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高通量脑片细胞识别方法:基于Imaris与ImageJ的对比研究
1
作者
赵高炀
冯晓龙
王枫
《神经解剖学杂志》
CAS
CSCD
2021年第6期637-645,共9页
目的:面对高分辨率的海量脑片染色信号数据,建立一种统一的方法来便捷的实现多场景下的准确识别.方法:选择5套不同分子标记的小鼠鼠脑荧光图像数据,对比分析了ImageJ和Imaris两种识别方法与人工识别的差异.结果:对于清晰无重叠的荧光信...
目的:面对高分辨率的海量脑片染色信号数据,建立一种统一的方法来便捷的实现多场景下的准确识别.方法:选择5套不同分子标记的小鼠鼠脑荧光图像数据,对比分析了ImageJ和Imaris两种识别方法与人工识别的差异.结果:对于清晰无重叠的荧光信号,Imaris和ImageJ均能进行快速准确地识别.而当图像内信号强度差异较大时,Imaris参数调整的识别结果是实时可见的,且鲁棒性较好,同一参数即可对全部信号进行较准确的量化,但在ImageJ中需要根据信号强度设置不同的参数进行多次识别.结论:Imaris是一种理想的、可以实现快速、方便、准确地识别和计算高通量脑片中荧光信号的方法.
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关键词
高通量细胞识别
脑片荧光信号
细胞计数
imaris
IMAGEJ
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职称材料
基于Imaris 3D图形渲染方法对神经元形态量化分析
2
作者
邵靖媛
李燊
+3 位作者
刘凤姣
吴燕
赵哲
吴海涛
《军事医学》
CAS
2021年第1期57-63,共7页
目的利用Imaris软件对在体稀疏标记神经元及体外培养原代神经元所收集的实验数据进行多种统计量化分析。方法利用Imaris软件的Filament模块、Spots模块、Surface模块,对神经科学领域中涉及神经元的荧光采集图像进行3D渲染并分析数据,包...
目的利用Imaris软件对在体稀疏标记神经元及体外培养原代神经元所收集的实验数据进行多种统计量化分析。方法利用Imaris软件的Filament模块、Spots模块、Surface模块,对神经科学领域中涉及神经元的荧光采集图像进行3D渲染并分析数据,包括质量检查、去除背景、神经元重构、胞体测量、突触棘分型统计以及体外培养神经元的量化统计。结果基于Imaris的在体神经元的量化统计结果显示,各级神经元平均体积存在显著差异,长度和面积差异无统计学意义;不同分型突触棘表面积差异存在统计学意义。结论Imaris 3D图形渲染方法可有效应用于神经元及树突棘形态重构、神经元胞体测量等量化分析中,从而为神经生物学的精准量化分析提供有力手段。
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关键词
imaris
神经元
树突棘
胞体
量化
原文传递
尼日尔Imari区块复杂地层钻井液技术研究
被引量:
1
3
作者
赵光辉
《中国石油和化工标准与质量》
2013年第16期125-125,共1页
根据尼日尔Imari区块地层特点,确定合理的钻井液体系、维持较好的以及相对稳定的钻井液性能是顺利穿过复杂地层成功的关键。通过对Imari区块地层特点以及临井资料的分析总结,利用KCL/Polymer钻井液体系的高抑制性,实施复杂地层分段维护...
