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Increment of hFIX expression with endogenous intron 1 in vitro
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作者 ZHENG BING XIAO YUN QIU +4 位作者 MIN TAN YONG NA XING DARU LU JING LUN XUE XIN FANG QIU(Institute of Genetics, Fudan Univerisity, Shanghai 200433) 《Cell Research》 SCIE CAS CSCD 1997年第1期21-29,共9页
This paper probes into the feasibility of increasing expression level of hFIX gene with endogenous nitron 1 sequence. hFIX minigene was obtained with middle sequence truncated nitron 1 inserted into the relative site ... This paper probes into the feasibility of increasing expression level of hFIX gene with endogenous nitron 1 sequence. hFIX minigene was obtained with middle sequence truncated nitron 1 inserted into the relative site of hFIX cDNA, and plasmid vector pKG5i’IX, retroviral vector GINaCi’IX were constructed. These vectors were transduced into target cells of PA317, C2C12, primary rabbit skin fibroblasts (RSF) and primary human skin fibroblasts (HSF). The expression level of mixed colonies are PA317/pKG5i’IX, 151 "g/106 cells/24h; PA317/GINaCi’IX, 308ng/106 cells/24 h; C2C12/G1 NaCi’IX, 186 ng/106 cells/24 h; RSF/GINaCi’IX, 1929 ng/106 cells/24 h; HSF/GlNaCi’IX, 1646 ng/106 cells/ 24 h. These results indicated that hFIX minigene with nitron 1 is able to increase the expression level to about 3 times of that of hFIX cDNA. Meanwhile, in order to study the application of hFIX minigene in the retroviral-mediated gene transfer system and refrain from nitron splicing during viral production, a retroviral vector GlNaCi’IXR with reversely inserted hFIX minigene expression cassette was constructed. The expression level of reverse constructor in PA317 cells was 390 ng/106 cells/24 h with 79% of bioactivity. PCR detection of HT/GlNaCi’IXR cells infected with PA317/ClNaCi’IXR supernatant confirmed the existence of nitron 1 sequence. These results suggested that expression vector with forward-inserted intronl-carrying hFIX expression cassette can be used in directed gene Human factor IX expression with nitron transfer, but when using the retroviral-mediated gene transfer system, reversely-inserted intronl-carrying hFIX expression cassette should be considered. 展开更多
关键词 基因内区1 hFIX 人类凝血因子IX 基因转化 体外高表达 反向插入序列 血友病B 基因治疗
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牦牛和普通牛DRB1*Intron1-exon2序列变异分析 被引量:3
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作者 田知利 陈杰 +5 位作者 胡江 罗玉柱 刘秀 李少斌 郭淑珍 牟永娟 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2016年第3期72-79,共8页
为揭示牦牛抗逆性及抗病育种积累更多的分子遗传学资料,通过检测DRB1基因在牦牛和普通牛群体中的变异,分析该基因检测区域遗传参数。以甘南牦牛、青海牦牛、天祝白牦牛、大通牦牛和普通牛为研究对象。应用PCR-SSCP方法检测BoLA-DRB1基因... 为揭示牦牛抗逆性及抗病育种积累更多的分子遗传学资料,通过检测DRB1基因在牦牛和普通牛群体中的变异,分析该基因检测区域遗传参数。以甘南牦牛、青海牦牛、天祝白牦牛、大通牦牛和普通牛为研究对象。应用PCR-SSCP方法检测BoLA-DRB1基因第1内含子及第2外显子部分序列多态性。DRB1基因第1内含子区检测到4处SNPs及1处插入/缺失突变,第2外显子区检测到17处SNPs,两区域均表现为高度多态;单倍型连锁分析发现21种intron 1-exon 2单倍型组型且存在单倍型连锁不平衡现象,A-A1、A-B1、B-A1和B-B1单倍型在牦牛和普通牛中频率较高;聚类分析表明,牦牛DRB1基因第2外显子区碱基序列与普通牛及山羊的同源性最高,系统进化情况与它们亲缘关系远近一致。牦牛和普通牛BoLA-DRB1基因第1内含子及第2外显子多态性丰富,可作为牦牛和普通牛BoLADRB1的遗传标记。 展开更多
关键词 牦牛 普通牛 DRB1基因 intron l EXON 2 多态性
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Association of TSHR gene intron 1 and 4p14 single-nucleotide polymorphisms and gene-gene interactions with Graves' disease
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作者 吴静 《China Medical Abstracts(Internal Medicine)》 2016年第3期129-,共1页
