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基于iTRAQ技术对棉花叶片响应化学打顶的差异蛋白质组学分析 被引量:7
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作者 侯晓梦 刘连涛 +4 位作者 李梦 孙红春 张永江 杜欢 李存东 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第19期3665-3677,共13页
【目的】比较化学打顶和人工打顶方式下棉花植株生理变化及蛋白质的差异表达,为化学打顶的作用机理提供理论依据。【方法】以黄河流域大面积推广的冀棉863为试验品种,于2015—2016年设置人工打顶、化学打顶和未打顶3种处理,于7月20日进... 【目的】比较化学打顶和人工打顶方式下棉花植株生理变化及蛋白质的差异表达,为化学打顶的作用机理提供理论依据。【方法】以黄河流域大面积推广的冀棉863为试验品种,于2015—2016年设置人工打顶、化学打顶和未打顶3种处理,于7月20日进行统一打顶处理,化学打顶剂为人工喷施,用量为1.125 L·hm^(-2)。打顶处理后定期测定各处理间棉花株高与主茎功能叶内源激素含量。株高测量为子叶节到主茎生长点的高度,使用直尺测量。使用酶联免疫法测定棉花功能叶的生长素(IAA)、赤霉素(GA_3)、脱落酸(ABA)和玉米素核苷(ZR)含量。采用iTRAQ技术对人工打顶和化学打顶处理的打顶后20 d的主茎功能叶进行差异蛋白质组学分析。【结果】与人工打顶的棉花相比,化学打顶处理株高显著高于人工打顶处理,两年试验中分别高11.8%和14.5%,但显著低于未打顶处理,两年试验中分别低6.0%和6.5%,喷施化学打顶剂有效抑制了棉花株高的增长。不同打顶处理对棉花功能叶GA_3含量影响较大,打顶后GA3含量变化为单峰曲线,处理30 d各处理之间达到显著差异,GA3含量为未打顶>化学打顶>人工打顶,30 d后化学打顶与未打顶处理呈下降趋势,人工打顶处理则在20 d时出现下降趋势,在处理后50 d时各处理GA_3含量无显著差异。2016年IAA含量峰值出现在处理后40 d,化学打顶处理峰值显著低于其他两个处理,2015年3种打顶处理间无显著差异。ABA含量在处理后40 d时达到最大值,未打顶处理峰值显著低于其他两个处理。3种打顶处理的ZR含量无显著差异。化学打顶与人工打顶处理相比,iTRAQ标记方法检测到69个差异表达蛋白,29个上调表达,40个下调表达,其中碳水化合物和能量代谢相关的蛋白多下调表达,降低了植株的长势;与GA调节正相关蛋白多上调表达,增强GA效应。【结论】化学打顶能有效控制棉花株高,对棉花功能叶的GA含量影响较大,化学打顶处理含量显著高于人工打顶处理,与人工打顶处理相比,化学打顶与植物生长发育相关蛋白多下调表达,可能是植株通过降低碳水化合物合成,减少能量代谢,增加GA含量,激活GA效应来实现株高的控制。 展开更多
关键词 棉花 化学打顶 激素 itraq技术 差异蛋白质
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基于iTRAQ技术的脂多糖刺激下奶牛乳腺上皮细胞的蛋白组学分析 被引量:4
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作者 李莲 唐娟 +1 位作者 吴洁 王根林 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期1853-1860,共8页
基于iTRAQ多重标记串联质谱技术系统研究脂多糖刺激下乳腺上皮细胞蛋白的差异表达,并对与乳蛋白、乳脂肪相关差异表达基因进行验证。培养纯化后的乳腺上皮细胞,经脂多糖(LPS)处理后提取细胞蛋白,采用iTRAQ标记和联合二维液相色谱-串联质... 基于iTRAQ多重标记串联质谱技术系统研究脂多糖刺激下乳腺上皮细胞蛋白的差异表达,并对与乳蛋白、乳脂肪相关差异表达基因进行验证。培养纯化后的乳腺上皮细胞,经脂多糖(LPS)处理后提取细胞蛋白,采用iTRAQ标记和联合二维液相色谱-串联质谱(2D-LC-MS/MS)检测分析得到各组间细胞差异表达蛋白,并采用蛋白印迹和酶联免疫法(ELISA)对差异蛋白进行验证,然后对与乳蛋白、乳脂肪相关基因的相互作用蛋白进行PPI(Protein protein interaction)预测。乳腺上皮细胞共鉴定出2 487个蛋白,其中差异蛋白共341个,与对照组相比,163个蛋白表达上调,178个蛋白表达下调。iTRAQ测定结果显示,LPS处理组与对照组相比,αs1-酪蛋白(CSN1S1)、κ-酪蛋白(CSN3)和脂肪酸合酶(FASN)基因蛋白表达水平有统计学意义;经蛋白印迹试验结果表明,LPS诱导组αs1-酪蛋白表达水平同对照组比较,明显降低(P<0.05);应用ELISA方法测定细胞培养液中αs1-酪蛋白、κ-酪蛋白和脂肪酸合酶的浓度结果显示,LPS诱导组细胞培养液中上述蛋白的浓度明显低于对照组(P<0.05)。综上表明,LPS诱导的炎症反应可影响乳腺上皮细胞的乳蛋白和乳脂肪的合成。 展开更多
