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天麻PCR‑层析试纸条快速可视化检测方法的建立与评价
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作者 马秋贺 马玉贺 +9 位作者 刘悦 李涛 刘昂 徐子强 柴金军 王艳茹 高丽君 夏薇 李明成 曲永梅 《上海中医药杂志》 CSCD 2024年第3期79-85,共7页
目的通过聚合酶链式反应(PCR)与层析试纸条结合的方法,实现天麻快速可视化真伪鉴别,并对其检测效果进行评价。方法采用一步法提取天麻及其伪品基因组DNA,应用NCBI数据库设计天麻特异性引物。采用DNA分子克隆技术制备天麻阳性质粒,作为... 目的通过聚合酶链式反应(PCR)与层析试纸条结合的方法,实现天麻快速可视化真伪鉴别,并对其检测效果进行评价。方法采用一步法提取天麻及其伪品基因组DNA,应用NCBI数据库设计天麻特异性引物。采用DNA分子克隆技术制备天麻阳性质粒,作为天麻阳性对照品。建立PCR-层析试纸条法鉴定天麻真伪,摸索最优实验条件,并进行方法学评价。结果①样品DNA提取的纯度符合要求,最优的PCR反应引物浓度为1μmol/L,循环为29次。②分子克隆的天麻阳性质粒序列与天麻DNA分子标记特异性指纹区片段序列同源性为98%,可作为天麻PCR-层析试纸条法的阳性对照品。③PCR-层析试纸条法的方法学评价结果显示:天麻对照药材在试纸条上出现两个条带,伪品和阴性对照品出现1个条带,与琼脂糖凝胶电泳法结果一致,特异性良好;PCR-层析试纸条法较琼脂糖凝胶电泳法的灵敏度高100倍,天麻DNA浓度为10-1 mg/L时,试纸条仍有模糊条带;在第3、6、9、12个月采用PCR-层析试纸条法进行检测,检测结果与预期一致,稳定性良好;混合样品验证显示,PCR-层析试纸条法的最低检测限为10%,而琼脂糖凝胶电泳法的最低检测限为50%。④采用PCR-层析试纸条法对15份市售天麻样品进行检测,鉴别出3个伪品,与琼脂糖凝胶电泳法结果一致。结论所构建的PCR-层析试纸条检测方法特异性强、灵敏度高、操作简便快速,可在短时间内实现鉴定结果的可视化,检测结果准确、稳定,为道地药材天麻的真伪鉴别提供了新方法。 展开更多
关键词 天麻 聚合酶链式反应 试纸条 分子克隆 可视化鉴定 中药研究
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芸薹属植物MYBL2基因的克隆及其在A、B、C基因组中的PCR鉴别 被引量:1
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作者 邹婷 刘丽莉 +6 位作者 向建华 周定港 吴金锋 李莓 李宝 张大为 严明理 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期416-429,I0001-I0020,共34页
【目的】MYBL2负调控拟南芥花青素和原花青素的生物合成。从芸薹属6个物种的不同叶色材料中克隆MYBL2基因,分析其序列和表达模式,探究其在芸薹属植物花青素生物合成途径中的功能,为油菜的品质、抗逆性、观赏性等性状改良提供参考。【方... 【目的】MYBL2负调控拟南芥花青素和原花青素的生物合成。从芸薹属6个物种的不同叶色材料中克隆MYBL2基因,分析其序列和表达模式,探究其在芸薹属植物花青素生物合成途径中的功能,为油菜的品质、抗逆性、观赏性等性状改良提供参考。【方法】以芸薹属6个物种19份供试材料的总DNA为模板,同源克隆MYBL2基因,并进行多序列比对和进化树分析;对白菜、甘蓝型油菜、芥菜型油菜以及埃塞俄比亚芥的紫叶材料进行遮光处理,结合转录组和qRT-PCR分析MYBL2基因表达水平;对甘蓝、甘蓝型油菜、芥菜型油菜以及埃塞俄比亚芥紫、绿叶材料进行qRT-PCR分析MYBL2基因表达水平;根据克隆MYBL2-1和MYBL2-2序列的核苷酸变异位点设计特异性引物,开发能够区分MYBL2基因组来源的PCR标记。【结果】克隆获得MYBL2-1和MYBL2-2各9个同源基因共56个拷贝。其中,BcaMYBL2-1为首次获得,BcaMYBL2-1编码区序列全长为867 bp,包含2个内含子,分别为168和102 bp,编码198个氨基酸,分子量为22.69 kD,等电点(pI)为8.72。序列比对和进化分析表明,BcaMYBL2-1来源于B基因组。芸薹属6个物种MYBL2-1和MYBL2-2同源基因中,仅BraA07.MYBL2-1、BolC06.MYBL2-1和BcaMYBL2-1在不同叶色材料中存在序列差异。经遮光处理后,紫叶材料叶色变浅,在白菜紫宝5号中,BraA07.MYBL2-1和BraA02.MYBL2-2表达量分别为未遮光部分的0.7和0.4倍;在紫叶白花甘蓝型油菜中,BnaA07.MYBL2-1、BnaC06.MYBL2-1、BnaA02.MYBL2-2和BnaC02.MYBL2-2表达量分别为未遮光部分的0.4、0.5、0.4和0.4倍;在紫叶芥中,BjuA07.MYBL2-1、BjuB03.MYBL2-1、BjuA02.MYBL2-2和BjuB05.MYBL2-2表达量分别为未遮光部分的0.4、0.3、0.4和0.2倍;在紫秆埃芥中,BcaMYBL2-1、BcaB03.MYBL2-1和BcaC03.MYBL2-2表达量分别为未遮光部分的0.3、0.4和0.5倍,而BcaB05.MYBL2-2表达量为未遮光部分的2.4倍。