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柳杉毛虫JHBP家族基因鉴定及生物信息学分析
1
作者
叶淑婷
陈祯鸿
+3 位作者
赵真辉
何欢
林孝春
梁光红
《森林与环境学报》
CSCD
北大核心
2024年第1期95-104,共10页
研究我国林业重要食叶害虫——柳杉毛虫保幼激素结合蛋白(JHBP),对于揭示其生长发育、化蛹、摄食、交配生殖及抗药性等生命活动具有重要意义。参照模式昆虫家蚕的41条JHBP蛋白序列,构建系统进化树,并对这些基因所编码的蛋白质二级结构...
研究我国林业重要食叶害虫——柳杉毛虫保幼激素结合蛋白(JHBP),对于揭示其生长发育、化蛹、摄食、交配生殖及抗药性等生命活动具有重要意义。参照模式昆虫家蚕的41条JHBP蛋白序列,构建系统进化树,并对这些基因所编码的蛋白质二级结构、疏水性、蛋白质序列基序和三级结构等生物学特性进行分析,利用heatmap可视化工具分析柳杉毛虫JHBP在不同发育时期的表达水平。结果表明,柳杉毛虫JHBP基因共有JHBPa、JHBPc、JHBPd 3个亚家族,分别包含6、26、15个JHBP基因;蛋白序列至少含有1个JHBP结构域,且其中Dho05G001220蛋白序列不仅含有JHBP结构域,还含有Grp allergen结构域,各蛋白序列的疏水性区域呈明显的聚集分布,亲水性区域的聚集分布则不明显;JHBP基因在柳杉毛虫的低龄和中龄幼虫、蛹和成虫中显著表达,表明JHBP明显参与调控不同虫态的发育或变态过程。研究结果可为进一步明确柳杉毛虫JHBP基因家族的生物学功能提供参考。
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关键词
柳杉毛虫
基因家族
jhbp
生物信息学分析
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职称材料
舞毒蛾保幼激素结合蛋白家族基因克隆及对CO2胁迫的响应
被引量:
4
2
作者
闫丽琼
汤方
+3 位作者
龚尚骞
罗佳煜
苑冉
曹传旺
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2019年第6期1339-1347,共9页
保幼激素结合蛋白(JHBP)是存在于血淋巴和细胞内的一类载体蛋白,与保幼激素结合运送到靶标组织。本文研究舞毒蛾JHBP基因特性及其对高浓度CO 2胁迫的响应,为明确全球气候变化下舞毒蛾适应性机制提供理论依据。通过舞毒蛾转录组文库分析...
保幼激素结合蛋白(JHBP)是存在于血淋巴和细胞内的一类载体蛋白,与保幼激素结合运送到靶标组织。本文研究舞毒蛾JHBP基因特性及其对高浓度CO 2胁迫的响应,为明确全球气候变化下舞毒蛾适应性机制提供理论依据。通过舞毒蛾转录组文库分析结合RT-PCR克隆鉴定出7个JHBP基因,并进行基因特性和发育阶段特异性分析,同时利用密闭式CO2人工气候箱在不同CO2浓度(397μL/L、550μL/L和750μL/L)下将舞毒蛾卵饲养至3龄幼虫,利用qRT-PCR技术测定3龄幼虫JHBP基因表达量变化。结果表明,舞毒蛾JHBP家族7个基因全长开放阅读框大小为714~756 bp,编码237~251个氨基酸,分子质量为28.22~28.54 kDa,理论等电点为5.33~8.47。7个基因在不同发育阶段的表达存在差异,幼虫期LdJHBP1、2、5、6基因表达量较高,而LdJHBP3、4和7在蛹期和成虫期高表达。进化树分析表明舞毒蛾LdJHBP1、LdJHBP2、LdJHBP6分别与棉铃虫Helicoverpa armigera、家蚕Bombyx mori、冬尺蛾Operophtera brumata的JHBP亲缘关系较近。高浓度CO2下舞毒蛾3龄幼虫的LdJHBP表达量下降。JHBP基因表达可能影响JH结合与运输从而调节生长发育。
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关键词
舞毒蛾
jhbp
基因
CO2浓度
基因表达
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职称材料
灰飞虱保幼激素结合蛋白基因的克隆及表达动态
被引量:
7
3
作者
贺秀婷
张亚楠
+2 位作者
李飞
李国清
董双林
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期59-64,共6页
克隆了灰飞虱的1个保幼激素结合蛋白(JHBP)基因,命名为LstrJHBP(GenBank登录号:JF728808)。该基因全长1 514 bp,开放阅读框编码289个氨基酸,5'和3'UTR区分别为124和522 bp,预测的相对分子质量为32 599,等电点5.47。综合信号肽...
