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Characteristics of Deposition of Inosine Monophosphate(IMP) and Intramuscular Fat(IMF) in Muscles of Jinghai Yellow Chicken and Its Crossbreeds 被引量:2
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作者 谢恺舟 李爱华 +7 位作者 孙瑛瑛 陈学森 黄玉萍 张小杰 赵敏 张跟喜 戴国俊 王金玉 《Agricultural Science & Technology》 CAS 2013年第1期144-148,154,共6页
[Objective] This study aimed to investigate the characteristics of deposition of inosine monophosphate (IMP) and intramuscular fat (IMF) in muscles of Jinghai yellow chickens and its crossbred.[Method] The charact... [Objective] This study aimed to investigate the characteristics of deposition of inosine monophosphate (IMP) and intramuscular fat (IMF) in muscles of Jinghai yellow chickens and its crossbred.[Method] The characteristics of IMP and IMF deposition of 112-day-old Jinghai yellow chickens (J×J) and its two different 70-day- old crossbreeds (J×B and B×B) were analyzed. The IMP content in breast muscle and leg muscle were determined by HPLC. [Result] The contents of IMP and cor- rected inosine monophosphate (IMPc) in breast muscle were significantly or ex- tremely significantly higher than that in leg muscle of the chickens in the three groups whether in male or female chickens (P〈0.05 or P〈0.01). There were no sig- nificant difference in the contents of IMP and IMPc between hens and roosters (P〉 0.05). The fresh degree of breast muscle and leg muscle was 96,11%-98.16% and 87.22%-93.07%, respectively. And the fresh degree of breast muscle was higher than that of leg muscle. In the three groups, the IMF content in leg muscle was significantly higher than that in breast muscle whether in male or female chickens (P〈0.05). The contents of IMF in breast muscle and leg muscle were 0.36%-0.75% and 1.84%-2.38%, respectively. The iMP content in breast muscle of chickens in Bx J group was extremely significantly higher than that in breast muscle of chickens in JxJ group (P〈0.01), but the contents of IMPc and iMF of breast muscle and leg muscle of the chickens in the three groups had no significant difference (P〉0.05). [Conclusion] To sum up, the freshness and flavor significantly differ between the breast muscle and leg muscle of chickens, but show no significant difference among the three groups. 展开更多
关键词 Crossbred combinations Muscles Inosine monophosphate (IMP) lintra- muscular fat (IMF) DEPOSITION jinghai yellow chicken
