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Co-positivity of anti-dengue virus and anti-Japanese encephalitis virus IgM in endemic area:co-infection or cross reactivity?
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作者 Kaleshwar Prasad Singh Gitika Mishra +9 位作者 Parul Jain Nidhi Pandey Rachna Nagar Shikha Gupta Shantanu Prakash Om Prakash Danish Nasar Khan Sakshi Shrivastav Desh Deepak Singh Amita Jain 《Asian Pacific Journal of Tropical Medicine》 SCIE CAS 2014年第2期124-129,共6页
Objective:To report high co-positivity of anti-dengue virus(DV)and anti-Japanese encephalitis virus(JEV)IgM in an area endemic for both the viruses and to discuss the possibilities of coinfection.Methods:Serum samples... Objective:To report high co-positivity of anti-dengue virus(DV)and anti-Japanese encephalitis virus(JEV)IgM in an area endemic for both the viruses and to discuss the possibilities of coinfection.Methods:Serum samples from the patients who presented with fever,suspected central nervous system infection and thrombocytopenia,were tested for anti-DV IgM and antiJEV IgM antibodies.Conventional reverse transcriptase polymerase chain reaction was done for detection of DV RNA and JEV RNA.Results:Of 1 410 patient sera tested for anti-DV and antiJEV antibodies,129(9.14%)were co-positive for both.This co-positivity was observed only in those months when anli-JEV IgM positivily was high.Tilers of both anli-DV IgM and anti-JEV IgM were high in most of the co-positive eases.Among these 129 co-positive cases,76 were lesled by conventional reverse Iranscriplase polymerase chain reaction for both flaviviruses,of which eight cases were co-positive for DV and JEV.Conclusions:Co-infection with more than one fluvivirus species can occur in hyperendemic areas. 展开更多
关键词 CO-INFECTION Co-circulation Dengue virus IGM japanese encephalitis virus reverse transcriptase polymerase chain reaction
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复合探针实时荧光RT-PCR法检测小儿上呼吸道感染甲型流感病毒的价值 被引量:1
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作者 杨彬彬 陈秋虾 郭丽清 《中国医药指南》 2024年第15期103-105,共3页
目的 分析小儿上呼吸道感染甲型流感病毒应用复合探针实时荧光反转录聚合酶链反应(RT-PCR)法检测的临床价值。方法选择2023年1月至2023年12月流感监测信息系统两家监测点上呼吸道感染甲型流感病毒感染的患儿80例监测标本进行回顾性分析... 目的 分析小儿上呼吸道感染甲型流感病毒应用复合探针实时荧光反转录聚合酶链反应(RT-PCR)法检测的临床价值。方法选择2023年1月至2023年12月流感监测信息系统两家监测点上呼吸道感染甲型流感病毒感染的患儿80例监测标本进行回顾性分析,均开展复合探针实时荧光RT-PCR法检测,分析其诊断价值。结果 根据监测标本最终诊断结果显示,阳性标本68例、阴性标本12例。经复合探针实时荧光RT-PCR法检出67例,检出率为83.75%,敏感度为95.59%、特异度为83.33%、准确度为93.75%、阳性结果预测值为97.01%、阴性结果预测值为76.92%;批间批内变异系数均小于5%。结论 小儿上呼吸道感染甲型流感病毒应用复合探针实时荧光RT-PCR技术具有较高的敏感度、特异度及准确度,且检查结果快速,可为小儿上呼吸道感染甲型流感病变提供可靠的诊断,有利于制订合理的治疗方案。 展开更多