对比芸薹属不同叶色材料MYBL2基因表达情况,结果表明,除了羽衣甘蓝,在紫叶材料中MYBL2基因大部分同源基因的表达量均高于绿叶。在羽衣甘蓝中,绿叶羽衣甘蓝BolC06.MYBL2-1和BolC02.MYBL2-2的表达量分别为紫叶羽衣甘蓝的2.5和3.5倍;在甘蓝型油菜中,紫叶白花BnaA07.MYBL2-1、BnaC06.MYBL2-1和BnaC02.MYBL2-2的表达量分别为绿叶白花的7.5、8.6和26.0倍,而绿叶白花BnaA02.MYBL2-2的表达量为紫叶白花的13.0倍;在芥菜型油菜中,紫叶芥BjuA07.MYBL2-1、BjuB03.MYBL2-1、BjuA02.MYBL2-2和BjuB05.MYBL2-2的表达量分别为四川黄籽的8.3、11.8、23.2和14.6倍;在埃塞俄比亚芥中,紫秆埃芥BcaMYBL2-1、BcaB03.MYBL2-1的表达量分别为W-BCDH76的7.1和27.6倍,而W-BCDH76的BcaB05.MYBL2-2和BcaC03.MYBL2-2的表达量则分别为紫秆埃芥的2.8和5.0倍。依据克隆的基因序列设计出5对引物,可以有效鉴别芸薹属植物MYBL2基因的A、B、C基因组来源。【结论】芸薹属紫叶材料MYBL2基因的表达与光照密切相关,而且参与花青素生物合成的调控机制与拟南芥MYBL2负调控花青素生物合成的机制有所不同。 展开更多
关键词 芸薹属植物 MYBL2基因 同源克隆 基因表达 基因组pcr鉴别
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Cloning of Bt cry Genes by Rapid Screening of DNA Libraries with PCR-RFLP
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作者 CHEN-Zhong-yi HUANGDa-fang 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2003年第2期132-136,共5页
Bacillus thuringiensis (Bt) strain C002 contains crylAa, cry2Ab, crylCa insecticidal crystal genes and an unkown gene cryX, among which crylCa is located in a 6 -9 kb EcoR I fragment of the chromosomal DNA. The total ... Bacillus thuringiensis (Bt) strain C002 contains crylAa, cry2Ab, crylCa insecticidal crystal genes and an unkown gene cryX, among which crylCa is located in a 6 -9 kb EcoR I fragment of the chromosomal DNA. The total DNA and the plasmids DNA libraries of C002 were constructed in Bt-E. coli shuttle plasmid pHT315 by inserting 6 - 9 kb chromosomal and plasmid DNA fragments prepared respectively with EcoR I complete and 5au3A I partial digestion. On the basis of every 50 transformants pooled together from 5-10 tubes, the pools containing about 2 000 transformants from the plasmids DNA library and 400 transformants from the total DNA library were rapidly screened by PCR-RFLP. Clones containing crylAa, cryX, crylCa , and cry2Ab were isolated and named as pHT-1Aa, pHT-X, pHT-1Ca and pHT-2Ab respectively. Restriction analysis indicated that pHT-1Aa, pHT-1Ca and pHT-2Ab had the typical physical map of the homologous cry genes. Furthermore, each plasmid was transferred into Bt acrystalliferous strain cryB- by eletropora-tion. SDS-PAGE result showed that transformant of pHT-1Ca expressed 130 kDa protein and bioassay result proved its high toxicity against Spodotera exigua 1st instar larvae with 100% corrected motality. 展开更多
