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脑膜炎大肠杆菌IbeA蛋白结合肽序列的亲和筛选
被引量:
1
1
作者
曹虹
林琳
+4 位作者
刘北一
陈丽丹
杨军
贡树基
李明
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第5期101-106,共6页
应用噬菌体展示肽库技术,以重组的脑膜炎大肠杆菌致病蛋白IbeA作为靶分子,经过吸附-洗脱-扩增-再吸附的亲和筛选,随机挑选亲和力强的噬菌体克隆,进行ELISA、竞争抑制实验和序列测定。结果显示,经3轮淘选后,间接ELISA鉴定得到高亲和性结...
应用噬菌体展示肽库技术,以重组的脑膜炎大肠杆菌致病蛋白IbeA作为靶分子,经过吸附-洗脱-扩增-再吸附的亲和筛选,随机挑选亲和力强的噬菌体克隆,进行ELISA、竞争抑制实验和序列测定。结果显示,经3轮淘选后,间接ELISA鉴定得到高亲和性结合IbeA蛋白的15个阳性克隆。竞争抑制实验结果表明,游离IbeA蛋白能竞争抑制噬菌体结合肽克隆与固相包被的IbeA蛋白的结合,其抑制作用随游离IbeA蛋白浓度的降低而减弱。测序结果得到5种阳性噬菌体克隆展示肽序列。上述结果提示以脑膜炎大肠杆菌IbeA蛋白为靶筛选所获得的噬菌体12肽克隆,具有特异性,其结合肽序列呈现相对保守性。建立的从噬菌体随机肽库筛选IbeA蛋白结合肽的方法具有方便、灵活和高效可行的特点。
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关键词
噬菌体展示肽库
脑膜炎大肠杆菌
ibea蛋白
结合肽
亲和筛选
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职称材料
肠上皮细胞中大肠杆菌侵袭素IbeA结合蛋白的分离
被引量:
1
2
作者
惠长野
郭妍
+3 位作者
李珺
郝小燕
曹虹
黄胜和
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第12期2375-2378,共4页
目的分离肠上皮Caco-2细胞中与IbeA相互作用的蛋白。方法表达并纯化重组IbeA,将1、5、10μg/ml的His-IbeA及牛血清白蛋白与Caco-2单层细胞4℃孵育30min后,在37℃利用庆大霉素保护实验测定各组大肠杆菌K1致病株E44侵袭率的变化。裂解Cac...
目的分离肠上皮Caco-2细胞中与IbeA相互作用的蛋白。方法表达并纯化重组IbeA,将1、5、10μg/ml的His-IbeA及牛血清白蛋白与Caco-2单层细胞4℃孵育30min后,在37℃利用庆大霉素保护实验测定各组大肠杆菌K1致病株E44侵袭率的变化。裂解Caco-2得全细胞蛋白,上样至结合有His-IbeA的金属离子螯和柱,His pull down纯化特异性结合蛋白,电泳分析,Far-Western blotting进行两者结合特异性的验证,并分析结合蛋白N末端氨基酸序列。结果重组IbeA阻断E44侵袭Caco-2,并呈一定剂量依赖关系,对照组BSA对侵袭没有显著影响。His pull down的方法纯化出两个结合条带,Far-Western blotting验证了结合的特异性。并测定强结合条带pI约5.0,N端序列为MASITKLP。结论分离得到两个与IbeA相互作用的蛋白,为研究IbeA分子致病机制奠定了基础。
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关键词
CACO-2细胞
ibea蛋白
侵袭
结合
蛋白
纯化
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职称材料
脑膜炎大肠埃希菌侵袭素IbeA结合多肽的初步研究
被引量:
1
3
作者
曹虹
陈丽丹
+4 位作者
林琳
刘北一
杨军
贡树基
李明
《免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第6期618-622,共5页
目的脑膜炎大肠埃希菌(E.coli)侵袭素IbeA通过与脑微血管内皮细胞表面受体结合,从而介导细菌穿透血脑屏障引起新生儿细菌性脑膜炎。为通过肽库筛选获得与IbeA蛋白结合的多肽,建立噬菌体随机肽库筛选IbeA结合多肽模体的方法。方法首先制...
