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茶树菇复合群菌株内ITS序列异源特征分析
1
作者
钱蓉
柴红梅
+2 位作者
赵永昌
陈玉惠
陈卫民
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2021年第6期116-125,共10页
ITS序列作为常用的分子标记,广泛应用于真菌系统学研究,然而在茶树菇类群分析中缺乏综合分析。结果表明:对茶树菇菌株ITS序列进行测序,从中发现了8个菌株ITS测序图谱存在套峰。各菌株分离的子代同核体群体中存在2种ITS序列类型,推测亲...
ITS序列作为常用的分子标记,广泛应用于真菌系统学研究,然而在茶树菇类群分析中缺乏综合分析。结果表明:对茶树菇菌株ITS序列进行测序,从中发现了8个菌株ITS测序图谱存在套峰。各菌株分离的子代同核体群体中存在2种ITS序列类型,推测亲本由不同ITS类型同核体杂交而成。从混杂的ITS扩增产物里进行克隆测序后,发现ITS1和ITS2区域存在模板复制转换的现象。依据ITS和线粒体小亚基mtSSU构建的聚类树显示的拓扑结构不一致,部分来自于同一菌株的ITS序列聚类到不同的群中。因此,茶树菇的ITS序列显示出多样性且组成复杂,从ITS杂合菌株中直接进行克隆分析会产生不正确的序列信息,给菌株鉴定和系统分析造成错误的结果。
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关键词
茶树菇
its异源
系统分析
套峰
线粒体
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职称材料
题名
茶树菇复合群菌株内ITS序列异源特征分析
1
作者
钱蓉
柴红梅
赵永昌
陈玉惠
陈卫民
机构
西南林业大学生命科学学院
云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所
云南省农业生物技术重点实验室
农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室
出处
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2021年第6期116-125,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31960017)资助
国家现代农业(食用菌)产业技术体系项目(CARS20)资助。
文摘
ITS序列作为常用的分子标记,广泛应用于真菌系统学研究,然而在茶树菇类群分析中缺乏综合分析。结果表明:对茶树菇菌株ITS序列进行测序,从中发现了8个菌株ITS测序图谱存在套峰。各菌株分离的子代同核体群体中存在2种ITS序列类型,推测亲本由不同ITS类型同核体杂交而成。从混杂的ITS扩增产物里进行克隆测序后,发现ITS1和ITS2区域存在模板复制转换的现象。依据ITS和线粒体小亚基mtSSU构建的聚类树显示的拓扑结构不一致,部分来自于同一菌株的ITS序列聚类到不同的群中。因此,茶树菇的ITS序列显示出多样性且组成复杂,从ITS杂合菌株中直接进行克隆分析会产生不正确的序列信息,给菌株鉴定和系统分析造成错误的结果。
关键词
茶树菇
its异源
系统分析
套峰
线粒体
Keywords
Cyclocybe aegerita
ITS heterogeneity
phylogenetic analysis
double peak
mitochondria
分类号
S759.81 [农业科学—森林经理学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
茶树菇复合群菌株内ITS序列异源特征分析
钱蓉
柴红梅
赵永昌
陈玉惠
陈卫民
《西南林业大学学报(自然科学)》
CAS
北大核心
2021
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