关键词 Bacillus thuringiensis DNA library pcr-RFLP cry genes Gene cloning
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Cloning a Full-length cDNA Encoding UDP-glucose Pyrophosphorylase from Amorpha fruticosa by PCR-based Methods
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作者 刘文哲 Hu Xuejun +4 位作者 Gao Xiaorong Yuan Xiaodong Liu Zhe FAN Qi An Lijia 《High Technology Letters》 EI CAS 2002年第3期5-10,共6页
A method based on degenerate Oligo primed polymerase chain reaction (PCR) and random amplification of cDNA end (RACE) PCR for cloning a full length cDNA is described. An Amorpha fruticosa cDNA clone encoding UDP gluco... A method based on degenerate Oligo primed polymerase chain reaction (PCR) and random amplification of cDNA end (RACE) PCR for cloning a full length cDNA is described. An Amorpha fruticosa cDNA clone encoding UDP glucose pyrophosphorylase (UGP), a key enzyme producing UDP glucose in the synthesis of sucrose and cellulose, is cloned by using this method. We design 5’ RACE primers based on UGPA1 fragment, which obtains from degenerate PCR. Inverse PCR and nested PCR enable cloning of the remainder 5’ and 3’ end fragments of the gene. The deduced amino acid sequence exhibits significant homology with the other UGP genes cloned. This method is more simple and inexpensive than screening cDNA library, and can be easily adapted to clone other genes. 展开更多
关键词 CDNA UDP葡萄糖 聚合反应
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Isolating cDNA clones from rice induced by Magnaporthe grisea using PCR based differential screening method
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作者 DONG Haitao, DONG Jixin, WU Yuliang, HE Zuhua,and Li Debao,Biotechnology Institute,ZheJiang Agri Univ, Hangzhou 310029, China 《Chinese Rice Research Newsletter》 1998年第3期1-2,共2页