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Effects of Different Dietary Energy and Protein Levels on Meat Performance and Meat Quality of Jinghai Yellow Chickens 被引量:2
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作者 Jianfeng WANG Lulu CUI +6 位作者 Kaizhou XIE Yingying SUN Lirui SUN Jianyu LIU Genxi ZHANG Guojun DAI Jinyu WANG 《Agricultural Biotechnology》 CAS 2014年第4期31-35,共5页
To investigate the effect of different dietary energy and protein levels on meat performance and meat quality of Jinghai yellow chickens, 480 43-day old Jinghai yellow chickens with similar weight were randomly divide... To investigate the effect of different dietary energy and protein levels on meat performance and meat quality of Jinghai yellow chickens, 480 43-day old Jinghai yellow chickens with similar weight were randomly divided into four experimental groups: experimental group 1 (protein 15%, metabolic energy 9.95 MJ/kg), experimental group 2 (protein 16%, metabolic energy 10.95 MJ/kg), experimental group 3 (protein 17%, metabolic energy 12.65 MJ/kg) and experimental group 4 ( protein 18%, metabolic energy 13.95 MJ/kg), respectively. All chickens were slaughtered at 112-day old. The breast and leg muscles of Jinghai yellow chickens were collected, to determine the slaughter performance, conventional meat quality and muscle chemical indicators. The results indicated that dressing-out percentage and eviscerated yield percentage in four experimental groups were above 87.27% and 67.00%, respectively; other slaughter performance indicators exhibited no significant differences among various groups (P 〉 0.05 ) ; breast muscle color of hens in experimental group 4 varied significantly from that in other three groups ( P 〈 0.05 ) ; leg muscle color of hens in experimental group 2 varied extremely significantly from that in other three groups ( P 〈 0.01 ) ; water-holding capacity of breast muscles of hens in experimental group 3 was significantly higher than that in experimental group 4 (P 〈 0.05 ) ; thiamine content of breast muscles of cocks in experimental group 3 was significandy higher than that in experimental group 2 ( P 〈 0.05 ) ; however, other properties exhibited no significant differenees among various groups (P 〉 0.05 ). 展开更多
关键词 Energy and protein levels Meat performance Meat quality jinghai yellow chickens
