期刊文献+
共找到29篇文章
< 1 2 >
每页显示 20 50 100
猪食道口线虫ITS-1和ITS-2rDNA的PCR-SSCP分析 被引量:13
1
作者 林瑞庆 张新高 +4 位作者 胡友兰 李国清 翁亚彪 宋慧群 朱兴全 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期323-326,331,共5页
以采自我国不同地区猪体的食道口线虫虫株为研究对象,PCR扩增出ITS-1和ITS-2序列片段,然后采用单链构象多态性(SSCP)方法分析PCR产物,对不同地区食道口线虫进行分子鉴定。所有样品经SSCP分析显示两种带型,第一种为有齿食道口线虫带型,... 以采自我国不同地区猪体的食道口线虫虫株为研究对象,PCR扩增出ITS-1和ITS-2序列片段,然后采用单链构象多态性(SSCP)方法分析PCR产物,对不同地区食道口线虫进行分子鉴定。所有样品经SSCP分析显示两种带型,第一种为有齿食道口线虫带型,另一种为未定种食道口线虫带型。代表性样品的测序结果表明,未定种食道口线虫带型的样品为四棘食道口线虫。本研究在国际上首次报道了中国猪四棘食道口线虫的ITS序列,并建立了区分有齿食道口线虫和四棘食道口线虫的PCR-SSCP方法,从而为食道口线虫的分子生物学的进一步研究奠定了基础。 展开更多
关键词 食道口线虫 its-1 its-2 单链构象多态性(SSCP)
下载PDF
嗜群血蜱和长角血蜱ITS-2、COⅠ和COⅡ基因序列变异与亲缘关系分析 被引量:15
2
作者 古小彬 余增莹 +4 位作者 杨光友 孙家刚 魏洪 李开均 王淑贤 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第6期746-754,共9页
本研究旨在阐明长角血蜱与嗜群血蜱间的亲缘关系。采用聚合酶链式反应(PCR)技术从长角血蜱和嗜群血蜱基因组DNA中扩增得到核糖体第二内部转录间隔区基因(ITS-2)片段、线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ基因(COⅠ)片段和线粒体细胞色素氧化酶亚... 本研究旨在阐明长角血蜱与嗜群血蜱间的亲缘关系。采用聚合酶链式反应(PCR)技术从长角血蜱和嗜群血蜱基因组DNA中扩增得到核糖体第二内部转录间隔区基因(ITS-2)片段、线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ基因(COⅠ)片段和线粒体细胞色素氧化酶亚基II基因(COⅡ)片段,并进行测序,进而分析其基因变异与系统发育。结果表明,长角血蜱和嗜群血蜱的ITS-2、COⅠ和COⅡ基因片段的大小存在差异,长角血蜱3种基因分别为361、479和647bp,嗜群血蜱基因分别为354、474和661bp。长角血蜱与嗜群血蜱间ITS-2、COⅠ和COⅡ基因的相似性分别为84.2%、89.0%和88.4%。以3种基因构建的NJ进化树中,长角血蜱和嗜群血蜱均聚类。因此,认为长角血蜱和嗜群血蜱间ITS-2、COI和COII基因间变异较小,它们是血蜱属中亲缘关系较近的2个有效种,支持传统形态学的分类地位。 展开更多
关键词 长角血蜱 嗜群血蜱 its-2 COⅠ COⅡ 序列变异 亲缘关系
下载PDF
大熊猫等八种野生珍稀动物蛔虫ITS-2基因的序列分析 被引量:9
3
作者 何光志 牛李丽 +6 位作者 杨光友 邓家波 王帅 余星明 汪涛 古小彬 陈维刚 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第11期933-938,共6页
为了探讨寄生在大熊猫、小熊猫、黑猩猩、白眉长臂猿和4种熊科动物(北极熊、棕熊西藏亚种、狗熊四川亚种和棕熊东北亚种)体内蛔虫的分类地位,测定了核糖体第二内转录间隔区(ITS-2)基因序列,并对这些序列进行同源性分析和采用UPGMA法构... 为了探讨寄生在大熊猫、小熊猫、黑猩猩、白眉长臂猿和4种熊科动物(北极熊、棕熊西藏亚种、狗熊四川亚种和棕熊东北亚种)体内蛔虫的分类地位,测定了核糖体第二内转录间隔区(ITS-2)基因序列,并对这些序列进行同源性分析和采用UPGMA法构建分子系统树。结果表明:寄生在大熊猫、小熊猫和4种熊科动物体内的蛔虫均为贝蛔属蛔虫;寄生在黑猩猩和白眉长臂猿体内的蛔虫为蛔属蛔虫。分析结果提示蛔虫与宿主之间存在协同进化关系。 展开更多
关键词 大熊猫 野生珍稀动物 蛔虫 核糖体its-2基因 序列分析 协同进化
下载PDF
