种加词以地域定名的竹种分析

整理出世界竹子清单(World Checklist of Bamboos,WCBs)中隶属73个竹属里的以地域名称命名的352个竹种,其中50个竹种以国家、洲际等大尺度地理区域名称命名,302个竹种以省市、山川等地域名称命名(中国128个),发现约有1/5竹种、竹属以地域定名,比较普遍。详细分析了以竹属、竹区、命名人、合格发表时间等约束因素条件下的种加词拉丁化定名现象,以及其中的多类型地域名称种加词的凝练形式。提出区别对待新陈、扬弃地域定名的观点,以修订新版植物命名法规,更准确反映竹子的遗传地理特性,甄别竹种,服务竹业。

分枝杆菌菌种中文译名专家共识

分枝杆菌是一大类革兰氏阳性、杆状、抗酸染色阳性的细菌,包含诸如结核分枝杆菌等很多重要的危害人类健康的病原菌。2018年分枝杆菌分类学发生了重大变革,将分枝杆菌属拆分为分枝杆菌属及4个新的属。2018-2022年新鉴定出34个菌种。为使从事结核病防治的工作者及基础研究人员对照了解新命名的变化,同时也为99个尚无中文译名的菌种确定规范的中文名称,中国疾病预防控制中心传染病预防控制所及中国防痨协会人兽共患结核病专业分会组织业内专家,通过资料查询、专家研讨的方式,在既有中文译名专家共识的基础上,沿用中华医学会结核病学分会制定分枝杆菌菌种中文译名的原则,对分枝杆菌菌种的中文译名进行了补充及更新,并形成本专家共识。

ICNP与SeqCode:组学时代原核生物命名面临的机遇与挑战

自1936年细菌学家Buchanan负责起草专门的细菌命名法规以来,国际原核生物命名法规(International Code of Nomenclature of Prokaryotes,ICNP)在不断发展和完善过程中,积极促进了原核生物分类学及相关学科的发展。随着组学技术在原核生物多样性研究中的应用,越来越多未培养的细菌和古菌新类群被发现,却因为ICNP要求活的生物材料作为命名模式(nomenclatural type),而无法获得生效名称(validly published name)。2022年,原核生物命名法规从序列数据描述原核生物命名法(Code of Nomenclature of Prokaryotes Described from Sequence Data,SeqCode)正式发布,以补充ICNP在未培养微生物类群命名方面的不足。SeqCode不希望和ICNP产生较大分歧,并尽可能保留在将来和ICNP合并的可能性。然而,作为两种独立运行的命名法规,尚不明确SeqCode和ICNP并存会对学术界产生怎样的影响。本文系统介绍了ICNP和SeqCode各自的发展历程和主要内容,分析了二者的优势和局限性,并呼吁微生物学相关领域的学者共同关注原核生物命名法规并应用于实践,以期构建更加合理、有效的原核生物名称系统。

大叶十字苣苔的正确学名考证

正确学名是物种在国际上的唯一通用名称,最大限度减少了交流时的歧义,若使用有误则会造成研究和生产的混乱。苦苣苔科(Gesneriaceae)作为一个研究活跃的类群,名称上的变动较多,也引发了一些问题。长期以来,不同文献中大叶十字苣苔(Stauranthera grandifolia Benth.)的种加词有grandifolia和grandiflora两种使用情况。本文根据《国际藻类、菌物和植物命名法规》的规定,使用文献考证的方法,确定大叶十字苣苔的种加词应为grandifolia。

关于竹类栽培品种国际登录中的命名问题

在国际竹类栽培品种登录实践中,命名问题是一个关键性问题,事关国际登录工作的成败,理应引起各从事竹品种研究、开发、培育、生产、推广、加工和贸易的单位、企业或个人的高度重视。本文依据《国际栽培植物命名法规》中关于栽培植物命名的相关规定,结合竹类植物的具体特点,对竹栽培品种的命名规则、要求与方法进行了专题阐述,目的在于为相关从业者提供专业指导和帮助,从而减少在国际竹类栽培品种登录中不必要的精力、时间和成本付出。

世界慈竹属栽培品种整理

全世界竹亚科(Bambusoideae)慈竹属(Neosinocalamus Keng f.)植物只有2种,均产自中国,主要分布于长江流域,以四川盆地最为丰富,分布面积约10万hm2。由于历史上慈竹与人类的生产生活关系密切,故其资源随着人类社会的不断发展而逐步扩大,目前所见慈竹属植物大多为人工栽培。其中,慈竹N.affinis(Rendle)Keng f.有10个栽培品种,方城慈竹N.fangchengensis Yi et J.Y.Shi有2个栽培品种。文章整理了这些栽培品种及其相关信息,以便查阅和参考。