关键词 复合探针 上呼吸道感染 实时荧光反转录聚合酶链反应 甲型流感病毒
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帕利亚姆病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用
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作者 杨恒 李占鸿 +5 位作者 宋子昂 高林 李卓然 廖德芳 肖雷 李华春 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期395-400,共6页
本研究拟建立帕利亚姆病毒(Palyam virus,PALV)血清型特异性实时荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)方法用于临床样本或媒介中PALV血清型鉴定。根据我国流行PALV毒株的基因节段2序列,设计扩增引物和TaqMan探针,建立PALV血清型特异型qRT-PCR方法,... 本研究拟建立帕利亚姆病毒(Palyam virus,PALV)血清型特异性实时荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)方法用于临床样本或媒介中PALV血清型鉴定。根据我国流行PALV毒株的基因节段2序列,设计扩增引物和TaqMan探针,建立PALV血清型特异型qRT-PCR方法,对方法的特异性、灵敏性与重复性进行评估;以我国分离的28株PALV和90份核酸阳性血液样本评估检测方法的可靠性;利用建立的方法对采集库蠓样本中携带的PALV进行血清型鉴定。结果显示,建立的PALV血清型qRT-PCR检测方法具有良好的特异性与灵敏性,可检出核酸拷贝数下限在22至28 copies·μL^(-1)。对28株PALV的qRT-PCR检测结果与病毒测序鉴定结果一致;对PALV不同感染阶段哨兵动物血液(90份)中的qRT-PCR鉴定结果与分离病毒的血清型鉴定结果一致;建立的方法可准确鉴定库蠓中携带PALV的血清型。本研究建立的PALV血清型qRT-PCR定型方法具有良好的特异强、敏感性与重复性,可用于PALV感染动物与媒介中PALV血清型的鉴定,具有良好的应用价值。 展开更多
关键词 帕利亚姆病毒 血清型鉴定 实时荧光定量RT-PCR 检测方法
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菊芋HtMYB2基因VIGS体系构建与功能验证
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作者 王莹 李娟 孙雪梅 《中国农学通报》 2024年第24期116-121,共6页
颜色作为一种重要的农艺性状,影响作物的价值。紫皮菊芋与白皮菊芋相比,具有较好的外观颜色、营养价值和商品价值。本研究旨在探究菊芋块茎表皮颜色形成的潜在机制。通过前期转录组测序技术对紫皮和白皮菊芋块茎表皮分析,筛选得到与花... 颜色作为一种重要的农艺性状,影响作物的价值。紫皮菊芋与白皮菊芋相比,具有较好的外观颜色、营养价值和商品价值。本研究旨在探究菊芋块茎表皮颜色形成的潜在机制。通过前期转录组测序技术对紫皮和白皮菊芋块茎表皮分析,筛选得到与花青素合成代谢相关转录因子HtMYB2。本研究以紫皮菊芋品种为材料,利用VIGS技术将HtMYB2进行基因沉默,对其功能进行验证。结果表明侵染后的菊芋块茎表皮颜色变浅,花青素含量显著下降为15.34 mg/g;同时RT-PCR结果显示HtMYB2基因表达量为2.06,与对照组相比显著降低,沉默效率为73.96%,推测HtMYB2基因的沉默使菊芋块茎中花青素基因的表达受阻,花青素合成功能减弱,导致花青素含量降低,表明HtMYB2基因在花青素合成途径中起正调控作用。本研究为菊芋块茎表皮花青素的生物合成机理提供理论依据,并进一步揭示了该基因在调控块茎颜色和花青素合成途径中的重要性。 展开更多
关键词 菊芋 HtMYB2 花青素 病毒介导的基因沉默(VIGS) 块茎表皮颜色 逆转录聚合酶链反应 基因表达 生物合成途径
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基于直扩RT-PCR技术的寨卡病毒快速检测方法的建立
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作者 李浪 古莉冰 +6 位作者 朱丽 何建安 叶颖 张然 李华文 李福缘 顾大勇 《国际检验医学杂志》 CAS 2024年第3期358-364,共7页