目的脑膜炎大肠埃希菌(E.coli)侵袭素IbeA通过与脑微血管内皮细胞表面受体结合,从而介导细菌穿透血脑屏障引起新生儿细菌性脑膜炎。为通过肽库筛选获得与IbeA蛋白结合的多肽,建立噬菌体随机肽库筛选IbeA结合多肽模体的方法。方法首先制备靶分子,用PCR扩增出全长ibeA基因序列,克隆至表达载体pET28a中,转化大肠埃希菌BL21(DE3),经IPTG诱导表达出带有His-tag的目的蛋白,经变性复性后通过Ni2+-NTA亲和层析柱得到纯度达90%的重组蛋白。然后以固相化IbeA重组蛋白为靶亲和筛选噬菌体线性12肽库。结果经过3轮淘选,得到能和IbeA结合的24个重组噬菌体克隆;挑选15个亲和力高的克隆进行DNA测序,对比分析所得的短肽序列。固相Fmoc法合成短肽,并进行结合实验、阻断实验和竞争抑制实验。结论以重组表达的IbeA融合蛋白为靶筛选得到的重组噬菌体十二肽克隆,能够和IbeA蛋白结合,为IbeA蛋白结合多肽。结果提示所筛选的阳性噬菌体克隆及其合成肽可能模拟IbeA受体表位的结构。
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关键词
脑膜炎大肠杆菌
ibea蛋白
表达
噬菌体展示肽库
结合多肽
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职称材料
脑膜炎大肠杆菌新基因cglE的克隆、表达及功能分析
被引量:
5
4
作者
陈丽丹
曹虹
+3 位作者
黄胜和
杨军
周浩
贡树基
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第5期419-422,共4页
目的研究脑膜炎大肠杆菌新基因cglE在细菌穿透血脑屏障中的作用。方法1)PCR扩增cglE基因片段,克隆到原核表达载体pET22b,转化大肠埃希菌BL21(DE3),IPTG诱导表达并对目的蛋白进行纯化及初步鉴定。2)应用生物信息学方法对cglE表达产物进...
目的研究脑膜炎大肠杆菌新基因cglE在细菌穿透血脑屏障中的作用。方法1)PCR扩增cglE基因片段,克隆到原核表达载体pET22b,转化大肠埃希菌BL21(DE3),IPTG诱导表达并对目的蛋白进行纯化及初步鉴定。2)应用生物信息学方法对cglE表达产物进行一级和二级结构预测。结果经Western-blot验证原核表达的CglE蛋白,SDS-PAGE电泳显示其分子量大小约50 000 Da。生物信息学分析表明,该基因与编码二氢硫辛酰胺脱氢酶(Dihydrolipoamide Ddhydrogenase,DLDH)的基因有同源性,与脑膜炎大肠杆菌侵袭素IbeA在二级结构上有相似性。结论建立稳定的原核表达系统并成功表达cglE基因产物,cglE基因可能与能量代谢及细菌穿透血脑屏障有关。目的蛋白CglE的表达及初步鉴定可为研究其功能及脑膜炎大肠杆菌的感染组学奠定了良好的基础。
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关键词
脑膜炎
大肠杆菌
cglE
ibea蛋白
表达
生物信息学
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职称材料
题名
脑膜炎大肠杆菌IbeA蛋白结合肽序列的亲和筛选
被引量:
1
1
作者
曹虹
林琳
刘北一
陈丽丹
杨军
贡树基
李明
机构
南方医科大学公共卫生与热带医学学院微生物学教研室
南方医科大学基础医学院免疫学教研室
南方医科大学生物技术学院
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第5期101-106,共6页
基金
东省自然科学基金重点项目(No.C020094)
文摘
应用噬菌体展示肽库技术,以重组的脑膜炎大肠杆菌致病蛋白IbeA作为靶分子,经过吸附-洗脱-扩增-再吸附的亲和筛选,随机挑选亲和力强的噬菌体克隆,进行ELISA、竞争抑制实验和序列测定。结果显示,经3轮淘选后,间接ELISA鉴定得到高亲和性结合IbeA蛋白的15个阳性克隆。竞争抑制实验结果表明,游离IbeA蛋白能竞争抑制噬菌体结合肽克隆与固相包被的IbeA蛋白的结合,其抑制作用随游离IbeA蛋白浓度的降低而减弱。测序结果得到5种阳性噬菌体克隆展示肽序列。上述结果提示以脑膜炎大肠杆菌IbeA蛋白为靶筛选所获得的噬菌体12肽克隆,具有特异性,其结合肽序列呈现相对保守性。建立的从噬菌体随机肽库筛选IbeA蛋白结合肽的方法具有方便、灵活和高效可行的特点。
关键词
噬菌体展示肽库
脑膜炎大肠杆菌
ibea蛋白
结合肽
亲和筛选
Keywords
Phage display pepfide library, Meningitic E. coli
ibea
protein, Binding-pepfide, Affinity screening
分类号
R91 [医药卫生—药学]
下载PDF
职称材料
题名
肠上皮细胞中大肠杆菌侵袭素IbeA结合蛋白的分离
被引量:
1
2
作者
惠长野
郭妍
李珺
郝小燕
曹虹
黄胜和
机构
南方医科大学公共卫生与热带医学学院微生物学系
中国科学院深圳先进技术研究院
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第12期2375-2378,共4页
基金
国家自然科学基金(30972637)
文摘
目的分离肠上皮Caco-2细胞中与IbeA相互作用的蛋白。方法表达并纯化重组IbeA,将1、5、10μg/ml的His-IbeA及牛血清白蛋白与Caco-2单层细胞4℃孵育30min后,在37℃利用庆大霉素保护实验测定各组大肠杆菌K1致病株E44侵袭率的变化。裂解Caco-2得全细胞蛋白,上样至结合有His-IbeA的金属离子螯和柱,His pull down纯化特异性结合蛋白,电泳分析,Far-Western blotting进行两者结合特异性的验证,并分析结合蛋白N末端氨基酸序列。结果重组IbeA阻断E44侵袭Caco-2,并呈一定剂量依赖关系,对照组BSA对侵袭没有显著影响。His pull down的方法纯化出两个结合条带,Far-Western blotting验证了结合的特异性。并测定强结合条带pI约5.0,N端序列为MASITKLP。结论分离得到两个与IbeA相互作用的蛋白,为研究IbeA分子致病机制奠定了基础。