关键词 乳腺上皮细胞 itraq技术 蛋白质组学 脂多糖
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基于iTRAQ技术筛选膝骨关节炎模型鼠差异表达蛋白及右归丸延缓膝关节退变的分子机制 被引量:4
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作者 安方玉 颜春鲁 +5 位作者 刘永琦 张艳霞 蒋国凤 邓婕 吕学颖 张蕾蕾 《中华骨质疏松和骨矿盐疾病杂志》 CSCD 北大核心 2021年第1期49-59,共11页
目的利用同位素相对和绝对标记定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技术筛选正常大鼠和膝骨关节炎模型大鼠关节组织中差异表达蛋白,进一步研究右归丸对膝骨关节炎模型鼠差异表达蛋白组织蛋白酶K(cathep... 目的利用同位素相对和绝对标记定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技术筛选正常大鼠和膝骨关节炎模型大鼠关节组织中差异表达蛋白,进一步研究右归丸对膝骨关节炎模型鼠差异表达蛋白组织蛋白酶K(cathepsin K,CtsK)、凝血酶敏感蛋白-2(thrombospondin-2,TSP-2)、Rho蛋白依赖性肌球蛋白磷酸酶(Rho protein-dependent myosin phosphatase,Mprip)和钙调蛋白-1(calmodulin-1,CaM-1)等蛋白表达的影响,以揭示右归丸治疗膝骨关节炎的可能机制。方法60只SD大鼠分为假手术组、模型组、硫酸氨基葡萄糖组(0.17 g/kg)及右归丸高(4.8 g/kg)、中(2.4 mg/kg)、低(1.2 g/kg)剂量组,每组10只。除假手术组外,采用改良Hulth法建立KOA大鼠模型,模型制备成功6周后分别给予干预,假手术组和模型组给予0.9%(质量分数)氯化钠注射液、硫酸氨基葡萄糖组给予硫酸氨基葡萄糖,右归丸干预组给予不同浓度的右归丸水煎剂,各组大鼠连续灌胃2个月,处死大鼠取膝关节。iTRAQ技术筛选假手术组和模型组大鼠的差异表达蛋白,并利用生物信息学软件进行数据分析。HE法观察各组大鼠软骨组织病理形态改变并进行Mankin评分,免疫组化法验证各组大鼠软骨组织差异表达蛋白CtsK、TSP-2、Mprip和CaM-1等表达。结果假手术组和模型组共筛选出有意义的差异蛋白1000个(以差异倍数≥1.2或≤0.83为筛选标准),其中上调蛋白442个,下调蛋白558个。基因本体论(Gene Ontology,GO)分析显示这些差异表达蛋白可分为59种功能类型,17种参与细胞成分,16种参与基因的分子功能,26种参与生物学过程,Pathway通路分析显示这些差异蛋白主要集中在核糖体、酪氨酸、Th17细胞分化、Th1和Th2细胞分化、戊糖磷酸化通路等。与假手术组比较,模型组关节软骨边缘严重破坏,软骨细胞排列紊乱;其Mankin评分、TSP-2、CtsK等蛋白表达均明显升高,Mprip、CaM-1等蛋白表达均明显降低(P<0.05)。与模型组比较,右归丸高剂量组软骨结构趋于正常,软骨细胞分布偶见不均,关节软骨表面欠光滑;其软骨组织Mankin评分、TSP-2、CtsK等蛋白表达均明显降低,Mprip、CaM-1等蛋白表达均明显增强(P<0.05)。结论膝骨关节炎的形成是多基因共同作用的结果,其中CtsK、TSP-2、Mprip和CaM-1对膝骨关节炎的发生、发展起着至关重要的作用,右归丸治疗效果可能通过下调TSP-2、CtsK和上调Mprip、CaM-1蛋白表达而实现。 展开更多
关键词 右归丸 膝骨关节炎 itraq技术 差异蛋白
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基于iTRAQ技术的2型糖尿病脾虚证唾液蛋白质组学研究 被引量:4
4
作者 孙珂焕 丁峰 +4 位作者 范大华 曹美群 杨长青 李仲秋 吴正治 《世界中西医结合杂志》 2017年第12期1680-1685,共6页