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不同光色条件下京海黄鸡垂体转录组功能分析
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作者 王莹 李扶石 +1 位作者 张杨扬 王金玉 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期797-805,共9页
【目的】对不同光色条件下京海黄鸡垂体进行转录组测序分析,了解不同光色条件下京海黄鸡垂体的表达谱,旨在筛选出红光影响京海黄鸡生殖激素合成的关键基因,为提高种鸡产蛋性能提供理论基础。【方法】红光组京海黄鸡产蛋量(90.61枚)显著... 【目的】对不同光色条件下京海黄鸡垂体进行转录组测序分析,了解不同光色条件下京海黄鸡垂体的表达谱,旨在筛选出红光影响京海黄鸡生殖激素合成的关键基因,为提高种鸡产蛋性能提供理论基础。【方法】红光组京海黄鸡产蛋量(90.61枚)显著高于白光组(87.44枚)(P<0.05)。选取红光和白光条件下京海黄鸡各3只,采集其垂体进行高通量测序,利用HISAT和DESeq等方法获得差异表达基因(DEGs)进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析。【结果】通过高通量测序获得4892794884~4980565639条Raw reads,比对到参考基因组的read比对率在92.00%以上,GC含量为48.54%~49.11%。将红光和白光条件下京海黄鸡的垂体进行比较,共获得155个DEGs,其中红光组与白光组(RP vs WP)相比,有90个基因表达上调和65个基因表达下调。对DEGs进行GO功能注释分析,主要在生物调控、细胞过程、细胞、细胞组分、连接和催化活性功能等重要生物途径。KEGG信号通路分析结果显示,DEGs主要富集在细胞因子—细胞因子受体相互作用、类固醇激素的生物合成通路、视黄醇的新陈代谢、花生四烯酸代谢、神经活性配体—受体相互作用等信号通路,这些通路中的促性腺激素释放激素基因(GNRH1)、分泌型磷蛋白1基因(SPP1)、信号转导蛋白1基因(SMAD1)、骨形态形成蛋白拮抗蛋白2抗体基因(GREM2)和表皮调节素基因(EREG)等表达可能受光色的影响,从而影响种鸡的产蛋性能。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果证明了转录组测序结果准确可靠。【结论】与白光相比,红光能显著提高京海黄鸡的产蛋量。筛选获得的GNRH1、SPP1、SMAD1、GREM2和EREG等基因可能在光色调控京海黄鸡产蛋性能中发挥重要作用,可作为种鸡垂体组织调控其产蛋性能分子机制研究的关键基因。 展开更多
关键词 光色 京海黄鸡 转录组 垂体
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京海黄鸡肉用性能及肉品质的研究 被引量:49
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作者 谢恺舟 戴国俊 +3 位作者 王金玉 顾云飞 顾玉萍 施会强 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2008年第1期45-48,共4页
以112日龄京海黄鸡为素材,测定其屠宰性能、肉品质和化学指标。结果表明:京海黄鸡产肉性能良好,112日龄屠宰率在91%以上,全净膛率在67%以上;胸、腿肌pH值分别为5.92、6.37;胸肌失水率大于腿肌,胸、腿肌水分含量为710~750mg·g^-1... 以112日龄京海黄鸡为素材,测定其屠宰性能、肉品质和化学指标。结果表明:京海黄鸡产肉性能良好,112日龄屠宰率在91%以上,全净膛率在67%以上;胸、腿肌pH值分别为5.92、6.37;胸肌失水率大于腿肌,胸、腿肌水分含量为710~750mg·g^-1;粗蛋白质含量母鸡胸、腿肌分别为229.8、206.6mg·g^-1,公鸡分别为236.7、203.7mg·g^-1;粗脂肪含量母鸡胸、腿肌分别为10.9、42.5mg·g^-1,公鸡分别为10.8、38.8mg·g^-1;硫胺素含量母鸡胸、腿肌分别为0.27、0.51mg·kg^-1,公鸡分别为0.29、0.54mg·kg^-1;肌苷酸含量母鸡胸、腿肌分别为4.15、2.63mg·g^-1,公鸡分别为4.36、2.84mg·g^-1。胸肌与腿肌硫胺素和肌苷酸含量差异均极显著,说明不同部位肌肉在风味和鲜味方面存在差异,但性别间差异不显著。 展开更多
关键词 京海黄鸡 肉用性能 肉品质
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京海黄鸡体重、体尺及屠宰性状间的典型相关分析 被引量:27
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作者 杨燕 王金玉 +3 位作者 谢恺舟 吕慎金 王丽云 于佳慧 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2007年第17期5-8,共4页