福建缢蛏野生群体与养殖群体的ITS-1和ITS-2分析 被引量:8
4
作者 姜志勇 牛东红 +2 位作者 陈慧 沈和定 李家乐 《海洋渔业》 CSCD 2007年第4期314-318,共5页
采用PCR技术对福建缢蛏的霞浦野生群体(WP)和漳湾养殖群体(CZ)进行了ITS-1和ITS-2的多态性分析。利用贝类通用引物扩增了ITS-1和ITS-2序列,PCR产物经纯化、测序、同源序列比对,获得长度分别为495 bp的ITS-1和485 bp的ITS-2核苷酸序列,... 采用PCR技术对福建缢蛏的霞浦野生群体(WP)和漳湾养殖群体(CZ)进行了ITS-1和ITS-2的多态性分析。利用贝类通用引物扩增了ITS-1和ITS-2序列,PCR产物经纯化、测序、同源序列比对,获得长度分别为495 bp的ITS-1和485 bp的ITS-2核苷酸序列,其中分别包括25 bp和22 bp的插入缺失。ITS-1和ITS-2片段的T、C、A、G四种碱基的平均含量分别为13.6%、30.2%、28.3%、29.7%(ITS-1),16.2%、33.7%、19.5%、30.6%(ITS-2),A+T含量显著低于G+C含量。序列分析显示,野生群体和养殖群体的单倍型多样性指数、多态位点数、平均核苷酸差异数分别为1.0、40、10.54(ITS-1),0.96、27、11.91(ITS-2)和1.0、28、8.23(ITS-1),0.96、28、10.16(ITS-2),揭示出福建两个缢蛏群体的遗传多样性均较为丰富,其变异主要源于碱基的插入和缺失,野生群体的多样性较高于养殖群体,但是遗传组成存在着较高的一致性,群体间没有遗传分化。 展开更多
关键词 缢蛏 its-1 its-2 遗传多样性
下载PDF
兔痒螨和水牛痒螨第二转录间隔区(ITS-2)基因序列分析 被引量:7
5
作者 贾小勇 杨光友 +1 位作者 古小彬 赖松家 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第5期545-550,共6页
为了探讨水牛痒螨株和兔痒螨株的分类地位,采用PCR技术扩增了四川水牛痒螨株和四川兔痒螨株的第二内部转录间隔区(ITS-2)基因,并与GenBank中注册的5个国外痒螨株的同源基因进行了比较。序列分析发现:兔痒螨株和水牛痒螨株的序列长度分别... 为了探讨水牛痒螨株和兔痒螨株的分类地位,采用PCR技术扩增了四川水牛痒螨株和四川兔痒螨株的第二内部转录间隔区(ITS-2)基因,并与GenBank中注册的5个国外痒螨株的同源基因进行了比较。序列分析发现:兔痒螨株和水牛痒螨株的序列长度分别为277bp和281bp,两序列间存在多处转换、颠换和缺失。四川水牛痒螨株同四川兔痒螨株间及国外痒螨分离株间的ITS-2基因同源性较低(87.1%~88.0%);而四川兔痒螨株与国外痒螨分离株的同源性较高(95.5%~100.0%)。用痒螨ITS-2基因构建的MP,NJ,ME及UPGM树中,兔痒螨株和水牛痒螨株在不同的系统树中其位置比较固定,且两者相距均较远。根据痒螨ITS-2基因同源性分析和系统树构建结果以及其他已报道的相关证据,作者认为:兔痒螨株和水牛痒螨株可能为痒螨属Psoroptes中两个不同的种,兔痒螨分离株为马痒螨P.equi;而水牛痒螨株与来自兔、山羊、绵羊和黄牛等痒螨株亲缘关系较远,可能为痒螨属中的另一个独立有效种。 展开更多
关键词 痒螨 痒螨株 分类地位 水牛 第二内部转录间隔区(its-2) 系统发育
下载PDF
长耳珠母贝核rRNA基因ITS-2序列分析 被引量:12
6
作者 何毛贤 黄良民 《热带海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第5期81-84,共4页
以相应引物聚合酶链式反应(PCR)扩增长耳珠母贝(Pinctadachemnitzi)核核糖体RNA基因第2转录间隔区(ITS 2),PCR产物大小约500bp,经克隆、测序,所得序列包含5.8S和28SrRNA基因部分序列和ITS 2全序列,4种碱基含量分别为27.11%(A)、24.95%(G... 以相应引物聚合酶链式反应(PCR)扩增长耳珠母贝(Pinctadachemnitzi)核核糖体RNA基因第2转录间隔区(ITS 2),PCR产物大小约500bp,经克隆、测序,所得序列包含5.8S和28SrRNA基因部分序列和ITS 2全序列,4种碱基含量分别为27.11%(A)、24.95%(G)、21.26%(T)和26.68%(C)。5个克隆的DNA序列差异为0.0%—0.4%,不存在个体内变异。对其潜在应用进行了讨论。 展开更多