目的应用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)蛋白组学技术分析2型糖尿病脾虚证的差异蛋白质谱,从唾液蛋白质水平上阐释2型糖尿病脾虚证的证候本质和生物学机制。方法收集糖尿病脾虚... 目的应用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)蛋白组学技术分析2型糖尿病脾虚证的差异蛋白质谱,从唾液蛋白质水平上阐释2型糖尿病脾虚证的证候本质和生物学机制。方法收集糖尿病脾虚证34例和正常健康组45例唾液样本,分离、鉴定两组的差异蛋白质,并利用生物信息学软件进行分析。结果两组共鉴定到1757个蛋白。以差异倍数≥1.5或≤0.67为筛选标准,共筛选出有意义的差异蛋白155个,其中上调蛋白107个,下调蛋白48个,基于本体论(Gene Ontology,GO)分析显示差异蛋白主要富集在免疫反应、物质代谢、氧气运输等功能分类上;KEGG(Kyoto Encycl-opedia of Genes and Genomes)通路分析差异蛋白主要涉及补体系统代谢通路、脂肪降解和吸收通路、维生素降解和吸收通路等。结论应用iTRAQ技术筛选出可能与2型糖尿病脾虚证发生发展相关的多个差异蛋白,且表明主要与机体免疫系统功能和物质代谢途径有密切关系,为从脾论治2型糖尿病脾虚证的相关机理和本质研究提供重要参考依据。 展开更多
关键词 2型糖尿病 脾虚证 唾液 蛋白质组学 itraq技术
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基于iTRAQ技术的慢性心力衰竭气虚血瘀证及气阴两虚证组差异蛋白质组学研究 被引量:6
5
作者 孟永梅 王伟 《世界中医药》 CAS 2018年第9期2111-2116,共6页
目的:寻找慢性心力衰竭(CHF)(Chronic Heart Failure,CHF)气虚血瘀证及气阴两虚证的相关蛋白质组学特征,探讨证候发生发展机制的可能生物学通路。方法:研究设计分为CHF气虚血瘀证、气阴两虚证、健康对照组,利用i TRAQ标记定量结合串联... 目的:寻找慢性心力衰竭(CHF)(Chronic Heart Failure,CHF)气虚血瘀证及气阴两虚证的相关蛋白质组学特征,探讨证候发生发展机制的可能生物学通路。方法:研究设计分为CHF气虚血瘀证、气阴两虚证、健康对照组,利用i TRAQ标记定量结合串联质谱技术分析CHF气虚血瘀证及气阴两虚证的相关表达差异蛋白质,为蛋白质组学层面的疾病与证候生物学基础提供实验依据,可以在一定层面上揭示证的内涵。结果:与健康对照组比较,在CHF气虚血瘀证组表达差异蛋白质有16个,其中载脂蛋白E、半乳糖凝集素-3结合蛋白等11个蛋白质表达上调,维生素D结合蛋白、胰蛋白酶抑制剂等5个蛋白质表达下调;与健康对照组比较,在CHF气阴两虚证组表达差异的蛋白质有15个,其中补体9、间-α-胰蛋白酶抑制剂家族重链相关蛋白等10个蛋白质表达上调,前血清淀粉样蛋白P、维生素D结合蛋白等5个蛋白质表达下调。结论:蛋白质组检测结果能够反映CHF气虚血瘀证及气阴两虚证的生物学基础,从而能客观的评价证候特征,为病证结合的研究开拓了新的视野。 展开更多
关键词 慢性心力衰竭 中医证候 itraq技术 蛋白质组学
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浅析基于iTRAQ技术的蛋白质组学在正常高值血压中医防治中的优势 被引量:1
6
作者 杨洁 杨传华 +1 位作者 杨雪松 崔平 《辽宁中医杂志》 CAS 2019年第9期1865-1866,共2页
高血压是威胁人类健康的几大杀手之一,而正常高值血压是介于健康和高血压之间的临界状态,及时采取措施可以减少高血压的发生并进一步预防心脑血管事件的风险。运用基于iTRAQ技术的蛋白质组学从分子层面探索高值血压防治规律,推进传统&#... 高血压是威胁人类健康的几大杀手之一,而正常高值血压是介于健康和高血压之间的临界状态,及时采取措施可以减少高血压的发生并进一步预防心脑血管事件的风险。运用基于iTRAQ技术的蛋白质组学从分子层面探索高值血压防治规律,推进传统'治未病'理论在高值血压防治中深入的发展具有明显的优势。 展开更多
关键词 itraq技术 正常高值血压 中医防治 治未病 优势
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应用iTRAQ技术快速鉴定稻米品质差异蛋白的方法分析 被引量:1
7
作者 闸雯俊 游艾青 《湖北农业科学》 2020年第17期175-177,共3页
以鄂中5号和桂朝2号为材料,应用iTRAQ技术快速鉴定稻米品质差异蛋白,从而根据差异蛋白快速和有效地筛选到与水稻(Oryza sativa L.)品质相关联的候选基因。结果表明,鄂中5号、桂朝2号共鉴定出水稻显著差异蛋白61个,其中上调蛋白21个,下... 以鄂中5号和桂朝2号为材料,应用iTRAQ技术快速鉴定稻米品质差异蛋白,从而根据差异蛋白快速和有效地筛选到与水稻(Oryza sativa L.)品质相关联的候选基因。结果表明,鄂中5号、桂朝2号共鉴定出水稻显著差异蛋白61个,其中上调蛋白21个,下调蛋白40个。该技术可广泛应用于水稻品质性状的研究和开发并且结合转基因技术培育高档优质水稻品种。 展开更多