对京海黄鸡体重、体尺和屠宰3组性状的23个变量进行了典型相关分析。结果表明:体重和体尺性状间,体重与屠宰性状间以及体尺与屠宰性状间的第1个典型相关系数均达极显著水平,其典型相关系数依次为0.915321、0.996883和0.961838,分别占总... 对京海黄鸡体重、体尺和屠宰3组性状的23个变量进行了典型相关分析。结果表明:体重和体尺性状间,体重与屠宰性状间以及体尺与屠宰性状间的第1个典型相关系数均达极显著水平,其典型相关系数依次为0.915321、0.996883和0.961838,分别占总相关的98.46%、98.96%和92.82%。在这些性状中,起主要作用的有16周龄重、胫长、胴体重及脚重。本研究结果对京海黄鸡的遗传育种和杂交优势利用有一定的参考意义。 展开更多
关键词 体重性状 体尺性状 屠宰性状 典型相关 京海黄鸡
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IGF-I与IGFBP-1基因对京海黄鸡生长性状的遗传效应分析 被引量:11
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作者 赵秀华 王金玉 +4 位作者 张跟喜 魏岳 顾玉萍 俞亚波 施会强 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期152-158,共7页
旨在对IGF-I和IGFBP-1基因部分SNPs与鸡生长性状进行关联分析。试验以京海黄鸡为材料,采用PCR-SSCP方法检测2个候选基因的单核苷酸多态性(SNPs),采用一般线性模型(GLM)分析基因型与生长性状的遗传效应。结果表明,IGF-I基因外显子3序列的... 旨在对IGF-I和IGFBP-1基因部分SNPs与鸡生长性状进行关联分析。试验以京海黄鸡为材料,采用PCR-SSCP方法检测2个候选基因的单核苷酸多态性(SNPs),采用一般线性模型(GLM)分析基因型与生长性状的遗传效应。结果表明,IGF-I基因外显子3序列的60bp处有A→G的点突变,在京海黄鸡中检测到AA、AB、BB 3种基因型,A等位基因频率为0.613,B等位基因的频率为0.387;IGFBP-1基因外显子2序列的21bp处有A→T的点突变,104bp处有T→C的突变,在京海黄鸡中检测到CC、CD和DD 3种基因型,C等位基因频率为0.558,D等位基因频率为0.442。IGF-I基因BB基因型个体4周龄体质量显著高于AA和AB型个体(P<0.05);IGFBP-1基因DD基因型个体8周龄体质量显著高于CC基因型个体(P<0.05),4、12和16周龄体质量差异极显著(P<0.01)。因此,推测这些SNPs对京海黄鸡生长性状具有一定的影响,应用于鸡育种过程中的标记辅助选择可以加快育种进程。 展开更多
关键词 京海黄鸡 胰岛素样生长因子-I基因 胰岛素样生长因子结合蛋白-1基因 遗传多态性 遗传效应
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脂联素基因对京海黄鸡体重及屠体性状的遗传效应 被引量:14
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作者 刘大林 俞亚波 +2 位作者 魏岳 张跟喜 王金玉 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2009年第1期31-34,共4页
以京海黄鸡为研究对象,探讨脂联素基因第1内含子1个突变的多样性,并研究该突变位点对鸡活重、半净膛率、腹脂重、腹脂率、胸肌重和腿肌重的遗传效应。结果表明:该基因1251处发生了C→T突变,PCR扩增产物SSCP后出现3种基因型(AA、AB、BB)... 以京海黄鸡为研究对象,探讨脂联素基因第1内含子1个突变的多样性,并研究该突变位点对鸡活重、半净膛率、腹脂重、腹脂率、胸肌重和腿肌重的遗传效应。结果表明:该基因1251处发生了C→T突变,PCR扩增产物SSCP后出现3种基因型(AA、AB、BB)。这3种基因型间半净膛率、胸肌重和腿肌重差异不显著,3种基因型个体均值较接近。该位点的3种基因型对公鸡的活重有显著效应,BB基因型个体的16周龄活重达(1755.14±223.85)g。就腹脂重而言,公鸡AA和AB型与BB型差异极显著,但母鸡3种基因型间差异不显著。公、母鸡AA和AB型腹脂重均值较接近,差异不显著。AA、AB和BB型腹脂重的变化趋势由低到高依次为AA、AB、BB型。公、母鸡的BB型个体腹脂率最高,分别为(2.20±1.18)%和(2.95±0.78)%,极显著高于AA和AB型个体,而AA和AB型个体均值却较接近。提示该基因可能是调控脂肪性状的主效基因或与主效基因连锁。 展开更多
关键词 京海黄鸡 脂联素 脂肪性状
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京海黄鸡与快大型品系的配合力测定试验 被引量:10
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作者 顾玉萍 顾云飞 +4 位作者 俞亚波 王金玉 施会强 朱建军 邱聪 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期30-33,共4页
利用京海黄鸡AA、BB、CC、WW 4个肉鸡品系和京海黄鸡(JJ),通过不完全双列杂交法,组成包括纯繁在内的9个组合,测定1~10周龄各周龄体重、10周末饲料报酬和成活率,推算其杂种优势率。结果表明:AA、BB、CC、WW系作为父本使用时,BJ和WJ组合... 利用京海黄鸡AA、BB、CC、WW 4个肉鸡品系和京海黄鸡(JJ),通过不完全双列杂交法,组成包括纯繁在内的9个组合,测定1~10周龄各周龄体重、10周末饲料报酬和成活率,推算其杂种优势率。结果表明:AA、BB、CC、WW系作为父本使用时,BJ和WJ组合生长速度优于AJ和CJ组合,AJ组合饲料报酬最好,为2.66:1;WJ组合其次,为2.67:1;CJ组合最差,为2.79:1。4个杂交组合中,BJ组合成活率为98.06%,杂种优势率最高,为6.07%;AJ组合成活率杂种优势率最低,为1.33%。 展开更多
