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九疑山兔线粒体基因组组装及系统进化分析
1
作者
李聪聪
黄子珂
+9 位作者
黄念旎
马诗语
刘晗
肖志标
宋果
蒋亮
彭为波
杨联熙
郭云涛
黄生强
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期4417-4427,共11页
旨在对九疑山兔线粒体基因组进行组装,探究其系统进化和分类地位。本研究采用高通量测序技术对20只150日龄九疑山兔的耳组织进行了全基因组测序,利用生物信息学软件对线粒体基因组进行组装,并对获得的线粒体基因组进行序列分析、基因预...
旨在对九疑山兔线粒体基因组进行组装,探究其系统进化和分类地位。本研究采用高通量测序技术对20只150日龄九疑山兔的耳组织进行了全基因组测序,利用生物信息学软件对线粒体基因组进行组装,并对获得的线粒体基因组进行序列分析、基因预测和注释,随后基于已发表的家兔、野兔、经济动物和模式动物的线粒体基因组序列进行多序列比对和系统进化分析,对研究群体的多态性位点进行鉴定。组装获得长度为17306 bp的九疑山兔线粒体基因组全序列,其碱基组成、基因分布与已发表的5个家兔品种的线粒体基因组基本一致。基于Dloop区的系统进化分析表明,九疑山兔与福建黄兔进化关系较近,而与欧洲穴兔、沂蒙毛兔、川白獭兔和新西兰白兔较远。通过其与14种野兔及11种经济/模式动物的种间系统进化分析表明,九疑山兔与欧洲野兔、海南兔和白靴兔亲缘关系较近,与其他野兔和经济/模式动物较远。研究群体的线粒体基因组保守区共鉴定到了12个突变位点,其中有3个突变的群体等位基因频率大于0.8,为多态性位点。本研究组装获得了首个九疑山兔的完整线粒体基因组序列,明确了九疑山兔与其它品种家兔、野兔和常见经济/模式动物的亲缘关系和分类地位,为九疑山兔的种质资源利用和品种选育等研究提供了基础数据。
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关键词
九疑山兔
线粒体基因组
高通量测序
系统进化
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职称材料
松针粉对九嶷山母兔生产性能及血清生化指标的影响
被引量:
3
2
作者
柴字光
张佩华
+4 位作者
南雪梅
陈宗青
贺长青
韩奇鹏
张春荣
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2014年第9期101-104,共4页
本试验旨在研究松针粉替代不同水平草粉对九嶷山母兔生产性能及血清生化指标的影响。选用健康、生长发育良好且体重相近的九嶷山母兔24只,随机分为3组,每组8只,于配种后12d在基础日粮中添加松针粉分别替代0(对照组)、7.5%(Ⅰ组)、15%(Ⅱ...
本试验旨在研究松针粉替代不同水平草粉对九嶷山母兔生产性能及血清生化指标的影响。选用健康、生长发育良好且体重相近的九嶷山母兔24只,随机分为3组,每组8只,于配种后12d在基础日粮中添加松针粉分别替代0(对照组)、7.5%(Ⅰ组)、15%(Ⅱ组)的草粉。预试期4d,正试期24d。结果表明,与对照组相比,Ⅰ、Ⅱ组平均日采食量显著降低(P<0.05),而平均日增重显著升高(P<0.05);随松针粉替代水平的升高,Ⅰ、Ⅱ组料重比呈降低趋势,初生仔兔窝重呈升高趋势,但差异均不显著(P>0.05);Ⅱ组血清中谷草转氨酶(AST)含量极显著高于对照组(P<0.01),各组血清中谷丙转氨酶(ALT)、乳酸脱氢酶(LDH)、碱性磷酸酶(ALP)和尿素氮(BUN)含量均无显著差异(P>0.05)。综上所述,松针粉替代不同水平草粉对九嶷山母兔的生产性能和血清生化指标产生的影响不同,其中以松针粉替代7.5%(全日粮3%)草粉时,九嶷山母兔的生长效果最好。
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关键词
九嶷山母兔
松针粉
生产性能
血清生化指标
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职称材料
题名
九疑山兔线粒体基因组组装及系统进化分析
1
作者
李聪聪
黄子珂
黄念旎
马诗语
刘晗
肖志标
宋果
蒋亮
彭为波
杨联熙
郭云涛
黄生强
机构
湖南农业大学动物科学技术学院
宁远县畜牧水产事务中心
湖南伊普吕农牧科技有限公司
中科基因生物科技(江苏)有限公司
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第10期4417-4427,共11页
