基于iTRAQ多重标记串联质谱技术系统研究脂多糖刺激下乳腺上皮细胞蛋白的差异表达,并对与乳蛋白、乳脂肪相关差异表达基因进行验证。培养纯化后的乳腺上皮细胞,经脂多糖(LPS)处理后提取细胞蛋白,采用iTRAQ标记和联合二维液相色谱-串联质...基于iTRAQ多重标记串联质谱技术系统研究脂多糖刺激下乳腺上皮细胞蛋白的差异表达,并对与乳蛋白、乳脂肪相关差异表达基因进行验证。培养纯化后的乳腺上皮细胞,经脂多糖(LPS)处理后提取细胞蛋白,采用iTRAQ标记和联合二维液相色谱-串联质谱(2D-LC-MS/MS)检测分析得到各组间细胞差异表达蛋白,并采用蛋白印迹和酶联免疫法(ELISA)对差异蛋白进行验证,然后对与乳蛋白、乳脂肪相关基因的相互作用蛋白进行PPI(Protein protein interaction)预测。乳腺上皮细胞共鉴定出2 487个蛋白,其中差异蛋白共341个,与对照组相比,163个蛋白表达上调,178个蛋白表达下调。iTRAQ测定结果显示,LPS处理组与对照组相比,αs1-酪蛋白(CSN1S1)、κ-酪蛋白(CSN3)和脂肪酸合酶(FASN)基因蛋白表达水平有统计学意义;经蛋白印迹试验结果表明,LPS诱导组αs1-酪蛋白表达水平同对照组比较,明显降低(P<0.05);应用ELISA方法测定细胞培养液中αs1-酪蛋白、κ-酪蛋白和脂肪酸合酶的浓度结果显示,LPS诱导组细胞培养液中上述蛋白的浓度明显低于对照组(P<0.05)。综上表明,LPS诱导的炎症反应可影响乳腺上皮细胞的乳蛋白和乳脂肪的合成。展开更多
目的应用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)蛋白组学技术分析2型糖尿病脾虚证的差异蛋白质谱,从唾液蛋白质水平上阐释2型糖尿病脾虚证的证候本质和生物学机制。方法收集糖尿病脾虚...目的应用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)蛋白组学技术分析2型糖尿病脾虚证的差异蛋白质谱,从唾液蛋白质水平上阐释2型糖尿病脾虚证的证候本质和生物学机制。方法收集糖尿病脾虚证34例和正常健康组45例唾液样本,分离、鉴定两组的差异蛋白质,并利用生物信息学软件进行分析。结果两组共鉴定到1757个蛋白。以差异倍数≥1.5或≤0.67为筛选标准,共筛选出有意义的差异蛋白155个,其中上调蛋白107个,下调蛋白48个,基于本体论(Gene Ontology,GO)分析显示差异蛋白主要富集在免疫反应、物质代谢、氧气运输等功能分类上;KEGG(Kyoto Encycl-opedia of Genes and Genomes)通路分析差异蛋白主要涉及补体系统代谢通路、脂肪降解和吸收通路、维生素降解和吸收通路等。结论应用iTRAQ技术筛选出可能与2型糖尿病脾虚证发生发展相关的多个差异蛋白,且表明主要与机体免疫系统功能和物质代谢途径有密切关系,为从脾论治2型糖尿病脾虚证的相关机理和本质研究提供重要参考依据。展开更多
目的利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)技术筛选急性心肌梗死(AMI)后表达的差异蛋白,寻找可早期诊断AMI的潜在血清标记物。方法 32条成年比格犬分为假手术组和AMI组(采用冠...目的利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)技术筛选急性心肌梗死(AMI)后表达的差异蛋白,寻找可早期诊断AMI的潜在血清标记物。方法 32条成年比格犬分为假手术组和AMI组(采用冠状动脉注射聚乙烯微球悬浮制剂和凝血酶粉剂制作动物模型),分别收集造模前和造模后1、2、3、6h血清。利用8标iTRAQ技术分析两组血清中蛋白质的表达情况,将表达差异倍数>1.2倍(上下调)且P<0.05的蛋白视为差异蛋白,并对差异蛋白进行基因本体(Geneontology,GO)功能注释和富集分析。结果 AMI后1h出现的差异蛋白有51种,上调28种,下调23种。AMI后2h出现的差异蛋白有54种,上调28种,下调26种。AMI后3h出现的差异蛋白有43种,上调24种,下调19种。AMI后6h出现的差异蛋白有54种,上调29种,下调25种。综合分析前6h差异蛋白,查阅文献资料排除未命名蛋白和犬特有蛋白后,共发现15种差异蛋白在AMI后6h内稳定表达,上调7种,下调8种。结论利用iTRAQ技术筛选出15种与早期AMI相关蛋白,对筛选出的差异蛋白进行功能分析并查阅相关文献,其中肌球蛋白作为早期诊断AMI的新型血清标记物可能有较大潜力。展开更多