The differential hybridization technique hasbeen widely used to identify genes that are dif-ferentially expressed.However,this approachhas several drawbacks.First,the screeningprocedures are rather labor-intensive and... The differential hybridization technique hasbeen widely used to identify genes that are dif-ferentially expressed.However,this approachhas several drawbacks.First,the screeningprocedures are rather labor-intensive and time-consuming.Second,the amount of phageDNAs transferred onto the two filters may notbe equivalent,which leads to an inaccurate se-lection of a positive clone.Third,isolation ofphage DNA is slow and cumbersome.Here,aPCR based differential screening method that 展开更多
关键词 cDNA pcr Isolating cDNA clones from rice induced by Magnaporthe grisea using pcr based differential screening method
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梅花鹿DLX5基因克隆及表达分析
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作者 王鹏 刘方政 +3 位作者 李萱博 王春花 于海浩 夏彦玲 《野生动物学报》 北大核心 2024年第1期50-57,共8页
为研究梅花鹿(Cervus nippon)DLX5基因的结构和功能,进一步探究其与梅花鹿茸角骨化机制间的关系,采用RT-PCR技术对梅花鹿DLX5基因进行克隆,获得包含全部编码区的c DNA序列,对该基因的氨基酸序列进行生物信息学分析并构建系统进化树,通过... 为研究梅花鹿(Cervus nippon)DLX5基因的结构和功能,进一步探究其与梅花鹿茸角骨化机制间的关系,采用RT-PCR技术对梅花鹿DLX5基因进行克隆,获得包含全部编码区的c DNA序列,对该基因的氨基酸序列进行生物信息学分析并构建系统进化树,通过KEGG富集分析其信号通路,运用实时荧光定量RT-PCR检测该基因在鹿茸生长不同时期的表达情况。结果表明:梅花鹿DLX5基因编码区长为870 bp,共编码289个氨基酸。DLX5蛋白为可溶性的不稳定蛋白,有2个保守结构域,主要定位于细胞核。梅花鹿DLX5蛋白与许多不同物种来源的DLX5蛋白氨基酸序列有较高相似度,比较保守。DLX5蛋白二级结构中无规则卷曲占比最大(78.89%),其后依次是α-螺旋、延伸链,占比分别为16.96%和4.15%。DLX5基因主要的作用通路为TGFβ信号通路、MAPK信号通路和Wnt信号通路等。实时荧光定量RT-PCR结果表明,DLX5基因在鹿茸生长后期(三杈茸)表达量显著增高,这种上调表达暗示了其在鹿茸骨化过程中发挥重要作用,说明其可能是鹿茸骨化相关候选基因。 展开更多
关键词 梅花鹿 DLX5基因 基因克隆 生物信息学分析 实时荧光定量RT-pcr
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猪附红细胞体PCR检测方法的建立 被引量:18
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作者 王妍 张守发 +1 位作者 刘思国 王春来 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期2153-2156,共4页
根据已发表的部分猪附红细胞体序列设计了一对特异性引物,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增出了一条约936bp的基因片段,并成功地将该基因克隆于克隆载体PMD18-T,经酶切分析和PCR进一步鉴定后进行序列测定,结果表明,所克隆的目的基因与GenBan... 根据已发表的部分猪附红细胞体序列设计了一对特异性引物,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增出了一条约936bp的基因片段,并成功地将该基因克隆于克隆载体PMD18-T,经酶切分析和PCR进一步鉴定后进行序列测定,结果表明,所克隆的目的基因与GenBank中发表的序列一致。并利用特异性引物初步建立了猪附红细胞体病PCR检测技术。 展开更多
关键词 附红细胞体 克隆 pcr pcr检测方法 猪附红细胞体病 聚合酶链式反应 GENBANK 特异性引物 序列设计
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有齿食道口线虫ITS及5.8S DNA片段的PCR扩增、克隆及序列分析 被引量:14
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作者 林瑞庆 陈丽莎 +5 位作者 翁亚彪 吴绍强 邹丰才 李明伟 宋慧群 朱兴全 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期639-642,共4页