关键词 水稻(Oryza sativa L.) itraq技术 差异蛋白 鉴定
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ITRAQ技术筛选系统性红斑狼疮合并股骨头坏死的血清差异蛋白质组学变化 被引量:8
8
作者 范思奇 曾平 +3 位作者 周怡 秦刚 廖小波 何凯毅 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2019年第3期476-481,共6页
背景:系统性红斑狼疮合并股骨头坏死是由于长期大剂量应用皮质类固醇糖皮质激素造成股骨头活性成分死亡的病理过程,但其早期诊治缺乏特异的生物标志物。目的:应用同位素相对标记与绝对定量技术(i TRAQ)筛选系统性红斑狼疮合并激素性股... 背景:系统性红斑狼疮合并股骨头坏死是由于长期大剂量应用皮质类固醇糖皮质激素造成股骨头活性成分死亡的病理过程,但其早期诊治缺乏特异的生物标志物。目的:应用同位素相对标记与绝对定量技术(i TRAQ)筛选系统性红斑狼疮合并激素性股骨头坏死的血清标志物。方法:分别收集系统性红斑狼疮合并激素性股骨头坏死患者血清8例(实验组)、系统性红斑狼疮使用激素后无股骨头坏死的患者血清(对照组)10例,采用i TRAQ联合二维液相色谱-串联质谱技术(2D-LC-MS/MS)对差异蛋白质进行筛选与鉴定。结果与结论:①共鉴定出10种差异蛋白质,与对照组相比有统计学差异,其中实验组中铜篮蛋白、免疫球蛋白Ig G、免疫球蛋白κ链、补体C2等4种蛋白表达上调;内皮细胞蛋白C受体、人源性激肽释放酶结合蛋白、色素上皮衍生因子、四连接素、胰岛素样生长因子2、甲状腺素运载蛋白等6种蛋白表达下调;②KEGG通路分析提示以上10个蛋白与Wnt信号通路、补体与凝血级联反应、系统性红斑狼疮这3条信号通路密切相关;③结果说明,通过蛋白质组学技术成功得到了可靠的激素性股骨头坏死血清差异蛋白质,为激素性股骨头坏死的诊断及其发病机制提供了理论依据。 展开更多
关键词 系统性红斑狼疮 激素性股骨头坏死 蛋白质组学 itraq技术 组织构建 红斑狼疮 系统性 股骨头坏死 蛋白质组学 组织工程
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基于iTRAQ技术的肝癌肝郁证唾液蛋白质组学 被引量:5
9
作者 丁峰 孙珂焕 +1 位作者 曹美群 吴正治 《武汉工程大学学报》 CAS 2019年第3期205-212,共8页
通过同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术分析原发性肝癌不同中医证型的差异蛋白表达谱,拟从唾液蛋白质水平阐述原发性肝癌肝郁证的证候本质。共收集肝郁证肝癌患者、非肝郁证肝癌患者以及健康对照组唾液样本各11例。在3组人群共鉴定1... 通过同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术分析原发性肝癌不同中医证型的差异蛋白表达谱,拟从唾液蛋白质水平阐述原发性肝癌肝郁证的证候本质。共收集肝郁证肝癌患者、非肝郁证肝癌患者以及健康对照组唾液样本各11例。在3组人群共鉴定1296个蛋白;与健康对照组比较,肝郁证组和非肝郁证组分别有390和231个显著差异表达蛋白(差异倍数>1.5或<0.67,p值<0.05)。进一步比较肝郁证组和非肝郁证组的差异蛋白,发现260个蛋白在肝郁证组中特异性表达,包括124个上调蛋白和136个下调蛋白。GO功能分类和KEGG通路分析表明,肝郁证组中特异表达蛋白主要涉及蛋白酶体通路、溶酶体通路、黏附连接通路等。建立了肝郁证肝癌特异的蛋白数据库,筛选出与肝郁证肝癌发生发展可能相关的多个差异蛋白。 展开更多
关键词 肝癌 肝郁证 唾液 差异表达蛋白 代谢通路 itraq技术
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基于iTRAQ技术的伴放线聚集杆菌细胞致死性扩张毒素诱导Jurkat细胞的凋亡研究 被引量:1
10
作者 陈旭 许悦 +3 位作者 俞文伟 贺凡真 徐艳 李璐 《口腔医学》 CAS 2016年第6期494-497,共4页