目的建立基于直扩实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术的寨卡病毒快速检测方法。方法采用特殊功能的DNA聚合酶,以及优选PCR增强剂,以此建立直扩RT-PCR技术的寨卡病毒快速检测5种样本(全血、血清、唾液、咽拭子和尿)的方法。结果... 目的建立基于直扩实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术的寨卡病毒快速检测方法。方法采用特殊功能的DNA聚合酶,以及优选PCR增强剂,以此建立直扩RT-PCR技术的寨卡病毒快速检测5种样本(全血、血清、唾液、咽拭子和尿)的方法。结果5种样本检测限分别为血清103 PFU/mL,尿、咽拭子和唾液102 PFU/mL,全血104 PFU/mL,标准曲线的拟合优度的可决系数均在0.98以上,扩增效率均在90%~110%;寨卡病毒核酸成功扩增,非寨卡病毒核酸均未能扩增;尿、全血和唾液样本的重复性实验中106 PFU/mL和102 PFU/mL两个浓度的6个重复Ct值的变异系数均<5%。该研究建立的直扩RT-PCR技术的寨卡病毒检测方法与常规RT-PCR技术的检测结果一致,8个寨卡病毒样本,均只检测出2个血清样本,其余62个非寨卡病毒样本及12个阴性样本均未得到扩增。结论成功建立基于直扩RT-PCR技术的寨卡病毒快速检测方法,该方法简便快捷且灵敏度高、特异度强。 展开更多
关键词 寨卡病毒 直扩实时荧光定量逆转录聚合酶链反应技术 DNA聚合酶
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Diagnosis of nervous necrosis virus in orange-spotted grouper,Epinephelus coioides, by a rapid and convenient RT-PCR method 被引量:6
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作者 MU Yinnan LIN Kebing +1 位作者 CHEN Xinhua AO Jingqun 《Acta Oceanologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2013年第10期88-92,共5页
Viral nervous necrosis (VNN) causes high mortality in marine fish, especially in the grouper, worldwide and in China. Since there is no effective vaccine or drug to deal with VNN, early detection and prevention is i... Viral nervous necrosis (VNN) causes high mortality in marine fish, especially in the grouper, worldwide and in China. Since there is no effective vaccine or drug to deal with VNN, early detection and prevention is important to block its outbreak. In this study, a reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) was developed for the rapid, convenient, and sensitive detection of the VNN pathogen, nervous necro- sis virus (NNV), in the grouper. The whole process was completed within 3.5 h from the RNA extraction to PCR product visualization. The detection limit of this method was 200 copies of NNV RNA standard, which corresponded to 200 copies of virus particles. This RT-PCR method was specific to the NNV detection with no cross-reactivity to other fish viral disease pathogens, such as infectious pancreatic necrosis virus (IPNV), infectious hematopoietic necrosis virus (IHNV), spring viraemia of carp virus (SVCV), epizootic haematopoietic necrosis virus (EHNV), and large yellow croaker iridovirus (LYC1V). With this method, the orange-spotted grouper (Epinephelus coioides) fry from hatcheries with or without incidence of the VN- N epidemic in Fujian Province were detected. The results showed that all or 93% of the fry from the two hatcheries with incidence of the epidemic were diagnosed as positive, while 40% or 25% of fry from the t- wo hatcheries without the VNN epidemic were also detected as NNV positive, indicating that this RT-PCR method can be used for rapid, sensitive detection of NNV infection and applied in the VNN epidemic alert. 展开更多
