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神农洁蜣螂两性成虫肠道微生物多样性分析
1
作者
毛月
袁辉
+2 位作者
陈红心
周启立
熊涛
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2024年第1期201-208,共8页
昆虫肠道微生物多样性对宿主的生长发育以及营养物质的消化和吸收等起着非常重要的作用。本研究利用16S rRNA基因序列构建神农洁蜣螂Catharsius molossus雌性成虫和雄性成虫肠道微生物的克隆文库,旨在探究其菌群的结构并加以对比和分析...
昆虫肠道微生物多样性对宿主的生长发育以及营养物质的消化和吸收等起着非常重要的作用。本研究利用16S rRNA基因序列构建神农洁蜣螂Catharsius molossus雌性成虫和雄性成虫肠道微生物的克隆文库,旨在探究其菌群的结构并加以对比和分析,采用Illumina NovaSeq高通量测序的方法揭示两种菌群组成方面的相似性和差异性。结果表明:神农洁蜣螂雌性成虫和雄性成虫肠道微生物在结构和组成方面存在着一定的差异。雌性成虫肠道菌群的物种丰富度和物种多样性都高于雄性成虫。雌性成虫、雄性成虫体内肠道菌群共有1 253个ASVs,归属于20个门、35个纲、54个目、134个科、253个属,其中雌性成虫肠道菌群的ASVs有1 024个,而雄性成虫肠道菌群的ASVs有410个,二者优势菌群虽然都为阴道球菌属Vagococcus,但二者所占的比例不同。本研究分析了神农洁蜣螂雌雄成虫肠道微生物多样性及群落在结构和组成方面的差异,为探究神农洁蜣螂雌雄成虫的肠道微生物的潜在功能,以及其肠道菌群的开发应用提供了理论支持。
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关键词
神农洁蜣螂
成虫
雌性
雄性
肠道菌群
illumina
novaseq
高通量测序
16S
rRNA
下载PDF
职称材料
长期种植云南大叶种茶对土壤真菌多样性的影响
被引量:
4
2
作者
浦滇
罗义菊
+2 位作者
陈洪宇
石明
蓝增全
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期440-448,共9页
为探究长期种植云南大叶种茶(Camellia sinensis var.assamica)对土壤真菌多样性的影响,在云南省双江县冰岛老寨茶园选取树龄依次为10年、40年、80年和100年以上的茶树片区(各设3个样方),同时选择相邻无植茶史的林区作为对照(CK),采集表...
为探究长期种植云南大叶种茶(Camellia sinensis var.assamica)对土壤真菌多样性的影响,在云南省双江县冰岛老寨茶园选取树龄依次为10年、40年、80年和100年以上的茶树片区(各设3个样方),同时选择相邻无植茶史的林区作为对照(CK),采集表层(0-20 cm)土壤并利用Illumina NovaSeq高通量测序技术鉴定真菌类群,解析植茶年限对土壤真菌群落结构与多样性的影响,并探究真菌群落与土壤化学因子之间的关系.结果发现,随着植茶年限的增加,土壤真菌多样性指数呈先减小后增加的趋势,其中40年的最低,且年限间存在显著差异(P<0.05).Spearman相关性分析表明土壤真菌多样性主要受速效钾、碱解氮、全钾、有机质含量和pH值影响;优势门子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)的相对丰度均大于10%,前者呈先减小后增加的趋势,而后者呈先增加后减小的趋势.非度量多维尺度分析(non-metric multidimensional scaling analysis,NMDS)和相似性分析(analysis of similarities,ANOSIM)表明不同植茶年限土壤真菌群落与对照明显分开且存在显著差异(R=0.56,P=0.0001),线性判别分析(linear discriminant analysis effect size,LEfSe)进一步表明对照和不同植茶年限土壤中均存在显著差异物种;Spearman相关性分析结果显示土壤有效磷、全磷、碱解氮和全钾是影响真菌群落的主要驱动因子.综上,长期种植云南大叶种茶树改变了土壤化学性质,进而使土壤真菌群落组成和多样性发生变化,植茶40年是土壤真菌群落产生重大变化的关键时期.
