鳓鱼全基因组survey分析及微卫星位点分布

为研究鳓鱼(Ilisha elongata)的遗传演化概况,对鳓鱼基因组进行了高通量测序并开展了survey分析和基因组范围内的遗传标记开发。K-mer分析结果显示,鳓鱼基因组大小约为692.8 Mb,杂合率为0.18%,重复序列比例为39.6%。基因组初步组装Scaffold N50为27694 bp,Contig N50为6306 bp。利用MISA软件对鳓鱼基因组的微卫星标记(simple sequence repeat,SSR)进行检索和分析,总共检测到786123个SSR位点,相对丰度为1204个/Mb。在所有类型中,重复最多的是二碱基,占SSR总量的75.94%,其SSR重复频率主要集中在6~28次;其次为单碱基和四碱基,分别占SSR总量的15.31%和4.25%。对二碱基类型而言,AC型具有最多的重复数量,为131732个,单碱基重复数量最多的则是A型,有48775个。研究结果表明,鳓鱼基因组经组装后可得到高质量的全基因组序列,经过筛选的SSR位点可为后续的遗传分子标记开发提供有力支持,研究结果可为鳓鱼种质资源管理和保护、生物进化和群体遗传等研究工作提供基础资料。

中国沿海鳓不同地理群体16SrRNA基因的遗传变异分析

为阐述过度捕捞后中国现存鳓(Ilisha elongata)资源的种质状况,采用16SrRNA基因测序技术对青岛、舟山、厦门和广州4个鳓地理群体的种群结构及遗传变异进行研究。通过对4个鳓群体共45个个体的线粒体16SrRNA基因进行测序,获得1个长度为657bp的同源序列。45个个体中共检测到32个多态位点,多态位点比例达4.88%,其中插入或缺失位点10个;45个个体中检测出20个单倍型,单倍型多样性指数(H)达0.812,核苷酸多样性指数(Pi)达0.0031,平均核苷酸差异数(K)达2.016。结果表明,中国现存鳓种群仍具较高的遗传多样性水平。对4个群体的遗传结构进行检测表明,青岛群体与其他3个群体间存在显著的遗传分化,两个类群间存在1个固定位点的核苷酸差异,分化系数(Fst)达0.3852(P<0.01),基因流(Nm)为0.7980;而舟山、厦门和广州这3群体内部则无显著遗传分化(P>0.01);AMOVA检测显示,69.48%的遗传差异存在于群体内部,而30.52%的遗传差异存在于群体间;聚类分析结果和单倍型网络关系图也证实上述鳓群体的地理分化。推测青岛群体的分化可能与晚更新世以来频繁的海平面变化有关。

珠江口水域鳓鱼生长和死亡参数估算

根据1996—1998年期间在珠江口及邻近海域采集的鳓鱼(IlishaelongataBennett)生物学资料,应用FiSATⅡ软件进行鳓鱼的生长和死亡参数估算。用ELEFANⅠ技术拟合的vonBertalanffy生长方程参数分别为L∞=53.13cm(叉长)、k=0.37a-1及t0=-0.62a,用Pauly经验公式计算的自然死亡系数为M=0.74,以长度变换渔获曲线法估算的总死亡系数为Z=2.53。运用Beverton Holt模型分析该群体的最适捕捞死亡系数为F=2.5,最适开捕年龄和叉长分别为1.6龄和29.8cm,目前该群体已处于捕捞过度状态,尤其以捕捞幼鱼的问题较为突出。建议南海北部鳓鱼的最小可捕规格应为叉长30cm。

东海鳓卵巢发育的组织学观察

于光镜下对东海鳓卵巢切片作了组织学观察 ,结果表明 ,5月 - 7月为东海鳓的繁殖期 ,其卵巢有Ⅳ期、Ⅴ期、Ⅵ -Ⅳ’期和Ⅴ’期 ;8月 - 9月鳓卵巢处在产后休整阶段 ;10月 -翌年 2月为越冬Ⅱ期卵巢 ;3月 - 4月卵巢处在产前发育阶段。在小生长期 ,卵核的体积较核质的体积增大快 ,核质比大 ,大生长期 ,随着卵黄物质的积累 ,卵母细胞体积快速增加 ,核质比下降。在鳓卵母细胞发育中 ,曾见有两层卵膜结构 ,但接近成熟的卵母细胞仅有一层卵膜。东海鳓的产卵方式为短期分批产卵类型。在一个生殖周期内 ,一般产卵 2次。