Objective To identify the association of thyroid stimulating hormone receptor(TSHR)gene intron 1 susceptible loci and 4p14 susceptible locus rs6832151 polymorphisms with Graves’disease(GD)in Han Chinese population in... Objective To identify the association of thyroid stimulating hormone receptor(TSHR)gene intron 1 susceptible loci and 4p14 susceptible locus rs6832151 polymorphisms with Graves’disease(GD)in Han Chinese population in Bengbu,Anhui,China.The gene-gene interaction among TSHR intron 1 susceptible loci and 4p14susceptible locus rs6832151 was also investigated.Methods The genotypes of the single-nucleotide polymor- 展开更多
关键词 TSHR Association of TSHR gene intron 1 and 4p14 single-nucleotide polymorphisms and gene-gene interactions with Graves DISEASE gene
原文传递
GK-IT1抑制JAK信号通路对胃癌细胞增殖和侵袭迁移的影响
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作者 王琼 李辉 伍勇彬 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2023年第12期974-979,共6页
目的研究长链非编码RNA GK内含子转录本1(GK-IT1)通过Janus激酶(JAK)信号通路对胃癌细胞生物学活性的影响。方法UALCAN平台分析胃癌组织中GK-IT1的表达。通过实时定量PCR(qPCR)评估GK-IT1在人胃癌细胞中的表达。BSG-823细胞进行GK-IT1... 目的研究长链非编码RNA GK内含子转录本1(GK-IT1)通过Janus激酶(JAK)信号通路对胃癌细胞生物学活性的影响。方法UALCAN平台分析胃癌组织中GK-IT1的表达。通过实时定量PCR(qPCR)评估GK-IT1在人胃癌细胞中的表达。BSG-823细胞进行GK-IT1干扰片段si-GK-IT转染或si-GK-IT转染与JAK2信号通路激活剂Coumermycin A1两者联合处理,分为阴性对照组、si-GK-IT1组和si-GK-IT1+JAK2组。通过CCK-8、划痕和Transwell实验评估细胞增殖、迁移和侵袭情况。qPCR或Western blot检测B细胞淋巴瘤2(Bcl-2)、裂解的半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(CCP3)、基质金属蛋白酶9(MMP-9)和磷酸化Janus激酶2(p-JAK2)的表达。结果GK-IT1在胃癌组织中表达上调,且与肿瘤分期和分级有关(P<0.05)。与胃黏膜上皮细胞RGM-1相比,胃癌细胞中GK-IT1表达水平更高(P<0.05)。与阴性对照组相比,si-GK-IT1组细胞增殖、迁移和侵袭能力减弱;si-GK-IT1+JAK2组逆转了上述结果(P<0.05)。与阴性对照组相比,si-GK-IT1组Bcl-2、MMP-9和p-JAK2的表达降低,而CCP3的表达升高(P<0.05);与si-GK-IT1组相比,除CCP3表达降低外,si-GK-IT1+JAK2组的其余因子表达增加(P<0.05)。结论GK-IT1通过JAK信号通路抑制来调控胃癌细胞的增殖和迁移侵袭过程,有望成为胃癌的潜在靶点。 展开更多
关键词 胃癌 GK内含子转录本1 增殖 侵袭迁移 JAK信号通路
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Construction and expression of inverted configuration of retroviral vector containing intron 1 of hFIX
5
作者 Wang Hongwei Bao Yun +5 位作者 Xin Yongna Yang Xiaoqin Shi Qian Lu Daru Qiu Xinfang Xue Jinglun 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 1998年第4期315-318,共4页
Intron was found to play an important role in improving gene expression. To improve the human factor IX(hFIX) expression level in hemophilia B gene therapy study, the retroviral vector containing intron 1 of hFIX gene... Intron was found to play an important role in improving gene expression. To improve the human factor IX(hFIX) expression level in hemophilia B gene therapy study, the retroviral vector containing intron 1 of hFIX gene was constructed in forwarded configuration, but the intron 1 was found spliced in virus particles by RT_PCR detection. So the inverted configuration vector G1NaPAi′IX was suggested and constructed on the basis of SNMBAIXm and transfected into PA317. Then C2C12 cells were transfected using the above virus supernatant and the G418_resistant clones were selected. PCR and RT_PCR detection found that intron 1 structure existed in C2C12 clones and retroviral particles. And the expression level of inverted vector was 3 times higher than that of forwarded vector. These results showed that the inverted configuration vector was in deed able to avoid splicing of intron 1 during the process of retroviral packaging and improved the expression level of hFIX protein. 展开更多
关键词 hFIX CDNA intron 1 RETROVIRAL VECTOR gene therapy.
