0.97 kg/胎(P<0.05);在三胎健仔数和窝重性状中CC型均显著高于CT型(P<0.05),由此可见CC基因型为ITGB1在繁殖性状中的优势基因型。合并基因型分析结果发现:头胎的大白猪FSHβ-ITGB1合并基因型中最优分子标记组合为AATT,经产二胎、三胎次大白猪繁殖性状FSHβ-ITGB1最优分子标记组合为BBCC。 展开更多
关键词 母猪 ESR FSHΒ itgb1 繁殖性状
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LncRNA ITGB2-AS1靶向miR-338-3p对肺癌细胞多西他赛耐药性的影响
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作者 杨士杰 刘春盛 高丽环 《实用药物与临床》 CAS 2021年第1期17-22,共6页
目的研究lncRNA ITGB2-AS1对肺癌细胞增殖、凋亡及多西他赛耐药性的影响及潜在的分子机制。方法用不同浓度(6.25μg/L、12.5μg/L、25μg/L、50μg/L、100μg/L、200μg/L)多西他赛(DTX)处理肺癌A549和多西他赛耐药细胞A549/DTX细胞,CCK... 目的研究lncRNA ITGB2-AS1对肺癌细胞增殖、凋亡及多西他赛耐药性的影响及潜在的分子机制。方法用不同浓度(6.25μg/L、12.5μg/L、25μg/L、50μg/L、100μg/L、200μg/L)多西他赛(DTX)处理肺癌A549和多西他赛耐药细胞A549/DTX细胞,CCK8法测定DTX对A549细胞增殖抑制率和IC 50,qRT-PCR检测A549和A549/DTX细胞中lncRNA ITGB2-AS1和miR-338-3p的水平,Western blot检测细胞中CyclinD1、p21、Bax和Bcl-2表达水平,流式细胞术检测细胞凋亡率,双荧光素酶报告系统验证lncRNA ITGB2-AS1和miR-338-3p的靶向关系。结果多西他赛(DTX)(6.25μg/L、12.5μg/L、25μg/L、50μg/L、100μg/L、200μg/L)对A549/DTX细胞的抑制率显著低于A549细胞,呈浓度依赖性,A549/DTX对DTX的IC 50(256.80±10.22)μg/L显著高于A549细胞(23.57±2.11)μg/L;在A549/DTX中,lncRNA ITGB2-AS1含量显著高于A549细胞(P<0.05),miR-338-3p含量显著低于A549细胞(P<0.05);抑制lncRNA ITGB2-AS1联合12.5μg/L DTX处理可提高A549/DTX细胞凋亡率,增强DTX对A549/DTX细胞的增殖抑制率,上调p21和Bax水平,下调Cyclin D1和Bcl-2蛋白含量;lncRNA ITGB2-AS1靶向负调控miR-338-3p的表达;下调miR-338-3p可逆转抑制lncRNA ITGB2-AS1对A549/DTX细胞增殖、凋亡和多西他赛耐药性的作用。结论LncRNA ITGB2-AS1可靶向miR-338-3p调控A549/DTX细胞的增殖、凋亡及多西他赛耐药性。LncRNA ITGB2-AS1是肺癌潜在的分子靶点。 展开更多
关键词 肺癌 LncRNA itgb2-AS1 miR-338-3p 增殖 凋亡 多西他赛耐药性
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PRLR和ITGB1基因多态性对大白猪繁殖性能的影响 被引量:6
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作者 沈永巧 胡九英 +3 位作者 孙敬礼 鲁慧文 汪德明 黄涛 《石河子大学学报(自然科学版)》 CAS 2017年第2期146-151,共6页
为了研究PRLR和ITGB1基因多态性对大白猪繁殖性能的影响,本研究采用PCR-RFLP技术检测基因多态性,并将基因型与母猪繁殖性能进行关联分析。结果显示:对于PRLR基因,初产母猪各基因型间的繁殖性状差异均不显著(P>0.05);经产母猪的总产... 为了研究PRLR和ITGB1基因多态性对大白猪繁殖性能的影响,本研究采用PCR-RFLP技术检测基因多态性,并将基因型与母猪繁殖性能进行关联分析。结果显示:对于PRLR基因,初产母猪各基因型间的繁殖性状差异均不显著(P>0.05);经产母猪的总产仔数、活仔数和健仔数均呈现AA>AB>BB的趋势,AA型比BB型、AB型总仔数分别多0.55头(P<0.05)、0.13头,AA型、AB型比BB型活仔数分别多0.59头(P<0.05)、0.43头(P<0.05),AA型比BB型健仔数多0.5头(P<0.05)、0.26头。对于ITGB1基因,初产母猪和经产母猪各基因型间的个体繁殖性状虽有差异,但差异不显著(P>0.05)。对于合并基因型,初产母猪ABCC型比BBTT型个体的初生窝重多1.35头(P<0.05);经产母猪AACC型相对于BBCC和BBTC型,健仔数分别多1.07头(P<0.05)和0.71头(P<0.05),AACC型个体总仔数和活仔数分别比BBCC型多1.31和1.39头、比BBTT型多0.77头和0.64头,差异均显著(P<0.05)。 展开更多
