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一株深海细菌Idiomarina sp.406-6的微生物学特征分析 被引量:1
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作者 陈国忠 潘云军 +2 位作者 王文泽 林慧媛 张燕娇 《青岛农业大学学报(自然科学版)》 2017年第1期27-33,共7页
从印度洋海区水深为4 517m的深海泥样中筛选到一株细菌,菌株号为406-6。通过形态学特征和生理生化特征分析表明,菌株406-6为革兰氏阴性菌,细胞呈稍微弯曲的棒状。菌落为乳白色,圆形。菌株406-6生长需要NaCl,62℃时生长微弱,能利用小分... 从印度洋海区水深为4 517m的深海泥样中筛选到一株细菌,菌株号为406-6。通过形态学特征和生理生化特征分析表明,菌株406-6为革兰氏阴性菌,细胞呈稍微弯曲的棒状。菌落为乳白色,圆形。菌株406-6生长需要NaCl,62℃时生长微弱,能利用小分子的甘氨酸作为唯一碳源生长,但不能利用L-阿拉伯糖、D-木糖、D-葡萄糖、D-半乳糖、D-甘露糖、蔗糖、D-甘露醇、D-海藻糖和D-纤维二糖作为唯一碳源。能水解酪素、明胶、脱脂奶粉、Tween 40和Tween 60,但是不能水解淀粉、Tween 20和Tween 80。16SrRNA基因序列比对分析表明,菌株406-6与Idiomarina属的I.fontislapidosi F23~T相似性最高(98.0%),和其他属的相似性均低于94.0%。Neighbor-joining系统树中,菌株406-6和Idiomarina属内的菌种相聚成簇。基于以上微生物学特征分析表明,406-6为Idiomarina属内的一个潜在的细菌新物种,该研究丰富了Idiomarina属的物种多样性,为微生物资源的开发利用奠定基础。 展开更多
关键词 深海 idiomarina sp. 微生物学特征
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Purification and characterization of glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase from saline strain Idiomarina loihiensis
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作者 Ilham Mardad Tarik Baibai +1 位作者 Emna Ammar Abdelaziz Soukri 《Advances in Biological Chemistry》 2013年第2期170-176,共7页
Idiomarina loihiensis was isolated from the salt works in Sfax (Tunisia), until now, the characterization of the GAPDH phosphorylante was never studied. Here, we report the isolation and the biochemical characterizati... Idiomarina loihiensis was isolated from the salt works in Sfax (Tunisia), until now, the characterization of the GAPDH phosphorylante was never studied. Here, we report the isolation and the biochemical characterization of glyceralehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) fromI. loihiensis saline’s bacteria on the basis of the apparent native and subunit molecular weights, physico-chemical and kinetic characterizations. The purification method consisted of two steps, ammonium sulfate fractionation followed by one chromatographic step, namely dye-affinity on Blue Sepharose CL-6B. Polyclonal antibodies against the purified enzyme were used to recognize theI. loihiensis GAPDH by Western blotting. The optimum pH of the purified enzyme was 8.5. Studies on the effect of temperatures revealed an enzyme increasing activity of about 45?C. The molecular weight of the purified enzyme was 36 kDa determined by sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis. Non-denaturing polyacrylamide gels yield a molecular weight of 147 kDa. The Michaelis constants for NAD+ and D-glyceraldehyde-3-phosphate estimated was 19 μM and 3.1 μM, respectively. The maximal velocity of the purified enzyme was estimated to be 2.06 U/mg, approximately 6-fold increase in specific activity and a final yield of approximately 32.5%. The physicochemical properties of this GAPDH, being characterized, could be used in further studies. 展开更多
关键词 Glyceraldehyde-3-Phosphate DEHYDROGENASE idiomarina loihiensis Purification NAD^(+) Kinetics Saline Strain
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一株高产酯酶中度嗜盐菌的分离、鉴定及酯酶部分酶学性质的研究 被引量:10
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作者 董伟 郭立忠 +2 位作者 李翠翠 王琳 卢伟东 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期479-483,共5页
利用平板筛选法从盐场卤水池中筛选到一株高效降解Tween20的中度嗜盐菌DF-B6菌株。通过形态学、生理生化及16S rDNA序列分析确定该菌株为Idiomarina属的成员。底物特异性实验确定DF-B6菌株分泌的脂裂解酶为酯酶,而非脂肪酶。在含8%NaCl... 利用平板筛选法从盐场卤水池中筛选到一株高效降解Tween20的中度嗜盐菌DF-B6菌株。通过形态学、生理生化及16S rDNA序列分析确定该菌株为Idiomarina属的成员。底物特异性实验确定DF-B6菌株分泌的脂裂解酶为酯酶,而非脂肪酶。在含8%NaCl的0.05mol/L Tris-HCl(pH8.0)缓冲液中,50°C条件下作用,酶活性最高。当反应液中金属离子浓度为10mmol/L时,Mg2+、Ca2+和Mn2+对酶活有激活作用,而Zn2+、Fe3+和Cu2+则对酶反应有抑制作用。 展开更多
关键词 中度嗜盐菌 idiomarina 酯酶 16SrRNA
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甲硫氨酸γ-裂解酶基因在大肠杆菌中的高效表达和活性
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作者 胡海艳 杜少平 +2 位作者 夏枫耿 黄魁英 周世宁 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期3225-3232,共8页
【背景】为了开发海洋蕴藏的新型微生物资源,本研究团队采用不依赖培养的宏基因组技术,构建了深海宏基因组文库,并对其中的重要基因进行后续研究。【目的】使用来自深海宏基因组文库中的甲硫氨酸γ-裂解酶基因(mgl)在大肠杆菌中高效表... 【背景】为了开发海洋蕴藏的新型微生物资源,本研究团队采用不依赖培养的宏基因组技术,构建了深海宏基因组文库,并对其中的重要基因进行后续研究。【目的】使用来自深海宏基因组文库中的甲硫氨酸γ-裂解酶基因(mgl)在大肠杆菌中高效表达并对其活性进行检测。【方法】将mgl基因克隆到表达载体pET-28a(+)并转化大肠杆菌BL21(DE3),经异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导,并对表达条件进行优化,获得甲硫氨酸γ-裂解酶(Methionine-lyase,r MGL)的大量表达。亲和层析纯化重组蛋白后对酶的活性进行研究。【结果】亲和纯化后获得大量表达蛋白r MGL,大小与预测的46 kD相符合,并具有很高的裂解L-甲硫氨酸的活性。rMGL能催化L-甲硫氨酸和DL-同型半胱氨酸的裂解,但几乎不作用于L-半胱氨酸和L-胱氨酸,其中对DL-同型半胱氨酸的催化效率比对L-甲硫氨酸的催化效率高,相对活性约为对L-甲硫氨酸催化效率的1.4倍。【结论】来自深海宏基因组文库中的mgl基因能够利用p ET-28a(+)/BL21(DE3)高效表达rMGL。 展开更多
关键词 宏基因组文库 idiomarina 甲硫氨酸γ-裂解酶 诱导表达 重组蛋白纯化
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