目的探索伴放线聚集杆菌(Aggregatibacter actinomycetemcomitans,A.a)的一种毒力因子(cytolethal distending toxin,CDT)诱导人T淋巴细胞发生凋亡过程中表达改变的信号分子。方法培养Jurkat细胞,并进行分组:不做处理的正常细胞对照组... 目的探索伴放线聚集杆菌(Aggregatibacter actinomycetemcomitans,A.a)的一种毒力因子(cytolethal distending toxin,CDT)诱导人T淋巴细胞发生凋亡过程中表达改变的信号分子。方法培养Jurkat细胞,并进行分组:不做处理的正常细胞对照组、野生型A.a CDT刺激Jurkat细胞的野生组、突变型A.a CDT刺激Jurkat细胞的突变组,应用i TRAQ技术检测A.a CDT作用Jurkat细胞24 h过程中表达差异蛋白。结果通过筛选,我们得到20个凋亡相关的蛋白(变化倍数>1.3),其中表达上调的有8个(CASP8/CD3E/YY1/SH3BGRL3/P53/CASP3/UBE2I/TNFRSF10B),表达下调的有12个(F5/RPL18A/DAD1/MTCH2/HIST1H1E/CNBP/RBM25/SLC16A1/KDM2A/CD99/RAC2/TMX1)。结论本研究检测出了伴放线聚集杆菌细胞致死性膨胀毒素诱导人T淋巴细胞凋亡过程中表达差异的蛋白,并筛选了一条可能的信号通路UBE2I/P53/TNFRSF10B/CASP8/CASP3,为下一步研究及临床治疗局限型侵袭性牙周炎提供思路。 展开更多
关键词 伴放线聚集杆菌 细胞致死性膨胀毒素 JURKAT细胞 凋亡 itraq技术
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基于iTRAQ技术的鸡蛋清三种干燥方式差异蛋白质组分析 被引量:1
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作者 史胜娟 刘丽莉 +1 位作者 杨协力 张悦琪 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期260-266,273,共8页
为探究真空冷冻干燥(vacuum freeze-drying, FD)、喷雾干燥(spray-drying, SD)和微波真空冷冻干燥(microwave vacuum freeze-drying, MFD)3种干燥方式对蛋清蛋白的差异,利用iTRAQ技术对三者进行蛋白质组差异分析,在得到的157种具有定量... 为探究真空冷冻干燥(vacuum freeze-drying, FD)、喷雾干燥(spray-drying, SD)和微波真空冷冻干燥(microwave vacuum freeze-drying, MFD)3种干燥方式对蛋清蛋白的差异,利用iTRAQ技术对三者进行蛋白质组差异分析,在得到的157种具有定量信息的蛋清蛋白中,鉴定出87种差异蛋白。MFD vs FD组上调蛋白质数量为46个,占差异蛋白质总数的67.6%。KEGG富集显示,MFD vs FD组和MFD vs SD共有2个基因通路显著富集,分别为折叠和降解、运输和分解代谢。此外,在差异蛋白中筛选出4种蛋白质在干燥过程中丰度变化显著,分别为黏蛋白、血清白蛋白、卵清蛋白相关蛋白Y亚型X1和卵白蛋白相关蛋白Y。该研究首次采用蛋白质组学的方法分析不同干燥方式处理后的鸡蛋清差异蛋白的表达变化,为今后生产和开发高品质蛋清粉及功能性蛋制品提供参考依据。 展开更多
关键词 干燥方式 蛋清差异蛋白 itraq技术 生物信息学分析 蛋清粉
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iTRAQ技术在真菌研究中的应用进展 被引量:8
12
作者 刘原志 章强强 《中国真菌学杂志》 CSCD 2015年第3期185-189,共5页
iTRAQ技术是一种新的、功能强大的、可以最多同时比较8种不同样品中蛋白质相对或绝对含量的蛋白质组学方法,结合多维液相色谱和串联质谱分析,i TRAQ技术已成为差异蛋白质组学定量研究的主要工具之一。而真菌的致病作用是多种蛋白质共同... iTRAQ技术是一种新的、功能强大的、可以最多同时比较8种不同样品中蛋白质相对或绝对含量的蛋白质组学方法,结合多维液相色谱和串联质谱分析,i TRAQ技术已成为差异蛋白质组学定量研究的主要工具之一。而真菌的致病作用是多种蛋白质共同参与的真菌-宿主相互作用的复杂过程,因此整体、定量地分析真菌致病过程中的差异表达蛋白质谱,对于研究真菌的致病机制具有重要作用。该文重点就i TRAQ技术在真菌研究中的应用进展进行综述。 展开更多
关键词 itraq技术 真菌 比较蛋白质组学
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iTRAQ技术及其在蛋白质组学中的应用 被引量:63
13
作者 谢秀枝 王欣 +3 位作者 刘丽华 董世雷 皮雄娥 刘伟 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第7期616-621,共6页
