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神农洁蜣螂两性成虫肠道微生物多样性分析
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作者 毛月 袁辉 +2 位作者 陈红心 周启立 熊涛 《环境昆虫学报》 CSCD 北大核心 2024年第1期201-208,共8页
昆虫肠道微生物多样性对宿主的生长发育以及营养物质的消化和吸收等起着非常重要的作用。本研究利用16S rRNA基因序列构建神农洁蜣螂Catharsius molossus雌性成虫和雄性成虫肠道微生物的克隆文库,旨在探究其菌群的结构并加以对比和分析... 昆虫肠道微生物多样性对宿主的生长发育以及营养物质的消化和吸收等起着非常重要的作用。本研究利用16S rRNA基因序列构建神农洁蜣螂Catharsius molossus雌性成虫和雄性成虫肠道微生物的克隆文库,旨在探究其菌群的结构并加以对比和分析,采用Illumina NovaSeq高通量测序的方法揭示两种菌群组成方面的相似性和差异性。结果表明:神农洁蜣螂雌性成虫和雄性成虫肠道微生物在结构和组成方面存在着一定的差异。雌性成虫肠道菌群的物种丰富度和物种多样性都高于雄性成虫。雌性成虫、雄性成虫体内肠道菌群共有1 253个ASVs,归属于20个门、35个纲、54个目、134个科、253个属,其中雌性成虫肠道菌群的ASVs有1 024个,而雄性成虫肠道菌群的ASVs有410个,二者优势菌群虽然都为阴道球菌属Vagococcus,但二者所占的比例不同。本研究分析了神农洁蜣螂雌雄成虫肠道微生物多样性及群落在结构和组成方面的差异,为探究神农洁蜣螂雌雄成虫的肠道微生物的潜在功能,以及其肠道菌群的开发应用提供了理论支持。 展开更多
关键词 神农洁蜣螂 成虫 雌性 雄性 肠道菌群 illumina novaseq高通量测序 16S rRNA
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Composition of intestinal microflora associated with Yang-deficiency 被引量:7
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作者 Tengjie Huang Qizhai Li +7 位作者 Yuqing Yin Junheng Wang Shuxian Sun Fei Yang Lingru Li Ji Wang Qi Wang Yingshuai Li 《Journal of Traditional Chinese Medical Sciences》 2017年第3期254-260,共7页
Objective:In this study,we investigated the composition of the intestinal microflora associated with Yang-deficiency and the function-specific members of this microflora.Method:Subjects with normal and Yang-deficient ... Objective:In this study,we investigated the composition of the intestinal microflora associated with Yang-deficiency and the function-specific members of this microflora.Method:Subjects with normal and Yang-deficient constitutions were recruited in Beijing,with 30 subjects in each group.Illumina high-throughput sequencing was used to sequence the DNA of their fecal bacteria in the 16S rRNA V3-V4 region.The species abundance and distribution of the intestinal microflora in each specimen were determined with a statistical analysis of these sequences.We identified an underlying taxonomic trend with nonparametric PCoA and other statistical techniques.Results:(1) Subjects with Yang-deficiency displayed more uneven abundances of the taxa in their intestinal microflora than the subjects with normal Yang;(2) several differences were observed in the proportions of certain bacterial groups between the Yang-deficient and control groups;and (3) the fallowing bacteria differed significantly between the two groups:(i) Brevundimonas,Leuconostoc,Turicibacter,Defluviitaleaceae incertae sedis,Rothia,and Butyricimonas were slightly higher in the Yang-deficient subjects,whereas (ii)Megasphaera,Ruminococcus,and Lachnospira were higher in the normal subjects than in the Yang-deficient subjects. 展开更多
关键词 Yang-deficient CONSTITUTION Intestinal FLORA illumina high-throughput sequencing
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长期种植云南大叶种茶对土壤真菌多样性的影响 被引量:6