运用 PCR 方法以保守引物 NC5 及 NC2 扩增了从广东阳江地区猪体分离的食道口线虫 rDNA 的内转录间隔区(ITS)及 5.8S 序列。将 PCR 扩增出的片段纯化后克隆至 pGEM-T Easy 载体,用 PCR 技术及酶切鉴定阳性菌落,对阳性菌落质粒 DNA 进行... 运用 PCR 方法以保守引物 NC5 及 NC2 扩增了从广东阳江地区猪体分离的食道口线虫 rDNA 的内转录间隔区(ITS)及 5.8S 序列。将 PCR 扩增出的片段纯化后克隆至 pGEM-T Easy 载体,用 PCR 技术及酶切鉴定阳性菌落,对阳性菌落质粒 DNA 进行测序。结果表明,扩增的片段大小为 828 bp,包含部分的 18S、28S 及全部的 ITS-1(362 bp)、5.8S(153 bp)及 ITS-2(217 bp)序列。序列比较表明,该食道口线虫为有齿食道口线虫。本研究在国际上首次报道了中国猪有齿食道口线虫的 ITS 及 5.8S 序列,为食道口线虫的分子生物学的进一步研究奠定了基础。 展开更多
关键词 阳性 菌落 pcr扩增 克隆 阳江地区 首次 DNA片段 食道口线虫 中国猪 猪体
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采用FISH、DGGE和Cloning对短程脱氮系统中硝化菌群的比较分析 被引量:22
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作者 曾薇 杨庆 +4 位作者 张树军 马勇 刘秀红 彭永臻 李军 《环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期734-739,共6页
针对4种不同的实际污水短程生物脱氮系统(SBR大型中试反应器、UASB-A/O小型反应器、A/O中试反应器和SBR小型反应器),采用Fish、PCR-DGGE和PCR-Cloning-Sequencing分子生物学方法对系统中硝化菌群AOB和NOB进行定性与定量化分析.Fish结... 针对4种不同的实际污水短程生物脱氮系统(SBR大型中试反应器、UASB-A/O小型反应器、A/O中试反应器和SBR小型反应器),采用Fish、PCR-DGGE和PCR-Cloning-Sequencing分子生物学方法对系统中硝化菌群AOB和NOB进行定性与定量化分析.Fish结果表明,在4种短程脱氮系统中,AOB相比于NOB已成为明显的优势菌群,占总菌群的3%~12%;在SBR中试和小试反应器中没有检测出NOB;A/O中试反应器中存在极少量的Nitrospira(<0.2%),而UASB-A/O小型反应器中存在极少量的Nitrobacteria(<0.2%).PCR-DGGE结果表明SBR中试、A/O和UASB-A/O 3种短程脱氮系统中的AOB均以Nitrosomonas-like为主.SBR大型中试反应器中污泥样品的PCR-Cloning-Sequencing结果表明,所有的克隆相似于Nitrosomonas,其中60%以上的克隆相似于Nitrosomonas europaea. 展开更多
关键词 短程脱氮 AOB FISH pcr-DGGE pcr-cloning-Sequencmg
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简并PCR技术及其在基因克隆中的应用 被引量:29
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作者 王洪振 周晓馥 +2 位作者 宋朝霞 刘文广 曾宪录 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期201-204,共4页
本文简要介绍简并PCR技术,包括什么是简并引物,如何设计简并引物,进行简并PCR的反应条件,应用简并PCR获得全长基因的方法和简并PCR技术的应用范围,并对简并PCR技术的局限性及其新进展进行讨论。在此基础上,简述基因的克隆策略以及简并PC... 本文简要介绍简并PCR技术,包括什么是简并引物,如何设计简并引物,进行简并PCR的反应条件,应用简并PCR获得全长基因的方法和简并PCR技术的应用范围,并对简并PCR技术的局限性及其新进展进行讨论。在此基础上,简述基因的克隆策略以及简并PCR技术在基因克隆中的应用。简并PCR技术是寻找和发现"新"基因或蛋白质家族新成员的一种非常有用的工具。 展开更多
关键词 简并pcr 简并引物 基因克隆
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水中轮状病毒实时定量PCR外标准品的构建 被引量:15
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作者 胡秀华 何苗 +2 位作者 刘丽 李丹 施汉昌 《环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第2期380-385,共6页