近年来随着蛋白质组学的迅速发展,其相应的方法学研究也取得了巨大的进步,一系列新技术融入了蛋白质组学研究中,极大地促进了这门学科的发展.相对和绝对定量同位素标记(iTRAQ)技术与高度敏感性和准确性的串联质谱及多维液相色谱联用技... 近年来随着蛋白质组学的迅速发展,其相应的方法学研究也取得了巨大的进步,一系列新技术融入了蛋白质组学研究中,极大地促进了这门学科的发展.相对和绝对定量同位素标记(iTRAQ)技术与高度敏感性和准确性的串联质谱及多维液相色谱联用技术已成为蛋白质定性和定量研究的主要工具之一.该技术可对复杂样本、细胞器、细胞裂解液等样本进行相对和绝对定量研究,具有较好的定量效果、较高的重复性.由于其能够同时对多达8种样品进行标记分析,故在生命科学的各个领域得到了广泛的应用.本文对iTRAQ的原理、实验流程、优缺点及近几年的应用进展进行综述. 展开更多
关键词 相对和绝对定量同位素标记(itraq)技术 蛋白质组学 串联质谱 多维液相色谱 生物标记物
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基于iTRAQ技术的血清蛋白质组学研究进展 被引量:6
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作者 王秋红 王悦 +2 位作者 杨欣 薛娟 匡海学 《辽宁中医药大学学报》 CAS 2017年第1期5-7,共3页
随着分子生物学的快速发展,血清蛋白质组学成为研究的热点。相对和绝对定量同位素标记(i TRAQ)技术没有出现之前大部分研究主要在双向凝胶电泳技术的支持下完成,但是该技术具有费时、费力、重复性差等缺点,不能完全避免和消除,人们就注... 随着分子生物学的快速发展,血清蛋白质组学成为研究的热点。相对和绝对定量同位素标记(i TRAQ)技术没有出现之前大部分研究主要在双向凝胶电泳技术的支持下完成,但是该技术具有费时、费力、重复性差等缺点,不能完全避免和消除,人们就注入了新的研究方法—i TRAQ技术,该技术具有灵敏度高、分辨率高、重复性好、易自动化和检测范围广等诸多优点,使该技术在医学和生物制药领域受到高度关注和广泛应用。该文就最近几年基于i TRAQ技术的血清蛋白质组学研究进展、标志物的探索等相关问题进行综述。 展开更多
关键词 相对和绝对定量同位素标记(itraq)技术 血清蛋白质组学 质谱技术 生物标记物
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iTRAQ技术筛选急性心肌梗死动物血清早期潜在标记物的试验研究
15
作者 娄江杰 翁莹政 +6 位作者 曾广忠 刘小伟 金红峰 王亚利 杜常青 徐晨凯 唐礼江 《浙江医学》 CAS 2019年第4期310-313,384,共5页
目的利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)技术筛选急性心肌梗死(AMI)后表达的差异蛋白,寻找可早期诊断AMI的潜在血清标记物。方法 32条成年比格犬分为假手术组和AMI组(采用冠... 目的利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)技术筛选急性心肌梗死(AMI)后表达的差异蛋白,寻找可早期诊断AMI的潜在血清标记物。方法 32条成年比格犬分为假手术组和AMI组(采用冠状动脉注射聚乙烯微球悬浮制剂和凝血酶粉剂制作动物模型),分别收集造模前和造模后1、2、3、6h血清。利用8标iTRAQ技术分析两组血清中蛋白质的表达情况,将表达差异倍数>1.2倍(上下调)且P<0.05的蛋白视为差异蛋白,并对差异蛋白进行基因本体(Geneontology,GO)功能注释和富集分析。结果 AMI后1h出现的差异蛋白有51种,上调28种,下调23种。AMI后2h出现的差异蛋白有54种,上调28种,下调26种。AMI后3h出现的差异蛋白有43种,上调24种,下调19种。AMI后6h出现的差异蛋白有54种,上调29种,下调25种。综合分析前6h差异蛋白,查阅文献资料排除未命名蛋白和犬特有蛋白后,共发现15种差异蛋白在AMI后6h内稳定表达,上调7种,下调8种。结论利用iTRAQ技术筛选出15种与早期AMI相关蛋白,对筛选出的差异蛋白进行功能分析并查阅相关文献,其中肌球蛋白作为早期诊断AMI的新型血清标记物可能有较大潜力。 展开更多
关键词 急性心肌梗死 生物标记物 itraq技术 肌球蛋白
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基于iTRAQ技术对桥本甲状腺炎血清蛋白组学变化的研究
16
作者 加孜热亚·再依拿提 李素丽 +4 位作者 张竞 刘晴晴 杜丹阳 董玲玲 郭艳英 《新疆医学》 2021年第3期281-284,共4页