关键词 PRLR itgb1 繁殖性能
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ITGB1基因表达与鹅肥肝形成的关系 被引量:1
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作者 顾旺 张宜辉 +2 位作者 张军 耿拓宇 龚道清 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 2021年第5期771-776,共6页
为探究ITGB1基因与鹅肥肝形成的关系,选取30只70日龄健康朗德公鹅,随机分为填饲组与对照组并进行24 d填饲。运用ITGB1基因序列进行生物信息学分析,采用RT-q PCR技术检测不同填饲阶段(填饲12 d与24 d)鹅肝脏中ITGB1基因的表达水平,同时,... 为探究ITGB1基因与鹅肥肝形成的关系,选取30只70日龄健康朗德公鹅,随机分为填饲组与对照组并进行24 d填饲。运用ITGB1基因序列进行生物信息学分析,采用RT-q PCR技术检测不同填饲阶段(填饲12 d与24 d)鹅肝脏中ITGB1基因的表达水平,同时,使用不同剂量的脂肪肝形成相关因子(胰岛素、葡萄糖、油酸、亚油酸和棕榈酸)处理鹅原代肝细胞,检测ITGB1基因的表达水平。结果发现:全长CDS共2418 bp,编码805个氨基酸,与鸭的同源性高于98%,可编码1种亲水性蛋白;与对照相比,填饲12 d与24 d时,鹅肝脏中ITGB1基因的表达均显著上调(P<0.05);0.5 mmol·L^(-1)油酸、亚油酸和棕榈酸均能显著地诱导鹅原代肝细胞中ITGB1基因上调(P<0.05);200 mmol·L^(-1)葡萄糖能极显著地诱导鹅原代肝细胞中ITGB1基因上调(P<0.01);此外,0.2 mmol·L^(-1)胰岛素也能在一定程度上有诱导其表达上调的趋势(P=0.098)。结果表明,ITGB1基因表达上调与鹅肥肝形成密切相关,受脂肪肝形成相关因子诱导,提示ITGB1基因表达上调可能会促进鹅肥肝的形成。 展开更多
关键词 itgb1 肥肝 基因表达
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广西扶绥县壮族肝癌家系人群Itgb1基因多态性与肝癌遗传易感性的研究 被引量:1
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作者 毛赛兰 何承诚 +3 位作者 赵瑞强 闫雷 黄正 谢裕安 《中国癌症防治杂志》 CAS 2016年第2期78-82,共5页
目的研究广西扶绥县壮族肝细胞癌(hepatocellularcarcinoma,HCC,以下简称肝癌)高发家系人群hgbl基因m2298141位点单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)和肝癌遗传易感性的关系。方法采用病例一对照研究方法,选择... 目的研究广西扶绥县壮族肝细胞癌(hepatocellularcarcinoma,HCC,以下简称肝癌)高发家系人群hgbl基因m2298141位点单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)和肝癌遗传易感性的关系。方法采用病例一对照研究方法,选择扶绥县20个肝癌高发家系共79例(肝癌高发家系组)和10个正常对照家系共40名(正常对照家系组)为研究对象,应用时间飞行质谱技术(MALDI—TOFMS)检测两组ltgbI基因rs2298141位点的基因型及等位基因频率,并应用非条件logistic回归分析该位点基因多态性与肝癌遗传易感性的关系。结果正常对照家系组人群携带AA、AG、GG基因型频率分别为40.00%、47.50%、12.50%。肝癌高发家系组人群携带AA、AG、GG基因型频率分别为50.00%、40.00%、10.00%;两组^加J基因rs2298141位点各基因型频率与期望值吻合度较好(JD〉0.05),符合HaMy—Weinberg遗传平衡定律。正常对照家系组人群中AG、GG基因型个体罹患肝癌的风险分别是AA基因型个体的0.67倍(95%C1:0.22~2.1,P=0.50)和1.05倍(95%C1:0.17~6.6,P=0.96);肝癌高发家系组人群中未患肝癌者AG、GG基因型个体罹患肝癌的风险分别是AA基因型个体的0.91倍(95%CI:0.31.2.71,P=O.86)和2.2倍(95%CI:0.40~11.96,P=0.37),但差异无统计学意义(P〉0.05)。结论广西扶绥县壮族人群中hgbl基因rs2298141位点的SNP与罹患肝癌无明显相关性。 展开更多