根据尼日尔Imari区块地层特点,确定合理的钻井液体系、维持较好的以及相对稳定的钻井液性能是顺利穿过复杂地层成功的关键。通过对Imari区块地层特点以及临井资料的分析总结,利用KCL/Polymer钻井液体系的高抑制性,实施复杂地层分段维护、处理的方法,保证钻井的顺利施工。
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关键词
尼日尔Imari区块
复杂地层
钻井液
井漏
坍塌
井壁稳定
原文传递
题名
高通量脑片细胞识别方法:基于Imaris与ImageJ的对比研究
1
作者
赵高炀
冯晓龙
王枫
机构
中国科学院深圳先进技术研究院
中国科学院大学
出处
《神经解剖学杂志》
CAS
CSCD
2021年第6期637-645,共9页
基金
广东省重点领域研发计划(2018B030331001)
粤港澳大湾区脑科学与类脑研究中心开放课题(2019025)
深圳市科技计划(ZDSYS20200828154800001)。
文摘
目的:面对高分辨率的海量脑片染色信号数据,建立一种统一的方法来便捷的实现多场景下的准确识别.方法:选择5套不同分子标记的小鼠鼠脑荧光图像数据,对比分析了ImageJ和Imaris两种识别方法与人工识别的差异.结果:对于清晰无重叠的荧光信号,Imaris和ImageJ均能进行快速准确地识别.而当图像内信号强度差异较大时,Imaris参数调整的识别结果是实时可见的,且鲁棒性较好,同一参数即可对全部信号进行较准确的量化,但在ImageJ中需要根据信号强度设置不同的参数进行多次识别.结论:Imaris是一种理想的、可以实现快速、方便、准确地识别和计算高通量脑片中荧光信号的方法.
关键词
高通量细胞识别
脑片荧光信号
细胞计数
imaris
IMAGEJ
Keywords
high-throughput image identification
fluorescent signals in brain sections
cell counting
imaris
ImageJ
分类号
Q42 [生物学—神经生物学]
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职称材料
题名
基于Imaris 3D图形渲染方法对神经元形态量化分析
2
作者
邵靖媛
李燊
刘凤姣
吴燕
赵哲
吴海涛
机构
军事科学院军事医学研究院军事认知与脑科学研究所军事认知与应激医学研究室
青岛大学基础医学院神经生物学教研室
出处
《军事医学》
CAS
2021年第1期57-63,共7页
基金
国家自然科学基金面上项目(31770929,31522029)
国家自然科学基金青年科学基金(31800884)
文摘
目的利用Imaris软件对在体稀疏标记神经元及体外培养原代神经元所收集的实验数据进行多种统计量化分析。方法利用Imaris软件的Filament模块、Spots模块、Surface模块,对神经科学领域中涉及神经元的荧光采集图像进行3D渲染并分析数据,包括质量检查、去除背景、神经元重构、胞体测量、突触棘分型统计以及体外培养神经元的量化统计。结果基于Imaris的在体神经元的量化统计结果显示,各级神经元平均体积存在显著差异,长度和面积差异无统计学意义;不同分型突触棘表面积差异存在统计学意义。结论Imaris 3D图形渲染方法可有效应用于神经元及树突棘形态重构、神经元胞体测量等量化分析中,从而为神经生物学的精准量化分析提供有力手段。
关键词
imaris
神经元
树突棘
胞体
量化
Keywords
imaris
neurons
dendritic spines
cytoplasm
quantization
分类号
R338.1 [医药卫生—人体生理学]
原文传递
题名
尼日尔Imari区块复杂地层钻井液技术研究
被引量:
1
3
作者
赵光辉
机构
长城钻探钻井液公司尼日尔项目部
出处
《中国石油和化工标准与质量》
2013年第16期125-125,共1页
文摘
根据尼日尔Imari区块地层特点,确定合理的钻井液体系、维持较好的以及相对稳定的钻井液性能是顺利穿过复杂地层成功的关键。通过对Imari区块地层特点以及临井资料的分析总结,利用KCL/Polymer钻井液体系的高抑制性,实施复杂地层分段维护、处理的方法,保证钻井的顺利施工。
关键词
尼日尔Imari区块
复杂地层
钻井液
井漏
坍塌
井壁稳定
分类号
TE254 [石油与天然气工程—油气井工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
高通量脑片细胞识别方法:基于Imaris与ImageJ的对比研究
赵高炀
冯晓龙
王枫
《神经解剖学杂志》
CAS
CSCD
2021
0
下载PDF
职称材料
2
基于Imaris 3D图形渲染方法对神经元形态量化分析
邵靖媛
李燊
刘凤姣
吴燕
赵哲
吴海涛
《军事医学》
CAS
2021
0
原文传递
3
尼日尔Imari区块复杂地层钻井液技术研究
赵光辉
《中国石油和化工标准与质量》
2013
1
原文传递
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