HGT KAPs基因家族在辽宁绒山羊皮肤毛囊中的表达研究

为进一步探索高甘氨酸/酪氨酸角蛋白关联蛋白基因家族(HGT KAPs)与辽宁绒山羊羊绒品质——绒毛纤维直径的关系,本研究运用半定量RT-PCR检测KAP6-1.2、KAP6.2、KAP7.1、KAP8.1和KAP8.2在皮肤及各组织中的表达,通过原位杂交对其进行定位分析,采用实时荧光定量PCR检测兴盛期、退行期基因的相对表达量。结果表明:5个基因特异地表达于皮肤,在初、次级毛囊的皮质层、内根鞘中有明显的表达信号。KAP6-1.2和KAP8.1在兴盛期初次级毛囊的表达量差异不显著,KAP6.2在兴盛期、退行期初级毛囊的表达量均高于次级毛囊,而KAP7.1、KAP8.2在兴盛期次级毛囊的表达量高于初级毛囊,而退行期与之相反。因此推测,HGT KAPs基因家族在调控辽宁绒山羊绒毛纤维直径方面具有重要的作用,是编码羊绒结构蛋白的基因。

西藏绒山羊KAP13.1基因的多态性及其与生产性状的关联分析

为了解角蛋白关联蛋白（KAP）13.1基因在西藏绒山羊群体中的多态性与其生产性状的关联性,试验采用PCR-SSCP和DNA测序技术对343只西藏绒山羊KAP13.1基因编码区序列进行多态性分析,采用邓肯氏法进行多重比较,并与体长、体高、胸围、产绒量、羊绒长度、羊毛长度的关联性进行分析。结果表明：扩增产物序列中存在5个SNPs位点,分别为C73A、T115C、C124T、C213G和G447A,SNP位点都位于编码区。基因型2公羊的胸围、产绒量和毛长显著高于基因型3（P〈0.05）,而母羊的生产性能在3个基因型中差异不显著（P〉0.05））。说明KAP13.1基因可作为影响西藏绒山羊公羊胸围、产绒量和毛长的分子标记。

4个绒山羊群体KAP13-1基因的遗传多态性分析

【目的】对中国河西绒山羊、内蒙古绒山羊、辽宁绒山羊和陇东绒山羊4个绒山羊群体KAP13-1基因的遗传特征进行分析,为揭示绒山羊遗传特征和生产利用提供基础数据。【方法】采用PCR-SSCP方法,检测河西绒山羊、内蒙古绒山羊、辽宁绒山羊及陇东绒山羊(共721只)KAP13-1基因的多态性。同时基于DA遗传距离用UP-GMA法进行聚类分析,以明确各群体间的遗传关系。【结果】基因组DNA扩增后得到491bp的扩增产物,经SSCP分析,从4个绒山羊群体KAP13-1基因中共发现6种基因型,4个等位基因中存在5个变异位点,这些多态位点主要为点突变,且均处于编码区,其中转换位点3个(占60%),颠换位点2个(占40%)。在170和197位分别发生了T→G、C→G的错义突变,导致氨基酸分别由Leu、Thr变为Arg、Ser。该基因在河西绒山羊与陇东绒山羊中均存在4个等位基因,而内蒙古绒山羊未检测到C和D等位基因,辽宁绒山羊未检测到D等位基因。聚类结果显示,河西绒山羊与陇东绒山羊之间的遗传距离较小,在系统发生树中聚为一支,辽宁绒山羊与内蒙古绒山羊聚为一支。【结论】KAP13-1基因在4个绒山羊群体中呈中度多态,群体间存在差异。生态学作用对4个绒山羊品种的进化过程有一定的影响。

