10种冬青属植物遗传多样性RAPD和AFLPs分析

采用RAPD和AFLP技术,对10种冬青属植物基因组进行DNA片段扩增,以研究该属种间遗传多样性。结果表明:在RAPD分析中,通过对100种10个碱基随机引物的筛选,发现11种引物能得到多态性较高扩增产物,11种引物共扩增出301条多态性条带,多态率为98.63%。在AFLP分析中,3对选择性引物组合均扩增出了丰富的多态性片段。利用RAPD和AFLP技术分析,结果按UPGMA类平均法进行聚类,聚类结果显示冬青和代茶冬青,木姜冬青和浙江冬青以及光枝刺缘冬青与毛枝三花冬青之间的亲缘关系最近。

RFLP、RAPD、AFLP在水稻农垦58S和1514中多态性比较

本文用RFLP、RAPD和AFLP三种分子标记技术对农垦 58SX1 51 4组合及其F2 极性集团进行了分析 ,比较了它们多态性和阳性的比率 ,结果显示 ,三种分子标记的多态性和与目的基因连锁的阳性比率分别为 1 9.93% ,5.2 3% ;1 1 .1 7% ,0 .76%和 86.47% ,7.52 %。AFLP的多态性比率和阳性比率均为最高。

红花RAPD和AFLP分子标记技术多态性效率比较

目的探讨RAPD和AFLP这两种分子标记技术应用于红花不同品系多态性效率的比较。方法以河南无刺大红袍和若羌有刺白两个红花品系为材料，应用100条RAPD引物、64对AFLP引物，对两品系进行多态性筛选，初步确定反映品系间差异的引物。结果筛选到RAPD特异性引物共5条，分别为AA52726、AA52729、AA52739、AA52766、AA52785，在两品系间扩增到稳定的差异片段；筛选到AFLP特异性引物共7对，分别为AF26356、AF26372、AF26385、AF26311、AF26396、AF26327、AF26343，在两品系间扩增到稳定的差异片段。结果表明，平均每条RAPD引物可以扩增出红花基因组片段数目4～10条，多态性选出率为O．20％；平均每对AFLP引物可以扩增出红花基因组片段数目为50～80条，多态性选出率为O．31％。就每条（对）引物平均可以扩增出多态性条带的数目而言，RAPD引物为1～2条，AFLP引物组合则4～5条，AFLP的检测效率明显高于RAPD。结论在红花的分子标记研究中，AFLP较RAPD为更有效的分子标记。

应用RAPD和AFLP标记的方法对甜(辣)椒和番茄品种的多态性分析(英文)

应用 RAPD和 AFL P的 DNA指纹图谱方法分析 2 5个甜 (辣 )椒和 2 2个番茄品种的真实性 ,并进一步比较RAPD和 AFL P的 DNA指纹图谱在鉴定亲缘关系较近的品种之间的真实性时的有效性。对于甜 (辣 )椒品种 ,AFL P方法中 ,2个引物组合扩增反应的多态性片段即能将 2 5个品种完全分开。虽然 ,每个样品的 AFL P的扩增产物中多态性片段的百分率为 9% ,低于 RAPD的 35 %多态性片段的百分率。但是 ,AFL P的信息量远远大于RAPD的信息量 ,它的每对引物组合扩增的平均多态标记为 5 .1,而 RAPD仅为 2 .2。所以 ,在甜 (辣 )椒的指纹图谱中 ,AFL P的有效率是 RAPD的 2倍。对于番茄品种 ,每个样品的 AFL P的扩增产物中多态性片段的百分率为5 .5 % ,大大低于 RAPD的单引物 6 1%多态性片段和双引物 5 8%多态性片段的百分率。它的每对引物组合扩增反应的平均多态标记为 2 .6 ,而 RAPD中 ,单引物扩增的平均多态标记为 4 .2 ,双引物扩增的平均多态标记为 4 .4。一个单引物和一个双引物的 RAPD扩增反应的多态性片段即能将 2 2个番茄品种中的 2 1个完全分开。所以 ,在番茄的指纹图谱中 ,RAPD的有效率是 AFL P的 2倍。因此 ,在应用分子标记辅助鉴定品种的真实性时 ,不同的作物所适用的方法是不同的。