目的探讨桥本氏甲状腺炎(Hashimoto`s Thyroiditis,HT)患者血清蛋白质组学变化,寻找HT患者差异蛋白,为HT的预防、诊断和治疗提供新的生物标志物。方法收集9例HT患者、14例对照组患者的外周血标本。应用相对和绝对定量同位素标记(iTRAQ)... 目的探讨桥本氏甲状腺炎(Hashimoto`s Thyroiditis,HT)患者血清蛋白质组学变化,寻找HT患者差异蛋白,为HT的预防、诊断和治疗提供新的生物标志物。方法收集9例HT患者、14例对照组患者的外周血标本。应用相对和绝对定量同位素标记(iTRAQ)技术联合液相色谱法以及串联质谱分析对蛋白质进行鉴定和相对定量。结果与对照组相比,HT患者血清中共鉴定出有定量信息的蛋白质19个,包括4个上调蛋白和15个下调蛋白。对显著表达的CRTAC1、PI16、LUM、GPX3等上调蛋白及IGHG4、SERPINA5、SHBG、APOA等下调蛋白进行生物学功能分析,主要功能包括参与炎症反应、纤维化、应激反应、催化活性调节、内肽酶负调节、细胞蛋白质负调节、自身免疫等生物过程。结论本研究基于iTRAQ技术鉴定出桥本氏甲状腺炎的差异蛋白,生物学功能分析发现这些差异蛋白主要功能涉及炎症反应及纤维化、氧化应激等,参与自身免疫等多个生物过程,可能作为该病潜在的临床筛查生物学标志物。 展开更多
关键词 桥本甲状腺炎 itraq技术 蛋白组学
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基于iTRAQ技术分析镉胁迫下泽兰实蝇雄性附腺差异蛋白的表达
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作者 桂华敏 鲁武锋 +3 位作者 李丽芳 高平 吴国星 高熹 《云南农业大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期228-236,共9页
【目的】明确镉污染对泽兰实蝇(Procecidochares utilis Stone)雄性附腺蛋白质造成的影响。【方法】利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技术结合MS/MS对染镉与未染镉的泽兰... 【目的】明确镉污染对泽兰实蝇(Procecidochares utilis Stone)雄性附腺蛋白质造成的影响。【方法】利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技术结合MS/MS对染镉与未染镉的泽兰实蝇雄性附腺蛋白质进行分析与鉴定。【结果】共鉴定出3 661个蛋白质,具有定量信息差异的蛋白质58个,其中上调的蛋白质38个,下调的蛋白质20个。GO和KEGG注释分析和富集分析结果显示:这些蛋白质具有催化、代谢和转运等功能,表明染镉后泽兰实蝇雄性附腺中多种功能的蛋白质发生了变化。【结论】本研究明确了镉污染可改变泽兰实蝇雄性附腺蛋白质组,并鉴定了镉胁迫后泽兰实蝇雄性附腺的差异蛋白。 展开更多
关键词 泽兰实蝇 雄性附腺 同位素标记相对和绝对定量(itraq)技术 蛋白质组
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iTRAQ技术检测烟雾病病人硬脑膜特异性蛋白表达
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作者 张小军 尹林 +1 位作者 刘思远 张丽军 《中国临床神经外科杂志》 2021年第4期261-265,共5页
目的优化硬脑膜蛋白质的提取方法,筛选烟雾病(MMD)病人硬脑膜特异性表达蛋白质。方法收集96例MMD和13例非MMD病人的硬脑膜组织,用胶原酶Ⅳ孵育去除硬脑膜表面的血液,用机械破碎或液氮研磨方法提取蛋白质,一维凝胶电泳分离后进行质谱鉴定... 目的优化硬脑膜蛋白质的提取方法,筛选烟雾病(MMD)病人硬脑膜特异性表达蛋白质。方法收集96例MMD和13例非MMD病人的硬脑膜组织,用胶原酶Ⅳ孵育去除硬脑膜表面的血液,用机械破碎或液氮研磨方法提取蛋白质,一维凝胶电泳分离后进行质谱鉴定,用同位素相对标记与绝对定量(iTRAQ)技术进行标记、分离和鉴定差异蛋白质,应用R语言和生物信息学分析筛选MMD相关蛋白质,再应用组织芯片技术验证差异蛋白质表达。结果胶原酶Ⅳ消化、液氮研磨和十二烷基硫酸钠法提取硬脑膜蛋白质效果较好;iTRAQ技术和生信分析发现23个差异蛋白质,组织芯片结果证实MMD病人硬脑膜组织SLC4A1蛋白表达明显下调。结论iTRAQ技术可以很好地进行标记、分离和鉴定硬脑膜组织差异蛋白质,SLC4A1可能在MMD发病过程中具有一定的作用。 展开更多
关键词 烟雾病 硬脑膜 蛋白质组 生物信息学 组织芯片 同位素相对标记与绝对定量技术(itraq)
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基于iTRAQ技术分析早期糖尿病肾病肾阴虚证患者血浆蛋白质组学