关键词 京海黄鸡 不完全双列杂交 体重 成活率 饲料报酬 杂种优势
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京海黄鸡体组成性状的全基因组关联分析 被引量:8
9
作者 张涛 樊庆灿 +3 位作者 张向前 张跟喜 王金玉 顾玉萍 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第9期1502-1514,共13页
为了获得影响京海黄鸡体组成性状的SNPs标记及候选基因,为京海黄鸡的进一步遗传改良提供新的方法,本研究使用Illumina公司的鸡60KSNP芯片,对京海黄鸡13个体组成性状进行全基因组关联分析。共筛选出13个与体组成性状达到5%Bonferroni全... 为了获得影响京海黄鸡体组成性状的SNPs标记及候选基因,为京海黄鸡的进一步遗传改良提供新的方法,本研究使用Illumina公司的鸡60KSNP芯片,对京海黄鸡13个体组成性状进行全基因组关联分析。共筛选出13个与体组成性状达到5%Bonferroni全基因组显著相关的SNPs(P<1.8E-6),130个达到5%Bonferroni全基因组潜在相关的SNPs(P<3.59E-5)。13个显著SNPs位于GRIK1、NCAPG、KCNIP4和CACNA2 D2等12个基因的附近或内部,其中6个SNPs位于4号染色体上一个1.6Mb区域(74.3~75.9Mb)。130个潜在显著的SNPs中,有25个集中分布在4号染色体上的一个7.4Mb(71.5~78.9Mb)的区域内。共构建了5 650种单倍型,其中,14个与京海黄鸡6个体组成性状显著相关,14个单倍型中,9个位于4号染色体74.3~75.9Mb区域内,该区域内包括LCORL、QDPR、KCNIP4、LDB2和FAM184B在内的多个功能基因。本研究结果表明,位于4号染色体的71.5~78.9 Mb区域以及该区域附近的GRIK1、NCAPG、KCNIP4、CACNA2 D2、LCORL、QDPR、KCNIP4、LDB2和FAM184B基因对京海黄鸡的体组成有重要影响。 展开更多
关键词 京海黄鸡 全基因组关联分析 体组成 单倍型
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京海黄鸡卵巢转录组研究:基因结构分析与新基因发掘注释 被引量:12
10
作者 韩昆鹏 段炼 +5 位作者 李婷婷 王金玉 张涛 李国辉 张跟喜 薛倩 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2016年第4期854-861,共8页
本试验通过对京海黄鸡卵巢组织进行转录组分析,旨在为完善京海黄鸡部分基因结构和发掘新基因提供参考。选取高、低产京海黄鸡各4只,利用转录组测序(RNA-Seq)技术对其卵巢转录组进行测序,然后对得到的测序数据进行生物信息学分析。测序... 本试验通过对京海黄鸡卵巢组织进行转录组分析,旨在为完善京海黄鸡部分基因结构和发掘新基因提供参考。选取高、低产京海黄鸡各4只,利用转录组测序(RNA-Seq)技术对其卵巢转录组进行测序,然后对得到的测序数据进行生物信息学分析。测序数据经过质量控制后,8个样品共得到484 992 074条有效数据(Clean Reads),总计61.09Gb。筛选出1 445 264个京海黄鸡品种内SNP位点,其中位于基因区的SNP位点916 108个,位于基因间区的SNP位点552 168个。8个样品中平均新预测的可变剪接12 883个,并对7 481个基因结构进行了优化。与所选的参考基因组序列对比分析,共发掘4 431个新基因,通过与各数据库进行序列对比,1 809个新基因得到功能注释。本研究通过转录组测序技术检测了京海黄鸡卵巢组织的基因结构,为进一步完善京海黄鸡的基因结构信息及发掘潜在的新基因提供分子水平的依据。 展开更多
关键词 转录组测序 京海黄鸡 基因结构 SNP 新基因
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京海黄鸡生长模型拟合的研究 被引量:41
11
作者 杨燕 王金玉 +2 位作者 王丽云 于佳慧 吕慎金 《畜牧与兽医》 北大核心 2007年第6期17-20,共4页
用Logistic,Gompertz和Bertalanffy 3种非线性生长模型对不同性别京海黄鸡的生长发育进行拟合。研究结果表明,京海黄鸡公、母鸡在3周龄前生长曲线基本一致,而3周龄后公鸡明显快于母鸡;3种模型的拟合效果均很好,尤以Bertalanffy模型最佳... 用Logistic,Gompertz和Bertalanffy 3种非线性生长模型对不同性别京海黄鸡的生长发育进行拟合。研究结果表明,京海黄鸡公、母鸡在3周龄前生长曲线基本一致,而3周龄后公鸡明显快于母鸡;3种模型的拟合效果均很好,尤以Bertalanffy模型最佳;公、母鸡的生长拐点分别为12.81周和11.13周,公鸡的成年体重显著高于母鸡,但达到拐点的周龄较母鸡迟;3种模型的相对生长率所反映的生长规律基本相同:无论公母鸡,在6周龄之后,其相对生长率基本一致,但绝对生长率却存在差异。 展开更多