南江黄羊基因组DNA的AFLP和RAPD研究

目的研究南江黄羊遗传多态性和探讨AFLP标记在山羊遗传多态性方面应用的可行性。方法应用RAPD和AFLP两种方法对15只南江黄羊个体基因组DNA进行了分析,并比较两种方法的检测效果。结果RAPD标记检测得到的群体遗传相似系数和多态位点比率分别为0.942和26.98%;AFLP标记检测得到的群体遗传相似系数和多态位点比率分别为0.874和31.4%。结论AFLP方法和RAPD均适合于品系内个体间的遗传检测,并且为准确评价南江黄羊的遗传稳定性提供了相关的参数。

全缘冬青及其变型变种亲缘关系RAPD和AFLP分析

采用RAPD和AFLP技术对8个全缘冬青及其变型变种基因组进行扩增,以研究其物种间亲缘关系及遗传多样性。结果表明:在RAPD分析中,20条引物共扩增出187条多态性条带,多态率为60.75%。在AFLP分析中,10对选择性引物组合共扩增出350条谱带,其中268条具有多态性,占76.57%。综合RAPD和AFLP技术的聚类结果,"小叶枸骨叶"全缘冬青和"小叶密节"全缘冬青亲缘关系较近,全缘冬青和全缘冬青"卵叶密节"亲缘关系最近。这为冬青属植物的杂交育种与种质创新提供理论依据。

苦丁茶冬青的RAPD影响因素及实验条件的优化

以苦丁茶冬青为材料研究随机扩增多态DNA (RAPD)的影响因素及各种实验条件优化。研究结果表明 :模板DNA的浓度适宜范围为 2 0ng 反应～ 80ng 反应RAPD均可得到一致的结果 ;dNTPs的适宜浓度范围为 2 0 0 μmol L～ 4 0 0 μmol L ;Mg2 + 适宜浓度范围为 1 5mmol L～2 0mmol L ;其合适的复性温度为 35～ 37℃ ;2min的延伸时间 ,4 5次热循环。按照此优化的RAPD条件进行重复实验 ,实验结果重现性良好 ,因而确定了苦丁茶冬青RAPD反应体系之最佳的实验条件。

3种分子标记分析油菜品种间的多态性效率比较

应用RAPD、SSR和AFLP三种分子标记,对甘蓝型油菜恢复系垦C1和保持系1141B、32B的多态性进行了分析。在648条RAPD引物、196对SSR引物、414对AFLP引物中,两组合材料具有多态性的引物分别为172条和167条,131对和133对,147对和141对,而重复性好、多态性比率高的引物分别有78条,50对,120对组合;结果表明,平均每个(对)引物可以扩增出多态性片段数目为RAPD2.1个,SSR2.6个,AFLP引物12.7个。AFLP多态性检测效率高。AFLP、SSR是研究油菜遗传多样性比较有效的分子标记。

应用SCAR标记技术对苦丁茶炭疽病抗性进行早期鉴定的构想

讨论了苦丁茶冬青的经济价值及其抗炭疽病育种的必要性和紧迫性;论述了RAPD-SCAR和AFLP-SCAR双重分子标记对苦丁茶抗炭疽病育种的重要意义,以及对苦丁茶冬青炭疽病抗性基因成功进行SCAR标记所必须完成的主要研究内容和必需解决的关键问题;提出了研究方案,并对其可行性进行了分析;预测了此项研究工作的预期结果,并就RAPD-SCAR和AFLP-SCAR双重分子标记技术应用于苦丁茶冬青的抗炭疽病育种工作的创新意义进行了探讨。

26种冬青属植物遗传多样性分析

以26种冬青属植物种质资源为研究材料,利用RAPD和AFLP技术对基因组DNA进行扩增,以研究其物种间遗传多样性以及亲缘关系.结果表明:在RAPD分析中,从400条10个碱基的寡核苷酸引物中筛选出反应稳定、扩增性强、重复性好的引物20个,共扩增出312条多态性条带,多态率为95.41%;聚类分析显示26种冬青属植物间,布利奥特夫人枸骨叶冬青和黄果在AFLP分析中,10对选择性引物组合均扩增出了丰富的多态性片段,共扩增出350条谱带,其中336条具有多态性,占95.96%.综合RAPD和AFLP聚类结果,枸骨、无刺枸骨和日拉斯纳尔逊枸骨的亲缘关系较近,钝齿冬青、金宝石钝齿冬青和龟甲冬青三者的亲缘关系较近,可为冬青属植物的杂交育种与种质创新提供理论依据.