采用细胞培养和T-A克隆技术,在轮状病毒主要结构蛋白VP7基因序列上设计合成引物,经PCR扩增后将特异性产物连接入pGEM-T-easy载体中,经过酶切鉴定和测序分析获得轮状病毒cDNA标准品.利用常规PCR和实时定量PCR方法对所获得的cDNA标准品进... 采用细胞培养和T-A克隆技术,在轮状病毒主要结构蛋白VP7基因序列上设计合成引物,经PCR扩增后将特异性产物连接入pGEM-T-easy载体中,经过酶切鉴定和测序分析获得轮状病毒cDNA标准品.利用常规PCR和实时定量PCR方法对所获得的cDNA标准品进行特异性、稳定性和重复性指标的检验.结果表明,利用此标准品制备的标准曲线具有较高的扩增效率和良好的线性关系(斜率为-3.353,R^2=0.995);实时定量PCR熔解曲线分析表明,温度在81℃±0.5℃的PCR产物是轮状病毒VP7序列上的特异性产物,表明此标准品是轮状病毒特异性的;同时,所制备的标准品在实时定量PCR检测中具有较大的线性范围(9×10^0~9×10^11copies/μL,每个反应最低可以检测到9个拷贝数的轮状病毒cDNA,表明利用该标准品进行实时定量PCR分析时具有较高的检测灵敏性;此外,该标准品具有较高的稳定性和重复性(3次独立实验CV值在0.2%~0.9%之间),可长期稳定保存.构建的标准品可用作检测水环境中轮状病毒的实时荧光定量PCR的外标准品. 展开更多
关键词 轮状病毒 克隆 标准品 实时荧光定量pcr
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一种PCR产物克隆的新方法——T-A克隆法 被引量:23
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作者 李新波 赵小松 +2 位作者 田德志 朱依纯 姚泰 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1999年第2期187-189,共3页
介绍一种PCR产物克隆的新方法———TA克隆法.用改良碱裂解法抽提pBluescriptSK(+)质粒,用EcoRⅤ将pBluescriptSK(+)质粒切成平端,利用TaqDNA聚合酶及dTTP制备pBluesc... 介绍一种PCR产物克隆的新方法———TA克隆法.用改良碱裂解法抽提pBluescriptSK(+)质粒,用EcoRⅤ将pBluescriptSK(+)质粒切成平端,利用TaqDNA聚合酶及dTTP制备pBluescriptSK(+)TA载体.将βactincDNA片段克隆入自制的pBluescriptSK(+)TA载体,经EcoRⅠ及HindⅢ双酶切得到与设定长度一致的βactincDNA片段. 展开更多
关键词 T-A克隆载体 pcr产物 T-A克隆法
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巨峰葡萄查尔酮合成酶基因4的克隆及表达特性的RT-PCR分析 被引量:11
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作者 周军 陶建敏 +9 位作者 彭日荷 熊爱生 蔡斌 徐锦涛 金晓芬 张斌 高峰 高建杰 章镇 姚泉洪 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第2期39-44,共6页
克隆了葡萄查尔酮合成酶基因4(CHS4),并采用半定量RT-PCR技术,以actin为内参,分析了CHS4在巨峰葡萄果实发育阶段不同组织的表达。对CHS4的序列分析表明:CHS4含有1个内含子,2个外显子;与CHS1、CHS2、CHS3在核苷酸水平的同源性分别为99.3%... 克隆了葡萄查尔酮合成酶基因4(CHS4),并采用半定量RT-PCR技术,以actin为内参,分析了CHS4在巨峰葡萄果实发育阶段不同组织的表达。对CHS4的序列分析表明:CHS4含有1个内含子,2个外显子;与CHS1、CHS2、CHS3在核苷酸水平的同源性分别为99.3%、92.6%和76.0%。半定量RT-PCR分析结果表明:CHS4在果皮、果肉、种子、叶片和根系中均有表达,在花后30d的果皮中表达强烈,随后迅速降低,到花后70d表达又增强;CHS4在花后30~45d的果肉中表达强烈,随后迅速降低;在花后45d的种子中也表达强烈,随果实发育,其表达逐渐下降。高温处理抑制CHS4在巨峰葡萄幼叶中的表达,但诱导CHS4在幼根的表达。 展开更多
关键词 查尔酮合成酶基因4 巨峰葡萄 克隆 RT-pcr
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马铃薯纺锤块茎类病毒RT-PCR检测及全序列分析 被引量:11
14
作者 吴志明 贾晓梅 +3 位作者 谢晓亮 温春秀 田伟 张庆良 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2003年第F09期63-65,共3页
根据马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)基因序列设计合成引物,以感病组织和健康组织总RNA为模板,经RT PCR法扩增出全长的cDNA片段,结果从感病组织中扩增出与预期的360bp大小的目标片段,而健康组织无此扩增产物;将其克隆到质粒pGEM T载体上,... 根据马铃薯纺锤块茎类病毒(PSTVd)基因序列设计合成引物,以感病组织和健康组织总RNA为模板,经RT PCR法扩增出全长的cDNA片段,结果从感病组织中扩增出与预期的360bp大小的目标片段,而健康组织无此扩增产物;将其克隆到质粒pGEM T载体上,进行全序列分析。结果表明,与国内外的报道相比较,核苷酸同源率高达98%以上。PCR产物克隆作为RT PCR反应的阳性对照,解决了毒源保存和传播的问题,为进一步进行抗PSTVd基因工程研究打下了良好基础。 展开更多