关键词 京海黄鸡 生长模型 拟合
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脂联素基因c.249 C>T突变对京海黄鸡部分主要经济性状的影响 被引量:9
12
作者 俞亚波 王金玉 +3 位作者 顾玉萍 刘大林 魏岳 戴国俊 《西北农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期7-11,共5页
以京海黄鸡为试验材料,采用PCR-SSCP技术,探讨脂联素基因第一外显子和部分第一内含子碱基突变对屠宰和母鸡产蛋性状的遗传效应。结果表明,脂联素基因c.249位C>T突变的3种基因型(AA、AB和BB)对京海黄鸡的活体质量、半净膛率、胸肌质... 以京海黄鸡为试验材料,采用PCR-SSCP技术,探讨脂联素基因第一外显子和部分第一内含子碱基突变对屠宰和母鸡产蛋性状的遗传效应。结果表明,脂联素基因c.249位C>T突变的3种基因型(AA、AB和BB)对京海黄鸡的活体质量、半净膛率、胸肌质量、腿肌质量、胸肌率和腿肌率差异均不显著(P>0.05)。BB型个体的300日龄产蛋数和66周龄产蛋数显著高于AB型个体(P<0.05)。BB型个体的腹脂质量和腹脂率显著高于AB和AA型个体(P<0.05)。Adipo基因座对京海黄鸡开产日龄,300日龄产蛋数,300日龄蛋质量和66周龄产蛋数的主效应指数(MEI)均小于1.21,而其对公母鸡的腹脂质量主效应指数(MEI)分别为8.68和7.40。说明该基因可能是调控脂肪沉积的主效基因或与主效基因连锁。 展开更多
关键词 京海黄鸡 脂联素基因 腹脂 产蛋性状
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京海黄鸡不同品系间的配合力测定 被引量:12
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作者 顾玉萍 顾云飞 +4 位作者 俞亚波 王金玉 施会强 朱建军 邱聪 《中国家禽》 北大核心 2011年第4期30-32,共3页
用京海黄鸡EE、GG、SS、W1W1、W2W2系5个肉鸡品系和京海黄鸡JJ,组成包括纯繁在内的13个组合,以不完全双列杂交法,测定1~10周龄各周龄的体重、10周末的饲料报酬和成活力的杂种优势。结果表明:作为父本使用时,EE系和GG系生长速度优于SS、... 用京海黄鸡EE、GG、SS、W1W1、W2W2系5个肉鸡品系和京海黄鸡JJ,组成包括纯繁在内的13个组合,以不完全双列杂交法,测定1~10周龄各周龄的体重、10周末的饲料报酬和成活力的杂种优势。结果表明:作为父本使用时,EE系和GG系生长速度优于SS、W1W1和W2W2系。J×W2的饲料报酬最优,为2.20,杂种优势率为-31.57%;S×J的饲料报酬其次,为2.28,杂种优势率为-16.02%。所有组合中,W2×J和S×J的成活率最高,分别为98.98%和98.97%。 展开更多
关键词 京海黄鸡 不完全双列杂交 体重 成活率 饲料报酬 杂种优势
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京海黄鸡MyoG基因密码子特性分析 被引量:6
14
作者 张涛 张跟喜 +5 位作者 韩昆鹏 王金玉 樊庆灿 李婷婷 段炼 王永娟 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2014年第4期71-79,共9页
为了解鸡MyoG基因的密码子特性,以便于为MyoG基因的表达选择合适的外源表达系统,使用在线工具CUSP和CHIPS以及codonW软件对鸡MyoG基因进行分析,并与鸡基因、模式动物基因组和其他动物MyoG基因进行比较。结果表明,MyoG基因偏好于G/C结尾... 为了解鸡MyoG基因的密码子特性,以便于为MyoG基因的表达选择合适的外源表达系统,使用在线工具CUSP和CHIPS以及codonW软件对鸡MyoG基因进行分析,并与鸡基因、模式动物基因组和其他动物MyoG基因进行比较。结果表明,MyoG基因偏好于G/C结尾的密码子,CDS序列中,GC含量大于AT含量。MyoG基因与鸡其他31个基因密码子偏好性相似,均偏好于G/C结尾的密码子。与其他物种基因组密码子偏好性比较结果显示,密码子偏好性与小鼠差异最小,说明小鼠可以作为MyoG基因外源表达的宿主。与其他动物MyoG基因密码子偏好性比较显示,MyoG基因在包括京海黄鸡在内的32个物种中均有较高表达,几乎所有MyoG基因编码区对GC有较强的偏好性。基于RSCU值的聚类和基于CDS区系统发育树结果显示,亲缘关系近的物种之间倾向于拥有相似的密码子偏好性。 展开更多
关键词 京海黄鸡 MYOG 密码子 偏好性 聚类分析
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IL-6基因启动子区单核苷酸多态对京海黄鸡柔嫩艾美尔球虫抗性指标的影响 被引量:7
15
作者 王诗琴 辛世杰 +8 位作者 王晓慧 戴国俊 安婷婷 张菁菁 张涛 张跟喜 谢恺舟 王金玉 王宏胜 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS 北大核心 2018年第1期36-41,共6页