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作者 浦滇 罗义菊 +2 位作者 陈洪宇 石明 蓝增全 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期440-448,共9页
为探究长期种植云南大叶种茶(Camellia sinensis var.assamica)对土壤真菌多样性的影响,在云南省双江县冰岛老寨茶园选取树龄依次为10年、40年、80年和100年以上的茶树片区(各设3个样方),同时选择相邻无植茶史的林区作为对照(CK),采集表... 为探究长期种植云南大叶种茶(Camellia sinensis var.assamica)对土壤真菌多样性的影响,在云南省双江县冰岛老寨茶园选取树龄依次为10年、40年、80年和100年以上的茶树片区(各设3个样方),同时选择相邻无植茶史的林区作为对照(CK),采集表层(0-20 cm)土壤并利用Illumina NovaSeq高通量测序技术鉴定真菌类群,解析植茶年限对土壤真菌群落结构与多样性的影响,并探究真菌群落与土壤化学因子之间的关系.结果发现,随着植茶年限的增加,土壤真菌多样性指数呈先减小后增加的趋势,其中40年的最低,且年限间存在显著差异(P<0.05).Spearman相关性分析表明土壤真菌多样性主要受速效钾、碱解氮、全钾、有机质含量和pH值影响;优势门子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)的相对丰度均大于10%,前者呈先减小后增加的趋势,而后者呈先增加后减小的趋势.非度量多维尺度分析(non-metric multidimensional scaling analysis,NMDS)和相似性分析(analysis of similarities,ANOSIM)表明不同植茶年限土壤真菌群落与对照明显分开且存在显著差异(R=0.56,P=0.0001),线性判别分析(linear discriminant analysis effect size,LEfSe)进一步表明对照和不同植茶年限土壤中均存在显著差异物种;Spearman相关性分析结果显示土壤有效磷、全磷、碱解氮和全钾是影响真菌群落的主要驱动因子.综上,长期种植云南大叶种茶树改变了土壤化学性质,进而使土壤真菌群落组成和多样性发生变化,植茶40年是土壤真菌群落产生重大变化的关键时期. 展开更多
关键词 植茶年限 云南大叶种茶 illumina novaseq高通量测序 土壤真菌 群落特征
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两种食品添加剂对鲜天麻采后真菌多样性的影响
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作者 张旭 王瑞 +4 位作者 吉宁 孙海燕 潘成 雷霁卿 马超 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第11期2203-2217,共15页
食品添加剂在农产品采后病害的防治已得到广泛的应用。本研究以鲜天麻低温贮藏、室温货架腐烂情况为基础,通过Illumina NovaSeq高通量测序技术探究了脱氢乙酸钠、香芹酚及纯水处理对鲜天麻表皮真菌多样性变化的影响情况。结果表明,较直... 食品添加剂在农产品采后病害的防治已得到广泛的应用。本研究以鲜天麻低温贮藏、室温货架腐烂情况为基础,通过Illumina NovaSeq高通量测序技术探究了脱氢乙酸钠、香芹酚及纯水处理对鲜天麻表皮真菌多样性变化的影响情况。结果表明,较直接采挖的带土新鲜乌天麻(CK组),脱氢乙酸钠和香芹酚处理能够有效地延缓鲜天麻在整个贮藏和货架期间的腐烂,而纯水处理在短期低温贮藏可以延缓鲜天麻的腐烂。与CK组相比,脱氢乙酸钠处理、香芹酚处理和纯水处理能够降低真菌多样性和丰富度,其中脱氢乙酸钠处理组真菌多样性和丰富度最低,其次为香芹酚处理组。引起CK组腐烂的主要致腐菌为镰刀菌属Fusarium、土赤壳属Ilyonectria和青霉属Penicillium的种类。通过高通量测序可知,与CK组相比,脱氢乙酸钠和香芹酚处理能够降低病原菌镰刀菌属、青霉属和土赤壳属的相对丰富度,且脱氢乙酸钠对青霉属有较强的抑制作用,香芹酚对镰刀菌属和土赤壳属抑制作用较强。研究结果表明,脱氢乙酸钠和香芹酚处理能够较大程度导致鲜天麻表皮真菌群落发生变化,抑制天麻腐烂。 展开更多
关键词 鲜天麻 采后 脱氢乙酸钠 香芹酚 illumina novaseq测序 真菌多样性
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黄山典型植被类型土壤真菌群落特征及其影响因素 被引量:17
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作者 满百膺 向兴 +4 位作者 罗洋 毛小涛 张超 孙丙华 王希 《菌物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期2735-2751,共17页
黄山地势高差明显,植被类型多样,生态系统保存完整,是研究森林生态系统土壤真菌群落的天然实验室。本研究采集黄山典型植被下土壤样本,利用IlluminaNova Seq高通量测序技术分析土壤真菌群落结构,结合土壤理化性质探讨不同植被类型影响... 黄山地势高差明显,植被类型多样,生态系统保存完整,是研究森林生态系统土壤真菌群落的天然实验室。本研究采集黄山典型植被下土壤样本,利用IlluminaNova Seq高通量测序技术分析土壤真菌群落结构,结合土壤理化性质探讨不同植被类型影响真菌群落组成的潜在因素。结果共检测到13个真菌门,优势真菌门依次为:担子菌门Basidiomycota,获得38目,202属,相对丰度介于7.30%–90.71%,在常绿落叶阔叶混交林、山地矮林及落叶阔叶林中出现高值,局部呈现先增后减的单峰变化格局;子囊菌门Ascomycota有56目,393属,相对丰度介于4.69%–53.07%,随着典型植被类型变化无明显变化规律;被孢霉门Mortierellomycota获得1目和2属,相对丰度介于2.88%–29.92%,随着典型植被类型变化呈现U型变化模式;5种植被类型土壤中共检测到34个不同分类单元的真菌指示类群,落叶阔叶林土壤真菌指示类群最为丰富,占67%;p H显著影响土壤真菌α多样性(Pearson,P<0.001),是黄山土壤真菌群落变异的主控因子(Monte Corlo检验,P<0.01)。 展开更多
关键词 黄山 真菌群落结构 illumina novaseq测序 土壤PH
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