关键词 肝肿瘤 itgb1基因 家系 单核苷酸多态性 遗传易感性
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鸡ITGB1基因生物信息学分析 被引量:1
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作者 贾羽晴 夏晶晶 +6 位作者 薛百玲 税斐 曹程程 丁元飞 张泰康 耿照玉 金四华 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2022年第S01期339-347,共9页
利用生物信息学方法分析鸡ITGB1基因结构及其编码蛋白理化性质,结构位点及细胞定位等,旨在进一步探究该基因功能与潜在用途。同时从GenBank中下载鸡、鹅、鸭、火鸡、人、猪、兔、小鼠、大鼠、绵羊、黑猩猩11个物种的ITGB1基因CDS序列为... 利用生物信息学方法分析鸡ITGB1基因结构及其编码蛋白理化性质,结构位点及细胞定位等,旨在进一步探究该基因功能与潜在用途。同时从GenBank中下载鸡、鹅、鸭、火鸡、人、猪、兔、小鼠、大鼠、绵羊、黑猩猩11个物种的ITGB1基因CDS序列为材料,对该11个物种的ITGB1蛋白序列进行同源性和系统进化分析。结果表明,该基因CDS区长度为2412 bp,共编码803个氨基酸,其相对分子质量为88618.48,理论等电点为5.14;其是一个亲水性的稳定蛋白,有信号肽;蛋白二级结构上,含有162个α-螺旋,459个无规则卷曲,182伸展条和一个跨膜结构。鸡ITGB1基因的编码蛋白经同源性比对,发现其与鹅、火鸡、鸭的ITGB1蛋白高度同源。利用生物信息学方法对ITGB1基因及其表达的蛋白进行研究,有助于理解该基因在鸡这一物种上的相关作用,为进一步开发利用鸡ITGB1基因进行禽业生产、禽病防控以及分子育种提供了参考依据。 展开更多
关键词 itgb1基因 生物信息学分析 同源性
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猪ITGB1与mi R-181a靶向关系的验证
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作者 邱梅玉 黄涛 +2 位作者 胡广东 李涛 孙敬礼 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2018年第12期92-96,共5页
实验旨在探讨猪miR-181a与整合素β1(ITGB1)基因mRNA的靶向关系。通过生物信息学预测miR-181a与ITGB1-3'UTR的结合位点,人工合成猪ITGB1-3'UTR及突变型片段连接到双荧光素酶载体(psiCHECK-2)上,构建野生型(psiCHECK-2-W-ITGB1-3... 实验旨在探讨猪miR-181a与整合素β1(ITGB1)基因mRNA的靶向关系。通过生物信息学预测miR-181a与ITGB1-3'UTR的结合位点,人工合成猪ITGB1-3'UTR及突变型片段连接到双荧光素酶载体(psiCHECK-2)上,构建野生型(psiCHECK-2-W-ITGB1-3'-UTR)和突变型(psiCHECK-2-M-ITGB1-3'-UTR)双荧光酶报告载体。培养PK15细胞分别转染miR-181amimics、negativecontrol和psiCHECK-2-WITGB1-3'-UTR、psiCHECK-2-M-ITGB1-3'-UTR,用双荧光酶检测试剂盒检测荧光素酶活性,qRT-PCR检测ITGB1基因mRNA表达水平,Western blot检测ITGB1蛋白表达水平。将含psiCHECK-2-W-ITGB1-3'-UTR、psiCHECK-2-M-ITGB1-3'-UTR分别与miR-181amimic共转染PK-15细胞。结果表明:psiCHECK-2-W-ITGB1-3'-UTR组的荧光素酶活性极显著低于其阴性对照组(P<0.01);转染miR-181a mimics能极显著下调ITGB1基因mRNA的表达量(P<0.01),显著下调ITGB1蛋白表达量(P<0.05),而转染miR-181a Inhibitor组和Inhibitor-NC组相比,ITGB1基因mRNA和蛋白表达量差异均不显著(P>0.05)。本研究成功构建了猪野生型及突变型ITGB1-3'-UTR双荧光素酶报告质粒,并证实miR-181a与猪ITGB1-3'-UTR存在靶向关系。 展开更多
