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Genetic Diversity of Jute Mallow (Corchorus spp.) Accessions Based on ISSR Markers
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作者 Munguatosha Ngomuo Tsvetelina Stoilova +1 位作者 Tileye Feyissa Patrick A. Ndakidemi 《American Journal of Plant Sciences》 CAS 2024年第5期316-328,共13页
Jute mallow is a nutritious leafy vegetable. The leaves are rich in proteins, vitamins and essential amino acids. Molecular characterization of Jute mallow with focus on improvement of leaf yield is scarcely reported.... Jute mallow is a nutritious leafy vegetable. The leaves are rich in proteins, vitamins and essential amino acids. Molecular characterization of Jute mallow with focus on improvement of leaf yield is scarcely reported. In the present study, inter sequence simple repeats (ISSR) molecular markers were employed to assess genetic diversity and relationships of 83 accessions of Jute mallow from different parts of Africa and Asia conserved at the World Vegetable Center East and Southern Africa. A total of 89 bands were amplified by 8 ISSR primers. Number of polymorphic bands per primer ranged from 2 to 6 with an average of 2.75 bands per primer. Polymorphic information content (PIC) values ranged from 0.390 to 0.760 with average of 0.53. Average Nei’s gene diversity (h) and Shannon’s information index (I) were 0.335 and 0.494 respectively. The highest pairwise genetic distance was 0.431 observed in a population from East Africa accessions. PC1 and PC2 axis explained 21.69% and 11.66% of the total variation respectively. UPGMA cluster analysis grouped the accessions into six main clusters at genetic similarity coefficient of 0.53 as standard value for classification. These results have important implications for jute mallow breeding and conservation. 展开更多
关键词 Corchorus spp. genetic diversity issrS jute Mallow Leafy Vegetable
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RAPD和ISSR标记检测黄麻属遗传多样性的比较研究 被引量:46
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作者 祁建民 周东新 +3 位作者 吴为人 林荔辉 方平平 吴建梅 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第12期2006-2011,共6页
应用RAPD和ISSR标记,分别对来自非洲地区和中国的15份黄麻野生种(10个种),以及来自中国、印度、越南、日本等地的12份黄麻栽培品种基因组DNA的遗传多样性进行检测。结果表明:(1)参与分析的所有RAPD和ISSR引物都对DNA模板浓度的梯度变化... 应用RAPD和ISSR标记,分别对来自非洲地区和中国的15份黄麻野生种(10个种),以及来自中国、印度、越南、日本等地的12份黄麻栽培品种基因组DNA的遗传多样性进行检测。结果表明:(1)参与分析的所有RAPD和ISSR引物都对DNA模板浓度的梯度变化不敏感,对比RAPD和ISSR在PCR反应中的稳定性,ISSR优于RAPD;(2)25个RAPD和ISSR引物分别扩增出329条和283条带,多态比率分别为89.36%和92.5%,显然,ISSR检测出的多态性条带的能力优于RAPD;(3)RAPD和ISSR标记检测同组供试材料种间或种内的遗传相似性系数(GS)范围,分别为0.48~0.98和0.33~0.97,ISSR检测出种间遗传多样性的分辨力较RAPD为高,但两者GS相关系数高达0.955;(4)RAPD和ISSR标记的分子聚类获得了趋势相近,但不完全相同的聚类树,两种标记均能准确地把原始黄麻野生种与栽培种中的长果种和圆果种及其近缘野生种聚在不同的种群中,分子分类结果与传统经典分类相符,并揭示出种间或种内基因型的遗传差异与亲缘关系,而ISSR比RAPD能检测到种间更高的遗传差异性;(5)两种标记均可揭示种间与种内的遗传多样性及其进化的亲缘关系,可为进一步开展黄麻分子辅助育种和起源与进化研究提供有价值的理论依据。 展开更多
关键词 RAPD issr标记 遗传多样性 黄麻 遗传差异 亲缘关系 野生种 进化 PCR反应 分子分类
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用ISSR标记检测黄麻野生种与栽培种遗传多样性 被引量:33
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作者 祁建民 周东新 +3 位作者 吴为人 林荔辉 吴建梅 方平平 《应用生态学报》 CAS CSCD 2003年第9期1473-1477,共5页
利用ISSR标记对黄麻属(Corchorus)10个种27份材料的遗传多样性进行分析,25个ISSR引物共扩增出283条带,平均每个引物扩增出10.48条带,多态性条带比例(PPB)为92.85%;种间遗传相似系数在0.33~0.97之间,表现出丰富的遗传多样性。系统聚类... 利用ISSR标记对黄麻属(Corchorus)10个种27份材料的遗传多样性进行分析,25个ISSR引物共扩增出283条带,平均每个引物扩增出10.48条带,多态性条带比例(PPB)为92.85%;种间遗传相似系数在0.33~0.97之间,表现出丰富的遗传多样性。系统聚类结果显示,第Ⅰ、Ⅲ类群均为黄麻属8个种11份原始野生种,种间存在丰富的遗传多样性;第Ⅱ类群为黄麻两个栽培种及其近缘野生种,共16份材料,种遗传相似性较高;基因组聚类结果与经典分类相符。利用分子标记技术研究初步可以认为,荨麻叶种为最原始的黄麻野生种之一;三室种21C为三室种的一个变种;甜麻为一个尚待定性的野生种。同组材料的RAPD和ISSR分析结果,具有较高的相似性和可信度。 展开更多
关键词 黄麻 issr 遗传多样性 亲缘关系
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