卵形鲳JunB基因克隆及其胚胎组织表达分析

【目的】明确卵形鲳鲹(Trachinotus ovatus)JunB基因(ToJunB)在胚胎发育过程中的表达规律,为揭示JunB基因在鱼类胚胎发育过程中的作用机制打下基础。【方法】采用RT-PCR扩增ToJunB基因编码区(CDS)序列,通过ProtParam、NetSurfP 2.0、TMHMM、SignalP、PSORT及NetNGlyc 1.0等在线软件进行生物信息学分析,并采用荧光定量PCR检测ToJunB基因在卵形鲳鲹17个胚胎发育时期(受精卵、2-细胞期、8-细胞期、16-细胞期、32-细胞期、64-细胞期、多细胞期、高囊胚期、原肠早期、原肠中期、原肠末期、胚胎形成期、眼囊期、耳囊期、心脏跳动期、晶体出现期和初孵仔期)的表达情况。【结果】克隆获得的To JunB基因(1777 bp)包含344 bp的5’端非编码区(5’-UTR)、954 bp的开放阅读框(ORF)及479 bp的3’端非编码区(3’-UTR),共编码318个氨基酸残基;其编码蛋白分子量为35.03 kD,理论等电点(pI)为8.26,呈碱性;总平均疏水指数(GRAVY)为-0.567,为亲水性蛋白。ToJunB蛋白无跨膜结构和信号肽,主要定位于细胞核,属于非分泌型蛋白,在第39、129和168位氨基酸处各存在1个潜在的糖基化位点;其二级结构中α-螺旋占35.67%、延伸链占14.33%、无规则卷曲占50.00%。基于JunB氨基酸序列相似性构建的系统发育进化树显示,卵形鲳鲹与黄尾鰤的遗传距离最近,均隶属于鲈形目鲹科。To JunB基因在胚胎发育前期(受精卵至原肠早期)的相对表达量较高,至原肠中期达最高值,在胚胎发育后期(原肠末期至初孵仔期)的相对表达量均较低,且ToJunB基因在受精卵至原肠中期共10个发育时期的相对表达量极显著高于胚胎发育后期的7个时期(P<0.01)。【结论】ToJunB基因在卵形鲳鲹胚胎受精卵至原肠早期的相对表达量较高,于原肠中期达最高值后迅速降低,原肠末期至初孵仔期的相对表达量均较低,说明JunB基因在卵形鲳鲹胚胎发育的细胞分裂和增殖过程中发挥重要作用。

X射线照射诱导小鼠junB基因的表达

目的 探讨整体照射和不同剂量X射线离体照射后小鼠脾细胞和白血病细胞junB基因的表达。方法 3GyX射线小鼠全身照射及不同剂量X射线照射离体脾细胞和白血病细胞 ,提取RNA ,Northern杂交 ,定量分析junBmRNA。结果 3GyX射线全身照射后 ,小鼠脾细胞junB基因增强明显并迅速 ,C3H He小鼠 30min达高峰 ,BALB c小鼠 6 0min达高峰 ;不同剂量X射线照射离体脾细胞和白血病细胞后 ,junB基因也迅速被诱导 ,30～ 6 0min达峰值 ,2 4 0min逐渐降回假照组水平。结论 junB基因是一个辐射敏感基因 ,照射后立即表达 ,有可能在信号传递中起重要作用。

猪原癌基因JunB的电子克隆及比较基因组学分析

电子克隆了猪原癌基因JunB,并对其编码的蛋白基本理化性质、信号肽、疏水性、高级结构等进行了预测和分析。结果表明:猪JunB基因是一个cDNA全长为1 883 bp的单外显子基因,编码合成347个氨基酸的多肽;编码的蛋白分子量35 942.42 Da,属于亲水性蛋白,不含信号肽及跨膜结构,可剪切位点可能在第46个氨基酸残基处,可能是个非分泌性的蛋白,二级结构主要以α螺旋和无规则卷曲为主;在成年关节囊、成年肾上腺、舌头、血液、小肠、肌肉等组织和细胞中表达。

JUNB基因在先天性小耳畸形中的表达及临床意义

目的检测JUNB在先天性小耳畸形中的表达情况,探讨JUNB基因的异常表达在先天性小耳畸形中的临床意义。方法收集我院30例先天性小耳畸形患者的残耳软骨组及其正常耳软骨组织,分别提取总RNA,并反转录获得cDNA,利用实时荧光定量PCR技术检测两组耳软骨中JUNB基因表达情况。结果 JUNB基因在先天性小耳畸形患者残耳软骨组织中较正常耳软骨组织表达升高,且具有统计学意义(P<0.05)。结论 JUNB基因在先天性小耳畸形疾病中表达升高,其异常表达可能在先天性小耳畸形中发挥重要作用,具有一定的临床意义。