新疆细毛羊KAP6.1基因的克隆及序列分析

根据绵羊毛囊角蛋白关联蛋白(KAP)6.1(登录号为AY483218.1)基因序列设计合成2个特异性引物,以新疆细毛羊为研究对象,从采集的皮肤组织中提取RNA进行RT-PCR反应,扩增出长度为320 bp的特异性片段,回收目的片段并连接至pMD18-T载体后转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,检测阳性克隆、测序并进行分析。结果表明:试验成功克隆了新疆细毛羊KAP6.1基因,得到的长度为320 bp序列中包含252 bp的编码区序列。新疆细毛羊与绵羊亲缘关系最近,同源性为99.2%,与山羊同源性为94.8%,有13处核苷酸差异与人和兔的同源性分别为80.8%、75.1%。

KAP-1:转录调控中的一个桥梁分子

KAP-1(又称TIF1β,TRIM28等)是一种转录中介因子,在诸多转录调控复合体中起桥梁作用。它通过其N端RBCC结构域与含KRAB结构域的锌指蛋白、MDM2、MM1、C/EBPβ等相互作用;通过C端的PHD及BrD结构域与SETDB1、Mi-2α等分子相互作用,参与形成具有组蛋白甲基化酶或组蛋白去乙酰化酶活性的复合体;通过中间的HP1BD区域与HP1蛋白相互作用,进而与组蛋白相结合。大量研究表明,KAP-1作为一个桥梁分子,主要以共抑制因子形式参与转录抑制复合体的形成,在某些复合体中也可作为共激活因子发挥作用。KAP-1参与形成的复合体在精细胞发育、胚胎早期发育等生理过程中发挥重要的调控作用,这种调控属于表观遗传调控范畴。

牦牛KAP1家族基因长度多态研究

试验旨在研究牦牛角蛋白关联蛋白1(keratin associated protein 1,KAP1)家族基因长度多态与重复序列特点。研究对牦牛和黄牛KAP1家族基因进行测序,并与绵羊已知序列进行比较分析。结果发现,牛KAP1家族位于19号染色体,根据绵羊KAP1家族基因在染色体上的位置与相似性,重新命名了牛KAP1家族基因B2D、B2A、KAP1-1和B2C为KAP1-4、KAP1-1、KAP1-2、KAP1-3(按照染色体上的基因顺序)。KAP1家族基因之间在3′和5′端区域高度保守,中间有重复序列长度差异,其中牦牛KAP1-KAP4基因发现有30bp的长度多态。研究其蛋白序列发现5个氨基酸为基序的重复序列B(CCQTS)A1(CCQPT),以及一个新的重复序列C(SIQTS)。本研究结果说明重复序列是KAP1家族基因间和基因内的主要差异区域,这可能与其角蛋白结合螺旋数相关。

新吉细毛羊KAP24.1基因多态性及羊毛性状的相关性分析

为了解角蛋白关联蛋白(KAP)24.1基因在新吉细毛羊群体中的多态性与其毛用性状的关联性,试验采用DNA测序法对新吉细毛羊基因组编码区进行测序,找出基因突变位点,然后采用PCRSSCP技术对497只新吉细毛羊KAP24.1基因编码区序列进行多态性分析,并利用最小二乘模型对其多态性与产毛量、纤维直径、拉伸长度进行关联性分析。结果表明:在编码区有两处突变点,一处在348 bp处发生C→T的突变,脯氨酸突变为亮氨酸;另一处在414 bp处发生T→C的突变,丝氨酸突变为脯氨酸,均属于错义突变,KAP24.1基因的AA、AB、BB和CC基因型与纤维直径不相关(P>0.05),BB基因型的产毛量和拉伸长度显著大于AB基因型、CC基因型(P<0.05)。说明KAP24.1基因可以作为新吉细毛羊产毛量和拉伸长度主要候选基因之一,BB基因型可以作为分子标记用于预测绵羊产毛量和拉伸长度。

绒山羊KAP基因与遗传育种关系的研究进展

角蛋白关联蛋白(Keratin-assoc iated prote in,KAP)是绒毛的主要结构蛋白之一,它和角蛋白(Keratin)决定了绒毛的基本特性。近年来,许多研究发现KAP遗传多样性与绒山羊经济性状(绒细度、体重)等具有显著相关性。介绍了绒山羊毛囊KAP组成以及基因遗传多态性与绒山羊产绒性状的关系及研究进展。