关键词 viral nervous necrosis nervous necrosis virus orange-spotted grouper (Epinephelus coioides) reverse transcription-polymerase chain reaction DETECTION
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Expression of Cytokines IL-2, IL-10 and TNF-α in Mice with Herpes Simplex Viral Encephalitis 被引量:1
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作者 魏桂荣 张敏 +1 位作者 梅元武 董继华 《Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences)》 SCIE CAS 2006年第3期308-310,共3页
The expression of the cytokines IL-2, IL-10, TNF-α and their roles in mice with herpes simplex viral encephalitis (HSE) were studied. By using semiquantitative reverse transcription polymerase chain reaction (RT-... The expression of the cytokines IL-2, IL-10, TNF-α and their roles in mice with herpes simplex viral encephalitis (HSE) were studied. By using semiquantitative reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR), the expressions of IL-2, IL-10 and TNF-α mRNA in control group, HSE group and acyclovir (ACV)-treated group were detected and the pathological changes of brain were observed. It was found that after HSV1 infection, the cerebral lesions of haemorrhage and necrosis in mice were observed under the microscopy, and the levels of IL-2, IL-10 and TNF-α were increased remarkably. After treatment with ACV after HSV1 infection, the cerebral lesions in mice were improved, the level of IL-2 maintained stable, IL-10 was increased consistently, and TNF-α was decreased significantly as compared with those in HSE group. In acute HSE, many cytokines are upregulated, including IL-2, IL-10 and TNF-α to eliminate virus and TH1 type response is dominant. In convalescence, there is a shift in the cytokine expression profile from TH1 profile to TH2 profile and the shift can inhibit the overexpression of immune response in animals. ACV has remarkable effects in the treatment of HSE. 展开更多
关键词 herpes simplex encephalitis CYTOKINES reverse transcription polymerase chain reaction PATHOGENESIS ACYCLOVIR
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Genotyping of hepatitis C virus in patients with hepatocellular carcino Ma
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作者 崔晓红 潘卫 +5 位作者 戚中田 宋燕斌 印凯 张晓华 陈汉 吴孟超 《Journal of Medical Colleges of PLA(China)》 CAS 1995年第4期274-276,共3页