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关键词
植茶年限
云南大叶种茶
illumina
novaseq
高通量测序
土壤真菌
群落特征
原文传递
两种食品添加剂对鲜天麻采后真菌多样性的影响
3
作者
张旭
王瑞
+4 位作者
吉宁
孙海燕
潘成
雷霁卿
马超
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期2203-2217,共15页
食品添加剂在农产品采后病害的防治已得到广泛的应用。本研究以鲜天麻低温贮藏、室温货架腐烂情况为基础,通过Illumina NovaSeq高通量测序技术探究了脱氢乙酸钠、香芹酚及纯水处理对鲜天麻表皮真菌多样性变化的影响情况。结果表明,较直...
食品添加剂在农产品采后病害的防治已得到广泛的应用。本研究以鲜天麻低温贮藏、室温货架腐烂情况为基础,通过Illumina NovaSeq高通量测序技术探究了脱氢乙酸钠、香芹酚及纯水处理对鲜天麻表皮真菌多样性变化的影响情况。结果表明,较直接采挖的带土新鲜乌天麻(CK组),脱氢乙酸钠和香芹酚处理能够有效地延缓鲜天麻在整个贮藏和货架期间的腐烂,而纯水处理在短期低温贮藏可以延缓鲜天麻的腐烂。与CK组相比,脱氢乙酸钠处理、香芹酚处理和纯水处理能够降低真菌多样性和丰富度,其中脱氢乙酸钠处理组真菌多样性和丰富度最低,其次为香芹酚处理组。引起CK组腐烂的主要致腐菌为镰刀菌属Fusarium、土赤壳属Ilyonectria和青霉属Penicillium的种类。通过高通量测序可知,与CK组相比,脱氢乙酸钠和香芹酚处理能够降低病原菌镰刀菌属、青霉属和土赤壳属的相对丰富度,且脱氢乙酸钠对青霉属有较强的抑制作用,香芹酚对镰刀菌属和土赤壳属抑制作用较强。研究结果表明,脱氢乙酸钠和香芹酚处理能够较大程度导致鲜天麻表皮真菌群落发生变化,抑制天麻腐烂。
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关键词
鲜天麻
采后
脱氢乙酸钠
香芹酚
illumina
novaseq
测序
真菌多样性
原文传递
黄山典型植被类型土壤真菌群落特征及其影响因素
被引量:
14
4
作者
满百膺
向兴
+4 位作者
罗洋
毛小涛
张超
孙丙华
王希
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期2735-2751,共17页
黄山地势高差明显,植被类型多样,生态系统保存完整,是研究森林生态系统土壤真菌群落的天然实验室。本研究采集黄山典型植被下土壤样本,利用IlluminaNova Seq高通量测序技术分析土壤真菌群落结构,结合土壤理化性质探讨不同植被类型影响...
黄山地势高差明显,植被类型多样,生态系统保存完整,是研究森林生态系统土壤真菌群落的天然实验室。本研究采集黄山典型植被下土壤样本,利用IlluminaNova Seq高通量测序技术分析土壤真菌群落结构,结合土壤理化性质探讨不同植被类型影响真菌群落组成的潜在因素。结果共检测到13个真菌门,优势真菌门依次为:担子菌门Basidiomycota,获得38目,202属,相对丰度介于7.30%–90.71%,在常绿落叶阔叶混交林、山地矮林及落叶阔叶林中出现高值,局部呈现先增后减的单峰变化格局;子囊菌门Ascomycota有56目,393属,相对丰度介于4.69%–53.07%,随着典型植被类型变化无明显变化规律;被孢霉门Mortierellomycota获得1目和2属,相对丰度介于2.88%–29.92%,随着典型植被类型变化呈现U型变化模式;5种植被类型土壤中共检测到34个不同分类单元的真菌指示类群,落叶阔叶林土壤真菌指示类群最为丰富,占67%;p H显著影响土壤真菌α多样性(Pearson,P<0.001),是黄山土壤真菌群落变异的主控因子(Monte Corlo检验,P<0.01)。
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关键词
黄山
真菌群落结构
illumina
novaseq
测序
土壤PH
原文传递
题名
神农洁蜣螂两性成虫肠道微生物多样性分析
1
作者
毛月
袁辉
陈红心
周启立
熊涛
机构
长江大学生命科学学院
武汉大北农农牧发展有限公司
出处