关键词 长耳珠母贝 its-2 序列分析
下载PDF
虫卵ITS-2序列分析鉴别华支睾吸虫和扇棘单睾吸虫的研究 被引量:2
7
作者 吕国丽 杨益超 +6 位作者 蒋智华 韦海艳 张伟尉 唐雯茜 林源 黄福明 区方奇 《内科》 2014年第2期128-130,123,共4页
目的建立以分子生物学技术为基础的华支睾吸虫与扇棘单睾吸虫的ITS-2序列分析鉴别方法。方法在华支睾吸虫流行区采集华支睾吸虫和扇棘单睾吸虫成虫,从成虫虫体分离并收集虫卵。以蛔虫、鞭虫、钩虫、蛲虫做对照虫种,按不同虫种和虫卵数分... 目的建立以分子生物学技术为基础的华支睾吸虫与扇棘单睾吸虫的ITS-2序列分析鉴别方法。方法在华支睾吸虫流行区采集华支睾吸虫和扇棘单睾吸虫成虫,从成虫虫体分离并收集虫卵。以蛔虫、鞭虫、钩虫、蛲虫做对照虫种,按不同虫种和虫卵数分成5个实验组,各组分别提取DNA,并扩增ITS-2序列,对扩增产物进行测序并作同源性分析以确保为目标片段,根据PCR扩增产物电泳获得的条带判定虫种。结果以华支睾吸虫和扇棘单睾吸虫虫卵DNA为模板的PCR产物电泳图谱分别在400bp、500bp左右各显示一条明显条带;在以两种虫卵DNA混合液为模板的PCR产物中,电泳图谱在400bp左右和500bp左右各显示明显条带。将测序得到的两种核苷酸序列进行Blast比对后,显示与GenBank中相应的华支睾吸虫和扇棘单睾吸虫序列高度同源。混入四种肠道线虫虫卵DNA的PCR产物中,除目的条带外,无其他条带。结论该方法可以对华支睾吸虫及扇棘单睾吸虫虫卵进行鉴别,且结果不受常见四种肠道线虫虫卵干扰,敏感性和特异性较高,可作为两虫种的鉴别检测方法。 展开更多
关键词 华支睾吸虫 扇棘单睾吸虫 its-2 鉴别方法
下载PDF
应用ITS-2基因对小熊猫源恶丝虫虫种的鉴定 被引量:2
8
作者 费宇翔 黄红松 +6 位作者 杨光友 张志和 王成东 杨智 兰景超 罗娌 刘礼 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第7期593-596,共4页
为探讨采自小熊猫的恶丝虫虫种的分类地位,测定了四川雅安地区犬源犬恶丝虫和成都及重庆两地小熊猫源恶丝虫的核糖体第二内转录间隔区(ITS-2)基因序列并进行了比对分析。结果显示,犬源犬恶丝虫和小熊猫源恶丝虫与来自中国台湾、印度... 为探讨采自小熊猫的恶丝虫虫种的分类地位,测定了四川雅安地区犬源犬恶丝虫和成都及重庆两地小熊猫源恶丝虫的核糖体第二内转录间隔区(ITS-2)基因序列并进行了比对分析。结果显示,犬源犬恶丝虫和小熊猫源恶丝虫与来自中国台湾、印度的犬恶丝虫的ITS-2基因序列的同源性高达98.0%-100%。同时,构建的NJ树和MP树均显示不同宿主和不同地区的犬恶丝虫和小熊猫源恶丝虫聚类形成一个支系。表明,小熊猫源恶丝虫应为犬恶丝虫,而前苏联学者定名的小熊猫恶丝虫应为犬恶丝虫的同物异名虫种。 展开更多
关键词 犬恶丝虫 小熊猫 its-2基因 序列分析
下载PDF
不对称荧光PCR扩增白念珠菌ITS-2基因单链DNA实验 被引量:1
9
作者 王敬华 虞培娟 +4 位作者 葛平 徐蓉 陈蓉 刘学杰 王华梁 《检验医学》 CAS 2017年第3期210-213,共4页
目的比较在限制性引物不同稀释比例条件下,不对称荧光聚合酶链反应(PCR)扩增白念珠菌5.8S rDNA与28S rDNA间内转录间区2(ITS-2)基因的单链DNA(ssDNA)的实际效果,探讨其体系优化方法。方法以常规PCR为对照,将20μmol/L的正向引物(P1)按... 目的比较在限制性引物不同稀释比例条件下,不对称荧光聚合酶链反应(PCR)扩增白念珠菌5.8S rDNA与28S rDNA间内转录间区2(ITS-2)基因的单链DNA(ssDNA)的实际效果,探讨其体系优化方法。方法以常规PCR为对照,将20μmol/L的正向引物(P1)按照一定比例预稀释后,分别与20μmol/L的荧光标记反向引物(P2')组成含不同P1水平的引物对,采用不对称荧光PCR扩增真菌ITS-2,并对PCR产物进行电泳和测序分析,比较各实验组扩增ssDNA的效果。结果不对称荧光PCR成功扩增出白念珠菌ITS-2基因的ssDNA,随着限制性引物水平的降低,ITS-2基因的双链DNA(dsDNA)条带逐渐变淡,而ssDNA条带逐渐变亮;在限制性引物稀释比例达到1∶90~1∶100时,ds DNA条带已经模糊不清,而ssDNA条带则达到最亮。提示在此扩增体系条件下,ssDNA拷贝数最多,为不对称荧光PCR扩增白念珠菌ITS-2基因ssDNA的最佳扩增条件。PCR产物测序也表明,dsDNA上方的条带为ITS-2基因的ssDNA。结论通过优化限制性引物水平,不对称荧光PCR可以高效地扩增白念珠菌ITS-2基因的ssDNA。 展开更多
