JAK2基因单倍型46/1对中国人群骨髓增殖性肿瘤易感性的影响

从91例骨髓增殖性肿瘤(MPNs)患者及1 028例健康志愿者(均为中国人)外周血中提取基因组DNA,应用等位基因特异性PCR(ASP)技术,检测作为蛋白质酪氨酸激酶JAK2单倍型46/1标签的rs12343867和rs10974944位点的基因型,并结合临床资料,应用SNPstats软件进行统计学分析.实验结果表明:MPNs患者JAK2单倍型46/1出现的几率明显高于健康志愿者(P<0.000 1);MPNs患者的JAK2单倍型46/1更易在JAK2V617F突变阳性MPNs患者(n=70)中出现(P<0.000 1);具有JAK2单倍型46/1的中国人群患MPNs的风险增加显著,该结果与测试欧美人群的结果一致.

DF-1细胞MHC单倍型的分子鉴定

为了鉴定鸡胚成纤维细胞(DF-1细胞)主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)单倍型,试验选取生长状态良好的DF-1细胞,提取其总RNA并将总RNA反转录成cDNA;以DF-1细胞cDNA为模板,采用PCR方法扩增鸡MHC B基因座的微卫星LEI0258和MCW0371及BF2、BLB2基因并测序,同时采用“PCR+1”方法扩增BF2基因并测序,以根据上述序列及结构特征判定DF-1细胞的MHC单倍型。结果表明:微卫星LEI0258和MCW0371序列长度分别为357,205 bp,其中微卫星LEI0258含有1个CTATGTCTTCTTT重复单元和16个CTTTCCTTCTTT重复单元,与MHC B基因座B130、B131、B201、B5.1、B6.1、B21、B75单倍型的微卫星长度、重复单位的结构和数量完全相同;BF21基因序列长度为1117 bp,与GenBank收录3条鸡MHC B21单倍型的BF2基因序列(登录号分别为AF013493.1、S78682.1、NM-001031338.2)完全一致。说明DF-1细胞来源于MHC B21单倍型纯合鸡胚。

香稻Badh2基因单倍型及香气成分2-乙酰-1-吡咯啉代谢通路的研究进展

香米因其具有独特的香味,长期以来深受国际市场青睐。我国香稻种植历史悠久,香稻资源丰富,但缺乏高端优质香米品牌。当前消费者对优质香米的需求不断加大,进而加快了我国优质香稻的育种进程。稻米香味主要由编码甜菜碱醛脱氢酶基因Badh2控制,该基因功能突变能够导致稻米香气成分2-乙酰-1-吡咯啉(2AP)的积累。随着水稻功能基因组学的发展,香稻资源中Badh2基因单倍型得以深入挖掘,2AP生物合成通路被初步解析,它们将进一步加快香稻育种的进程。综述了目前在香稻资源中发现的19种Badh2基因单倍型,重点分析不同类型单倍型的地域分布特性,比较不同单倍型之间的2AP含量;同时阐述2AP生物合成通路涉及的谷氨酸-脯氨酸代谢途径和多胺代谢途径研究现状,总结香稻籽粒中2AP的分布特征,并对目前两种籽粒2AP积累的理论机制进行比较分析,提出利用多组学手段从籽粒动态发育过程研究2AP生物合成通路变化特性的策略,以期为香稻资源基因利用和籽粒2AP特异富集香稻品种的培育提供参考。

中国汉族人群PGC-1α基因Thr394Thr和Gly482Ser变异在2型糖尿病家系中传递的不平衡分析

目的了解中国汉族人群PGC-1α基因Thr394Thr和Gly482Ser变异与2型糖尿病的相关关系。方法招募350名中国南方汉族2型糖尿病先证者及其一级亲属，抽提外周血DNA。应用聚合酶链反应邛艮制性片段长度多态性（PCR—RFLP）分析和DNA直接测序技术鉴定PGC-1α基因型。基于2型糖尿病家系，采用单倍型相对危险度分析（HRR）和传递不平衡检验（TDT）方法分析Thr394Thr和Gly482Ser变异及其单倍型与2型糖尿病的关系。结果基于2型糖尿病家系的HRR分析显示，PGC-1α基因482Ser（A）等位基因更多向子代传递（x2=7．2170，P=0．0072，HRR=1．4496），而Thr394Thr（G／A）等位基因在传递与未传递两组间分布频率差异无统计学意义（x2=2．9557，P=0．0856，HRR=0．7638）。TDT分析提示，394Thr（A）-482Ser（A）单倍型在两组问分布差异有统计学意义（x2=33．160，P=0．002），且与2型糖尿病呈连锁不平衡关系（X2=4．6841，P=0．0292）。结论394A--482A联合变异可能增加了中国人患糖尿病的风险。