和田羊毛囊KAP1.1基因的克隆及生物信息学分析

为了分析和田羊毛囊角蛋白关联蛋白(KAP)1.1基因,试验以南疆地方品种羊(和田羊)为样本,从和田羊毛囊中提取总RNA,设计1对引物,通过PCR反应扩增出长度为535 bp的基因片段,连接到pMD18-T载体上。结果表明:克隆得到和田羊毛囊KAP1.1基因成熟蛋白编码序列,序列长度与GenBank上发表的序列长度相同,经生物信息学软件分析,有2处碱基发生突变,同源性为99%,说明试验成功克隆了KAP1.1基因。

高原型藏山羊KAP6.1和6.2位点与产绒性状的关系研究

采用PCR-SSCP技术,以65只高原型藏山羊高产群体(34只)和低产群体(31只)为样本,选取KAP基因作为候选基因,研究KAP基因与其产绒量、绒长度和细度之间的关系.结果表明:①产绒量性状KAP6.1位点的BB基因型LSM值显著高于AA基因型LSM值(P<0.05),判定BB基因型为首选标记基因;KAP6.2位点的AB基因型LSM值显著高于AA基因型LSM值(P<0.05),判定AB基因型为首选标记基因;通过计算选择反应,KAP6.1位点的BB基因型可作为首选标记基因.②绒长度性状KAP6.1和KAP6.2位点的AA基因型LSM值均显著高于AB和BB基因型LSM值(P<0.05),判定AA基因型为首选标记基因;通过计算选择反应,KAP6.2位点的AA基因型可作为首选标记基因.③绒细度性状KAP6.2位点的BB基因型SM值均显著高于AA和AB基因型LSM值(P<0.05),判定BB基因型为首选标记基因;通过计算选择反应,KAP6.2位点的BB基因型为首选标记基因型.

Hoxc13在毛囊发育中的作用

Hoxc13属于Hox(Homobox)基因家族Abd-B类成员之一,与毛囊形成和毛发生长密切相关。毛发结构蛋白KP(角蛋白)和KAP(角蛋白关联蛋白)的表达都受Hoxc13的严格调控,Hoxc13表达水平会直接影响毛发的特性,对维持毛囊的正常形态也至关重要。文章就Hoxc13的表达水平对毛囊发育和毛发生长的影响及Hoxc13与相关基因的调控进行了综述。

角蛋白关联蛋白基因与羊毛性状关系的研究进展

综述了与羊毛性状有关的角蛋白关联蛋白基因的定位、生物学功能及其与羊毛性状之间的关系,旨在为绒毛用羊品种改良和分子标记辅助选择育种提供理论基础。

西藏绒山羊KAP7.1和KAP8.2基因多态性及其对部分生产性状的影响

为分析西藏绒山羊角蛋白关联蛋白(KAP)7.1基因和8.2基因与生产性状的关系,采用PCR-SSCP和DNA测序技术对340只西藏绒山羊KAP7.1基因和KAP8.2基因编码区序列进行多态性分析,并与体长、体高、胸围、产绒量、羊绒长度、羊毛长度等生产性状进行关联分析。结果显示:PCR-SSCP检测发现KAP7.1基因只有1种带型,KAP8.2基因有6种带型;KAP7.1基因扩增产物序列中未发现碱基变化;KAP8.2基因扩增产物序列中存在5个SNPs位点,分别为C115T、A207G、A214G、G216A和A278T,除了A278T外都位于编码区;对KAP8.2基因的基因型1、基因型2和基因型3与生产性能进行关联分析发现,基因型1个体的胸深和产绒量显著高于基因型3个体(P<0.05)。结果表明:KAP8.2基因可作为影响西藏绒山羊胸深和产绒量的分子辅助选择标记。