关键词 miR-181a itgb1基因 靶基因验证 表达调控
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USP51/PD-L1/ITGB1-deployed juxtacrine interaction plays a cell-intrinsic role in promoting chemoresistant phenotypes in non-small cell lung cancer
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作者 Jianjun Li Xuechun Xiao +11 位作者 Yang Ou Lixia Cao Min Guo Chunchun Qi Zhaoyang Wang Yuxin Liu Qiuying Shuai Hang Wang Peiqing Sun Yi Shi Guang Yang Shuang Yang 《Cancer Communications》 SCIE 2023年第7期765-787,共23页
Background:Programmed death ligand 1(PD-L1)has been demonstrated to facilitate tumor progression and therapeutic resistance in an immuneindependent manner.Nevertheless,the function and underlying signaling network(s)o... Background:Programmed death ligand 1(PD-L1)has been demonstrated to facilitate tumor progression and therapeutic resistance in an immuneindependent manner.Nevertheless,the function and underlying signaling network(s)of cancer cell-intrinsic PD-L1 action remain largely unknown.Herein,we sought to better understand how ubiquitin-specific peptidase 51(USP51)/PD-L1/integrin beta-1(ITGB1)signaling performs a cell-intrinsic role in mediating chemotherapeutic resistance in non-small cell lung cancer(NSCLC).Methods:Western blotting and flow cytometry were employed for PD-L1 detection in NSCLC cell lines.Coimmunoprecipitation and pulldown analyses,protein deubiquitination assay,tissue microarray,bioinformatic analysis and molecular biology methods were then used to determine the significance of PD-L1 in NSCLC chemoresistance and associated signaling pathways in several different cell lines,mouse models and patient tissue samples.Ubiquitin-7-amido-4-methylcoumarin(Ub-AMC)-based deubiquitinase activity,cellular thermal shift and surface plasmon resonance(SPR)analyses were performed to investigate the activity of USP51 inhibitors.Results:We provided evidence that cancer cell-intrinsic PD-L1 conferred the development of chemoresistance by directly binding to its membrane-bound receptor ITGB1 in NSCLC.At the molecular