全文增补中
线粒体nad 1内含子2序列在石斛属植物分子鉴定中的应用(英文) 被引量:23
6
作者 张婷 王峥涛 +1 位作者 徐珞珊 周开亚 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2005年第7期1059-1062,共4页
目的在兰科石斛属药用植物鉴定中应用新的分子标记。方法扩增并测定9种石斛属植物线粒体中NADH脱氢酶亚基1编码基因(nad 1)内含子2(in tron 2)的全长序列。结果比对后的nad 1 in tron 2序列长872bp,其中有17个变异位点,可以鉴别除粉花石... 目的在兰科石斛属药用植物鉴定中应用新的分子标记。方法扩增并测定9种石斛属植物线粒体中NADH脱氢酶亚基1编码基因(nad 1)内含子2(in tron 2)的全长序列。结果比对后的nad 1 in tron 2序列长872bp,其中有17个变异位点,可以鉴别除粉花石斛D end robium lodd ig esii以外的8种植物。结论线粒体nad 1 in tron2序列可以作为一种新的分子标记用于石斛属植物的鉴定。 展开更多
关键词 石斛属 线粒体nad 1 intron 2 分子标记
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在转基因水稻植株中蜡质基因第1内含子对基因表达影响的分析 被引量:17
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作者 程世军 葛鸿飞 +1 位作者 王宗阳 洪孟民 《植物生理学报(0257-4829)》 CSCD 2001年第5期381-386,共6页
为阐明水稻Wx基因第 1内含子在整体植株的胚乳发育阶段是否确有增强基因表达的功能 ,以及弄清高和中、低直链淀粉含量的水稻品种Wx基因第 1内含子 112 6个碱基之间有差异的 16个碱基中哪几个碱基影响了该内含子的正常剪接从而降低了基... 为阐明水稻Wx基因第 1内含子在整体植株的胚乳发育阶段是否确有增强基因表达的功能 ,以及弄清高和中、低直链淀粉含量的水稻品种Wx基因第 1内含子 112 6个碱基之间有差异的 16个碱基中哪几个碱基影响了该内含子的正常剪接从而降低了基因的表达水平 ,我们分别用高直链淀粉含量品种的Wx基因翻译起始密码子ATG上游 3.1和 2 .1kb片段与GUS基因编码区融合构建成嵌合质粒 ,并在此基础上 ,(1)去除嵌合质粒中Wx基因的第 1内含子 ;(2 )将嵌合质粒Wx基因的第 1内含子中 (3.1kb)与中、低直链淀粉含量的水稻品种Wx基因第 1内含子有差异的 6个碱基以中、低直链淀粉含量的水稻品种的碱基替换。将上述改造过的几种质粒分别转化粳稻品种中花 11,测定转化植株未成熟种子胚乳中的GUS活性。结果表明第 1内含子的缺失或此内含子的 5′端剪接点上的碱基G以T替换均造成GUS活性的急剧下降 ,说明第 1内含子在植株体内的确有增强基因表达的功能 ,而且在中、低直链淀粉含量的水稻品种中Wx基因第 1内含子 5′端剪接点上自然存在的G→T突变是造成这些品种中该内含子剪接不正常。 展开更多
关键词 蜡质基因 1内含子 基因表达 转基因水稻
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云南元江普通野生稻群体Wx基因(CT)_n重复序列和第1内含子G/T位碱基分析 被引量:3
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作者 孙一丁 陆辉 许明辉 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期647-649,654,共4页
对云南元江普通野生稻90个个体Wx基因区段内的重复序列(CT)n和第1内含子供体+1位碱基G/T分别进行了比较分析。结果表明云南元江普通野生稻3个居群中的90个单株在重复序列(CT)n和G/T位点纯合一致,没有多态性;其G/T位点碱基均为G;其重复序... 对云南元江普通野生稻90个个体Wx基因区段内的重复序列(CT)n和第1内含子供体+1位碱基G/T分别进行了比较分析。结果表明云南元江普通野生稻3个居群中的90个单株在重复序列(CT)n和G/T位点纯合一致,没有多态性;其G/T位点碱基均为G;其重复序列(CT)n基因型与云南地方籼稻品种优势基因型相似但又有所区别。本研究结果为云南元江普通野生稻Wx基因利用和在稻种进化上的地位提供了信息。 展开更多
关键词 云南 普通野生稻 WX基因 微卫星重复序列 G/T碱基 遗传多样性
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糯性水稻中蜡质基因第1内含子的剪接活性 被引量:3
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作者 葛鸿飞 王宗阳 洪孟民 《植物生理学报(0257-4829)》 CSCD 2000年第3期237-240,共4页