【目的】明确镉污染对泽兰实蝇(Procecidochares utilis Stone)雄性附腺蛋白质造成的影响。【方法】利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技术结合MS/MS对染镉与未染镉的泽兰...【目的】明确镉污染对泽兰实蝇(Procecidochares utilis Stone)雄性附腺蛋白质造成的影响。【方法】利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技术结合MS/MS对染镉与未染镉的泽兰实蝇雄性附腺蛋白质进行分析与鉴定。【结果】共鉴定出3 661个蛋白质,具有定量信息差异的蛋白质58个,其中上调的蛋白质38个,下调的蛋白质20个。GO和KEGG注释分析和富集分析结果显示:这些蛋白质具有催化、代谢和转运等功能,表明染镉后泽兰实蝇雄性附腺中多种功能的蛋白质发生了变化。【结论】本研究明确了镉污染可改变泽兰实蝇雄性附腺蛋白质组,并鉴定了镉胁迫后泽兰实蝇雄性附腺的差异蛋白。展开更多
目的:筛选糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)肾阴虚证敏感的血浆分子标志物,探究糖尿病肾病肾阴虚证的生物学基础及其发病机制。方法:收集24例早期DN肾阴虚患者(DN阴虚证组)的血浆和24例正常人群血浆(NC组),应用同位素标记的相对和...目的:筛选糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)肾阴虚证敏感的血浆分子标志物,探究糖尿病肾病肾阴虚证的生物学基础及其发病机制。方法:收集24例早期DN肾阴虚患者(DN阴虚证组)的血浆和24例正常人群血浆(NC组),应用同位素标记的相对和绝对定量(isobaric tag for relative and absolute quan-tification,iTRAQ)标记的二维液相色谱串联质谱(two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry,2DLC-MS/MS)方法检测血浆蛋白质,利用基因本体论(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)及蛋白质互作网络等方法筛选血浆差异蛋白,采用Western blot对筛选出来的蛋白进行验证。结果:与NC组比较,DN阴虚证组中共鉴定出37个差异蛋白质(差异倍数>2,P<0.05),包括20个上调蛋白和17个下调蛋白。这些蛋白主要涉及胆固醇代谢、补体及凝血级联反应、脂肪消化吸收等与心血管疾病有明显关系的通路。进一步验证发现HP和FGG蛋白表达高于NC组,载脂蛋白AI表达低于NC组(P<0.05),Western blot结果与iTRAQ质谱结果具有一致性。结论:iTRAQ结合2DLC-MS/MS技术可以有效筛选出DN肾阴虚证中差异的蛋白,本研究鉴定的37种蛋白有可能为DN的早期诊断和中医证型研究提供潜在分子标志物。展开更多
文摘基于iTRAQ多重标记串联质谱技术系统研究脂多糖刺激下乳腺上皮细胞蛋白的差异表达,并对与乳蛋白、乳脂肪相关差异表达基因进行验证。培养纯化后的乳腺上皮细胞,经脂多糖(LPS)处理后提取细胞蛋白,采用iTRAQ标记和联合二维液相色谱-串联质谱(2D-LC-MS/MS)检测分析得到各组间细胞差异表达蛋白,并采用蛋白印迹和酶联免疫法(ELISA)对差异蛋白进行验证,然后对与乳蛋白、乳脂肪相关基因的相互作用蛋白进行PPI(Protein protein interaction)预测。乳腺上皮细胞共鉴定出2 487个蛋白,其中差异蛋白共341个,与对照组相比,163个蛋白表达上调,178个蛋白表达下调。iTRAQ测定结果显示,LPS处理组与对照组相比,αs1-酪蛋白(CSN1S1)、κ-酪蛋白(CSN3)和脂肪酸合酶(FASN)基因蛋白表达水平有统计学意义;经蛋白印迹试验结果表明,LPS诱导组αs1-酪蛋白表达水平同对照组比较,明显降低(P<0.05);应用ELISA方法测定细胞培养液中αs1-酪蛋白、κ-酪蛋白和脂肪酸合酶的浓度结果显示,LPS诱导组细胞培养液中上述蛋白的浓度明显低于对照组(P<0.05)。综上表明,LPS诱导的炎症反应可影响乳腺上皮细胞的乳蛋白和乳脂肪的合成。
文摘目的应用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)蛋白组学技术分析2型糖尿病脾虚证的差异蛋白质谱,从唾液蛋白质水平上阐释2型糖尿病脾虚证的证候本质和生物学机制。方法收集糖尿病脾虚证34例和正常健康组45例唾液样本,分离、鉴定两组的差异蛋白质,并利用生物信息学软件进行分析。结果两组共鉴定到1757个蛋白。以差异倍数≥1.5或≤0.67为筛选标准,共筛选出有意义的差异蛋白155个,其中上调蛋白107个,下调蛋白48个,基于本体论(Gene Ontology,GO)分析显示差异蛋白主要富集在免疫反应、物质代谢、氧气运输等功能分类上;KEGG(Kyoto Encycl-opedia of Genes and Genomes)通路分析差异蛋白主要涉及补体系统代谢通路、脂肪降解和吸收通路、维生素降解和吸收通路等。结论应用iTRAQ技术筛选出可能与2型糖尿病脾虚证发生发展相关的多个差异蛋白,且表明主要与机体免疫系统功能和物质代谢途径有密切关系,为从脾论治2型糖尿病脾虚证的相关机理和本质研究提供重要参考依据。
