目的:运用原子力显微镜(atomic force microscope,AFM)表征K562/A02细胞多药耐药基因Mdr1启动子区域的DNA。材料与方法:PCR扩增K562/A02细胞Mdr1基因启动子区域769bp的DNA,产物纯化后,分别按终浓度为5ng/μl、10ng/μl、20ng/μl固定在...目的:运用原子力显微镜(atomic force microscope,AFM)表征K562/A02细胞多药耐药基因Mdr1启动子区域的DNA。材料与方法:PCR扩增K562/A02细胞Mdr1基因启动子区域769bp的DNA,产物纯化后,分别按终浓度为5ng/μl、10ng/μl、20ng/μl固定在用1ng/μlL型多聚赖氨酸预先处理过的新剥离的云母片制备成观测样本。原子力显微镜观测样本,获取扫描图像后追踪DNA分子轮廓,进行模数分析。结果:用原子力显微镜能够成功地表征K562/A02mdr1基因启动子区域769bp的DNA片段,获得清晰的二维及三维图像。我们推测原子力显微镜观测该长度的DNA样本的最佳浓度为10ng/ul左右,在此浓度下对其三维图像进行图像处理后分析的DNA分子轮廓结果如下:DNA分子链的长度为(260.13±2.29)nm(n=50),平均宽度为(11.88±0.92)nm,双链的平均高度为1.2nm。结论:原子力显微镜能够成功地表征K562/A02细胞Mdr1基因启动子区域的DNA,获得清晰的二维及三维图象,并且能够直观地分析DNA轮廓,为进一步在分子层面上探讨研究Mdr1基因遗传信息提供了一种新的简单、直观、可靠的方法。展开更多
本研究旨在检测白血病细胞株及其耐药株中两种药物代谢相关基因的单核苷酸多态性。培养白血病细胞株K562及其耐药株K562/A02,采用QIAamp DNA Blood Minikit试剂盒提取基因组DNA,设计引物,应用PCR技术扩增相应目的片段;采用基于基质辅助...本研究旨在检测白血病细胞株及其耐药株中两种药物代谢相关基因的单核苷酸多态性。培养白血病细胞株K562及其耐药株K562/A02,采用QIAamp DNA Blood Minikit试剂盒提取基因组DNA,设计引物,应用PCR技术扩增相应目的片段;采用基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术检测mthfr基因rs1801131、rs1801133、rs2274976及dpyd基因rs1801159、rs1801160、rs17376848的单核苷酸多态性。结果表明,在K562和K562/A02两种细胞中,mthfr基因rs1801131基因型均为CA、rs1801133均为CC、rs2274976均为GG;dpyd基因rs1801159基因型均为GG、rs1801160均为GG、rs17376848均为AA。结论:mthfr、dpyd基因上述位点在K562和K562/A02两种细胞中基因表达无差别。展开更多
文摘目的:运用原子力显微镜(atomic force microscope,AFM)表征K562/A02细胞多药耐药基因Mdr1启动子区域的DNA。材料与方法:PCR扩增K562/A02细胞Mdr1基因启动子区域769bp的DNA,产物纯化后,分别按终浓度为5ng/μl、10ng/μl、20ng/μl固定在用1ng/μlL型多聚赖氨酸预先处理过的新剥离的云母片制备成观测样本。原子力显微镜观测样本,获取扫描图像后追踪DNA分子轮廓,进行模数分析。结果:用原子力显微镜能够成功地表征K562/A02mdr1基因启动子区域769bp的DNA片段,获得清晰的二维及三维图像。我们推测原子力显微镜观测该长度的DNA样本的最佳浓度为10ng/ul左右,在此浓度下对其三维图像进行图像处理后分析的DNA分子轮廓结果如下:DNA分子链的长度为(260.13±2.29)nm(n=50),平均宽度为(11.88±0.92)nm,双链的平均高度为1.2nm。结论:原子力显微镜能够成功地表征K562/A02细胞Mdr1基因启动子区域的DNA,获得清晰的二维及三维图象,并且能够直观地分析DNA轮廓,为进一步在分子层面上探讨研究Mdr1基因遗传信息提供了一种新的简单、直观、可靠的方法。
文摘本研究旨在检测白血病细胞株及其耐药株中两种药物代谢相关基因的单核苷酸多态性。培养白血病细胞株K562及其耐药株K562/A02,采用QIAamp DNA Blood Minikit试剂盒提取基因组DNA,设计引物,应用PCR技术扩增相应目的片段;采用基于基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术检测mthfr基因rs1801131、rs1801133、rs2274976及dpyd基因rs1801159、rs1801160、rs17376848的单核苷酸多态性。结果表明,在K562和K562/A02两种细胞中,mthfr基因rs1801131基因型均为CA、rs1801133均为CC、rs2274976均为GG;dpyd基因rs1801159基因型均为GG、rs1801160均为GG、rs17376848均为AA。结论:mthfr、dpyd基因上述位点在K562和K562/A02两种细胞中基因表达无差别。