目的:基于尿蛋白组学技术,筛选IgA肾病(IgAN)患者表达差异的蛋白,为探索IgAN发病机制和发现潜在生物标志物提供新的线索。方法:分析IgAN、膜性肾病及健康对照者的尿液蛋白组学数据。将膜性肾病患者和健康者作为对照,筛选出IgAN中差异表...目的:基于尿蛋白组学技术,筛选IgA肾病(IgAN)患者表达差异的蛋白,为探索IgAN发病机制和发现潜在生物标志物提供新的线索。方法:分析IgAN、膜性肾病及健康对照者的尿液蛋白组学数据。将膜性肾病患者和健康者作为对照,筛选出IgAN中差异表达的蛋白。筛选出蛋白Plexin-B2与临床病理指标进行相关性分析。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)对血、尿中Plexin-B2及其配体血管生成素(ANG)表达情况进行检测验证并采用免疫组化检测其在肾脏的表达。结果:与健康对照组相比,质谱法检测的IgAN患者尿液Plexin-B2(uPlexin-B2)表达明显增加,且与总胆固醇(r=0.34,P=0.02)及低密度脂蛋白(r=0.43,P=0.01)呈正相关。uPlexin-B2与节段性肾小球硬化(r=-0.28,P=0.04)呈负相关。ELISA发现IgAN患者uPlexin-B2有升高的趋势。IgAN患者血Ang表达水平明显高于健康对照组(61.97 vs 6.30,P<0.001)。血ANG与肾毛细血管内增殖呈负相关(r=-0.40,P=0.04),与节段性硬化个数呈负相关(r=-0.44,P=0.04)。uPlexin-B2与肾脏球性硬化个数呈负相关(r=-0.95,P=0.01)。Plexin-B2及ANG均在IgAN患者肾小管中高表达。结论:IgAN患者uPlexin-B2升高。Plexin-B2及ANG与IgAN中肾小球硬化显著相关。ANG在IgAN患者血液中明显升高。本研究可能为发现IgAN的潜在生物标志物提供线索,为探索肾脏病理发病机制提供新思路。展开更多
目的应用尿糖蛋白组学寻找尿液中糖基化修饰蛋白质可能和IgA肾病(IgA nephropathy,IgAN)相关的潜在生物学信息,尿蛋白组学可能提示IgAN诊断的生物标志物。方法采用液相色谱-串联质谱(liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC...目的应用尿糖蛋白组学寻找尿液中糖基化修饰蛋白质可能和IgA肾病(IgA nephropathy,IgAN)相关的潜在生物学信息,尿蛋白组学可能提示IgAN诊断的生物标志物。方法采用液相色谱-串联质谱(liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)在数据依赖性采集(data-dependent acquisition,DDA)模式下检测并比较IgAN患者(n=3)和健康对照者(n=3)的尿液糖蛋白质组。通过基因本体(gene ontology,GO)分析、京都基因、基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)对IgAN患者尿液中异表达的糖基化修饰蛋白质进行鉴定并通过网络互作图分析其相互关联性。最后结合目前研究现状,探索差异糖蛋白对IgAN诊断和预后可能存在的生物标志物作用。结果(1)糖蛋白质质谱结果显示,与健康对照组相比,IgAN患者尿液中上调蛋白共39个,且其中包含有11个特异性表达上调的蛋白;差异下调蛋白共149个,其中特异性表达下调蛋白有22个;(2)PPI分析显示140个差异表达蛋白有直接或间接相互作用关系。对各个差异蛋白进行GO功能富集分析显示差异糖蛋白与细胞成分组织、细胞生长的调节、蛋白质结合、O-酰基转移酶活性、多糖结合、胰岛素样生长因子结合及锚定相关。其中有富集的包括细胞黏附分子和代谢相关细胞功能(P<0.05)。参与这些信号通路的差异表达蛋白主要分布在细胞外基质和细胞膜中。KEGG富集显示差异糖蛋白参与生物路径主要包括细胞黏附分子、脂肪细胞因子信号通路、mTOR信号通路、胆固醇代谢、ECM-受体相互作用;(3)差异表达蛋白CCL25、PD-L1、HLA-DRB1、IL7R、CP、AFM和WDR82在PPI互作分析图中连结度较大,这些尿液差异表达蛋白质参与了KEGG所记录的如脂肪细胞因子信号通路,mTOR信号通路,胆固醇代谢通路,细胞黏附分子,P53信号通路,Notch信号通路,Hedgehog信号通路,ECM-受体交互作用通路。结论(1)IgAN患者与健康人群尿液中的糖蛋白表达水平存在明显差异;(2)GO和KEGG分析结果揭示IgAN患者尿液差异糖蛋白涉及与IgAN相关的多种生物功能和途径,基于UHPLC-MS/MS质谱分析的尿糖蛋白质组学可能是诊断IgAN的另一种选择;(3)IgAN诊断判断的潜在生物标志物可能包括但不限于CCL25、PD-L1、HLA-DRB1、IL7R、CP、AFM和WDR82。展开更多