level,PD-L1/ITGB1 interaction subsequently activated the nuclear factor-kappa B(NF-κB)axis to elicit poor response to chemotherapy.We further determined USP51 as a bona fide deubiquitinase that targeted the deubiquitination and stabilization of the PD-L1 protein in chemoresistant NSCLC cells.Clinically,we found a significant direct relationship between the USP51,PD-L1 and ITGB1 contents in NSCLC patients with chemoresistant potency.The elevated USP51,PD-L1 and ITGB1 levels were strongly associated with worse patient prognosis.Of note,we identified that a flavonoid compound dihydromyricetin(DHM)acted as a potential USP51 inhibitor and rendered NSCLC cells more sensitive to chemotherapy by targeting USP51-dependent PD-L1 ubiquitination and degradation in vitro and in vivo.Conclusions:Together,our results demonstrated that the USP51/PD-L1/ITGB1 network potentially contributes to the malignant progression and therapeutic resistance in NSCLC.This knowledge is beneficial to the future design of advanced cancer therapy. 展开更多
关键词 CHEMOSENSITIVITY DIHYDROMYRICETIN immune-independence itgb1 non-small cell lung cancer PD-L1 USP51
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稳定干扰ITGB1抑制人乳腺癌BT549细胞迁移和侵袭 被引量:2
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作者 郎磊 周明莉 +5 位作者 杨佳佳 孙可馨 阴嘉莉 席磊 陈燕林 柳满然 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期1737-1742,共6页
在人乳腺癌细胞系BT549中稳定干扰整合素β1(integrinβ1,ITGB1),研究其对乳腺癌细胞迁移和侵袭的影响。构建靶向干扰ITGB1基因的sh RNA慢病毒,感染BT549细胞,通过筛选成功获得稳定干扰ITGB1蛋白的BT-549细胞系,实验设空白对照组(Blank... 在人乳腺癌细胞系BT549中稳定干扰整合素β1(integrinβ1,ITGB1),研究其对乳腺癌细胞迁移和侵袭的影响。构建靶向干扰ITGB1基因的sh RNA慢病毒,感染BT549细胞,通过筛选成功获得稳定干扰ITGB1蛋白的BT-549细胞系,实验设空白对照组(Blank)、病毒感染阴性对照组(shNC)、ITGB1-shRNA慢病毒感染组(shITGB1);Real-time PCR和Western blotting法检测稳定干扰后ITGB1 mRNA和蛋白的表达情况;Western blotting法检测稳定干扰ITGB1后上皮间质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)相关标志蛋白(E-cadherin,Vimentin,N-cadherin,Fibronectin)的表达情况;利用划痕试实验和Transwell侵袭试实验分别检测稳定干扰ITGB1后细胞的迁移及侵袭能力。Real-time PCR和Western blotting结果显示,shITGB1组细胞ITGB1 mRNA和蛋白的表达水平显著低于Blank组和shNC组细胞(p<0.01,p<0.01)。Western blotting结果显示,稳定干扰ITGB1可部分逆转乳腺癌细胞BT549的EMT化;稳定干扰ITGB1后,上皮标志蛋白E-cadherin表达显著上调(p<0.01),间质标志蛋白Vimentin(p<0.05)、N-cadherin(p<0.01)和Fibronectin(p<0.01)的表达显著降低。划痕和Transwell侵袭试验实验结果显示,稳定干扰ITGB1后可显著降低乳腺癌细胞的迁移及侵袭能力(p<0.05,p<0.05)。在乳腺癌BT549细胞中稳定干扰ITGB1后,通过逆转EMT化抑制细胞迁移和侵袭。 展开更多