为探究白介素6(IL-6)基因5′启动子区单核苷酸突变对鸡柔嫩艾美尔球虫抗性指标的影响,以京海黄鸡为试验材料,对IL-6基因5′调控区单核苷酸多态性(SNPs)进行检测,根据感染组与对照组血浆抗性指标酶联免疫吸附试验检测结果,分析SNPs突变... 为探究白介素6(IL-6)基因5′启动子区单核苷酸突变对鸡柔嫩艾美尔球虫抗性指标的影响,以京海黄鸡为试验材料,对IL-6基因5′调控区单核苷酸多态性(SNPs)进行检测,根据感染组与对照组血浆抗性指标酶联免疫吸附试验检测结果,分析SNPs突变形成的基因型与抗性指标的关联。结果表明:感染组与对照组间过氧化氢酶(CAT)、谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)活性和丙二醛(MDA)含量差异极显著,超氧化物歧化酶(SOD)活性及IL-2、IL-16、IL-17、γ干扰素(IFN-γ)水平和体增重差异显著;通过京海黄鸡IL-6基因启动子区基因序列与GenBank上的SNPs数据库比对,发现3个新的SNPs(A-663G、C-447G和G-357A),其中A-663G位点只有1种基因型GG,C-447G和G-357A位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态且多态性丰富;C-447G突变位点各基因型间比较发现,血浆CAT、SOD、GSH-Px活性及IL-2、IL-16、IL-17水平和体增重差异极显著,MDA含量差异显著;G-357A突变位点各基因型间比较发现,血浆CAT、SOD活性及IL-16水平和体增重差异极显著,GSH-Px活性和IL-17水平差异显著。就主要抗性指标而言,C-447G和G-357A2个突变位点的CC和AA纯合型个体优于其他基因型个体,CC和AA基因型分别为2个突变位点鸡球虫抗性有利基因型,这一结果为京海黄鸡鸡球虫抗性分子标记辅助育种提供了参考。 展开更多
关键词 京海黄鸡 柔嫩艾美尔球虫 白介素6基因 单核苷酸多态性 抗性指标
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京海黄鸡体重性状全基因组关联分析 被引量:5
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作者 张涛 王文浩 +3 位作者 张跟喜 王金玉 薛倩 顾玉萍 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2015年第8期811-820,共10页
体重性状是肉鸡重要的经济性状。为了寻找可用于京海黄鸡体重性状遗传改良的分子标记及候选基因,本文以400只京海黄鸡核心群母鸡为基础,测定了0~14周龄体重,利用简化基因组测序技术(Specific—locusamplifiedfragmentsequencing,S... 体重性状是肉鸡重要的经济性状。为了寻找可用于京海黄鸡体重性状遗传改良的分子标记及候选基因,本文以400只京海黄鸡核心群母鸡为基础,测定了0~14周龄体重,利用简化基因组测序技术(Specific—locusamplifiedfragmentsequencing,SLAF—seq)对京海黄鸡体重性状进行全基因组关联研究(Genome—wideassociationstndy,GWAS),筛选与京海黄鸡体重性状相关的SNPs位点。结果共检测到100个与京海黄鸡体重相关的SNPs位点,其中15个位点效应达到全基因组显著水平(P〈1.87E-06),85个位点效应达到全基因组潜在显著水平(P〈3.73E-05)。通过筛选每个显著SNP周围1Mb区域内的基因,共找到9个可能的候选基因,其中FAMl24A(Familywithsequencesimilarity124A)、QDPR(Quinoiddihydropteridinereductase)、WDRI(WDrepeatdomain1)和SLC2A9(Solutecarrierfamily2(facilitatedglucosetransporter),member9)4个基因可能是影响体重性状的重要候选基因。同时还发现,4号染色体75.6~80.7Mb区域集中了大部分与京海黄鸡中后期体重性状显著相关的SNPs位点,该区域可能是影响京海黄鸡中后期生长体重的重要候选区域。 展开更多
关键词 京海黄鸡 全基因组关联分析 体重性状 简化基因组测序
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不同日粮蛋能水平对京海黄鸡肌肉中肌苷酸和肌内脂肪沉积规律的影响 被引量:13
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作者 王剑锋 李爱华 +6 位作者 谢恺舟 孙瑛瑛 赵敏 孙礼瑞 张跟喜 戴国俊 王金玉 《安徽农业科学》 CAS 2014年第3期803-805,共3页
[目的]为京海黄鸡的肉品质评价方法和评价标准的制定提供参考依据。[方法]以京海黄鸡为试验素材,研究不同日粮蛋白和能量水平对京海黄鸡肌肉中IMP和IMF沉积规律的影响。[结果]试验4组公鸡胸肌中IMP含量极显著高于试验1组(P<0.01),在... [目的]为京海黄鸡的肉品质评价方法和评价标准的制定提供参考依据。[方法]以京海黄鸡为试验素材,研究不同日粮蛋白和能量水平对京海黄鸡肌肉中IMP和IMF沉积规律的影响。[结果]试验4组公鸡胸肌中IMP含量极显著高于试验1组(P<0.01),在腿肌中IMP含量差异不显著(P>0.05);母鸡肌肉中IMP含量在同一部位、不同组别间差异均不显著(P>0.05),公、母混合后IMP含量随着蛋能水平的增加呈上升趋势,但在相同部位、不同组别间差异均不显著(P>0.05)。试验4组公鸡腿肌IMF含量显著高于试验1组(P<0.05),极显著低于试验2组(P<0.01),在胸肌中的IMF含量差异不显著(P>0.05);母鸡肌肉中IMP含量在同一部位、不同组别间差异均不显著(P>0.05),公、母混合后,试验2组腿肌IMF含量显著高于试验1组(P<0.05),极显著高于试验4组(P<0.01)。[结论]不同蛋能水平与京海黄鸡肌肉中IMP的沉积呈正相关,与IMF沉积呈负相关。 展开更多