以前的研究结果表明 ,非糯性的稻米中直链淀粉的含量与各品种中蜡质基因 (Wx)第 1内含子被剪接的效率有关 ,即剪接效率高的品种直链淀粉含量也高。为弄清糯米中不含直链淀粉是否也与此内含子剪接效率有关系 ,构建了蜡质基因启动子 (来... 以前的研究结果表明 ,非糯性的稻米中直链淀粉的含量与各品种中蜡质基因 (Wx)第 1内含子被剪接的效率有关 ,即剪接效率高的品种直链淀粉含量也高。为弄清糯米中不含直链淀粉是否也与此内含子剪接效率有关系 ,构建了蜡质基因启动子 (来自籼稻品种2 32 )、蜡质基因第 1内含子 [来自籼稻品种 2 32 (高直链淀粉含量的品种 )或粳稻品种寒丰 6 36 6 (中、低直链淀粉含量的品种 ) ]与GUS报告基因组成的两种嵌合基因 ,将含有这两种嵌合基因的质粒分别转化进粳性糯稻品种奉糯 5 93中 ,同时还分别转化进非糯性的籼稻品种特青和粳稻品种中花 11中作为对照 ,测定它们的抗性愈伤组织与转基因植株未成熟种子胚乳中的GUS酶活性。结果表明与在非糯性的籼稻和粳稻中一样 ,这两种嵌合质粒在不合成直链淀粉的糯稻中也有相当水平的表达。从此结果可以推测 ,糯稻品种有从嵌合基因的转录本中剪接蜡质基因第 1内含子的正常能力 。 展开更多
关键词 糯稻 蜡质基因 1内含子 剪接活性 直链淀粉
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倒位PCR法检测血友病A FⅧ基因内含子22/1倒位 被引量:3
10
作者 何国平 陈玲 +5 位作者 刘雨生 童先宏 宋雅娴 周桂香 骆丽华 张颖新 《临床输血与检验》 CAS 2010年第3期197-200,共4页
目的建立血友病A(hemophilia A,HA)FⅧ基因第22内含子倒位PCR检测法,并初步应用于HA直接基因诊断。方法应用倒位PCR(inversion-PCR,I-PCR)方法对24个HA家系中所有先证者的FⅧ基因22内含子倒位进行检测,对检测阳性者的母亲进一步用上述... 目的建立血友病A(hemophilia A,HA)FⅧ基因第22内含子倒位PCR检测法,并初步应用于HA直接基因诊断。方法应用倒位PCR(inversion-PCR,I-PCR)方法对24个HA家系中所有先证者的FⅧ基因22内含子倒位进行检测,对检测阳性者的母亲进一步用上述方法行携带者诊断,并对其中1例进行羊水产前基因诊断。检测阴性者再行内含子1倒位筛查。结果 24个HA家系中,7例先证者的F基因内含子22倒位检测为阳性,阳性检出率、可诊断率分别为29.17%、100%,未发现内含子1倒位;7例内含子22倒位突变阳性患者的母亲有6例为倒位携带者,羊水诊断未发现内含子22/1倒位。结论 I-PCR法能准确地检测F基因22内含子倒位突变,可应用于HA患者及携带者FⅧ基因22内含子倒位基因诊断及产前诊断。 展开更多
关键词 倒位PCR 长链PCR 血友病A FⅧ基因内含子22/1
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香猪PIT-1基因内含子多态性的研究 被引量:7
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作者 俞沛初 乔中东 +3 位作者 郭传甲 华修国 艾晓杰 方心葵 《上海交通大学学报(农业科学版)》 2004年第2期109-114,共6页
采用PCR和DNA测序方法,对香猪及对照猪种(上海白猪、大约克夏猪)的PIT-1基因进行了单核苷酸多态性(SNP)分析,并采用RT-PCR方法对3个猪种PIT-1基因的表达水平进行了半定量分析。结果显示:香猪在DNA序列的963位(位于第4内含子)和1429位(... 采用PCR和DNA测序方法,对香猪及对照猪种(上海白猪、大约克夏猪)的PIT-1基因进行了单核苷酸多态性(SNP)分析,并采用RT-PCR方法对3个猪种PIT-1基因的表达水平进行了半定量分析。结果显示:香猪在DNA序列的963位(位于第4内含子)和1429位(位于第5内含子)分别发生G→A突变,而对照猪种在这2个位置未发生突变;香猪PIT-1基因表达水平显著低于上海白猪和大约克夏猪(P<0.05)。结论:香猪第4和第5内含子的两处突变可能会造成PIT-1基因表达量下降,最终可能导致香猪的生长受到影响。 展开更多
关键词 香猪 PIT-1基因 内含子 多态性 半定量分析
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乳腺癌组织SPRY4-IT1表达水平及其对患者远期生存的预测价值 被引量:3
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作者 王焱 仰大贵 杨令芝 《华中科技大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2019年第1期93-97,共5页