文摘目的:基于尿蛋白组学技术,筛选IgA肾病(IgAN)患者表达差异的蛋白,为探索IgAN发病机制和发现潜在生物标志物提供新的线索。方法:分析IgAN、膜性肾病及健康对照者的尿液蛋白组学数据。将膜性肾病患者和健康者作为对照,筛选出IgAN中差异表达的蛋白。筛选出蛋白Plexin-B2与临床病理指标进行相关性分析。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)对血、尿中Plexin-B2及其配体血管生成素(ANG)表达情况进行检测验证并采用免疫组化检测其在肾脏的表达。结果:与健康对照组相比,质谱法检测的IgAN患者尿液Plexin-B2(uPlexin-B2)表达明显增加,且与总胆固醇(r=0.34,P=0.02)及低密度脂蛋白(r=0.43,P=0.01)呈正相关。uPlexin-B2与节段性肾小球硬化(r=-0.28,P=0.04)呈负相关。ELISA发现IgAN患者uPlexin-B2有升高的趋势。IgAN患者血Ang表达水平明显高于健康对照组(61.97 vs 6.30,P<0.001)。血ANG与肾毛细血管内增殖呈负相关(r=-0.40,P=0.04),与节段性硬化个数呈负相关(r=-0.44,P=0.04)。uPlexin-B2与肾脏球性硬化个数呈负相关(r=-0.95,P=0.01)。Plexin-B2及ANG均在IgAN患者肾小管中高表达。结论:IgAN患者uPlexin-B2升高。Plexin-B2及ANG与IgAN中肾小球硬化显著相关。ANG在IgAN患者血液中明显升高。本研究可能为发现IgAN的潜在生物标志物提供线索,为探索肾脏病理发病机制提供新思路。
文摘目的应用尿糖蛋白组学寻找尿液中糖基化修饰蛋白质可能和IgA肾病(IgA nephropathy,IgAN)相关的潜在生物学信息,尿蛋白组学可能提示IgAN诊断的生物标志物。方法采用液相色谱-串联质谱(liquid chromatography-tandem mass spectrometry,LC-MS/MS)在数据依赖性采集(data-dependent acquisition,DDA)模式下检测并比较IgAN患者(n=3)和健康对照者(n=3)的尿液糖蛋白质组。通过基因本体(gene ontology,GO)分析、京都基因、基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)对IgAN患者尿液中异表达的糖基化修饰蛋白质进行鉴定并通过网络互作图分析其相互关联性。最后结合目前研究现状,探索差异糖蛋白对IgAN诊断和预后可能存在的生物标志物作用。结果(1)糖蛋白质质谱结果显示,与健康对照组相比,IgAN患者尿液中上调蛋白共39个,且其中包含有11个特异性表达上调的蛋白;差异下调蛋白共149个,其中特异性表达下调蛋白有22个;(2)PPI分析显示140个差异表达蛋白有直接或间接相互作用关系。对各个差异蛋白进行GO功能富集分析显示差异糖蛋白与细胞成分组织、细胞生长的调节、蛋白质结合、O-酰基转移酶活性、多糖结合、胰岛素样生长因子结合及锚定相关。其中有富集的包括细胞黏附分子和代谢相关细胞功能(P<0.05)。参与这些信号通路的差异表达蛋白主要分布在细胞外基质和细胞膜中。KEGG富集显示差异糖蛋白参与生物路径主要包括细胞黏附分子、脂肪细胞因子信号通路、mTOR信号通路、胆固醇代谢、ECM-受体相互作用;(3)差异表达蛋白CCL25、PD-L1、HLA-DRB1、IL7R、CP、AFM和WDR82在PPI互作分析图中连结度较大,这些尿液差异表达蛋白质参与了KEGG所记录的如脂肪细胞因子信号通路,mTOR信号通路,胆固醇代谢通路,细胞黏附分子,P53信号通路,Notch信号通路,Hedgehog信号通路,ECM-受体交互作用通路。结论(1)IgAN患者与健康人群尿液中的糖蛋白表达水平存在明显差异;(2)GO和KEGG分析结果揭示IgAN患者尿液差异糖蛋白涉及与IgAN相关的多种生物功能和途径,基于UHPLC-MS/MS质谱分析的尿糖蛋白质组学可能是诊断IgAN的另一种选择;(3)IgAN诊断判断的潜在生物标志物可能包括但不限于CCL25、PD-L1、HLA-DRB1、IL7R、CP、AFM和WDR82。