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RAPD分析与ITS序列分析在拟茎点霉分类鉴定上的应用
被引量:
35
1
作者
陈永青
姜子德
戚佩坤
《菌物系统》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第1期39-46,共8页
采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术和核糖体RNA基因(rDNA)转录间隔区(ITS)序列分析对22种拟茎点霉共34个菌株进行了系统发育研究。RAPD分析构建的UPGMA聚类图所反映的种间、种内关系与形态学分类结果基本一致,可以清楚地将分自7科寄主植...
采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术和核糖体RNA基因(rDNA)转录间隔区(ITS)序列分析对22种拟茎点霉共34个菌株进行了系统发育研究。RAPD分析构建的UPGMA聚类图所反映的种间、种内关系与形态学分类结果基本一致,可以清楚地将分自7科寄主植物上的不同的种分别区分开来,但分自同科或同属寄主植物上的不同的种并不具有相近的亲缘关系。ITS序列分析结果不支持将Phomopsis mangiferae Ahmad和P. cytosporella Penz. et Sacc. 合并为同一个种的观点,同时还显示出P. mangiferae与P. psidii de Camara的亲缘关系非常近, 可能是异名同物;而为害木棉叶的拟茎点霉与杨梅枝枯病菌P. myricae Y.J.Huang et P.K.Chi之间的碱基差异亦属于种下不同菌株间的正常差别范围,很可能就是同一个种。对相同的供试菌株两技术所反映的亲缘关系趋势相同,表明两技术用于拟茎点霉的亲缘关系分析和种类鉴定均是可行的。
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关键词
拟茎点霉
RAPD
its区域分析
分类鉴定
应用
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职称材料
题名
RAPD分析与ITS序列分析在拟茎点霉分类鉴定上的应用
被引量:
35
1
作者
陈永青
姜子德
戚佩坤
机构
华南农业大学热带亚热带真菌研究室
出处
《菌物系统》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第1期39-46,共8页
基金
国家基金项目(39870001
39899400)
高等学校骨干教师资助计划项目的部分内容。
文摘
采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术和核糖体RNA基因(rDNA)转录间隔区(ITS)序列分析对22种拟茎点霉共34个菌株进行了系统发育研究。RAPD分析构建的UPGMA聚类图所反映的种间、种内关系与形态学分类结果基本一致,可以清楚地将分自7科寄主植物上的不同的种分别区分开来,但分自同科或同属寄主植物上的不同的种并不具有相近的亲缘关系。ITS序列分析结果不支持将Phomopsis mangiferae Ahmad和P. cytosporella Penz. et Sacc. 合并为同一个种的观点,同时还显示出P. mangiferae与P. psidii de Camara的亲缘关系非常近, 可能是异名同物;而为害木棉叶的拟茎点霉与杨梅枝枯病菌P. myricae Y.J.Huang et P.K.Chi之间的碱基差异亦属于种下不同菌株间的正常差别范围,很可能就是同一个种。对相同的供试菌株两技术所反映的亲缘关系趋势相同,表明两技术用于拟茎点霉的亲缘关系分析和种类鉴定均是可行的。
关键词
拟茎点霉
RAPD
its区域分析
分类鉴定
应用
Keywords
Phomopsis, RAPD, rDNA ITS, classification, identification
分类号
Q949.32 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
RAPD分析与ITS序列分析在拟茎点霉分类鉴定上的应用
陈永青
姜子德
戚佩坤
《菌物系统》
CAS
CSCD
北大核心
2002
35
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