基于RAD-seq简化基因组测序的金湖乌凤鸡遗传进化研究

利用RAD-seq简化基因组测序鉴定金湖乌凤鸡与其它18个地方鸡种、2个引入肉鸡品种的SNP标记,计算遗传统计量,分析金湖乌凤鸡的遗传多样性和遗传结构,鉴定受选择基因.结果表明,在金湖乌凤鸡中鉴定出SNP标记325 531个,SNP标记在染色体上均匀分布.金湖乌凤鸡的观察杂合度Ho为0.213 6、核苷酸多样度Pi为0.240 4,近交系数Fis为0.111 6,与其它18个地方鸡种相比遗传多样性较为丰富;金湖乌凤鸡的平均遗传分化系数Fst为0.155 6,平均基因流Nm为1.398 2,在系统发育树中形成一个相对独立的分支.通过Fst和θπ检验,在金湖乌凤鸡中发现23个受选择区域,包含104个受选择基因,功能分析表明这些受选择基因主要富集在代谢过程、发育过程、细胞信号转导等生物学通路.

金湖乌凤鸡体重与体尺相关及回归分析

为了分析金湖乌凤鸡体重与体尺的相关性,选取120日龄公母鸡各100羽进行测定和分析,结果表明:公鸡的体重、体斜长、龙骨长、胸宽、胸深、胫长、胫围指标极显著大于母鸡(P<0.01),公鸡的胸角极显著小于母鸡(P<0.01)。公鸡的体重、胸宽、胸深及母鸡体重、胸宽变异系数均大于10%,体尺其他性状指标均小于10%。公鸡体重与体斜长、龙骨长、胸宽、胫围呈极显著正相关性(P<0.01),与胸深呈显著正相关(P<0.05),其中与胫围的相关性最高(0.676);母鸡体重与体斜长、龙骨长、胸宽、胸深、胫长胫围呈极显著正相关(P<0.01),与胸角呈显著相关(P<0.05),其中与体斜长的相关性最高(0.761)。建立最优回归方程,公鸡体重=-1.229+0.392胫围+0.091龙骨长;母鸡体重=-2.377+0.114体斜长+0.224胫围+0.077龙骨长。

金湖乌凤鸡体重与体尺的通径分析

为了研究金湖乌凤鸡体重与体尺的关系,选用150日龄金湖乌凤鸡70羽(公、母各半),测定其体重(Y)、体斜长(X_(1))、龙骨长(X_(2))、胸宽(X_(3))、胸深(X_(4))、胫长(X_(5))、胫围(X_(6))、胸角(X_(7)),以体重为自变量,体尺指标为因变量进行相关性分析和通径分析。结果表明:金湖乌凤鸡公鸡体斜长(X_(1))、胸宽(X_(3))、胫围(X_(6))与体重(Y)呈极显著相关(P<0.01);母鸡除胸角(X_(7))与体重不显著相关(P>0.05)外,其余性状与体重呈极显著相关(P<0.01),体斜长(X_(1))、胸宽(X_(3))是影响公鸡体重最主要的体尺指标,公鸡的通径系数为P_(1)=0.824、P_(3)=0.203,最优回归方程为Y=-1575.935+137.899X_(1)+30.439X_(3);龙骨长(X_(2))、胸宽(X_(3))是影响母鸡体重最主要的体尺指标,母鸡的通径系数为P_(2)=0.813、P_(3)=0.233,最优回归方程为Y=-694.567+161.638X_(2)+41.051X_(3)。