克隆了灰飞虱的1个保幼激素结合蛋白(JHBP)基因,命名为LstrJHBP(GenBank登录号:JF728808)。该基因全长1 514 bp,开放阅读框编码289个氨基酸,5'和3'UTR区分别为124和522 bp,预测的相对分子质量为32 599,等电点5.47。综合信号肽预测、氨基酸序列比对及聚类分析结果,推测LstrJHBP是一个细胞质JHBP。qRT-PCR测定表明,LstrJHBP在灰飞虱若虫5个龄期及雌雄成虫均有表达,但4龄若虫期显著高于其他龄期,雌雄成虫间没有显著差异。研究结果为进一步明确灰飞虱的发育及变态调控机制奠定了基础。
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关键词
灰飞虱
保幼激素结合蛋白
基因克隆
表达动态
QRT-PCR
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职称材料
题名
柳杉毛虫JHBP家族基因鉴定及生物信息学分析
1
作者
叶淑婷
陈祯鸿
赵真辉
何欢
林孝春
梁光红
机构
福建农林大学林学院
福鼎市林业局
出处
《森林与环境学报》
CSCD
北大核心
2024年第1期95-104,共10页
基金
福建省科技厅引导性项目“多寄主新型混交林对柳杉毛虫成灾过程的阻滞效应及其应用”(2021N0002)
福建省林业科技推广项目“松毛虫本土优势寄生蜂应用关键技术推广与示范”(2023TG16)
福州市林业科学研究项目“松毛虫寄生蜂推广应用及控害效果评价”[榕财农(指)〔2022〕81号]。
文摘
研究我国林业重要食叶害虫——柳杉毛虫保幼激素结合蛋白(JHBP),对于揭示其生长发育、化蛹、摄食、交配生殖及抗药性等生命活动具有重要意义。参照模式昆虫家蚕的41条JHBP蛋白序列,构建系统进化树,并对这些基因所编码的蛋白质二级结构、疏水性、蛋白质序列基序和三级结构等生物学特性进行分析,利用heatmap可视化工具分析柳杉毛虫JHBP在不同发育时期的表达水平。结果表明,柳杉毛虫JHBP基因共有JHBPa、JHBPc、JHBPd 3个亚家族,分别包含6、26、15个JHBP基因;蛋白序列至少含有1个JHBP结构域,且其中Dho05G001220蛋白序列不仅含有JHBP结构域,还含有Grp allergen结构域,各蛋白序列的疏水性区域呈明显的聚集分布,亲水性区域的聚集分布则不明显;JHBP基因在柳杉毛虫的低龄和中龄幼虫、蛹和成虫中显著表达,表明JHBP明显参与调控不同虫态的发育或变态过程。研究结果可为进一步明确柳杉毛虫JHBP基因家族的生物学功能提供参考。
关键词
柳杉毛虫
基因家族
jhbp
生物信息学分析
Keywords
Dendrolimus houi
gene families
Juvenile hormone binding protein
bioinformatic analyses
分类号
S763.18 [农业科学—森林保护学]
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职称材料
题名
舞毒蛾保幼激素结合蛋白家族基因克隆及对CO2胁迫的响应
被引量:
4
2
作者
闫丽琼
汤方
龚尚骞
罗佳煜
苑冉
曹传旺
机构
东北林业大学林学院
南方现代林业协同创新中心
出处
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2019年第6期1339-1347,共9页
基金
国家重点研发计划项目(2018YFC1200400)
江苏省自然科学基金(BK20151517)
东北林业大学本科生创新项目(201710225173)
文摘