关键词 itgb1 人乳腺癌细胞BT549 EMT 细胞迁移 细胞侵袭
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MicroRNA-29a对人正常滋养细胞迁移和侵袭功能的影响及其可能的机制 被引量:5
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作者 莫玉俏 卢敏 陈小菊 《中国现代医学杂志》 CAS 2018年第10期60-65,共6页
目的检测microRNA-29a(miR-29a)在子痫前期孕妇胎盘组织中的表达及其对人正常滋养细胞系HTR8/Svneo迁移和侵袭能力的影响及可能的作用机制。方法收集行剖宫产分娩的30例子痫前期孕妇及30例正常妊娠孕妇的胎盘组织,应用实时聚合酶链反应(... 目的检测microRNA-29a(miR-29a)在子痫前期孕妇胎盘组织中的表达及其对人正常滋养细胞系HTR8/Svneo迁移和侵袭能力的影响及可能的作用机制。方法收集行剖宫产分娩的30例子痫前期孕妇及30例正常妊娠孕妇的胎盘组织,应用实时聚合酶链反应(real-time PCR)检测胎盘组织miR-29a的表达水平。应用生物信息学软件预测miR-29a的潜在靶基因,选取ITGB1作为研究靶基因。将miR-29a模拟物(miR-29a mimics)转染人正常滋养细胞系HTR8/Svneo,real-time PCR检测转染后HTR8/Svneo细胞中miR-29a的表达变化,划痕实验和Transwell侵袭实验检测转染后HTR8/Svneo细胞迁移和侵袭能力的变化,Western blot检测转染后HTR8/Svneo细胞ITGB1蛋白的表达变化。结果 real-time PCR结果显示子痫前期孕妇胎盘组织中miR-29a表达水平均较正常妊娠孕妇增高(P<0.05)。人正常滋养细胞系HTR8/Svneo细胞转染miR-29a mimics后,miR-29a表达水平增高(P<0.05),ITGB1蛋白表达水平降低(P<0.05),划痕实验和Transwell侵袭实验显示细胞迁移和侵袭能力降低(P<0.05)。结论 miR-29a在子痫前期孕妇胎盘组织中高表达,可能通过调控ITGB1的表达参与子痫前期的发生发展。 展开更多
关键词 microRNA-29a 子痫前期 滋养细胞 迁移 侵袭itgb1
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长链非编码RNA ITGB1调控胆囊癌细胞耐药的分子机制
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作者 厉冰 尚华 +3 位作者 梅孝臣 门中俊 翟润 孙万日 《中华实验外科杂志》 CAS 北大核心 2022年第11期2130-2132,共3页
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)ITGB1在胆囊癌中表达水平及其对胆囊癌细胞化疗耐药的影响及分子机制。方法选取2018年1月到2021年1月南阳市中心医院收治的61例胆囊癌组织和癌旁组织作为研究对象,采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析胆囊... 目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)ITGB1在胆囊癌中表达水平及其对胆囊癌细胞化疗耐药的影响及分子机制。方法选取2018年1月到2021年1月南阳市中心医院收治的61例胆囊癌组织和癌旁组织作为研究对象,采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)分析胆囊癌组织和癌旁组织中lncRNA ITGB1表达水平。在人胆囊癌细胞株GBC-SD细胞采用浓度梯度递增法建立5-氟尿嘧啶(5-Fu)耐药细胞株GBC-SD/5-Fu,采用对照短发卡RNA(shRNA)和lncRNA ITGB1 shRNA慢病毒感染GBC-SD/5-Fu细胞系,建立lncRNA对照组和ITGB1 KD组。