文摘为探究真空冷冻干燥(vacuum freeze-drying, FD)、喷雾干燥(spray-drying, SD)和微波真空冷冻干燥(microwave vacuum freeze-drying, MFD)3种干燥方式对蛋清蛋白的差异,利用iTRAQ技术对三者进行蛋白质组差异分析,在得到的157种具有定量信息的蛋清蛋白中,鉴定出87种差异蛋白。MFD vs FD组上调蛋白质数量为46个,占差异蛋白质总数的67.6%。KEGG富集显示,MFD vs FD组和MFD vs SD共有2个基因通路显著富集,分别为折叠和降解、运输和分解代谢。此外,在差异蛋白中筛选出4种蛋白质在干燥过程中丰度变化显著,分别为黏蛋白、血清白蛋白、卵清蛋白相关蛋白Y亚型X1和卵白蛋白相关蛋白Y。该研究首次采用蛋白质组学的方法分析不同干燥方式处理后的鸡蛋清差异蛋白的表达变化,为今后生产和开发高品质蛋清粉及功能性蛋制品提供参考依据。
文摘目的利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)技术筛选急性心肌梗死(AMI)后表达的差异蛋白,寻找可早期诊断AMI的潜在血清标记物。方法 32条成年比格犬分为假手术组和AMI组(采用冠状动脉注射聚乙烯微球悬浮制剂和凝血酶粉剂制作动物模型),分别收集造模前和造模后1、2、3、6h血清。利用8标iTRAQ技术分析两组血清中蛋白质的表达情况,将表达差异倍数>1.2倍(上下调)且P<0.05的蛋白视为差异蛋白,并对差异蛋白进行基因本体(Geneontology,GO)功能注释和富集分析。结果 AMI后1h出现的差异蛋白有51种,上调28种,下调23种。AMI后2h出现的差异蛋白有54种,上调28种,下调26种。AMI后3h出现的差异蛋白有43种,上调24种,下调19种。AMI后6h出现的差异蛋白有54种,上调29种,下调25种。综合分析前6h差异蛋白,查阅文献资料排除未命名蛋白和犬特有蛋白后,共发现15种差异蛋白在AMI后6h内稳定表达,上调7种,下调8种。结论利用iTRAQ技术筛选出15种与早期AMI相关蛋白,对筛选出的差异蛋白进行功能分析并查阅相关文献,其中肌球蛋白作为早期诊断AMI的新型血清标记物可能有较大潜力。
文摘【目的】明确镉污染对泽兰实蝇(Procecidochares utilis Stone)雄性附腺蛋白质造成的影响。【方法】利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技术结合MS/MS对染镉与未染镉的泽兰实蝇雄性附腺蛋白质进行分析与鉴定。【结果】共鉴定出3 661个蛋白质,具有定量信息差异的蛋白质58个,其中上调的蛋白质38个,下调的蛋白质20个。GO和KEGG注释分析和富集分析结果显示:这些蛋白质具有催化、代谢和转运等功能,表明染镉后泽兰实蝇雄性附腺中多种功能的蛋白质发生了变化。【结论】本研究明确了镉污染可改变泽兰实蝇雄性附腺蛋白质组,并鉴定了镉胁迫后泽兰实蝇雄性附腺的差异蛋白。
文摘目的:筛选糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)肾阴虚证敏感的血浆分子标志物,探究糖尿病肾病肾阴虚证的生物学基础及其发病机制。方法:收集24例早期DN肾阴虚患者(DN阴虚证组)的血浆和24例正常人群血浆(NC组),应用同位素标记的相对和绝对定量(isobaric tag for relative and absolute quan-tification,iTRAQ)标记的二维液相色谱串联质谱(two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry,2DLC-MS/MS)方法检测血浆蛋白质,利用基因本体论(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)及蛋白质互作网络等方法筛选血浆差异蛋白,采用Western blot对筛选出来的蛋白进行验证。结果:与NC组比较,DN阴虚证组中共鉴定出37个差异蛋白质(差异倍数>2,P<0.05),包括20个上调蛋白和17个下调蛋白。这些蛋白主要涉及胆固醇代谢、补体及凝血级联反应、脂肪消化吸收等与心血管疾病有明显关系的通路。进一步验证发现HP和FGG蛋白表达高于NC组,载脂蛋白AI表达低于NC组(P<0.05),Western blot结果与iTRAQ质谱结果具有一致性。结论:iTRAQ结合2DLC-MS/MS技术可以有效筛选出DN肾阴虚证中差异的蛋白,本研究鉴定的37种蛋白有可能为DN的早期诊断和中医证型研究提供潜在分子标志物。