关键词 不对称荧光聚合酶链反应 白念珠菌 its-2基因 单链DNA
下载PDF
北京犬ITS-2 rDNA的PCR扩增、克隆及分析
10
作者 张新高 王立欣 侯杰 《中国畜牧兽医文摘》 2011年第3期40-42,共3页
本研究以从中国广东深圳某动物医院采集的北京犬血液样品为研究对象,经反复摸索,选用LATaq酶结合降落PCR方法,成功地扩增出北京犬的核糖体基因组(rDNA)的第2内转录间隔区(ITS-2)序列。将PCR扩增出的片段纯化后克隆至pGEM-TEasy载体,用PC... 本研究以从中国广东深圳某动物医院采集的北京犬血液样品为研究对象,经反复摸索,选用LATaq酶结合降落PCR方法,成功地扩增出北京犬的核糖体基因组(rDNA)的第2内转录间隔区(ITS-2)序列。将PCR扩增出的片段纯化后克隆至pGEM-TEasy载体,用PCR技术及酶切鉴定阳性菌落,对阳性菌落质粒DNA进行测序。结果表明,ITS-2片段大小为1138bp,GC含量为83.57%。本研究为犬线粒体等真核生物高GC含量序列的有效扩增作了有益的探索。 展开更多
关键词 北京犬 its-2 高GC含量 PCR克隆
下载PDF
Prevalence of infection and molecular confirmation by using ITS-2 region of Fasciola gigantica found in domestic cattle from Chiang Mai province,Thailand
11
作者 Anawat Phalee Chalobol Wongsawad 《Asian Pacific Journal of Tropical Medicine》 SCIE CAS 2014年第3期207-211,共5页
Objective:To investigate the infection of Fasciola gigantka(F.gigantka)in domestic cattle from Chiang Mai province and molecular confirmation using ITS-2 region.Methods:The liver and gall bladder of Bubalus bubalis(B.... Objective:To investigate the infection of Fasciola gigantka(F.gigantka)in domestic cattle from Chiang Mai province and molecular confirmation using ITS-2 region.Methods:The liver and gall bladder of Bubalus bubalis(B.bubalis)and Bos taurus(B.taunts)from slaughterhouses were examined adult worms and prevalence investigation.The species confirmation with phylogenetic analysis using ITS-2 sequences was performed by maximum likelihood and UPGMA methods.Results:The total prevalences of infection in B.bubalis and Bubalus taurus(B.taurus)were67.27%and 52.94%respectively.The respective prevalence in both B.bubalis and B.taurus were acquired from Doi-Saket,Muang,and Sanpatong districts,with 81.25%,62.50%and 60.00%for B.bubalis and 62.50%,50.00%and 47.06%for Bos taunts respectively.The species confirmation of F.gigantka and some related species