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作者 耿宇轩 赵青 +4 位作者 郭文涛 程吟 黄怡 冯龙 卢洪梅 《中医学报》 CAS 2024年第2期400-405,共6页
目的:筛选糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)肾阴虚证敏感的血浆分子标志物,探究糖尿病肾病肾阴虚证的生物学基础及其发病机制。方法:收集24例早期DN肾阴虚患者(DN阴虚证组)的血浆和24例正常人群血浆(NC组),应用同位素标记的相对和... 目的:筛选糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)肾阴虚证敏感的血浆分子标志物,探究糖尿病肾病肾阴虚证的生物学基础及其发病机制。方法:收集24例早期DN肾阴虚患者(DN阴虚证组)的血浆和24例正常人群血浆(NC组),应用同位素标记的相对和绝对定量(isobaric tag for relative and absolute quan-tification,iTRAQ)标记的二维液相色谱串联质谱(two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry,2DLC-MS/MS)方法检测血浆蛋白质,利用基因本体论(Gene Ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)及蛋白质互作网络等方法筛选血浆差异蛋白,采用Western blot对筛选出来的蛋白进行验证。结果:与NC组比较,DN阴虚证组中共鉴定出37个差异蛋白质(差异倍数>2,P<0.05),包括20个上调蛋白和17个下调蛋白。这些蛋白主要涉及胆固醇代谢、补体及凝血级联反应、脂肪消化吸收等与心血管疾病有明显关系的通路。进一步验证发现HP和FGG蛋白表达高于NC组,载脂蛋白AI表达低于NC组(P<0.05),Western blot结果与iTRAQ质谱结果具有一致性。结论:iTRAQ结合2DLC-MS/MS技术可以有效筛选出DN肾阴虚证中差异的蛋白,本研究鉴定的37种蛋白有可能为DN的早期诊断和中医证型研究提供潜在分子标志物。 展开更多
关键词 糖尿病肾病 肾阴虚证 蛋白质组学 itraq技术
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基于iTRAQ技术挖掘德保猪睾丸内调控繁殖的关键蛋白
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作者 马原鼎 郑钧文 +1 位作者 曾素先 黎宗强 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2023年第4期58-63,129,130,共8页
为了筛选德保猪性成熟前后睾丸中差异表达蛋白(differentially expressed proteins,DEPs),试验选取相同饲养环境下的健康且无亲缘关系的1月龄(性成熟前)与6月龄(性成熟后)德保公猪各3头,采集它们的睾丸并提取蛋白质,利用同位素标记相对... 为了筛选德保猪性成熟前后睾丸中差异表达蛋白(differentially expressed proteins,DEPs),试验选取相同饲养环境下的健康且无亲缘关系的1月龄(性成熟前)与6月龄(性成熟后)德保公猪各3头,采集它们的睾丸并提取蛋白质,利用同位素标记相对和绝对定量(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)技术对性成熟前后德保猪睾丸中DEPs进行分析,并对DEPs在GO、KOG、KEGG数据库中进行功能注释及通路分析。结果表明:在性成熟前后德保猪睾丸中共鉴定7767个蛋白,筛选出611个DEPs,其中在性成熟后德保猪中显著上调的DEPs 347个,显著下调的DEPs 264个;397个蛋白在GO数据库中得到注释,并富集到53条GO term中,包括细胞过程、生物调节、代谢过程、催化活性等信号通路;409个蛋白在KOG数据库中得到注释,并富集到24种功能,包括信号转导机制、翻译后修饰、蛋白周转、监督等功能;329个蛋白在KEGG数据库得到注释,并富集到287条通路中,包括代谢途径通路、吞噬体、补体与凝血级联反应、肺结核、PI3K-Akt通路等;筛选出4个与繁殖相关的DEPs,包括脂联素(adiponectin)、AQP7、ODF1、磷酸甘油酸激酶2(PGK2),这4个DEPs在精子发生和成熟、保护精子完整性及维持精子活力与功能方面起重要作用。 展开更多
关键词 itraq技术 德保猪 睾丸 差异表达蛋白 生物学信息
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