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基于网络药理学和分子对接技术探讨解毒活血汤治疗新型冠状病毒肺炎的潜在作用机制
被引量:
3
1
作者
吕鑫
顾志荣
+3 位作者
张志红
祁梅
张锐
葛斌
《甘肃中医药大学学报》
2022年第4期34-44,共11页
目的 运用网络药理学方法和分子对接技术探讨解毒活血汤治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)多成分、多靶点、多通路的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索解毒活血汤中除生地黄外9味中药的活性成分及靶点,查阅...
目的 运用网络药理学方法和分子对接技术探讨解毒活血汤治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)多成分、多靶点、多通路的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索解毒活血汤中除生地黄外9味中药的活性成分及靶点,查阅文献筛选生地黄的活性成分,使用GeneCards数据库获取COVID-19的靶点,通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,利用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-化合物-靶点网络,通过R软件的ClusterProfiler包对关键靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后对严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)3CL水解酶(Mpro)、血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)及关键靶点与显著化合物进行分子对接。结果 解毒活血汤包含了10味中药、153个化合物和253个靶点,将解毒活血汤主要活性成分调控的靶点与COVID-19的治疗靶点取交集,得到51个潜在靶点,GO功能富集分析得到82个条目(P<0.05),KEGG通路富集分析筛选得到154条信号通路(P <0.05);分子对接结果显示,Mpro与槲皮素、ACE2与木犀草素、胱天蛋白酶3(CASP3)与槲皮素、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)与木犀草素、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)与汉黄芩素、丝裂原活化蛋白激酶8(MAPK8)与山奈酚、白细胞介素-6(IL-6)与木犀草素对接结果较好。结论 解毒活血汤治疗COVID-19的作用机制可能与其多个化学成分通过多靶点、多通路参与抗炎、抗病毒和免疫调节等作用有关。
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关键词
解毒
活
血
汤
新型冠状病毒肺炎
网络药理学
分子对接
作用机制
原文传递
题名
基于网络药理学和分子对接技术探讨解毒活血汤治疗新型冠状病毒肺炎的潜在作用机制
被引量:
3
1
作者
吕鑫
顾志荣
张志红
祁梅
张锐
葛斌
机构
甘肃中医药大学药学院
甘肃省人民医院药剂科
甘肃中医药大学期刊编辑部
出处
《甘肃中医药大学学报》
2022年第4期34-44,共11页
基金
甘肃省中医药管理局科研项目(GZK-2019-41)
甘肃省人民医院研发攻关项目(18GSSY2-3)。
文摘
目的 运用网络药理学方法和分子对接技术探讨解毒活血汤治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)多成分、多靶点、多通路的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索解毒活血汤中除生地黄外9味中药的活性成分及靶点,查阅文献筛选生地黄的活性成分,使用GeneCards数据库获取COVID-19的靶点,通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,利用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-化合物-靶点网络,通过R软件的ClusterProfiler包对关键靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后对严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)3CL水解酶(Mpro)、血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)及关键靶点与显著化合物进行分子对接。结果 解毒活血汤包含了10味中药、153个化合物和253个靶点,将解毒活血汤主要活性成分调控的靶点与COVID-19的治疗靶点取交集,得到51个潜在靶点,GO功能富集分析得到82个条目(P<0.05),KEGG通路富集分析筛选得到154条信号通路(P <0.05);分子对接结果显示,Mpro与槲皮素、ACE2与木犀草素、胱天蛋白酶3(CASP3)与槲皮素、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)与木犀草素、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)与汉黄芩素、丝裂原活化蛋白激酶8(MAPK8)与山奈酚、白细胞介素-6(IL-6)与木犀草素对接结果较好。结论 解毒活血汤治疗COVID-19的作用机制可能与其多个化学成分通过多靶点、多通路参与抗炎、抗病毒和免疫调节等作用有关。
关键词
解毒
活
血
汤
新型冠状病毒肺炎
网络药理学
分子对接
作用机制
Keywords
jiedu
huoxue
tang
(
解毒
活
血
汤
,
jdhxt
)
coronavirus disease 2019(COVID-19)
network pharmacology
molecular docking technology
mechanism
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
R563.1 [医药卫生—呼吸系统]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学和分子对接技术探讨解毒活血汤治疗新型冠状病毒肺炎的潜在作用机制
吕鑫
顾志荣
张志红
祁梅
张锐
葛斌
《甘肃中医药大学学报》
2022
3
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