采用5-Fu处理lncRNA对照组和ITGB1 KD组细胞24 h后,采用细胞计数试剂盒(CCK-8)分析细胞增殖能力;采用体外移植瘤分析胆囊癌化疗耐药;采用流式细胞术分析5-Fu对细胞凋亡的影响;采用蛋白质印迹法(Western blot)分析两组细胞Atg5蛋白表达水平。组间比较采用t检验。结果癌旁组织lncRNA ITGB1表达水平(0.98±0.15)明显低于胆囊癌组织中(1.51±0.44),差异有统计学意义(t=9.054,P<0.05)。lncRNA对照组细胞48 h吸光度值(2.03±0.11)明显高于ITGB1 KD组(1.26±0.17),差异有统计学意义(t=9.450,P<0.05)。lncRNA对照组细胞体内增殖体积[(859.10±83.80)mm^(3)]明显高于ITGB1 KD组[(577.18±50.37)mm^(3)],差异有统计学意义(t=7.063,P<0.05)。lncRNA对照组细胞凋亡比例[(5.20±1.32)%]明显高于ITGB1 KD组[(33.62±3.88)%],差异有统计学意义(t=16.960,P<0.05)。lncRNA对照组细胞Atg5蛋白表达水平(1.14±0.07)明显高于ITGB1 KD组(0.52±0.12),差异有统计学意义(t=10.420,P<0.05)。结论lncRNA ITGB1在胆囊癌中呈高表达,参与胆囊癌细胞对5-Fu耐药过程,可能与自噬相关蛋白Atg5表达相关。 展开更多
关键词 长链非编码RNA itgb1 5-氟尿嘧啶 胆囊癌 耐药 自噬
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猪RBP4和ITGB1基因多态性对母猪繁殖性能的影响 被引量:12
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作者 翟腾蛟 李梦寻 +3 位作者 马力鹏 胡九英 汪德明 黄涛 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第11期1959-1963,共5页
用PCR-RFLP的方法检测了猪视黄醇结合蛋白4(RBP4)和整合素β1(ITGB1)基因在试验猪群中的多态性,同时分析其对大白猪产仔数、产活仔数、健仔数、初生窝重等性状的影响。结果显示:RBP4基因AA型产仔数、产活仔数、初生窝重显著高于AB、BB型... 用PCR-RFLP的方法检测了猪视黄醇结合蛋白4(RBP4)和整合素β1(ITGB1)基因在试验猪群中的多态性,同时分析其对大白猪产仔数、产活仔数、健仔数、初生窝重等性状的影响。结果显示:RBP4基因AA型产仔数、产活仔数、初生窝重显著高于AB、BB型(P<0.05),AA型健仔数极显著高于BB型(P<0.01),显著高于AB型(P<0.05)。ITGB1基因TT型产仔数、产活仔数、健仔数高于TC、CC型,差异均不显著(P>0.05)。RBP4与ITGB1基因9种合并基因型中AATT型产仔数、产活仔数、健仔数均高于其他合并基因型,差异均不显著(P>0.05)。 展开更多
关键词 母猪 RBP4基因 itgb1基因 多态性 繁殖性能
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猪ITGB1基因多态性与产仔数的关联性分析 被引量:6
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作者 郭良勇 闫学军 +1 位作者 王爱国 傅金銮 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2012年第21期22-25,60,共5页
本研究以643头母猪为实验材料,利用CRS-RFLP技术对猪ITGB1基因第14外显子C42241T位点进行单核苷酸多态性分析,并将基因多态性与猪的产仔数进行关联分析,旨在探讨该多态位点能否作为猪产仔数性状的分子遗传标记。结果表明:42241多态位点... 本研究以643头母猪为实验材料,利用CRS-RFLP技术对猪ITGB1基因第14外显子C42241T位点进行单核苷酸多态性分析,并将基因多态性与猪的产仔数进行关联分析,旨在探讨该多态位点能否作为猪产仔数性状的分子遗传标记。结果表明:42241多态位点的基因型效应对长白猪的总产仔数(TNB)和产活仔数(NBA)影响不显著;对于大白猪和杜洛克猪,不同基因型个体之间的TNB和NBA差异显著(P<0.05),其效应为TT>TC>CC,且TT型个体具有较高的产仔数主要是由基因的加性效应导致的。因此,42241位点TT基因型可作为大白猪和杜洛克猪TNB和NBA性状的标记基因型。 展开更多
关键词 CRS—PCR itgb1 多态性 产仔数 母猪
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