by basing on maximum likelihood and UPGMA methods used,4 groups of trematodes were generated,first F.gigantka group including specimen of Chiang Mai,second 2 samples of F.hepatica,third group of 3 rumen flukes;Orthocoelium streptocoelium,F.elongatus and Paramphistomum epliclitum and fourth group of 3 minute intestinal flukes:Haplorchis taichui,Stellantchasmu falcatus.Haplorchoides sp.and liver fluke;Opisthorchis civerrini respectively.Conclusions:These results can be confirmed the Giant liver fluke which mainly caused fascioliasis in Chiang Mai was identified as F.gigantka and specimens were the same as those of F.gigantka recorded in olher different countries.Nucleotide sequence of ITS-2 region has been proven as effective diagnostic tool for the identification of F.gigantka. 展开更多
关键词 FASCIOLA gigantica Domestic cattle Chiang MAI MOLECULAR CONFIRMATION its-2 REGION
下载PDF
PCR Amplication and Sequencing of ITS-2 rDNA of Leucocytozoon caulleryi
12
作者 LIGuo-qing XUEHong ZHUXing-quan 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2003年第5期573-577,共5页
The second internal transcribed spacer (ITS-2) of Leucocytozoon caulleryi was amplified by PCR using a pair of conserved primers and cloned into the T-T windows of plasmid pGEM-T easy vector. The inserts were successf... The second internal transcribed spacer (ITS-2) of Leucocytozoon caulleryi was amplified by PCR using a pair of conserved primers and cloned into the T-T windows of plasmid pGEM-T easy vector. The inserts were successfully sequenced and the results revealed that the ITS-2 plus flanking sequence (ITS2+) was composed of 270 nucleotides. and the ITS-2 was 113 bp in length. The ITS-2 of L. caulleryi was analysed by NCBI Blast, and the degree of homology of the ITS-2 of L. caulleryi was compared with that of Eimeria tenella , Candida tropicalis and Saccharomyces kluyveri and others by wDNASIS. The results showed that the ITS-2 of L. caulleryi is characteristic and has the greatest similarity with E. tenella (21.2%). 展开更多