目的探讨乳腺癌组织SPRY4内含转录因子1(SPRY4-IT1)表达水平及其对远期生存的预测价值。方法采用实时定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测99例乳腺癌组织及配对癌旁组织SPRY4-IT1的表达。利用受试者工作特征曲线(ROC)确定SPRY4-IT1最... 目的探讨乳腺癌组织SPRY4内含转录因子1(SPRY4-IT1)表达水平及其对远期生存的预测价值。方法采用实时定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测99例乳腺癌组织及配对癌旁组织SPRY4-IT1的表达。利用受试者工作特征曲线(ROC)确定SPRY4-IT1最佳临界值及对乳腺癌的诊断效能;Kaplan-Meier法绘制不同SPRY4-IT1表达乳腺癌患者总体生存和无瘤生存曲线,Cox多因素回归模型分析乳腺癌预后的独立危险因素。结果乳腺癌组织SPRY4-IT1表达水平明显高于癌旁组织,差异具有统计学意义(P<0.05)。SPRY4-IT1最佳临界值为1.57,诊断乳腺癌的AUC为0.876,敏感度为78.6%,特异度为94.2%。SPRY4-IT1高表达与TNM分期、淋巴结转移、分子分型和增殖标志物Ki-67有关(均P<0.05),与年龄、肿瘤大小无关(均P>0.05)。乳腺癌患者中,SPRY4-IT1低表达组总生存率和无病生存率明显高于SPRY4-IT1高表达组,差异具有统计学意义(均P<0.05)。Luminal型乳腺癌中,SPRY4-IT1低表达组总生存率和无病生存率明显高于SPRY4-IT1高表达组(均P<0.05);三阴型乳腺癌中,SPRY4-IT1低表达组和高表达组总生存率、无病生存率比较差异无统计学意义(均P>0.05)。淋巴结转移、Ki-67阳性、SPRY4-IT1高表达是影响乳腺癌总体生存和无病生存的独立危险因素(均P<0.05)。结论 SPRY4-IT1在乳腺癌组织中表达升高,高表达SPRY4-IT1可以作为乳腺癌不良预后的预测因子。 展开更多
关键词 乳腺癌 SPRY4内含转录因子1 预后
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汉族人群促甲状腺素受体基因内含子1区域多态性与Graves病及临床表现的关系 被引量:1
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作者 吴晨辰 张晓梅 +3 位作者 孙卫华 王冉 赵文娣 刘田 《蚌埠医学院学报》 CAS 2016年第11期1405-1407,1412,共4页
目的:探讨汉族人群促甲状腺素受体(TSHR)基因内含子1区域上单核苷酸多态性(SNPs)位点与Graves病(GD)及临床表现的关系。方法:选取699例汉族GD患者和563名健康对照者入组。用Taq Man探针技术,检测GD患者和健康对照者14号染色体TSHR基因... 目的:探讨汉族人群促甲状腺素受体(TSHR)基因内含子1区域上单核苷酸多态性(SNPs)位点与Graves病(GD)及临床表现的关系。方法:选取699例汉族GD患者和563名健康对照者入组。用Taq Man探针技术,检测GD患者和健康对照者14号染色体TSHR基因内含子1区上6个SNPs位点的基因分型,进行相关性分析,研究这6个SNPs与GD易感性关系。结果:GD患者和对照组rs179247、rs2284722、rs12101261、rs4903964四个位点在病例-对照中的分布上均具有显著差异(P<0.01);rs12101261为与GD相关性最强的主效易感位点,与血清TRAb水平、性别有关,与甲状腺肿大程度、眼征无明显关联。结论:TSHR基因内含子1区域多态性与GD显著相关,其中rs12101261为相关性最强的主效易感位点,与促甲状腺素受体抗体阳性的GD患者发病密切相关。 展开更多
关键词 GRAVES病 促甲状腺素受体 基因内含子1 单核苷酸多态性
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水稻D_1 snoRNA及其基因的鉴定和功能分析 被引量:1
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作者 钟翎 陆勇军 +2 位作者 周惠 施苏华 屈良鹄 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 1998年第4期325-329,共5页