Forty-two patients with hepatocellular carcinoma (HCC) were examined for hepatitis C virus (HCV) RNA in liver tissues by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) with primers deduced from 5'-non-co... Forty-two patients with hepatocellular carcinoma (HCC) were examined for hepatitis C virus (HCV) RNA in liver tissues by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) with primers deduced from 5'-non-coding region (5'-NCR). HCV liver samples of 展开更多
关键词 HEPATOMA hepatitis C virus GENOTYPE reverse transcription-polymerase chain reaction PATIENTS
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寨卡病毒核酸检测技术研究进展
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作者 张智慧 王志江 +2 位作者 彭沫溱 李茜 苏品璨 《当代医学》 2023年第23期187-190,共4页
寨卡病毒(ZIKV)为黄病毒科黄病毒属的一种单链RNA病毒,主要通过埃及伊蚊和白纹伊蚊传播,也可通过血液、性、母婴等途径传播。传播ZIKV的蚊虫在我国分布广泛,同时,随着全球化的发展,世界各国人员往来日益频繁,ZIKV在我国有潜在传播的可... 寨卡病毒(ZIKV)为黄病毒科黄病毒属的一种单链RNA病毒,主要通过埃及伊蚊和白纹伊蚊传播,也可通过血液、性、母婴等途径传播。传播ZIKV的蚊虫在我国分布广泛,同时,随着全球化的发展,世界各国人员往来日益频繁,ZIKV在我国有潜在传播的可能性。核酸检测技术是实验室快速检测的有效手段,对预防和控制ZIKV传播具有重要意义。本文介绍了ZIKV基因组结构,并对ZIKV核酸检测的样本特点及方法进展作一综述。 展开更多
关键词 寨卡病毒 核酸检测 逆转录-聚合酶链反应 逆转录-环介导等温扩增技术 逆转录重组酶聚合酶扩增技术
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老年下呼吸道感染患者痰液培养细菌分布及新型冠状病毒感染对其分布的影响
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作者 卓影 李步任 +1 位作者 江莹莹 张诗颜 《检验医学与临床》 CAS 2023年第23期3493-3495,3500,共4页
目的分析老年下呼吸道感染患者痰液培养细菌分布和新型冠状病毒感染(以下简称新冠)对其分布的影响。方法选取2022年10月至2023年1月在该院诊断为下呼吸道感染的167例老年(年龄≥60岁)患者作为研究对象,收集所有研究对象的痰液标本,采用... 目的分析老年下呼吸道感染患者痰液培养细菌分布和新型冠状病毒感染(以下简称新冠)对其分布的影响。方法选取2022年10月至2023年1月在该院诊断为下呼吸道感染的167例老年(年龄≥60岁)患者作为研究对象,收集所有研究对象的痰液标本,采用常规方法对其进行细菌培养、分离及鉴定,同时以反转录酶聚合酶链反应(RT-PCR)法进行新冠病毒核酸检测,根据检测结果将研究对象分为新冠组和非新冠组。结果167例患者痰液标本分离细菌200株,主要为肺炎克雷伯菌(30.0%)、铜绿假单胞菌(18.5%)、鲍曼不动杆菌(12.5%)、大肠埃希菌(7.5%)、嗜麦芽窄食单胞菌(7.5%)。非新冠组感染鲍曼不动杆菌患者比例高于新冠组,而感染嗜麦芽窄食单胞菌患者比例低于新冠组,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论老年下呼吸道感染住院患者主要细菌为肺炎克雷伯菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌、大肠埃希菌和嗜麦芽窄食单胞菌,新冠病毒感染会影响老年患者下呼吸道感染的病原菌分布。 展开更多
关键词 老年 鲍曼不动杆菌 新型冠状病毒感染 反转录酶聚合酶链式反应
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RT-PCR检测猪瘟病毒初探 被引量:24
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作者 罗廷荣 波丹 +7 位作者 黄宪高 梁家权 刘芳 黄伟坚 秦爱珍 温荣辉 陆芹章 余克伦 《广西农业生物科学》 CAS CSCD 2001年第1期17-20,共4页
本研究建立了反转录聚合酶链反应 ( RT PCR)技术检测猪瘟病毒 ( Hog Cholera Virus,HCV)方法。合成的二对引物 HCV 1 / HCV 2和 HCV A1 / HCV A2成功地扩增兔化弱毒株、法国株和石门株的核酸 ,并对采自博白县 3个、贵港市 1个和武宣县 ... 本研究建立了反转录聚合酶链反应 ( RT PCR)技术检测猪瘟病毒 ( Hog Cholera Virus,HCV)方法。合成的二对引物 HCV 1 / HCV 2和 HCV A1 / HCV A2成功地扩增兔化弱毒株、法国株和石门株的核酸 ,并对采自博白县 3个、贵港市 1个和武宣县 1个猪场共 1 3份病料进行检测。结果从博白县和贵港市的 1 1份材料中检测到 HCV的核酸。 展开更多