关键词 Leucocytozoon caulleryi its-2 PCR CLONING SEQUENCING
下载PDF
陕西省榆林地区鸡蛔虫核糖体18S rRNA与ITS-2序列分析及种系发育关系研究
13
作者 崔巍山 李中波 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2023年第10期86-92,共7页
为了探究陕西省榆林地区鸡蛔虫核糖体18S rRNA、ITS-2基因序列特征及其种系发育关系,试验以采集于该地区的28条鸡蛔虫为样品,PCR扩增其18S rRNA、ITS-2基因的部分序列,测序后分别对鸡蛔虫18S rRNA、ITS-2基因序列的碱基组成进行分析,计... 为了探究陕西省榆林地区鸡蛔虫核糖体18S rRNA、ITS-2基因序列特征及其种系发育关系,试验以采集于该地区的28条鸡蛔虫为样品,PCR扩增其18S rRNA、ITS-2基因的部分序列,测序后分别对鸡蛔虫18S rRNA、ITS-2基因序列的碱基组成进行分析,计算A、T、G和C的含量,并对这两个基因的遗传多样性进行分析,比较其种内、种间差异,构建种系发育树。结果表明:测序所获得的鸡蛔虫18S rRNA、ITS-2基因序列的长度分别为637,350 bp;其中18S rRNA基因序列的A、T、G和C的含量分别为24.5%~25.2%、26.1%~26.4%、28.3%~28.7%和20.3%~20.9%,A+T含量为50.6%~51.6%,G+C含量为48.6%~49.6%,种内差异为0~1.6%;与猪蛔虫(MF358962)、人蛔虫(LC422643)、犬弓首蛔虫(FJ418788)及狮弓蛔虫(JF837179)种间差异为5.18%~61.38%;ITS-2基因序列中的A、T、G和C的含量分别为28.9%~29.1%、38.0%~38.6%、19.1%~19.7%与12.9%~13.7%,A+T含量为66.9%~67.7%,G+C含量为32.0%~33.4%,种内差异为0~2.3%,与猪蛔虫(MF358962)、人蛔虫(LC422643)、犬弓首蛔虫(FJ418788)及狮弓蛔虫(JF837179)种间差异为55.95%~58.42%。此外,所构建的两个种系发育树具有类似的拓扑结构,均显示来自于陕西省榆林地区的28条鸡蛔虫共同聚为一个分支。说明来自于陕西省榆林地区鸡蛔虫的ITS-2序列呈AT偏好,其18S rRNA、ITS-2基因序列均具有种内差异小而种间差异大的特点,且个体之间存在一定程度的遗传差异,但它们之间的亲缘关系较近。 展开更多
关键词 鸡蛔虫 18S rRNA its-2 遗传多样性 种系发育
原文传递
根据rRNA基因ITS-2序列研究舌蝇属的种系发生 被引量:2
14
作者 陈小爱 李嵩 +2 位作者 李昌本 赵寿元 SerapAksoy 《中国科学(C辑)》 CSCD 1999年第3期283-290,共8页
舌蝇又称采采蝇 ,是传播非洲锥虫病 (又称非洲睡眠病 )的重要媒介 .采用PCR方法得到的不同种采采蝇的核糖体DNA内部转录间隔序列 2 (ITS 2 )来分析采采蝇的种系发生 .用简约法 (parsimony)产生的进化树证实了所有采采蝇的单源种类发生... 舌蝇又称采采蝇 ,是传播非洲锥虫病 (又称非洲睡眠病 )的重要媒介 .采用PCR方法得到的不同种采采蝇的核糖体DNA内部转录间隔序列 2 (ITS 2 )来分析采采蝇的种系发生 .用简约法 (parsimony)产生的进化树证实了所有采采蝇的单源种类发生并且表明Austenina亚属最早分化 ,然后依次是Glossina和Nemorhina亚属 .经典的形态和生化分类法对Glossinaausteni的进化地位一直有争议 .通过ITS 2位点序列的分析 ,认为G .austeni可以成为独立的亚属和Glossina亚属成为姊妹亚属关系 . 展开更多
关键词 its-2 舌蝇属 种系发生 RRNA 基因 双翅目
原文传递
11株螨虫分离株的ITS-2序列分析与系统关系研究 被引量:6
15
作者 古小彬 张晓谦 +2 位作者 杨光友 贾小勇 王帅 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期235-242,共8页