关键词 马铃薯 纺锤块茎类病毒 PSTVD 基因序列 全序列分析 RT-pcr检测 抗病品种 脱毒种苗
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李矮缩病毒RT-PCR方法建立及检测应用 被引量:16
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作者 侯义龙 杨俊玲 李春敏 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期425-427,共3页
以感病和健康指示植物GF305的总RNA为模板,进行cDNA的合成和PCR扩增,结果从感病材料中扩增出与预期的172bp大小一致的目的片段,而健康的材料无此扩增产物。对此PCR扩增产物克隆测序,进一步佐证了RT-PCR检测结果。经过多次试验验证该检... 以感病和健康指示植物GF305的总RNA为模板,进行cDNA的合成和PCR扩增,结果从感病材料中扩增出与预期的172bp大小一致的目的片段,而健康的材料无此扩增产物。对此PCR扩增产物克隆测序,进一步佐证了RT-PCR检测结果。经过多次试验验证该检测体系,都可得到很好的重演性,从而建立了李矮缩病毒快速、灵敏、准确的RT-PCR检测技术,并进行了实际应用。 展开更多
关键词 矮缩病 RT-pcr检测技术 指示植物 扩增产物 pcr扩增 病毒 RT-pcr方法 健康 GF 灵敏
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淋病奈瑟菌隐蔽性质粒的克隆及PCR的建立与应用 被引量:7
16
作者 叶芳耘 蔡龙荣 +4 位作者 施少林 何建文 辛宏 于洋 晏碧君 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 1995年第2期71-73,共3页
用分子生物学方法自淋病奈瑟菌标准分离株中克隆了4.2kb的隐蔽性质粒,并根据该质粒DNA序列,设计引物,建立淋病奈瑟菌PCR检测方法。该方法标本处理简单、反应程序优化,可在2.5小时内完成一次检测。对21株淋病奈瑟菌... 用分子生物学方法自淋病奈瑟菌标准分离株中克隆了4.2kb的隐蔽性质粒,并根据该质粒DNA序列,设计引物,建立淋病奈瑟菌PCR检测方法。该方法标本处理简单、反应程序优化,可在2.5小时内完成一次检测。对21株淋病奈瑟菌标本进行检测,结果全为阳性;而对22株其它菌株检测均为阴性,证实了该法的特异性。与涂片、培养法比较,PCR阳性率最高。结合临床检测了706例性病患者,总阳性率为28.6%(202/706)。实验表明该PCR方法简便快速、敏感特异,对淋病的流行病学调查和早期防治有重要意义。所克隆的含有4.2kb隐蔽性质粒DNA还可用作制备探针和PCR阳性对照。 展开更多
关键词 淋病奈瑟菌 质粒 克隆 聚合酶链反应
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烟草环斑病毒PCR产物的克隆及部分序列分析 被引量:8
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作者 相宁 孙彤 +2 位作者 刘宏迪 张成良 杨立 《植物检疫》 北大核心 1998年第5期260-263,共4页
将TRSV的PCR产物与pGET-TEasyVector连接,克隆到大肠杆菌TG1中,得到白色菌落,重组质粒通过酶切鉴定、PCR扩增和部分序列分析,表明TRSV的PCR产物确实插入了质粒,并已克隆到大肠杆菌中,测序列... 将TRSV的PCR产物与pGET-TEasyVector连接,克隆到大肠杆菌TG1中,得到白色菌落,重组质粒通过酶切鉴定、PCR扩增和部分序列分析,表明TRSV的PCR产物确实插入了质粒,并已克隆到大肠杆菌中,测序列240个碱基,与资料显示的序列相比较,同源性达92.5%,可用于解决病毒检疫应用中阳性对照有扩散危险的疑难问题。 展开更多
关键词 烟草 环斑病毒 pcr产物 序列分析 克隆
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改进的反向PCR技术克隆转移基因的旁侧序列 被引量:19
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作者 李竹红 刘德培 梁植权 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 1999年第6期600-602,共3页
对传统的反向PCR 技术作了一些改进: 用巢式PCR 扩增含量极少的靶序列; PCR 反应体系中加入5 % 的甲酰胺以减少非特异性扩增. 结果表明, 改进的反向PCR 体系是克隆人基因组已知片段旁侧序列的高度灵敏、高度特异的方法.