测定和比较了籼稻(OryzasativaL.sp.indica)、粳稻(O.sativaL.sp.japonica)和多年生野生稻(O.rufipogonW.Grifith)hsp70基因第一个内含子中D1DNA以及... 测定和比较了籼稻(OryzasativaL.sp.indica)、粳稻(O.sativaL.sp.japonica)和多年生野生稻(O.rufipogonW.Grifith)hsp70基因第一个内含子中D1DNA以及部分上游序列,并通过Northern杂交及cDNA序列分析对D1DNA编码的D1snoRNA进行了实验鉴定。D1snoRNA属于反义snoRNA家族,它与水稻25SrRNA互补序列为14个核苷酸长。根据理论计算,D1snoRNA具有指导水稻25SrRNA中第807位的核糖甲基化功能。D1DNA与C1DNA相隔仅105个核苷酸,在内含子中如此短的距离内连续编码两种snoRNA是罕见的,这一结构为研究串联结构的snoRNA转录后加工机制提供了一个良好的研究体系。 展开更多
关键词 D1snoRNA 内含子 水稻 基因鉴定 功能
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lncRNA GABPB1-IT1靶向下调miR-501抑制宫颈癌细胞增殖、侵袭和迁移的机制
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作者 赵丹华 田艳杰 +3 位作者 李秋爽 刘丽 李翠英 孙静莉 《广西医科大学学报》 CAS 2021年第7期1276-1282,共7页
目的:探讨lncRNA GABPB1-IT1靶向下调miR-501抑制宫颈癌细胞增殖、侵袭和迁移的机制。方法:qRT-PCR方法检测宫颈癌HeLa、Caski、SiHa细胞和正常宫颈上皮Ect1/E6E7细胞中GABPB1-IT1表达水平。宫颈癌SiHa细胞分成Control组、Vector组(转染... 目的:探讨lncRNA GABPB1-IT1靶向下调miR-501抑制宫颈癌细胞增殖、侵袭和迁移的机制。方法:qRT-PCR方法检测宫颈癌HeLa、Caski、SiHa细胞和正常宫颈上皮Ect1/E6E7细胞中GABPB1-IT1表达水平。宫颈癌SiHa细胞分成Control组、Vector组(转染pcDNA)、GABPB1-IT1组(转染pcDNA-GABPB1-IT1)、GABPB1-IT1+miR-NC组(转染pcDNA-GABPB1-IT1和mimics control)、GABPB1-IT1+miR-501组(转染pcDNA-GABPB1-IT1和miR-501 mimics)。CCK-8法检测细胞增殖;Transwell小室检测细胞迁移和侵袭;Western blotting检测细胞中MMP-2、MMP-9、N-cadherin、E-cadherin蛋白表达。利用starbase数据库对GABPB1-IT1的靶基因进行分析,通过荧光素酶报告系统鉴定靶向关系。结果:宫颈癌HeLa、Caski、SiHa细胞中GABPB1-IT1表达水平低于正常宫颈上皮Ect1/E6E7细胞(均P<0.05)。宫颈癌HeLa、Caski细胞中GABPB1-IT1表达水平高于宫颈癌SiHa细胞(均P<0.05)。与Control组、Vector组比较,GABPB1-IT1组宫颈癌SiHa细胞存活率降低,细胞迁移和侵袭数目减少,细胞中MMP-2、MMP-9、N-cadherin蛋白表达水平降低,E-cadherin蛋白表达水平升高(均P<0.05)。与GABPB1-IT1+miR-NC组比较,GABPB1-IT1+miR-501组宫颈癌SiHa细胞中miR-501水平升高,细胞存活率、细胞迁移数目和侵袭数目均升高,细胞中MMP-2、MMP-9、N-cadherin蛋白表达水平升高,E-cadherin蛋白表达水平降低(均P<0.05)。GABPB1-IT1靶向下调miR-501表达水平。结论:lncRNA GABPB1-IT1靶向下调miR-501抑制宫颈癌细胞增殖、侵袭和迁移。 展开更多
关键词 宫颈癌 GA结合蛋白转录因子亚基β1-内含子转录本1 微小RNA(miR)-501 侵袭 迁移
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新疆锁阳线粒体nad 1基因第2内含子序列居群间变异分析
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作者 王果平 王川易 +1 位作者 贾新岳 郭宝林 《中国现代中药》 CAS 2010年第10期12-14,共3页
目的:对分布于新疆的锁阳Cynomorium songaricum 4个居群22个个体进行了线粒体nad1基因第2内含子序列的比较研究,分析序列居群差异。方法:提取锁阳DNA,用通用引物扩增线粒体nad1基因第2内含子序列,Clustal W软件比较分析序列。结果:锁... 目的:对分布于新疆的锁阳Cynomorium songaricum 4个居群22个个体进行了线粒体nad1基因第2内含子序列的比较研究,分析序列居群差异。方法:提取锁阳DNA,用通用引物扩增线粒体nad1基因第2内含子序列,Clustal W软件比较分析序列。结果:锁阳22个样本的nad 1基因第2内含子序列变异均表现为插入和缺失,无碱基替换发生,有13个个体序列完全一致,9个个体有变异位点,变异位点为10个;4个居群间分化不明显,其中b居群可能存在一定的分化,有两个个体y4和a19存在较大的变异,可能具有一定的遗传学意义。结论:线粒体nad 1基因第2内含子序列给出的锁阳4个居群分化不明显。 展开更多