为探讨动物体上一些常见寄生螨虫的分类地位,对11株螨虫分离株的核糖体第二内部转录间隔区(ITS-2)基因序列进行测定,并从GenBank下载21条螨虫的ITS-2序列,用UPGMA法构建分子系统树。序列分析结果显示:6株疥螨分离株ITS-2基因全... 为探讨动物体上一些常见寄生螨虫的分类地位,对11株螨虫分离株的核糖体第二内部转录间隔区(ITS-2)基因序列进行测定,并从GenBank下载21条螨虫的ITS-2序列,用UPGMA法构建分子系统树。序列分析结果显示:6株疥螨分离株ITS-2基因全长均为361bp,含有335个保守性位点,15个变异位点和9个简约信息位点;序列间的同源性为96.9%~99.7%。5株足螨分离株ITS-2基因存在长度上的变异(225~232bp),序列中包括184个保守性位点,44个变异位点,9个简约信息位点;分离自黄牛和奶牛的4株足螨分离株的ITS-2序列同源性为92.4%~97.3%,而熊猫足螨分离株同黄牛、奶牛足螨分离株的同源性较低(78.7%~82.6%)。UPGMA显示:32株螨虫分离株分成2个支系,第1个支系包括疥螨科的疥螨属Sarcoptes和背肛螨属Notoedres;第2个支系包括痒螨科的足螨属Chorioptes和痒螨属Psoroptes。从分析结果来看,笔者支持疥螨的单种说法;而足螨属中分离自熊猫的足螨和痒螨属中分离自水牛的痒螨的分类地位还有待进一步探讨。 展开更多
关键词 螨虫分离株 核糖体its-2基因 序列分析 分子系统发生
下载PDF
鸡后口吸虫的形态学特征及分子鉴定
16
作者 包敏 宋铭忻 《动物医学进展》 北大核心 2024年第5期30-33,共4页
许多地方都报道过鸡盲肠中的吸虫,但对其详细的形态学和分子鉴定的研究较少。为对辽宁锦州地区家鸡盲肠中分离到的数条吸虫做虫种鉴定,观察了其成虫和虫卵的形态学特征,对成虫和虫卵进行了分子生物学分析。结果显示,分离到的吸虫形态呈... 许多地方都报道过鸡盲肠中的吸虫,但对其详细的形态学和分子鉴定的研究较少。为对辽宁锦州地区家鸡盲肠中分离到的数条吸虫做虫种鉴定,观察了其成虫和虫卵的形态学特征,对成虫和虫卵进行了分子生物学分析。结果显示,分离到的吸虫形态呈舌状,口吸盘和咽部十分发达,食道短,2条盲肠弯曲,伸达到虫体的末端。睾丸前后排列于虫体的后部,卵巢位于睾丸的对侧。卵黄腺发达,直伸到虫体前部。虫卵淡黄色,呈芝麻状,有卵盖,卵内含有毛蚴。形态学观察鉴定为鸡后口吸虫。利用PCR扩增该吸虫的rDNA ITS序列,测序后经NCBI数据库比对分析,测序所得序列与鸡后口吸虫(MH915391)的序列相似性为99.76%;基于ITS-2序列构建系统进化树,分析显示分离的吸虫与鸡后口吸虫聚集在同一个分支。结果表明,病鸡盲肠中分离鉴定出鸡后口吸虫,为该虫的分子检测提供依据。 展开更多
关键词 鸡后口吸虫 形态学鉴定 分子生物学分析 its-2序列
下载PDF
小熊猫槽盘吸虫的形态学鉴定及分子进化研究
17
作者 张爱辉 胡春波 +4 位作者 魏伟 毛瑞峰 贾斌 王春仁 高俊峰 《云南畜牧兽医》 2024年第1期9-13,共5页
为鉴定我国黑龙江省分离的小熊猫肠道吸虫的种类及确定其在复殖吸虫中的分类地位,本研究首先对分离的吸虫进行染色制作虫体装片,根据虫体形态学特征初步鉴定为小熊猫槽盘吸虫。采用PCR方法扩增该吸虫的rDNA ITS序列,测序后与NCBI数据库... 为鉴定我国黑龙江省分离的小熊猫肠道吸虫的种类及确定其在复殖吸虫中的分类地位,本研究首先对分离的吸虫进行染色制作虫体装片,根据虫体形态学特征初步鉴定为小熊猫槽盘吸虫。采用PCR方法扩增该吸虫的rDNA ITS序列,测序后与NCBI数据库中相关序列进行比对分析。结果表明,本研究分离的吸虫rDNA ITS序列全长为936 bp,其中ITS-1、5.8S和ITS-2序列分别为518 bp、126 bp和292 bp,与NCBI数据库中鹿槽盘吸虫(Ogmocotyle sikae)的同源性达到94.9%。最后,基于rDNA ITS-2序列构建系统发生树,探讨本研究中分离的吸虫在复殖吸虫中的分类地位。进化分析结果表明,在复殖目吸虫的分支中,本次分离的小熊猫肠道吸虫与槽盘属吸虫处于同一分支,因此鉴定本研究分离的吸虫为小熊猫槽盘吸虫。研究填补了槽盘吸虫的分子数据,为小熊猫槽盘吸虫病的流行及防控提供依据。 展开更多
关键词 小熊猫槽盘吸虫 形态学 rDNA its-2序列 进化分析
下载PDF
魁蚶核糖体DNA基因转录间隔区的序列特征 被引量:27
18
作者 陈琳琳 孔晓瑜 +2 位作者 周立石 陈丽梅 喻子牛 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期104-108,共5页