Discriminating ability of molecular markers and morphological characterization in the establishment of genetic relationships in cultivated genotypes of almond and related wild species

A 总数 23 词法特点， 19 AFLP教材联合， 80 份 RAPD 教材和 32 SSR 教材配对被用来比较随机的放大多态的 DNA ( RAPD )的增进知识的海角和效率，在在 29 杏仁栽培变种和三相关的野种之中建立基因关系放大了碎片长度多型性( AFLP )和简单顺序重复( SSR )标记。SSR 与 AFLP 和 RAPD 相比介绍了多型性和更大的信息内容的高水平，由期望的 hetrozygosity 估计了。期望的 hetrozygosity 的最低价值为 AFLP 被获得；然而， AFLP 显示出最高的效率，由于他们揭示每反应的大量乐队的能力，它为差异的索引的各种各样的类型导致了高价值。所有三种技术很有效地区别了杏仁遗传型，除了 SSR 没能在‘ M 之间区别 onagha' 和‘ S efied' 杏仁遗传型之外。类似的关联系数为所有三个标记系统是统计上重要的，但是比为 RAPD 和 AFLP 为 SSR 数据是更低的。为所有标记， dendrogram 拓扑学的高类似被获得，尽管一些差别被观察。所有 dendrograms 包括由所有标记数据的联合使用获得了那，根据他们的地理散开为大多数栽培变种反映关系。AMOVA 检测了更多的变化在之中在每个地理组以内栽培了并且联系杏仁的野种类。自举分析表明使用的标记的数字为基因类似的可靠评价并且为标记类型的有意义的比较是足够的。

分子标记法和形态学特征对杏仁栽培种及野生种基因型的遗传关系构建的辨别

应用23个形态学特征,19个扩增片段长度多态性(AFLP)引物组合,80个随机扩增多态DNA (RAPD)引物和32个简单序列重复(SSR)引物对,比较三种分子标记法在29个杏仁栽培种和3个野生种遗传关系构建中的信息量和效率。根据预期杂合度的评价,与AFLPs和RAPDs相比,SSRs具有较高水平的多态性和较大的信息量。AFLPs预期杂合度值最低,但其辨别效率值最高,因为AFLPs能揭示每个反应中的大量条带,导致各种类型的多样性指数均较高。三种分子标记法对杏仁基因型的辨别效率均较高,只是SSRs无法辨别‘Monagha’和‘Sefied’杏仁基因型。三种分子标记法基因型相似性相关系数统计上显著,但SSR数据要低于RAPDs和AFLPs的值。尽管三种分子标记法树形图拓扑结构存在一些差异,但相似性水平均较高。SSRs、 RAPDs和AFLPs的系统树图及其综合数据都能依据地理散布反映大多数栽培种的关系。AMOVA检测到每个地理组中栽培种和野生种的变异。辅助程序分析表明,实验所应用的标记物数量足以保证基因相似性估计的可靠性和标记法间的比较是有意义的。

pms3 is the locus causing the original photoperiod-sensitive male sterility mutation of‘Nongken 58S'

Photoperiod-sensitive genic male sterile (PSGMS) rice is a very useful germplasm for hybrid rice development. It was first found as a spontaneous mutant in a japonica cultivar ’Nongken 58’. pms3 on chromosome 12 was determined to be the locus where the original PSGMS mutation occurred, changing the normal cultivar Nongken 58 to PSGMS Nongken 58S. Large amounts of RAPD and AFLP analyses were also conducted for the fine mapping of the pms3 genomic region, which resulted in 4 molecular markers linked to pms3. Although these markers somewhat increased the marker density of this region, the pms3 locus is still located in a marker-sparse region.