关键词 锁阳 NAD 1基因第2内含子 序列分析
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以HIV-1为骨架的慢病毒载体在其假病毒的转录本中保留其内含子不被剪切
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作者 张帆 方彧聃 张敬之 《生命科学研究》 CAS CSCD 2011年第3期195-202,共8页
通过在FUGW中克隆入各外源基因表达盒,如红系特异表达人β珠蛋白(HBG),或山羊乳腺特异表达人血清白蛋白(pBLG-ALB)等,研究以HIV-1为骨架的慢病毒载体FUGW在其假病毒的转录本中内含子的剪切情况.将慢病毒载体制备成假病毒后抽提其病毒RNA... 通过在FUGW中克隆入各外源基因表达盒,如红系特异表达人β珠蛋白(HBG),或山羊乳腺特异表达人血清白蛋白(pBLG-ALB)等,研究以HIV-1为骨架的慢病毒载体FUGW在其假病毒的转录本中内含子的剪切情况.将慢病毒载体制备成假病毒后抽提其病毒RNA,通过逆转录和PCR验证其内含子剪切保留情况;同时,在相对应的慢病毒假病毒介导的转基因小鼠中也进行类似的PCR验证.在制备假病毒的转录过程中,其外源基因所携带的內含子在病毒所包含的基因组RNA中被部分保护不被剪切,且优先保护5′端的内含子.此现象正好与野生型HIV-1的保护顺序相反. 展开更多
关键词 艾滋病毒 慢病毒载体 内含子 剪切 剪切保护
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SPRY4-IT1在子痫前期患者胎盘中的表达及对滋养层细胞增殖、侵袭的影响 被引量:1
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作者 李莎 刘能英 +2 位作者 蔡强 陈莉 曾丽 《中国性科学》 2021年第4期42-45,共4页
目的探讨SPRY4内含子转录本1(SPRY4-IT1)在子痫前期(PE)患者胎盘中的表达及对滋养层细胞增殖、侵袭的影响。方法选取2017年6月至2019年6月在宜宾市第二人民医院产科行剖宫产术的34例PE患者(PE组)和32例正常妊娠孕妇(对照组)作为研究对... 目的探讨SPRY4内含子转录本1(SPRY4-IT1)在子痫前期(PE)患者胎盘中的表达及对滋养层细胞增殖、侵袭的影响。方法选取2017年6月至2019年6月在宜宾市第二人民医院产科行剖宫产术的34例PE患者(PE组)和32例正常妊娠孕妇(对照组)作为研究对象。采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)法检测胎盘中SPRY4-IT1表达水平。将HTR8/SVneo细胞分为空白对照组(不转染)、无义转染组(转染空载体)和上调组(转染SPRY4-IT1过表达载体);检测各组HTR8/SVneo细胞增殖、周期分布、细胞凋亡、侵袭情况及细胞中基质金属蛋白酶(MMP)-2、MMP-9蛋白表达情况。结果PE组胎盘组织中SPRY4-IT1表达水平较对照组显著下调(P<0.05);上调组HTR8/SVneo细胞OD值,S期、G_(2)/M期HTR8/SVneo细胞比例、穿膜细胞数,MMP-2、MMP-9蛋白表达水平均较无义转染组、空白对照组显著升高(P<0.05),HTR8/SVneo细胞凋亡率、G_(0)/G_(1)期HTR8/SVneo细胞比例均较无义转染组、空白对照组显著降低(P<0.05)。结论SPRY4-IT1在PE患者胎盘组织中呈低表达,SPRY4-IT1可能通过上调MMP-2、MMP-9表达,调控细胞周期,参与促进HTR8/SVneo细胞增殖、侵袭及抑制其凋亡过程。 展开更多
关键词 SPRY4内含子转录本1 子痫前期 胎盘 滋养层细胞 增殖 侵袭
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八肋游仆虫Rab家族新成员Eo-rab-1 N基因的克隆与序列分析 被引量:7
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作者 李凌燕 柴宝峰 +2 位作者 梁爱华 孙永华 王伟 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期437-442,共6页