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2024年第1期201-208,共8页
基金
大北农基金(横20220013)
兽医生物技术国家重点实验室开放课题资助青年基金(SKLVBF202002)。
文摘
昆虫肠道微生物多样性对宿主的生长发育以及营养物质的消化和吸收等起着非常重要的作用。本研究利用16S rRNA基因序列构建神农洁蜣螂Catharsius molossus雌性成虫和雄性成虫肠道微生物的克隆文库,旨在探究其菌群的结构并加以对比和分析,采用Illumina NovaSeq高通量测序的方法揭示两种菌群组成方面的相似性和差异性。结果表明:神农洁蜣螂雌性成虫和雄性成虫肠道微生物在结构和组成方面存在着一定的差异。雌性成虫肠道菌群的物种丰富度和物种多样性都高于雄性成虫。雌性成虫、雄性成虫体内肠道菌群共有1 253个ASVs,归属于20个门、35个纲、54个目、134个科、253个属,其中雌性成虫肠道菌群的ASVs有1 024个,而雄性成虫肠道菌群的ASVs有410个,二者优势菌群虽然都为阴道球菌属Vagococcus,但二者所占的比例不同。本研究分析了神农洁蜣螂雌雄成虫肠道微生物多样性及群落在结构和组成方面的差异,为探究神农洁蜣螂雌雄成虫的肠道微生物的潜在功能,以及其肠道菌群的开发应用提供了理论支持。
关键词
神农洁蜣螂
成虫
雌性
雄性
肠道菌群
illumina
novaseq
高通量测序
16S
rRNA
Keywords
Catharsius molossus
adult
female
male
gut microbiota
illumina novaseq
high-throughput Sequencing
16S rRNA
分类号
Q968.1 [生物学—昆虫学]
S89 [农业科学—特种经济动物饲养]
下载PDF
职称材料
题名
长期种植云南大叶种茶对土壤真菌多样性的影响
被引量:
4
2
作者
浦滇
罗义菊
陈洪宇
石明
蓝增全
机构
西南林业大学生态与环境学院
西南林业大学园林园艺学院
西南林业大学林学院
西南林业大学绿色发展研究院
出处
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期440-448,共9页
基金
国家林业和草原局科技项目(2019130004-149)
云南省科技项目生物资源数字化开发应用(202002AA100007)
+2 种基金
云南省野生动植物保护项目(2063146)
古茶树保护与可持续利用国家创新联盟([2018]96)
社科规划科普项目(SKPJ02020)资助
文摘
为探究长期种植云南大叶种茶(Camellia sinensis var.assamica)对土壤真菌多样性的影响,在云南省双江县冰岛老寨茶园选取树龄依次为10年、40年、80年和100年以上的茶树片区(各设3个样方),同时选择相邻无植茶史的林区作为对照(CK),采集表层(0-20 cm)土壤并利用Illumina NovaSeq高通量测序技术鉴定真菌类群,解析植茶年限对土壤真菌群落结构与多样性的影响,并探究真菌群落与土壤化学因子之间的关系.结果发现,随着植茶年限的增加,土壤真菌多样性指数呈先减小后增加的趋势,其中40年的最低,且年限间存在显著差异(P<0.05).Spearman相关性分析表明土壤真菌多样性主要受速效钾、碱解氮、全钾、有机质含量和pH值影响;优势门子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)的相对丰度均大于10%,前者呈先减小后增加的趋势,而后者呈先增加后减小的趋势.非度量多维尺度分析(non-metric multidimensional scaling analysis,NMDS)和相似性分析(analysis of similarities,ANOSIM)表明不同植茶年限土壤真菌群落与对照明显分开且存在显著差异(R=0.56,P=0.0001),线性判别分析(linear discriminant analysis effect size,LEfSe)进一步表明对照和不同植茶年限土壤中均存在显著差异物种;Spearman相关性分析结果显示土壤有效磷、全磷、碱解氮和全钾是影响真菌群落的主要驱动因子.综上,长期种植云南大叶种茶树改变了土壤化学性质,进而使土壤真菌群落组成和多样性发生变化,植茶40年是土壤真菌群落产生重大变化的关键时期.