保幼激素结合蛋白(JHBP)是存在于血淋巴和细胞内的一类载体蛋白,与保幼激素结合运送到靶标组织。本文研究舞毒蛾JHBP基因特性及其对高浓度CO 2胁迫的响应,为明确全球气候变化下舞毒蛾适应性机制提供理论依据。通过舞毒蛾转录组文库分析结合RT-PCR克隆鉴定出7个JHBP基因,并进行基因特性和发育阶段特异性分析,同时利用密闭式CO2人工气候箱在不同CO2浓度(397μL/L、550μL/L和750μL/L)下将舞毒蛾卵饲养至3龄幼虫,利用qRT-PCR技术测定3龄幼虫JHBP基因表达量变化。结果表明,舞毒蛾JHBP家族7个基因全长开放阅读框大小为714~756 bp,编码237~251个氨基酸,分子质量为28.22~28.54 kDa,理论等电点为5.33~8.47。7个基因在不同发育阶段的表达存在差异,幼虫期LdJHBP1、2、5、6基因表达量较高,而LdJHBP3、4和7在蛹期和成虫期高表达。进化树分析表明舞毒蛾LdJHBP1、LdJHBP2、LdJHBP6分别与棉铃虫Helicoverpa armigera、家蚕Bombyx mori、冬尺蛾Operophtera brumata的JHBP亲缘关系较近。高浓度CO2下舞毒蛾3龄幼虫的LdJHBP表达量下降。JHBP基因表达可能影响JH结合与运输从而调节生长发育。
关键词
舞毒蛾
jhbp
基因
CO2浓度
基因表达
Keywords
Lymantria dispar
jhbp
gene
CO2 concentration
gene expression
分类号
Q963 [生物学—昆虫学]
S433 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
灰飞虱保幼激素结合蛋白基因的克隆及表达动态
被引量:
7
3
作者
贺秀婷
张亚楠
李飞
李国清
董双林
机构
南京农业大学植物保护学院/农作物生物灾害综合治理教育部重点实验室
出处
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012年第2期59-64,共6页
基金
国家转基因生物新品种培育重大专项(2009ZX08001-002B)
国家973计划项目(2010CB126200)
江苏高校优势学科建设工程资助项目
文摘
克隆了灰飞虱的1个保幼激素结合蛋白(JHBP)基因,命名为LstrJHBP(GenBank登录号:JF728808)。该基因全长1 514 bp,开放阅读框编码289个氨基酸,5'和3'UTR区分别为124和522 bp,预测的相对分子质量为32 599,等电点5.47。综合信号肽预测、氨基酸序列比对及聚类分析结果,推测LstrJHBP是一个细胞质JHBP。qRT-PCR测定表明,LstrJHBP在灰飞虱若虫5个龄期及雌雄成虫均有表达,但4龄若虫期显著高于其他龄期,雌雄成虫间没有显著差异。研究结果为进一步明确灰飞虱的发育及变态调控机制奠定了基础。
关键词
灰飞虱
保幼激素结合蛋白
基因克隆
表达动态
QRT-PCR
Keywords
Laodelphax striatellus ( Fallen )
juvenile hormone binding protein (
jhbp
)
cDNA cloning
temporal expression
qRT-PCR
分类号
Q965.8 [生物学—昆虫学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
柳杉毛虫JHBP家族基因鉴定及生物信息学分析
叶淑婷
陈祯鸿
赵真辉
何欢
林孝春
梁光红
《森林与环境学报》
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
舞毒蛾保幼激素结合蛋白家族基因克隆及对CO2胁迫的响应
闫丽琼
汤方
龚尚骞
罗佳煜
苑冉
曹传旺
《环境昆虫学报》
CSCD
北大核心
2019
4
下载PDF
职称材料
3
灰飞虱保幼激素结合蛋白基因的克隆及表达动态
贺秀婷
张亚楠
李飞
李国清
董双林
《南京农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2012
7
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职称材料
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