东海区鳓鱼的摄食习性

利用2008年5月、8月、11月和2009年2月在东海区采集到的309 ind鳓鱼(Ilisha elongata)样品为研究对象,对其胃含物进行了分析,应用K-W非参数检验、卡方检验等方法,对不同季节鳓鱼的食物组成进行了研究。结果表明,东海鳓鱼的饵料生物种类有60余种,浮游甲壳类、鱼类和不可辨认的头足类为其主要食物类群。按相对重要性指数百分比(IRI%)排序,优势饵料种类最高的是七星底灯鱼(Benthosema pterotum)(IRI%为46.54%),其次是中国毛虾(Acetes chinensis)(IRI%为30.38%)、太平洋磷虾(Euphausia pacifica)(IRI%为12.08%)和不可辨认的头足类(IRI%为6.48%)等。统计分析检验表明,鳓鱼的空胃率和平均胃饱满系数有显著的季节变化(P<0.01),而无明显的叉长变化,摄食强度春季最高,秋季次之,夏季相对较高,而冬季最低。

鳓形态指标体系分析及雌雄鉴别模型

对鳓的形态指标体系进行了主成分分析和R—聚类分析。鳓的形态指标大体可归纳为“大小因子”、“形态因子”和“头型因子”;关子“肥瘦”方面、“长度”方面和“头部”的指标各自的相关较为密切,而这三类指标间的相关较小。在此分析基础上,构建了48个相对指标,并用逐步判别建立了雌雄判别模型,此模型回判的错判率为8.9％。

华南沿海5种海水鱼类血液生化指标的比较研究

使用罗氏C311型全自动生化分析仪测定计算白鳓鱼、斜带髭鲷、红鱼、卵形鲳鲹和鲈鱼血清中葡萄糖(BG)、胆固醇(CHO)、甘油三酯(TG)、总蛋白(TP)、白蛋白(ALB)、球蛋白(GLO)、谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)、碱性磷酸酶(ALP)、尿素氮(UREAL)10项指标含量,比较研究这几种海水养殖鱼类生化指标的差异。

闽江口鳓鱼生殖群体的生态特性

报道了闽江口海域鳓鱼的生殖群体结构、生长特性、死亡参数和繁殖、摄食习性等生态学资料。阐述了鳓鱼的捕捞死亡系数、捕捞努力量及单位网产的变化，分析讨论了捕捞努力量对捕捞死亡系数和单位网产的影响。针对目前沿岸定置网作业对鳓鱼幼鱼损害的严重性，指出８～１０月保护鳓鱼幼鱼的重要性。

东海鳓鱼精巢的周年变化

本文研究了东海鳓鱼精巢的周年变化。结果表明,鳓鱼精巢为典型的壶腹型精巢。其基本结构:精小叶、精小囊、精小叶腔以及小时间组织等都随季节而周期性变化。本文还对小叶问组织的生理功能和繁殖季节过后,精巢内残留精子的退化等问题作了描述和探讨。

东海鳓鱼雌雄性状比较及其鉴别

本文对在１９８５－１９８７年间舟山近岸采集的鳓鱼雌雄个体性状作了比较分析。结果表明：除了吻长、叉长／体长等指标在雌雄间有显著差异外，其它指标均无显著差异。到了繁殖早期，雄鱼的体厚、成熟系数都显著地大于雌鱼，而肝指数却显著地小于雌鱼。本文还进一步用逐步判别的方法给出了鉴别雌雄的判别函数：ｙ＿１＝－６３４．８８０５＋１３７．４８４５ｘ＿１＋９０７．１５９８ｘ＿２＋７４５．８３６３ｘ＿３ｙ＿２＝－６２３．６２９８＋１２３．６８９２ｘ＿１＋８９４．３３４０ｘ＿２＋７６６．０１６６ｘ＿３式中ｘ＿１为吻长／头长，ｘ＿２为叉长／体长，ｘ＿３为体厚／体高，用４６个样品回代进行判别，得错判率为１０．９％

加速溶剂萃取-气相色谱/质谱法测定鳓鱼肌肉中脂肪酸

采用加速溶剂萃取-气相色谱/质谱法对鳓鱼肌肉中脂肪酸组成进行分析。共检测到17种脂肪酸,其中饱和脂肪酸5种,相对含量为30.92%,不饱和脂肪酸12种,相对含量为69.08%,其中单不饱和脂肪酸7种,相对含量为40.68%,多不饱和脂肪酸5种,相对含量为28.40%。鳓鱼富含EPA(Eicosa pentaenoic Acid)和DHA(Docosahexaenoic acid),EPA+DHA含量达24.43%,鳓鱼肌肉中棕榈酸含量较高,达21.6%。