关键词 不同蛋能水平 肌苷酸 肌内脂肪 沉积 京海黄鸡
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京海黄鸡IGFBP-3基因外显子1和内含子1部分序列多态性及其与生长繁殖性状的相关性 被引量:8
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作者 金崇富 王金玉 +3 位作者 王慧华 张跟喜 施会强 俞亚波 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2010年第9期132-135,共4页
以京海黄鸡母鸡为材料,采用PCR-SSCP技术对IGFBP-3基因外显子1及内含子1部分序列多态位点进行研究,并计算基因型频率、基因频率、卡方值和部分遗传多态性指标。结果表明,在外显子1上没有检测到多态位点,在内含子1上检测到1个多态位点,... 以京海黄鸡母鸡为材料,采用PCR-SSCP技术对IGFBP-3基因外显子1及内含子1部分序列多态位点进行研究,并计算基因型频率、基因频率、卡方值和部分遗传多态性指标。结果表明,在外显子1上没有检测到多态位点,在内含子1上检测到1个多态位点,该位点为中度多态,在160 bp处发生T到G的突变,导致BB、AB型的56日龄体重显著大于AA型(P<0.05),AA型的11月产蛋数显著大于BB、AB型(P<0.05)。由此初步推断,内含子1对产蛋及生长发育很可能有一定的促进作用,A为产蛋的优势基因,B为体重的优势基因。 展开更多
关键词 京海黄鸡 IGFBP-3 SNP位点 多态性
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京海黄鸡MC4R基因多态性及其与生长性能的关联分析 被引量:11
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作者 陶勇 李国辉 +3 位作者 王金玉 胡玉萍 张根喜 陈宽维 《中国家禽》 北大核心 2008年第5期21-23,共3页
研究以140只京海黄鸡为试验材料,以MC4R为候选基因,采用PCR-SSCP和DNA测序技术分析了MC4R基因在京海黄鸡群体中的多态性。结果表明:MC4R基因编辑区第662bp处有G→C碱基的点突变,在京海黄鸡中检测到AA、AB、BB3种基因型,A等位基因的频率... 研究以140只京海黄鸡为试验材料,以MC4R为候选基因,采用PCR-SSCP和DNA测序技术分析了MC4R基因在京海黄鸡群体中的多态性。结果表明:MC4R基因编辑区第662bp处有G→C碱基的点突变,在京海黄鸡中检测到AA、AB、BB3种基因型,A等位基因的频率为0.929,B等位基因的频率为0.071。经过基因型与生长性能的关联分析得知:不同基因型与京海黄鸡4、8、12周龄体重差异显著(P<0.05),与16周龄体重差异极显著(P<0.01)。由此推测,MC4R基因可能对于鸡生长性能具有很大的影响或与控制生长性能的主基因连锁。 展开更多
关键词 京海黄鸡 MC4R基因 PCR-SSCP 生长性状
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京海黄鸡4个肉质性状的全基因组关联分析 被引量:5
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作者 张向前 董新龙 +4 位作者 凌姣姣 樊庆灿 张跟喜 王金玉 王永娟 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2015年第21期9-14,共6页
肉质性状对于家禽产业来说非常重要。为了获得影响鸡肉质性状的SNPs以及候选基因,本研究使用Illumina公司的鸡60K SNP芯片,对京海黄鸡的4个肉质性状(FLM、FBM、PLM、PBM)进行全基因组关联分析。结果表明:共鉴定出9个与肉质性状显著关联... 肉质性状对于家禽产业来说非常重要。为了获得影响鸡肉质性状的SNPs以及候选基因,本研究使用Illumina公司的鸡60K SNP芯片,对京海黄鸡的4个肉质性状(FLM、FBM、PLM、PBM)进行全基因组关联分析。结果表明:共鉴定出9个与肉质性状显著关联的SNPs位点,其中,有2个SNPs达到5%Bonferroni全基因组显著水平(P<1.8E-6),7个SNPs位点达到5%Bonferroni全基因组潜在显著水平(P<3.59E-6)。9个SNPs定位于LOC101747478、CBLN2、HPGDS、SETD2、ANKRD46、ZFPM2和GRM4 7个基因的附近或内部,该7个基因可能为影响京海黄鸡4个肉质性状的重要候选基因。构建5 650种单倍型,单倍型分析表明,只有一种单倍型与FLM性状显著相关。以上结果显示,本研究发现的9个SNPs和7个基因可能为影响京海黄鸡4个肉质性状的重要候选标记和基因。 展开更多
关键词 京海黄鸡 全基因组关联分析 肉质性状 单倍型
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