Rab蛋白家族属于小分子GTP结合蛋白家族Ras超家族中最大的亚家族,主要在囊泡运输中起作用。实验运用PCR、RT-PCR等技术,从八肋游仆虫中克隆到一种新的tab基因。序列分析结果表明:在大核中,该基因全长884bp,除去两端的端粒与非编码... Rab蛋白家族属于小分子GTP结合蛋白家族Ras超家族中最大的亚家族,主要在囊泡运输中起作用。实验运用PCR、RT-PCR等技术,从八肋游仆虫中克隆到一种新的tab基因。序列分析结果表明:在大核中,该基因全长884bp,除去两端的端粒与非编码区,该基因在大核中由723bp组成。从小核中克隆相应的基因片段,此基因片段序列与大核中序列一致,表明该基因在小核中无内部删除序列的存在。通过RT-PCR,从mRNA获得的该基因的开放读框为663bp,表明该基因在转录过程中有内含子的删除。大核基因序列和cDNA序列比较,发现60bp的内含子序列位于大核基因的153~212bp之间,并符合一类内含子GU-AG剪切规则。在遗传密码使用上,该基因内部含有2个TGA,在游仆虫中编码半胱氨酸。同时首次发现,八肋游仆虫基因使用TAG作为终止密码子。NCBI上序列比对表明该基因翻译的蛋白与其他物种Rabl蛋白的同源性达49%~52%,因此我们将它命名为Eo-rab-1N,GenBank登录号为DQl05562。Eo-rab-1N与其他物种的Rab1蛋白构建进化树,发现该蛋白的进化与物种的进化保持一致,表明该基因在细胞中具有重要功能。 展开更多
关键词 八肋游仆虫 Eo—rab-1N基因 基因克隆 内含子
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知母皂苷A-Ⅲ调控ASAP1-IT1/DNMT3b/YAP1轴在非小细胞肺癌中的作用机制研究
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作者 付相君 王梅 +3 位作者 张远 李艳娜 耿彪 赵文英 《包头医学院学报》 CAS 2022年第11期10-17,33,共9页
目的:研究知母皂苷A-Ⅲ(timosaponin A-Ⅲ,TAⅢ)对非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)生长的影响及其作用机制。方法:采用不同浓度TAⅢ(5、10、15、20、25、30μmol/L)处理非小细胞肺癌细胞A549,使用CCK8法检测细胞活力。... 目的:研究知母皂苷A-Ⅲ(timosaponin A-Ⅲ,TAⅢ)对非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)生长的影响及其作用机制。方法:采用不同浓度TAⅢ(5、10、15、20、25、30μmol/L)处理非小细胞肺癌细胞A549,使用CCK8法检测细胞活力。以定量逆转录聚合酶链式反应(qRT-PCR)检测二磷酸腺苷核糖化因子鸟苷酸激酶1-内含子转录因子1(adenosine diphosphate ribosylation factor guanylate kinase 1-intronic transcript 1,ASAP1-IT1)、Yes相关蛋白1(Yes-associated protein 1,YAP1)在组织及细胞中的表达。以EDU、流式细胞术和Western blot检测ASAP1-IT1、DNA(胞嘧啶-5-)-甲基转移酶3β(DNA(cytosine-5-)-methyltransferase 3 beta,DNMT3b)、YAP1对细胞增殖情况、细胞凋亡率及其相关基因(Bax和caspase-3)与抗凋亡基因Bcl2的影响。亚硫酸氢盐测序聚合酶链式反应(Bisulfite sequencing PCR,BSP)分析检测ASAP1-IT1与YAP1的关系。RNA免疫沉淀法(RNA binding protein immunoprecipitation,RIP)和qRT-PCR法检测ASAP1-IT1与DNMT3b之间的相互作用。免疫共沉淀实验(Co-immunoprecipitation,Co-IP)检测DNMT3b与YAP1之间的关系。采用qRT-PCR方法检测TAⅢ对ASAP1-IT1/DNMT3b/YAP1轴相关基因表达的影响。结果:ASAP1-IT1和YAP1在NSCLC组织和A549细胞中表达上调,而DNMT3b表达下调,加入TAⅢ可逆转这些效应。沉默ASAP1-IT1和YAP1、过表达DNMT3b或应用TAⅢ可增加A549细胞凋亡率和细胞凋亡相关指数。TAⅢ有逆转沉默或过表达ASAP1-IT1、DNMT3b和YAP1的作用。最后发现ASAP1-IT1与DNMT3b相互作用,而DNMT3b与YAP1相互作用。结论:ASAP1-IT1/DNMT3b/YAP1轴通过调节细胞增殖和凋亡促进NSCLC进展。TAⅢ通过调节ASAP1-IT1/DNMT3b/YAP1轴抑制肺癌细胞增殖,促进其凋亡。 展开更多
关键词 二磷酸腺苷核糖化因子鸟苷酸激酶1-内含子转录因子1 Yes相关蛋白1 非小细胞肺癌 知母皂苷A-Ⅲ
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