胡麻亚麻酸亚油酸相关KASP标记的开发

胡麻是北方地区特有的、富含不饱和脂肪酸的油料作物。培育高亚麻酸品种、高亚油酸品种是胡麻品质育种的主要目标。分子标记辅助选择能提高胡麻育种效率,缩短育种年限。本研究进行了胡麻资源材料自然群体多年多点脂肪酸检测数据的统计分析和基因分型、群体构建、亚麻酸、亚油酸相关SNP位点的KASP基因分型及其验证等研究,取得了以下几个方面的结果:(1)检测246份胡麻种质资源材料多年多点5种脂肪酸成分,并对其进行了统计分析。相关性分析结果显示,亚麻酸与其他成分之间呈极显著负相关,尤其是亚麻酸和亚油酸之间负相关性最高;(2)对5种脂肪酸表型数据进行统计分析,确定了亚麻酸、亚油酸相关SNP标记分型群体:包括49份高亚麻酸(≥54%)材料、36份低亚油酸(≤13.5%)材料,及8号(CH-89)和254号(CI637PI91037)高亚油酸低亚麻酸材料;(3)验证并确定了7个SNP位点:g6-6229142、g10-19305239、g9-18961021与亚麻酸显著关联;g6-19208888、g9-14900088、g15-22369840和g2-7680441与亚油酸显著关联;(4)对确定的7个SNP位点进行了高通量测序,结果与KASP基因分型结果完全一致,证明KASP基因分型体系的有效性及准确性。

鸡快慢羽基因分子检测新方法探究

该研究旨在开发新的能准确区分所有鸡快慢羽基因型的检测方法。试验基于实验室自有的和公开数据库下载的来自全球各种快慢羽品系共1175个个体数据,从全基因组数据中寻找出K*K基因连锁程度较高的SNP或SV,使用竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive Allele-Specific PCR,KASP)基因分型方法在我国地方鸡群体中验证其检测结果与基因型的符合度。结果显示,本研究从超过1.2万个突变位点中确定了1个可作为分子标记的SNP位点(位于Z染色体10706144bp处)。根据测交结果比较KASP基因分型的结果,基因型吻合个体的比率为77.5%。下一步需要在更小范围的样本中搜索准确度更高的分子标记,如我国的黄羽肉鸡、优质蛋鸡等,以助力我国地方鸡品种的培育。