以相应引物PCR扩增魁蚶(Scapharcabroughtonii)的核糖体转录间隔子ITS 1和ITS 2片段,测序后得到长度分别为461bp和533bp的核苷酸序列(含引物)。其中A、T、G、C4种碱基的含量分别为21 91%、24 73%、28 20%和25 16%(ITS 1),27 02%、25 52%... 以相应引物PCR扩增魁蚶(Scapharcabroughtonii)的核糖体转录间隔子ITS 1和ITS 2片段,测序后得到长度分别为461bp和533bp的核苷酸序列(含引物)。其中A、T、G、C4种碱基的含量分别为21 91%、24 73%、28 20%和25 16%(ITS 1),27 02%、25 52%、25 52%和21 95%(ITS 2)。将这2个片段与其他双壳贝类的相应片段进行比较,发现ITS 1和ITS 2引物在贝类中具有良好的通用性。比较几种贝类的ITS 1片段发现有1~100bp长度不等、弥散状态的插入/缺失;对5种蚶科贝类的ITS 2相应片段进行比较,发现中间有75bp的保守区域,与本研究在魁蚶ITS 2群体序列研究中观察到的情况相同。 展开更多
关键词 魁蚶 核苷酸序列 its-1 its-2
下载PDF
栉孔扇贝核糖体DNA转录间隔子序列研究及其潜在应用(英文) 被引量:18
19
作者 喻子牛 孔晓瑜 +2 位作者 庄志猛 刘亚军 宋林生 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期6-9,共4页
以相应引物PCR扩增栉孔扇贝 (Chlamysfarreri)核基因组的核糖体DNA两个转录间隔子 (ITS - 1和ITS - 2 ) ,PCR产物经T载体连接后进行克隆、测序 ,分别得到了 340bp和 510bp的碱基序列 ,序列大小非常适合遗传变异及分子系统学研究。其A、T... 以相应引物PCR扩增栉孔扇贝 (Chlamysfarreri)核基因组的核糖体DNA两个转录间隔子 (ITS - 1和ITS - 2 ) ,PCR产物经T载体连接后进行克隆、测序 ,分别得到了 340bp和 510bp的碱基序列 ,序列大小非常适合遗传变异及分子系统学研究。其A、T、G、C含量在ITS - 1分别为 32 .0 6 % ,2 0 .59% ,2 2 .35%和2 5.0 0 % ,在ITS - 2分别为 30 .0 0 % ,2 1.37% 2 4 .12 %和 2 4 .51%。这两个变异性较大的序列在扇贝种群中应用潜力很大 ,可广泛用于种内群体间遗传变异研究、种质鉴别及系统学研究。 展开更多
关键词 栉孔扇贝 its-1 its-2 基因序列 核糖体DNA 转录间隔子
下载PDF
荧光定量PCR检测异尖线虫类病原体 被引量:10
20
作者 张少雷 王何兰 +3 位作者 刘江 倪芳 徐世三 罗大民 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第3期194-199,共6页
目的运用荧光定量PCR法检测异尖线虫类病原体。方法于鱼类内脏中检获6种异尖线虫类幼虫:抹香鲸异尖线虫、简单异尖线虫、内弯对盲囊线虫、带鱼针蛔线虫、灰海鳗对盲囊线虫和台湾海峡鱼类中一优势种对盲囊线虫。提取各虫体DNA,PCR扩增IT... 目的运用荧光定量PCR法检测异尖线虫类病原体。方法于鱼类内脏中检获6种异尖线虫类幼虫:抹香鲸异尖线虫、简单异尖线虫、内弯对盲囊线虫、带鱼针蛔线虫、灰海鳗对盲囊线虫和台湾海峡鱼类中一优势种对盲囊线虫。提取各虫体DNA,PCR扩增ITS-2序列,测序并进行数据库比对。依据测序结果设计特异引物,常规PCR检验引物特异性。将ITS-2序列扩增产物回收、纯化后经T克隆转入大肠埃希菌DH5α,提取重组质粒,鉴定后作为标准品模板建立荧光定量PCR标准曲线,并做敏感性和重复性试验。结果构建的荧光定量PCR标准曲线循环阈值与模板浓度呈良好的线性关系,相关系数均在0.998以上。重复性实验中,6种虫体对应的变异系数(cv)最小值为0.18%,最大值为2.80%,试验间平均cv最小值为0.55%,最大值为1.94%,无非特异性扩增,溶解曲线的特异性和重复性良好。灵敏度实验中,可检出的最低模板浓度为1×102拷贝/μl,比常规PCR灵敏度高100倍。结论初步建立了SYBRGreenⅠ荧光定量PCR检测异尖线虫类病原体的方法 。 展开更多
关键词 异尖线虫病 异尖线虫 its-2序列 荧光定量PCR SYBRGreenⅠ
下载PDF
上一页 1 2 下一页 到第
使用帮助 返回顶部