国际竹类栽培品种登录的理论与实践

国际竹类栽培品种登录的理论基础是由国际权威组织正式颁布实施的《国际栽培植物命名法规》(ICNCP)及其相关理论支撑体系;国际竹类栽培品种登录实践的有效开展则有赖于国际栽培植物登录权威体系的建立、国际竹类栽培品种登录中心的组建和国际竹类栽培品种登录规则的制定。据此,文章系统介绍了《国际栽培植物命名法规》的基本情况以及与《国际植物命名法规》(ICBN)的相互关系,国际栽培植物登录权威(ICRA)体系的基本概念及其与法定植物登录权威(SPRA)的相互关系,申报国际竹类栽培品种登录权威的目的、意义、必要性及其资源基础,国际竹类栽培品种登录权威的申报与批准,国际竹类栽培品种登录工作的组织形式、操作方法、阶段性成果及发展趋势,旨在为世界各产竹国、产竹区和从事竹资源研发、培育、生产、加工、交流和利用的机构、企业及个人开展竹类栽培品种国际登录提供指导和帮助。

微体化石研究中应注意的问题

多数微体化石仅是生物体的一部分,我国微体古生物学家对生物整体或器官的研究不够,相当多的作者仍在命名大量的形态属种,落后于世界古生物学的发展现状。微体化石是重要的,但微体古生物学家不能过份强调微体化石的重要而忽视与大化石和岩相研究的结合。在化石处理和鉴定过程中,由于微体古生物研究者对混杂问题注意和警惕不够,以至混入现代生物,误作化石。我国小壳化石的新属中,至少有5个属都是现代植物的种子或颖果,有的属中,也包括了无机成因的微球粒,这是值得我们特别警惕的。化石处理过程中,样品一定要冲洗干净,避免杂质,鉴定中,首先要确定是否为化石。目前,我国古生物界存在很多违反国际动物命名法规的现象,出版界也没有注意把关,古生物学家和出版界编辑都应注意遵守国际动物命名法规。

我国古植物命名中若干值得重视的问题——兼述维也纳法规中有关的规定

根据2006年发表的新版国际植物命名法规(维也纳法规)的有关规则和条款,讨论我国古植物命名中一些值得重视的和存在的问题,着重在分类单元名称的合格发表、模式指定以及拉丁属、种名称构成和性别等几个方面。文中也介绍了新法规中对古植物形态分类单元(morphotaxa)定义的改变和相关规则的更动情况,以及有关在学位论文和电子版文档中发表分类单元名称等新规则。文后附有古植物命名的一些重要规则生效的日期和相关说明。

苦苣苔科植物学名种加词的问题

苦苣苔科植物是个研究活跃的类群,近年来随着新类群的报道和分类系统的变动,在该科的分类学研究中,出现了不少学名的种加词的性和属名不一致或出现拼写错误的情况,虽然这些错误不影响该名称的合格发表,但还是有必要根据《国际藻类、菌物和植物命名法规》进行改正。该文就苦苣苔科植物中属名以-stigma结尾的学名、属名以-cheilos结尾的学名、根据属名词尾不容易判断出性别的学名、拼写错误的名称等问题进行了分析,并对13个不符合法规的名称予以改正。此外,还就苦苣苔科植物学名的合格发表和规范使用进行了讨论。

丝绦蚴集群与猬旋宫绦虫种名有效性

寄生虫和宿主的学名要服从《国际动物命名法规》,关键要素是科、属、种分类单元名称的载名模式原则、优先原则和同名关系原则,指导动物学家正确、一致地使用可用名,不正确的名称是无效名。集群是为某些集合动物体的分类权宜而特别建立的名称,按属级名称对待,但无模式种,不参预优先原则竞争。假叶目绦虫的稚绦期发育中,全尾蚴的中文术语不合称裂头蚴,无据称"无头蚴";俗名丝绦蚴用作专业术语丝绦蚴,以属级名称对待权宜称丝绦蚴集群。双槽绦虫名称不该被裂头绦虫占用,旋宫绦虫名称比迭宫绦虫更符合原文。旋宫绦虫属genus Spirometra原始指定的属模种是伪装双槽绦虫Diphyllobothrium decipiens(Diesing,1850);2010年英国保健与农业局数据库(CAB Thesaurus)收录猬旋宫绦虫Spirometra erinacei是有效名,欧猬旋宫绦虫Spirometra erinaceieuropaei和曼氏双槽绦虫Diphyllobothrium mansoni(Joyeux et Houdemer,1928)都是其异名。

世界方竹属栽培品种整理

全世界竹亚科(Bambusoideae)方竹属(Chimonobambusa Makino)植物约有30余种及种下分类群,主要分布于中国(秦岭以南各地区及西藏东南部)、日本和越南,缅甸、美国、欧洲也有少量引栽。根据《国际栽培植物命名法规(ICNCP)》的相关规则和要求,国际竹类栽培品种登录中心(ICRCB)组织有关专家,对竹亚科方竹属的栽培品种进行了系统整理。到目前为止,已经确认全世界有17个栽培品种,涉及4个不同的方竹属竹种。现将这些栽培品种及其相关信息整理报道,以便查阅和参考。

