黄河故道地区葡萄根结线虫rDNA-ITS-PCR研究

用PCR方法扩增来自黄河故道地区不同区域葡萄根结线虫群体的ITS片段,并进行克隆和序列分析。结果表明,来自6个不同采集点的供试线虫属于同一种群,获得的ITS序列长度为766 bp,与已知南方根结线虫ITS区编码序列一致性达到99.74%;聚类结果显示,与南方根结线虫亲缘关系最近。结合形态鉴定结果,初步确定黄河古道地区葡萄根结线虫病病原为南方根结线虫(Meloidogyne incognita)。

魔芋软腐病菌分子鉴定与遗传多样性

通过对分离的魔芋软腐病菌株和其它参试菌株的致病性测定、选择性培养基培养性状观察和16S-23S rDNA转录间隔区PCR(ITS-PCR)分析,将测试的33株软腐病菌株主要分为3个组群。第1组群为胡萝卜软腐欧文氏杆菌胡萝卜软腐亚种(Erwinia carotovorasubsp.carotovora,E.c.c.);第2组群为菊欧文氏杆菌(Erwinia chrysanthemi,E.ch.);还有一组未能确定的菌株。利用细菌基因组重复序列通用引物BOX和J3进行Rep-PCR特异性扩增,引起软腐病的菌株E.c.c.和E.ch.(ITS-PCR鉴定)种内的Rep-PCR指纹存在明显的遗传分化,经聚类分析,在0.1水平上把E.c.c.13株区分为5个类群。

西藏地区传统发酵乳宏基因组DNA的提取及微生物群落多样性分析

采用CTAB-SDS-冻融、液氮研磨、玻璃珠吸附3种方法提取来自西藏地区的传统发酵乳样品中微生物宏基因组DNA。结果表明,采用经过改良的CTAB-SDS-冻融法提取效果较佳,可直接用于后续的微生物多样性分析。分别采用16SrRNA-RFLP和ITS-PCR分析发酵乳中细菌和真菌的微生物多样性,结果显示,来自西藏当雄龙仁乡的2个样品中微生物的多样性较为丰富,并且优势菌群较为相近,而来自西藏当雄纳木错的样品微生物多样性丰度较低,其优势菌群与前2个样品有较大的差异性。此结果同时表明了运用细菌16SrRNA-RFLP和真菌ITS-PCR相结合的方法能够全面快速地比较分析发酵乳中的微生物多样性。

咖啡短体线虫分子鉴定

本实验采用单条线虫法提取DNA,rDNA-ITS-PCR技术扩增目的片段(ITS1、5.8S、ITS2和部分的18S和28S),将此片段纯化回收,克隆测序分析,与GenBank比对,结果为:该种群的基因序列与AY561436(基因库编号)的相似度为92.3%,与AB053485的相似度为91.3%。分子鉴定结果与形态鉴定该线虫为咖啡短体线虫。

纤维素酶产生菌灰白青霉HML0233的分离及系统分类研究

通过滤纸纤维素平板及发酵产酶鉴定,从腐木下土壤中分离出一株分解纤维素能力较强的真菌HML0233。该菌株的CMC酶活为31.04U/mL,β-葡萄糖苷酶酶活为47.66U/mL,滤纸酶活为5.28U/mL。根据形态特征观察初步推测该菌株属于青霉属;经5.8SrDNA基因两侧的内转录间隙ITS序列同源性分析及构建系统进化树分析,该菌株和Penicillium canescens NRRL 35656同源性很高,推测该菌株为灰白青霉(Penicillium canescens)。