关键词
植茶年限
云南大叶种茶
illumina
novaseq
高通量测序
土壤真菌
群落特征
Keywords
years of tea planting
Yunnan large-leaf tea(Camellia sinensis var.assamica)
illumina novaseq
high-throughput sequencing
soil fungal
community characteristics
分类号
S154.3 [农业科学—土壤学]
S571.1 [农业科学—茶叶生产加工]
原文传递
题名
两种食品添加剂对鲜天麻采后真菌多样性的影响
3
作者
张旭
王瑞
吉宁
孙海燕
潘成
雷霁卿
马超
机构
贵阳学院食品与制药工程学院
陕西理工大学生物科学与工程学院
贵州乌蒙腾菌业有限公司
出处
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第11期2203-2217,共15页
文摘
食品添加剂在农产品采后病害的防治已得到广泛的应用。本研究以鲜天麻低温贮藏、室温货架腐烂情况为基础,通过Illumina NovaSeq高通量测序技术探究了脱氢乙酸钠、香芹酚及纯水处理对鲜天麻表皮真菌多样性变化的影响情况。结果表明,较直接采挖的带土新鲜乌天麻(CK组),脱氢乙酸钠和香芹酚处理能够有效地延缓鲜天麻在整个贮藏和货架期间的腐烂,而纯水处理在短期低温贮藏可以延缓鲜天麻的腐烂。与CK组相比,脱氢乙酸钠处理、香芹酚处理和纯水处理能够降低真菌多样性和丰富度,其中脱氢乙酸钠处理组真菌多样性和丰富度最低,其次为香芹酚处理组。引起CK组腐烂的主要致腐菌为镰刀菌属Fusarium、土赤壳属Ilyonectria和青霉属Penicillium的种类。通过高通量测序可知,与CK组相比,脱氢乙酸钠和香芹酚处理能够降低病原菌镰刀菌属、青霉属和土赤壳属的相对丰富度,且脱氢乙酸钠对青霉属有较强的抑制作用,香芹酚对镰刀菌属和土赤壳属抑制作用较强。研究结果表明,脱氢乙酸钠和香芹酚处理能够较大程度导致鲜天麻表皮真菌群落发生变化,抑制天麻腐烂。
关键词
鲜天麻
采后
脱氢乙酸钠
香芹酚
illumina
novaseq
测序
真菌多样性
Keywords
fresh Gastrodia elata
postharvest
sodium dehydroacetate
carvacrol
illumina novaseq
sequencing
fungal diversity
分类号
TS202.3 [轻工技术与工程—食品科学]
原文传递
题名
黄山典型植被类型土壤真菌群落特征及其影响因素
被引量:
14
4
作者
满百膺
向兴
罗洋
毛小涛
张超
孙丙华
王希
机构
上饶师范学院生命科学学院
安徽省黄山生物多样性与短尾猴行为生态学国际联合研究中心
出处
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期2735-2751,共17页
基金
安徽省黄山生物多样性与短尾猴行为生态学国际联合研究中心开放课题(KF200013)。
文摘
黄山地势高差明显,植被类型多样,生态系统保存完整,是研究森林生态系统土壤真菌群落的天然实验室。本研究采集黄山典型植被下土壤样本,利用IlluminaNova Seq高通量测序技术分析土壤真菌群落结构,结合土壤理化性质探讨不同植被类型影响真菌群落组成的潜在因素。结果共检测到13个真菌门,优势真菌门依次为:担子菌门Basidiomycota,获得38目,202属,相对丰度介于7.30%–90.71%,在常绿落叶阔叶混交林、山地矮林及落叶阔叶林中出现高值,局部呈现先增后减的单峰变化格局;子囊菌门Ascomycota有56目,393属,相对丰度介于4.69%–53.07%,随着典型植被类型变化无明显变化规律;被孢霉门Mortierellomycota获得1目和2属,相对丰度介于2.88%–29.92%,随着典型植被类型变化呈现U型变化模式;5种植被类型土壤中共检测到34个不同分类单元的真菌指示类群,落叶阔叶林土壤真菌指示类群最为丰富,占67%;p H显著影响土壤真菌α多样性(Pearson,P<0.001),是黄山土壤真菌群落变异的主控因子(Monte Corlo检验,P<0.01)。
关键词
黄山
真菌群落结构
illumina
novaseq
测序
土壤PH
Keywords
Mount Huangshan
fungal community structure
illumina novaseq
sequencing
soil pH
分类号
S714.3 [农业科学—林学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
神农洁蜣螂两性成虫肠道微生物多样性分析
毛月
袁辉
陈红心
周启立
熊涛
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
长期种植云南大叶种茶对土壤真菌多样性的影响
浦滇
罗义菊
陈洪宇
石明
蓝增全
《应用与环境生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
4
原文传递
3
两种食品添加剂对鲜天麻采后真菌多样性的影响
张旭
王瑞
吉宁
孙海燕
潘成
雷霁卿
马超
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
原文传递
4
黄山典型植被类型土壤真菌群落特征及其影响因素
满百膺
向兴
罗洋
毛小涛
张超
孙丙华
王希
《菌物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
14
原文传递
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