世界单竹属栽培品种研究

竹亚科(Bambusoideae)单竹属(Lingnania McClure)是竹类植物中的一个特殊类群,由于其节间较长,特别适于劈蔑编制生产和生活用品,历史上一直都是其分布区居民不可或缺的生产和生活资料,被广泛栽培和应用。单竹属植物种类较少,全世界近20种,中国产14种,主要分布于华中及华南部分省区。越南有少量分布。为适应国际竹类栽培品种登录工作的需要,依据《国际栽培植物命名法规(ICNCP)》的规则和要求,经系统整理,已确认单竹属传统栽培品种4个,新登录栽培品种1个,再加上2个原栽培品种,共计7个栽培品种,分属于2个不同竹种。现将这些栽培品种及其相关信息整理,以便查阅和参考。

一个不合格发表的新种名——福建双翅龙脑香

杨永康等建立并发表的化石新种福建双翅龙脑香(Dipterocarpus fujianensis Y.K.Yang,H.M.Li etJ.K.Wu sp.nov.fossil plant)未附任何照片或素描图,且无正规的模式标本登记号和确切的存放单位,与国际植物命名法规中有关古植物的重要条款和规则不符。因此,这个新种名属于不合格发表。

竹栽培品种的发表、建立与国际登录

《国际栽培植物命名法规》(ICNCP)对栽培植物的发表、建立与国际登录均有明确规定,竹栽培品种的发表、建立与国际登录亦应遵循该规则,这关系到该竹栽培品种存在及交流的科学性、有效性与合法性。文章根据ICNCP的相关规定,结合竹类植物的具体特点,对竹栽培品种的发表、建立与国际登录、尤其是三者之间的相互关系进行了专题阐述,目的在于为相关从业者提供专业指导和帮助。

是细菌,还是藻类?

蓝藻早年被认为是藻类植物,在系统学上早已建有蓝藻门,近年来,蓝藻又被确认为原核生物,并与某些细菌十分相似之后,即有许多科学家称之为蓝细菌,并建议将之归于细菌类,这是生物学界近年中发生的一件大事,引起许多人的重视。但到目前为止,此问题尚未获得一致意见,更未采取统一行动。本文简述此事的大体经过,并着重介绍双方各自主张的理论根据和工作方法上有何不同。

竹品种国际登录中的重要术语及含义

在国际竹类栽培品种登录实践中,常常遇到许多专业术语语义不明、翻译困难等问题,给竹类栽培品种国际登录申请者及相关工作人员造成困扰。为便于准确使用登录用语、提高登录工作效率,国际竹类栽培品种登录中心(ICRCB)组织相关专家,以《国际栽培植物命名法规》(ICNCP)第八版和第九版附件《术语表》为基础,结合竹类植物的具体实际,编撰了这套适于竹品种国际登录的《术语表》并介绍了每个术语的基本含义。该《术语表》中的术语排序,是按汉语拼音的字首字母排列先后为序。

种级异物同名处理及属名变动影响分析

讨论《国际动物命名法规》 (简称《法规》)关于种级单元异物同名的处理及相关规定。以斧须隐翅虫亚科Oxyporinae的同名问题为例 ,笔者分析了属级单元名称变动对种级单元同名关系的影响。一些古老的属级单元有很长且比较复杂的分类历史 ,深入分析可将各类变化归纳为六类 ,其中三类与原同名有关 ,二类与后同名有关 ,余一类不再影响种级同名关系。文中讨论了第 4版《法规》中与种级同名关系有关的若干重要变动 ,通过分析比较 ,说明《法规》的这类变动如何影响动物分类名称的稳定性与正确性。这些分析 ,可望有助于避免产生新的次同名 ,也有助于正确恰当地解决已有的同名问题。

国际植物学墨尔本大会上命名法规的变化

2011年7月在第18届国际植物学大会命名法分会上通过了命名法规的一系列重大改动,并在全体大会上得到了接受批准。文中就命名法规的变化进行了简单概述,同时也讨论了这些变化的意义,特别是对菌物研究的意义,以期引起广大研究人员的关注。

中药信息学研究进展

本文对现阶段中药信息学的内容与特点进行了分析。总结了国内外近几年有突破性的中药信息学科研成果,简要介绍了随机森林、自组织映射、分子对接以及构建种质资源进化树等数据挖掘技术在中药信息学中的应用。阐述了结合现代信息技术的中药信息学对中药现代化发展的推动作用。通过实例指出了中药信息资源建设与维护中涉及到民间药物、植物化学、植物分类学等亟待解决的若干问题,同时论述了对中药信息学进行资源拓展的必要性和国际化的发展道路。