关键词 反转录-聚合酶链反应 猪瘟病毒 检测
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RT-PCR快速诊断禽流感 被引量:21
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作者 刘明 于康震 +3 位作者 崔尚金 孔宪刚 唐秀英 徐宜为 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 2000年第S1期176-177,共2页
根据禽流感病毒NP基因的序列分析结果,设计了一对NP基因特异的引物。采用该对引物,不经病毒分离,直接从禽流感病毒感染鸡的气管、泄殖腔棉拭子和组织样品中提取核酸, RT~PCR可以扩增出 326bp的 NP基因片段。采用... 根据禽流感病毒NP基因的序列分析结果,设计了一对NP基因特异的引物。采用该对引物,不经病毒分离,直接从禽流感病毒感染鸡的气管、泄殖腔棉拭子和组织样品中提取核酸, RT~PCR可以扩增出 326bp的 NP基因片段。采用该技术对14个亚型禽流感病毒标准参考株,4个亚型12株国内分离野毒株,RT-PCR检测的结果都呈阳性;对新城疫病毒、传染性法氏囊病毒、传染性支气管炎病毒、传染性喉气管炎病毒以及减蛋综合症病毒,RT-PCR扩增结果都呈阴性。禽流感病毒 A/Goose/Guangdong(H5N1)和 A/African Starling/England(H7N1)实验感染鸡样品 RT-PCR检测与鸡胚病毒分离阳性率分别为34/42、32/42; 24/55、24/55, 二者符合率大于95%。 RT-PCR最少可检测到10pg的病毒核酸。对山东某地发病鸡场样品进行RT-PCR检测,只用6个小时就可得出准确的诊断结果,证明RT-PCR检测方法敏感特异,可用于禽流感的快速诊断。 展开更多
关键词 禽流感病毒 诊断 反转录-聚合酶链式反应
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鉴别猪瘟强毒和弱毒的反转录-复合套式聚合酶链式反应(RT-nPCR)检测方法的建立 被引量:26
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作者 李艳 仇华吉 +5 位作者 王秀荣 张守发 朱庆虎 李娜 李国新 童光志 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第9期1907-1914,共8页
【目的】建立一种能区分猪瘟病毒(classicalswinefever,CSFV)强毒和弱毒的反转录-复合套式聚合酶链式反应(RT-nPCR)检测方法。【方法】根据GenBank上登录的现有CSFV基因组全序列,选择高度保守区设计了一对CSFV通用引物,并在该对引物跨... 【目的】建立一种能区分猪瘟病毒(classicalswinefever,CSFV)强毒和弱毒的反转录-复合套式聚合酶链式反应(RT-nPCR)检测方法。【方法】根据GenBank上登录的现有CSFV基因组全序列,选择高度保守区设计了一对CSFV通用引物,并在该对引物跨越区域的内部设计了猪瘟兔化弱毒疫苗和强毒特异性引物,建立了一种能区分猪瘟强毒和弱毒的RT-nPCR鉴别诊断方法。【结果】应用该方法从猪瘟兔化弱毒疫苗和石门强毒株基因组中扩增出了大小分别为447和343bp的一条特异性片段,从两种病毒基因组混合物中扩增出了大小为447和343bp的两条特异性片段,但对牛病毒性腹泻病毒和其它常见猪源病毒细胞培养物以及正常细胞基因组进行检测时均为阴性。该方法可以检测出0.04pg的CSFVRNA。对从黑龙江省采集的15份疑似猪瘟病料进行了检测,结果表明,有14份类似猪瘟强毒,1份类似弱毒疫苗。限制性片段长度多态性和种系发生分析证实了RT-nPCR的检测结果。【结论】本研究建立的RT-nPCR可以有效区分猪瘟强毒和弱毒,减少了未感染的免疫猪被误杀的可能性。 展开更多
关键词 猪瘟病毒 反转录-复合套式聚合酶链式反应 限制性片段长度多态性分析
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乙脑病毒嵌套式RT-PCR检测方法的建立及初步应用 被引量:12
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作者 高正琴 贺争鸣 +2 位作者 邢瑞昌 卫礼 王吉 《中国人兽共患病杂志》 CSCD 北大核心 2005年第4期279-282,共4页
目的 建立适用于检测人用猪源性生物制品中外源性乙脑病毒(JEV)的嵌套式RT- PCR方法。方法 根据已公布的JEV序列(GenBank登录号为M5 5 5 0 6 ) ,设计合成两对引物,对JEV感染的乳鼠脑组织和培养JEV的BHK 2 1细胞抽提RNA进行RT PCR和RT ... 目的 建立适用于检测人用猪源性生物制品中外源性乙脑病毒(JEV)的嵌套式RT- PCR方法。方法 根据已公布的JEV序列(GenBank登录号为M5 5 5 0 6 ) ,设计合成两对引物,对JEV感染的乳鼠脑组织和培养JEV的BHK 2 1细胞抽提RNA进行RT PCR和RT nestedPCR ,将PCR产物进行了克隆测序;同时对猪细小病毒(PPV)、猴空泡病毒4 0 (SV4 0 )及正常乳鼠脑组织、正常BHK 2 1细胞、PK15细胞、BSC 1细胞提取核酸进行PCR ,并对2 10份临床样品进行了检测。结果 PCR产物经琼脂糖凝胶电泳检测,JEV感染的乳鼠脑组织和培养JEV的BHK 2 1细胞均扩增出10 15bp和6 2 2bp目的基因片段,而PPV、SV4 0及未感染JEV的乳鼠脑组织、正常BHK 2 1细胞、PK15细胞、BSC 1细胞均未见特异性扩增条带,2 10份猪组织样品中未检出阳性样品。RT nestedPCR检测的最低限度为10PFU病毒。从样品核酸的提取到PCR扩增及检测结果的报告可在8小时内完成。结论 本研究建立的RT NestedPCR方法具有快速、特异、敏感、可靠的特点,可用于人用猪源性生物制品中外源性JEV的污染检测。 展开更多