关键词 反向pcr 旁侧序列 转移基因
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TAIL-PCR方法快速克隆银杏查尔酮合成酶基因及序列分析(英文) 被引量:20
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作者 许锋 程水源 +2 位作者 王燕 李琳玲 程述汉 《果树学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期237-243,共7页
热不对称交错PCR(TAIL-PCR)方法已广泛应用于从多种生物克隆已知DNA序列的侧翼序列。对传统的TAIL-PCR方法进行改良:(1)将TAIL技术应用于TAIL-PCR中第3步PCR循环。(2)以10bp的随机简并引物即RAPD引物代替基因侧翼简并引物。以银杏品种... 热不对称交错PCR(TAIL-PCR)方法已广泛应用于从多种生物克隆已知DNA序列的侧翼序列。对传统的TAIL-PCR方法进行改良:(1)将TAIL技术应用于TAIL-PCR中第3步PCR循环。(2)以10bp的随机简并引物即RAPD引物代替基因侧翼简并引物。以银杏品种家佛手的叶基因组DNA为模板,利用简并引物克隆到银杏查尔酮合成酶基因(CHS)片段序列Gbchs1,以此序列设计3条特异引物,利用改良的热不对称交错PCR方法克隆到CHS基因Gbchs2。结果表明,Gbchs2长1238bp,编码304个氨基酸并包含3’末端序列。GbCHS2蛋白质序列与其他植物的CHS蛋白质序列高度同源,包含CHS蛋白质保守的环化作用活性位点,催化活性位点、香豆素活性位点、及催化活性基序。改良后的TAIL-PCR方法为基因全长的克隆提供了一种简单快速高效的新方法。 展开更多
关键词 银杏 热不对称交错pcr 查尔酮合成酶基因 克隆 序列分析
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PCR技术在住肉孢子虫虫种鉴定上的应用 被引量:4
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作者 汪明 孔繁瑶 +2 位作者 肖兵南 董海涛 张长弓 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第S2期52-59,共8页
采用 RAPD 方法对水牛梭形住内孢子虫、待定种及黄牛枯氏住内孢子虫缓殖子基因组 DNA 进行了分析,待定种 PCR 产物的电泳带型与枯氏住肉孢子虫的差异较梭形住内孢子虫大,这与二者表型性状一致的研究结果不吻合.对3种包囊种特异性的 PCR... 采用 RAPD 方法对水牛梭形住内孢子虫、待定种及黄牛枯氏住内孢子虫缓殖子基因组 DNA 进行了分析,待定种 PCR 产物的电泳带型与枯氏住肉孢子虫的差异较梭形住内孢子虫大,这与二者表型性状一致的研究结果不吻合.对3种包囊种特异性的 PCR 指纹进行了筛选,回收和纯化了3种包囊种特异性的 DNA 片段,待定种0.7kb 片段经α-^(32)PdATP 标记后用作探针,只与同源 DNA 杂交,不与其它包囊、宿主细胞和艾美耳球虫杂交,用 pGEM-T Easy Vector 对该片段克隆成功,并测出其全长序列,为进一步设计特异引物建立标准 PCR 诊断方法和用作核酸探针奠定了基础。 展开更多
关键词 住肉孢子虫 多聚酶链反应 分子杂交 分子克隆
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