基金
湖南省科技厅项目:九疑山兔选优提纯研究(2019NK4192)。
文摘
旨在对九疑山兔线粒体基因组进行组装,探究其系统进化和分类地位。本研究采用高通量测序技术对20只150日龄九疑山兔的耳组织进行了全基因组测序,利用生物信息学软件对线粒体基因组进行组装,并对获得的线粒体基因组进行序列分析、基因预测和注释,随后基于已发表的家兔、野兔、经济动物和模式动物的线粒体基因组序列进行多序列比对和系统进化分析,对研究群体的多态性位点进行鉴定。组装获得长度为17306 bp的九疑山兔线粒体基因组全序列,其碱基组成、基因分布与已发表的5个家兔品种的线粒体基因组基本一致。基于Dloop区的系统进化分析表明,九疑山兔与福建黄兔进化关系较近,而与欧洲穴兔、沂蒙毛兔、川白獭兔和新西兰白兔较远。通过其与14种野兔及11种经济/模式动物的种间系统进化分析表明,九疑山兔与欧洲野兔、海南兔和白靴兔亲缘关系较近,与其他野兔和经济/模式动物较远。研究群体的线粒体基因组保守区共鉴定到了12个突变位点,其中有3个突变的群体等位基因频率大于0.8,为多态性位点。本研究组装获得了首个九疑山兔的完整线粒体基因组序列,明确了九疑山兔与其它品种家兔、野兔和常见经济/模式动物的亲缘关系和分类地位,为九疑山兔的种质资源利用和品种选育等研究提供了基础数据。
关键词
九疑山兔
线粒体基因组
高通量测序
系统进化
Keywords
jiuyishan rabbit
mitochondrial genome
high-throughput sequencing
phylogenetic evolution
分类号
S829.1 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
松针粉对九嶷山母兔生产性能及血清生化指标的影响
被引量:
3
2
作者
柴字光
张佩华
南雪梅
陈宗青
贺长青
韩奇鹏
张春荣
机构
湖南农业大学动物科学技术学院
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
宁远九嶷山兔业有限公司
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2014年第9期101-104,共4页
基金
湖南省高校创新团队“畜禽应激生理与营养调理”
九嶷山兔生产性能测定技术规程湖南省地方标准制定(2013湘財行指128号)
文摘
本试验旨在研究松针粉替代不同水平草粉对九嶷山母兔生产性能及血清生化指标的影响。选用健康、生长发育良好且体重相近的九嶷山母兔24只,随机分为3组,每组8只,于配种后12d在基础日粮中添加松针粉分别替代0(对照组)、7.5%(Ⅰ组)、15%(Ⅱ组)的草粉。预试期4d,正试期24d。结果表明,与对照组相比,Ⅰ、Ⅱ组平均日采食量显著降低(P<0.05),而平均日增重显著升高(P<0.05);随松针粉替代水平的升高,Ⅰ、Ⅱ组料重比呈降低趋势,初生仔兔窝重呈升高趋势,但差异均不显著(P>0.05);Ⅱ组血清中谷草转氨酶(AST)含量极显著高于对照组(P<0.01),各组血清中谷丙转氨酶(ALT)、乳酸脱氢酶(LDH)、碱性磷酸酶(ALP)和尿素氮(BUN)含量均无显著差异(P>0.05)。综上所述,松针粉替代不同水平草粉对九嶷山母兔的生产性能和血清生化指标产生的影响不同,其中以松针粉替代7.5%(全日粮3%)草粉时,九嶷山母兔的生长效果最好。
关键词
九嶷山母兔
松针粉
生产性能
血清生化指标
Keywords
jiuyishan
female
rabbit
s
pine needle power
production performance
serum biochemical indices
分类号
S829.1 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
九疑山兔线粒体基因组组装及系统进化分析
李聪聪
黄子珂
黄念旎
马诗语
刘晗
肖志标
宋果
蒋亮
彭为波
杨联熙
郭云涛
黄生强
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
松针粉对九嶷山母兔生产性能及血清生化指标的影响
柴字光
张佩华
南雪梅
陈宗青
贺长青
韩奇鹏
张春荣
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2014
3
下载PDF
职称材料
已选择
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