关键词 乙脑病毒 反转录-嵌套式聚合酶链反应 检测
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湖北发生的水稻矮缩病是南方水稻黑条矮缩病毒引起的 被引量:24
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作者 章松柏 罗汉刚 +3 位作者 张求东 张长青 吴祖建 谢联辉 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期223-226,共4页
近年来由水稻黑条矮缩病毒和南方水稻黑条矮缩病毒引起的水稻黑条矮缩病在华南、华东等地区暴发流行,给水稻生产带来严重损失,而湖北一直未有水稻黑条矮缩病流行的报道。然而,2009年和2010年在湖北省长江沿线的荆州、孝感、咸宁、黄石... 近年来由水稻黑条矮缩病毒和南方水稻黑条矮缩病毒引起的水稻黑条矮缩病在华南、华东等地区暴发流行,给水稻生产带来严重损失,而湖北一直未有水稻黑条矮缩病流行的报道。然而,2009年和2010年在湖北省长江沿线的荆州、孝感、咸宁、黄石、鄂州、黄冈等水稻种植区普遍发生水稻矮缩减产的现象。经过症状观察、dsRNA电泳图谱分析、RT-PCR等方法,诊断该病是由南方水稻黑条矮缩病毒引起,说明该病毒已经随介体昆虫白背飞虱从我国南方传播至中部水稻种植区。 展开更多
关键词 水稻黑条矮缩病毒 南方水稻黑条矮缩病毒 基因组电泳 反转录聚合酶链式反应 病毒鉴定
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上海地区儿童急性下呼吸道常见病毒及鼻病毒感染的临床研究 被引量:37
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作者 李军 朱启镕 +1 位作者 俞蕙 顾新焕 《临床儿科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2007年第6期457-461,共5页
目的了解上海地区急性下呼吸道感染(ALRTI)患儿病毒感染病原体的现状。方法收集2005年1月至12月住院确诊为ALRTI的342例患儿深部鼻咽分泌物(NPS)标本,建立套式RT-PCR的方法测定NPS中的鼻病毒(HRV)基因,用直接免疫荧光法(DFA)检测NPS中... 目的了解上海地区急性下呼吸道感染(ALRTI)患儿病毒感染病原体的现状。方法收集2005年1月至12月住院确诊为ALRTI的342例患儿深部鼻咽分泌物(NPS)标本,建立套式RT-PCR的方法测定NPS中的鼻病毒(HRV)基因,用直接免疫荧光法(DFA)检测NPS中的呼吸道合胞病毒(RSV)、流感病毒(IFV)、副流感病毒(PIV)、腺病毒(ADV)抗原,对各种病毒在小儿ALRTI中的流行特点及临床特征进行分析。结果342例ALRTI患儿NPS标本中,检测到HRV阳性46例(13.45%)。HRV阳性患儿中,3岁以下婴幼儿38例(82.6%),1岁以下27例(58.7%)。HRV致ALRTI全年可见,3到5月份为最高峰。RSV阳性64例(18.70%),1岁以下46例(71.88%)。1岁以下与1岁以上患儿RSV的检出率比较差异有统计学意义(χ2=4.03,P<0.05)。RSV的检出阳性率从2月份起逐渐下降,6到7月份达到最低,8月份起检出率逐渐升高,至12月份达到最高。ADV感染9例(2.63%),PIV感染8例(2.30%),IFV感染7例(2.0%)。本组患儿病毒混合感染共4例。130例病毒性ALRTI患儿诊断支气管肺炎122例,体温正常42例、低热34例、中度热50例、高热仅4例,以中度发热以下为主,末梢血白细胞<10×109/L93例(71.5%),中性粒细胞<50%94例(72.3%),CRP<8mg/L99例(76.2%),均符合病毒性肺炎的特点。64例RSV感染病例中有30例合并喘息(46.9%),36例HRV感染病例中24例合并喘息(52.2%)。结论病毒病原在上海地区小儿ALRTI中占有重要地位,小儿病毒性ALRTI以RSV及HRV为主,ADV、PIV及IFV相对少见,混合性病毒感染少见。HRV所致小儿ALRTI以3岁以下儿童多见,尤以1岁以下为多。上海地区HRV感染主要集中于春秋两季。RSV所致小儿ALRTI以1岁以下为主,以秋、冬、春气温较低的季节多发。除RSV外,HRV也是导致ALRTI患儿喘息的重要病原。 展开更多
关键词 急性下呼吸道感染 病毒 套式RT—PCR 直接免疫荧光法 儿童
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应用RT-PCR分子检测技术快速检测大蒜普通潜隐病毒 被引量:16
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作者 张威 张匀华 +2 位作者 李学湛 高艳玲 白艳菊 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期133-137,共5页
