网络药理学联合基因表达数据库芯片分析及分子对接技术探讨健脾清化化瘀汤治疗胃癌前病变的潜在机制

目的基于网络药理学联合基因表达数据库(GEO)芯片分析及分子对接技术探讨健脾清化化瘀汤治疗胃癌前病变(PLGC)的成分靶点及信号通路,预测其潜在作用机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及本草组鉴数据库(HERB)搜集健脾清化化瘀汤中14味药物的活性成分和靶点。通过GEO数据库中的GSE55696基因芯片获取差异表达基因,利用人类孟德尔遗传在线数据库(OMIM)、Dis Ge Net、Gene Cards疾病数据库获取PLGC的相关疾病靶点,运用R软件获取健脾清化化瘀汤治疗PLGC的关键靶点。通过R语言对关键靶点进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组的百科全书(KEGG)通路富集分析,利用蛋白互作(STRING)数据库及Cytoscape3.9.1软件绘制关键靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选出核心靶点,利用Cytoscape3.9.1构建健脾清化化瘀汤与PLGC的“活性成分-关键靶点”网络,筛选出核心成分,最后将核心成分与核心靶点进行分子对接,探索蛋白与分子间的亲和性。结果共获得健脾清化化瘀汤226个活性成分,对应416个药物靶点;获得PLGC差异表达基因1673个,疾病数据库获得相关靶点1302个;药物与疾病交集基因149个;GO功能富集分析得到2802个条目,KEGG通路富集分析得到161条相关通路,主要涉及糖尿病并发症晚期糖基化终末产物/AGEs受体(AGE-RAGE)信号通路与癌症相关信号通路;筛选得到核心活性成分槲皮素、木犀草素等,核心靶点TP53、JUN、AKT1等;分子对接结果证实核心成分与核心靶点之间有较好的结合活性。结论健脾清化化瘀汤可能通过参与多条信号通路作用于多成分、多靶点,从而发挥治疗PLGC的效用。