关键词
CACO-2细胞
ibea蛋白
侵袭
结合
蛋白
纯化
Keywords
Caco-2
ibea
invasion
binding protein
purification
分类号
R378.21 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
脑膜炎大肠埃希菌侵袭素IbeA结合多肽的初步研究
被引量:
1
3
作者
曹虹
陈丽丹
林琳
刘北一
杨军
贡树基
李明
机构
南方医科大学公共卫生与热带医学学院微生物学系
南方医科大学基础医学院
南方医科大学生物技术学院
出处
《免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第6期618-622,共5页
基金
广东省自然科学基金重点项目(C020094)
文摘
目的脑膜炎大肠埃希菌(E.coli)侵袭素IbeA通过与脑微血管内皮细胞表面受体结合,从而介导细菌穿透血脑屏障引起新生儿细菌性脑膜炎。为通过肽库筛选获得与IbeA蛋白结合的多肽,建立噬菌体随机肽库筛选IbeA结合多肽模体的方法。方法首先制备靶分子,用PCR扩增出全长ibeA基因序列,克隆至表达载体pET28a中,转化大肠埃希菌BL21(DE3),经IPTG诱导表达出带有His-tag的目的蛋白,经变性复性后通过Ni2+-NTA亲和层析柱得到纯度达90%的重组蛋白。然后以固相化IbeA重组蛋白为靶亲和筛选噬菌体线性12肽库。结果经过3轮淘选,得到能和IbeA结合的24个重组噬菌体克隆;挑选15个亲和力高的克隆进行DNA测序,对比分析所得的短肽序列。固相Fmoc法合成短肽,并进行结合实验、阻断实验和竞争抑制实验。结论以重组表达的IbeA融合蛋白为靶筛选得到的重组噬菌体十二肽克隆,能够和IbeA蛋白结合,为IbeA蛋白结合多肽。结果提示所筛选的阳性噬菌体克隆及其合成肽可能模拟IbeA受体表位的结构。
关键词
脑膜炎大肠杆菌
ibea蛋白
表达
噬菌体展示肽库
结合多肽
Keywords
Meningitic E. coil
ibea
protein
Expression
Phage display peptide library
Binding peptide
分类号
R378 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
脑膜炎大肠杆菌新基因cglE的克隆、表达及功能分析
被引量:
5
4
作者
陈丽丹
曹虹
黄胜和
杨军
周浩
贡树基
机构
南方医科大学微生物学教研室
Childrens Hospital Los Angele California CA
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第5期419-422,共4页
基金
广东省自然科学基金重点项目(C020094)
文摘
目的研究脑膜炎大肠杆菌新基因cglE在细菌穿透血脑屏障中的作用。方法1)PCR扩增cglE基因片段,克隆到原核表达载体pET22b,转化大肠埃希菌BL21(DE3),IPTG诱导表达并对目的蛋白进行纯化及初步鉴定。2)应用生物信息学方法对cglE表达产物进行一级和二级结构预测。结果经Western-blot验证原核表达的CglE蛋白,SDS-PAGE电泳显示其分子量大小约50 000 Da。生物信息学分析表明,该基因与编码二氢硫辛酰胺脱氢酶(Dihydrolipoamide Ddhydrogenase,DLDH)的基因有同源性,与脑膜炎大肠杆菌侵袭素IbeA在二级结构上有相似性。结论建立稳定的原核表达系统并成功表达cglE基因产物,cglE基因可能与能量代谢及细菌穿透血脑屏障有关。目的蛋白CglE的表达及初步鉴定可为研究其功能及脑膜炎大肠杆菌的感染组学奠定了良好的基础。
关键词
脑膜炎
大肠杆菌
cglE
ibea蛋白
表达
生物信息学
Keywords
meningitis
E. coil
cglE
ibea
protein expression
bioinformaties.
分类号
R378.2 [医药卫生—病原生物学]
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职称材料
题名
作者
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被引量
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1
脑膜炎大肠杆菌IbeA蛋白结合肽序列的亲和筛选
曹虹
林琳
刘北一
陈丽丹
杨军
贡树基
李明
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2006
1
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职称材料
2
肠上皮细胞中大肠杆菌侵袭素IbeA结合蛋白的分离
惠长野
郭妍
李珺
郝小燕
曹虹
黄胜和
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
1
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职称材料
3
脑膜炎大肠埃希菌侵袭素IbeA结合多肽的初步研究
曹虹
陈丽丹
林琳
刘北一
杨军
贡树基
李明
《免疫学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2006
1
下载PDF
职称材料
4
脑膜炎大肠杆菌新基因cglE的克隆、表达及功能分析
陈丽丹
曹虹
黄胜和
杨军
周浩
贡树基
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2006
5
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职称材料
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