根据大蒜普通潜隐病毒(Garlic common latent virus,GCLV)的外壳蛋白区域的保守序列设计合成一对寡核苷酸引物,以带毒植物的总RNA为模板,进行反转录和PCR扩增,通过反应体系和反应程序的建立与优化,扩增得到长300 bp的目的片段,并将目的... 根据大蒜普通潜隐病毒(Garlic common latent virus,GCLV)的外壳蛋白区域的保守序列设计合成一对寡核苷酸引物,以带毒植物的总RNA为模板,进行反转录和PCR扩增,通过反应体系和反应程序的建立与优化,扩增得到长300 bp的目的片段,并将目的片段转入大肠杆菌进行了克隆和序列测定。测序结果与GenBank中其他GCLV相应区域的序列同源性最高达98%。并对其检测的特异性和灵敏度进行了验证,从而建立了快速、灵敏、特异性强的GCLV分子生物学检测方法。 展开更多
关键词 大蒜普通潜隐病毒 反转录-聚合酶链式反应 病毒检测
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马铃薯病毒一步法RT-PCR诊断研究 被引量:11
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作者 关翠萍 张鹤龄 +3 位作者 门福义 宋艳茹 蒙美莲 陈正华 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2005年第2期178-185,共8页
运用一步法RT-PCR对马铃薯和烟草中的马铃薯X病毒、马铃薯Y病毒和马铃薯卷叶病毒进行了检测,实验表明:对酚-SDS方法提取的病毒核酸进行扩增,一步法RT-PCR检测到的扩增产物的灵敏度较两步法RT-PCR的高100倍左右.两种提取方法对比,用一步... 运用一步法RT-PCR对马铃薯和烟草中的马铃薯X病毒、马铃薯Y病毒和马铃薯卷叶病毒进行了检测,实验表明:对酚-SDS方法提取的病毒核酸进行扩增,一步法RT-PCR检测到的扩增产物的灵敏度较两步法RT-PCR的高100倍左右.两种提取方法对比,用一步法RT-PCR进行扩增,检测到的PEG法扩增产物的灵敏度较酚-SDS法扩增产物的灵敏度高3倍.建立了快速、简便、灵敏度高、特异性强的马铃薯病毒一步法RT-PCR检测技术. 展开更多
关键词 马铃薯X病毒 马铃薯Y病毒 马铃薯卷叶病毒 反转录-聚合酶链式反应 诊断
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马铃薯Y病毒的RT-PCR检测 被引量:30
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作者 李浩戈 吴元华 赵秀香 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 1999年第3期244-246,共3页
通过两种方法提取了烟草病叶中PVY病毒的RNA,然后针对PVY^N的CP基因序列,设计合成了一对特异性引物,运用反转录PCR技术对提取的PVY-RNA进行了体外扩增,结果得到与预期大小相一致的780bp片段,而对照未得到任何产物,从而建立了运... 通过两种方法提取了烟草病叶中PVY病毒的RNA,然后针对PVY^N的CP基因序列,设计合成了一对特异性引物,运用反转录PCR技术对提取的PVY-RNA进行了体外扩增,结果得到与预期大小相一致的780bp片段,而对照未得到任何产物,从而建立了运用RT-PCR手段检测植物中PVY的又一有效途径,并运用此方法对东北三省部分地区马铃薯种薯中PVY的带毒情况进行了检测。 展开更多
关键词 反转录PCR 马铃薯 Y病毒 检测
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上海市儿童下呼吸道感染常见病毒诊断方法比较 被引量:24
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作者 王春 赵百慧 +1 位作者 张泓 张曦 《检验医学》 CAS 北大核心 2011年第9期589-592,共4页
目的应用直接免疫荧光法(DFA)和多重逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)对呼吸道感染患儿鼻咽分泌物的常见病毒进行检测,比较2种方法的符合率并评估其临床应用价值。方法选取急性呼吸道感染患儿鼻咽分泌物540例,分别用DFA和多重RT-PCR进行检测... 目的应用直接免疫荧光法(DFA)和多重逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)对呼吸道感染患儿鼻咽分泌物的常见病毒进行检测,比较2种方法的符合率并评估其临床应用价值。方法选取急性呼吸道感染患儿鼻咽分泌物540例,分别用DFA和多重RT-PCR进行检测,分析其结果。结果 DFA检测阳性率为43.9%(237/540),多重RT-PCR检测阳性率为55.7%(301/540),多重RT-PCR阳性检出率显著高于DFA的阳性检出率(χ2=29.093,P<0.01)。DFA和多重RT-PCR同时阳性163例,DFA阳性而多重RT-PCR阴性74例,多重RT-PCR阳性而DFA阴性138例,DFA和多重RT-PCR同时阴性165例。DFA和多重RT-PCR同时为阳性的163例标本中,有15例标本两者检测结果不一致,符合率为91.0%。结论 DFA快速、简便、特异性及敏感性高,适用于临床检测。多重RT-PCR的敏感性高,检测病毒谱广,且可以做亚型鉴定,适用于呼吸道病毒流行病学的调查。 展开更多
关键词 呼吸道病毒感染 直接免疫荧光法 多重逆转录聚合酶链反应 儿童
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