先天性脊柱骨骺发育不良家系COL2A1基因的突变

目的:报道1个涉及四代9例患者因患有常染色体显性遗传的先天性脊柱骨骺发育不良的家系COL2A1基因突变。方法:发现18个月的先证者未出现股骨头的继发性骨化中心。其父骨骼改变主要表现为椎骨椎体扁平、股骨颈结构不规则、股骨头骨化缺如、髋臼顶扁平和髋内翻。该家系的其他患者均有类似改变。在明确诊断为先天性脊柱骨骺发育不良后,对该家系进行12号染色体上5个微卫星标记物的单倍体分型。在确定COL2A1基因为疾病的候选基因后,对该家系所有患者及获得血样的正常成员进行该基因54个外显子和启动子的测序。同时对10名健康对照者的第23外显子测序。结果:所有患者COL2A1基因第23外显子的1510 G→A,使第504个氨基酸由甘氨酸→丝氨酸(G504S),但家系中健康者和无血缘关系的10名健康对照者均无此改变。结论:COL2A1基因第23外显子的1510 G→A的改变是该家系患者先天性脊柱骨骺发育不良的原因。该家系详细的影像学资料将扩大人们对Ⅱ型胶原病表型的认识。

HLA-DMA及DMB基因与1型糖尿病相关性的研究进展

现有研究资料表明:和经典的人主要组织相容性复合体(HLA)Ⅱ类基因一样,HLAⅡ类非经典基因DMA及DMB基因与1型糖尿病存在显著的相关性且存在一定的人种差异。HLA经典Ⅱ类分子抗原结合槽所结合肽的性质对1型糖尿病的发病有着重要影响。推测在HLA经典Ⅱ类分子所允许结合的一系列肽系中,DM易感性基因或二聚体编码的DM分子在行使其功能的过程中,更易使致糖尿病性肽复合物“得以生存”,并被呈递至细胞表面,使辅助性T细胞(Th)1/Th2比例上调,从而导致1型糖尿病的发生。对多人种进行包含DM分子在内的扩展单倍型与1型糖尿病易感相关性的研究有着重要的意义。

PGC-1α基因多态性与2型糖尿病的相关性

目的了解华南汉族人群PGC-1α基因单核苷酸多态性与2型糖尿病的相关性。方法采集350例2型糖尿病患者和其父母以及366名正常糖耐量志愿者的血样，提取基因组DNA。应用PCR-限制性片段长度多态性（RFLP）和DNA直接测序技术鉴定PGC-1α基因多态性位点的基因型。应用病例-对照方法和基于家庭的单倍型相对危险度分析（HRR）和传递不平衡检验（TDT）方法分析相关多态性及其单倍型与2型糖尿病的相关性。结果（1）病例一对照研究显示Gly482Ser（G／A）多态性G、A等位基因在2型糖尿病组和正常糖耐量组分布频率分别为0．589、0．411和0．687、0．313（χ^2=15．076，P〈0．01）。Thr394Thr（G／A）、Thr528Thr（A／G）和Thr612Met（C／T）等位基因在两组间分布频率差异无统计学意义（均P〉0．05）。394A-482A-528A单倍型在两组间分布差异有统计学意义（χ^2=40．2，P〈0．05），且与2型糖尿病存在连锁不平衡（t=2．503，P〈0．05）。（2）基于家庭研究显示PGC-1α基因Gly482Ser变异的A等位基因由父母更多地向患者传递（χ^2=7．217，P=0．007，HRR=1．450），TDT—ETDT结果均显示482位点A等位基因由杂合子父母传递给患病子代的频率偏离0．5（均P〈0．05），单倍型TDT分析显示394A-482A-528A-612C，394A-482A-528A-612T，394A-482A-528G-612C和394A-482A-528G-612T单倍型分布频率显著偏离0．5（P〈0．05或P〈0．01）。结论Gly482Ser（G／A）变异与华南汉族2型糖尿病的易感性密切相关，Thr394Thr（G／A）变异可能辅助了这种作用。

KIR2DL1框架基因cDNA的分子克隆测序及一个新等位基因的鉴定

目的建立K工R2DLI框架基因cDNA的分子克隆测序方法，并鉴定南方汉族人群一个新的KIR2DL1等位基因。方法对-K豫2DL1框架基因测序分型结果异常的外周血样，提取mRNA，反转录为cDNA，用1对KIR2DLl框架基因特异性PCR引物进行扩增，特异性扩增产物（1．2kb）经切胶回收纯化后，进行分子克隆和单倍型测序。结果KIR2DL1特异性PCR扩增产物，经分子克隆和单倍型测序，检出1个正常的K／R2DL1＊00302等位基因和1个新变异的KIR2DL1等位基因。该新等位基因的序列与KIR2DL1＊00302最相近，但存在编码区nt 188A〉G点突变、位于第4外显子的第42密码子由GAG变成GGG，导致第42位氨基酸残基发生GIu42Gly改变；其序列提交GenBank（序列号：KP025960）和IPD-KIR数据库（IWS40001982），已被世界卫生组织HLA因子命名委员会KIR分委会正式命名为KIR2DL1＊031。结论我们建立了KIR2DL1框架基因cDNA分子克隆测序方法，在等位基因水平的KIR研究中具有广泛的应用前景。