三黄鸡NHE1基因的克隆和序列分析

钠氢离子交换泵1(NHE1)是一种跨膜蛋白,作为已经被证明的J亚群白血病病毒受体在该病的进程中起着关键性的作用。为全面了解NHE1的基因及其编码蛋白的生物学信息,对三黄鸡NHE1基因进行了克隆和序列分析。参考原鸡NHE1基因序列设计引物,采用PCR技术分段克隆三黄鸡NHE1基因序列,并对其进行序列分析。结果表明,克隆得到的三黄鸡NHE1基因全长2 412 bp,含有1个2 412 bp的完整开放式阅读框,编码803个氨基酸。其CDS编码区的核苷酸序列与原鸡、鹌鹑、人、猪、鼠、牛、弓形虫的NHE1基因对应序列的同源性分别为99.8%、92%、78.1%、73.5%、80%、81.8%、40.9%,推导的氨基酸序列同源性分别为99.5%、93.2%、79.3%、79.6%、78.9%、78.7%、26.8%。进化树分析发现,物种内的核苷酸序列的同源性很高,种间同源性较低。生物信息学预测NHE1蛋白结构发现,NHE1蛋白多肽链N端含有12个跨膜结构,有37个磷酸化位点和1个特异性蛋白激酶磷酸化位点。