基于GEO数据库筛选多发性硬化症关键基因Kcnc1、Kcnc2的分析研究

目的:筛选多发性硬化症(MS)的关键基因,探讨其发病机制并寻找潜在的治疗靶点。方法:从基因芯片数据库(GEO)搜索MS在皮层的基因表达数据,并分析与正常皮层组织的差异表达基因(DEGs);利用DAVID在线软件对挑选出的DEGs进行GO富集分析。基于STRING数据库及Cytoscape软件构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,利用MCODE与Cytohubaa分析其关键基因簇并筛选出有交集的关键基因,最后在动物模型中加以验证。结果:共纳入两套MS基因芯片数据,选出有交集的DEGs 74个,其中上调基因2个,下调基因72个。DEGs GO富集分析发现钾离子跨膜转运等生物学过程与MS的发生发展相关。Cytoscape软件筛选出10个关键基因,从中选出Kcnc1、Kcnc2两个下调基因,并在小鼠EAE模型中得到验证。结论:利用生物信息学方法有效筛选出参与MS发生的Kcnc1、Kcnc2基因,为MS的治疗提供潜在的治疗靶点和策略。

王者之风——KCNC Steady脚蹬评测

“脚蹬,是自行车的重要部件。当然了,除了性能,脚蹬的造型也是非常重要的。本期评测,是来自台湾KCNC的Steady钛轴脚蹬。这个脚蹬有2个版本,钛合金轴和不锈钢镀钛轴。笔者这次拿到的是SS Spindle,也就是不锈钢镀钛版本。”既然涉及到“钛”这个骑友们非常敏感的词了,那么我们首先要说一下质量（重量）的事情。

KCNC1基因突变导致的进行性肌阵挛癫痫3例及文献复习

目的总结3例KCNC1基因突变导致进行性肌阵挛癫痫(PME)患儿的临床表型及基因型特点,并进行文献复习。方法对2016年10月至2019年1月就诊于北京大学第一医院儿科的3例KCNC1基因突变患儿的临床特点和基因型特点进行分析,并对国际上已报道的25例KCNC1基因突变患者进行总结分析。结果本研究中的3例患儿均为KCNC1基因新生变异,2例为c.959G>A(p.Arg320His)变异,1例为c.1262C>T(p.Ala421Val)变异。3例患儿临床特点均符合PME,癫痫发病年龄分别为3月龄、10岁和11岁;3例患儿均有肌阵挛发作,1例有全面强直阵挛发作(GTCS),2例有局灶性发作;3例患儿均有智力和/或运动发育落后。3例患儿脑电图均显示广泛性棘慢波或多棘慢波,2例有局灶性放电。头颅影像学均无异常。末次随访年龄分别为3岁、13岁和12岁。截至2019年3月,国际上已报道25例KCNC1基因突变患者,加上本研究3例共28例患者,其中25例临床诊断符合PME,基因检测结果为位于跨膜区的p.Arg320His变异24例;位于跨膜区的p.Ala421Val变异1例;另3例患者仅有智力运动发育落后,无癫痫发作,该3例患者均为位于胞内区的p.Arg339X变异。28例患者中,获得头颅影像学资料16例,其中小脑萎缩12例,正常4例。28例患者中,智力发育落后18例,运动发育落后或倒退27例,其中9例丧失独立行走能力。10例患者报道时超过30岁,仅1例患者在63岁因肺炎及呼吸衰竭死亡。结论KCNC1基因突变主要导致PME表型,少数可仅表现为智力运动发育落后;p.Arg320His为KCNC1基因最常见的变异类型。不同结构区域的变异导致的临床表型存在差异,位于跨膜区的变异可导致更严重的临床表型。本研究中3例KCNC1基因突变患儿为国内首次报道。

KCNC1基因新生突变(c.1262C>T)致早发肌阵挛伴全面性发育落后的进行性肌阵挛癫痫1例

对遵义医科大学第一附属医院儿科病房收治的1例KCNC1基因新生突变(c.1262C>T)所致早发肌阵挛伴全面性发育落后的进行性肌阵挛癫痫(PME)患儿的临床资料行回顾性分析。患儿,女,9岁,起病早、症状重,4个月大时出现频繁肌阵挛发作,随年龄增长出现明显的共济失调,且自幼发育全面落后。脑电图显示醒睡期多量棘慢波节律中-长程阵发,可见频繁肌阵挛发作。基因检测发现KCNC1基因新生错义突变(c.1262C>T)。说明KCNC1基因新发突变可能引起早发性PME伴全面性发育落后,提示对于早期起病的肌阵挛癫痫伴有全面性发育落后的患儿,需注意钾通道基因的检查。

阿尔茨海默病发病机制相关基因生物信息学分析及实验验证

背景:阿尔茨海默病的机制挖掘十分重要,通过生物信息学对阿尔茨海默病潜在治疗靶点的研究,可以为阿尔茨海默病治疗提供良好的指示作用。目的:使用生物信息学分析方法筛选与阿尔茨海默病发病机制相关的基因并在动物水平加以实验验证。方法:利用GEO在线数据库筛选差异基因;利用DAVID在线数据库进行GO/KEGG富集分析;使用STRING数据库进行蛋白互作网络的构建;使用HPA数据库判断目的蛋白在人体中的分布情况;最后使用免疫荧光技术和免疫印迹技术验证分析蛋白表达情况。结果与结论:①利用GEO在线数据库内数据集GSE48350获取阿尔茨海默病与健康人群的基因芯片,使用GEO2R在线分析平台分析两个人群的差异基因,其中上调基因42个,下调基因131个;②GO基因功能注释分析结果显示差异基因主要位于突触前、运输囊泡和胞外囊泡;介导神经递质释放和突触小泡功能等生物进程;参与磷脂结合、受体-配体活性和网格蛋白结合等分子功能的构成;③KEGG通路分析结果显示差异基因主要富集于神经活性配体-受体相互作用、γ-氨基丁酸神经突触与逆行内源性大麻素信号等突触功能相关信号通路;④结合蛋白互作网络筛选出5个上调关键基因:CLU、GFAP、CD44、FOS、ANXA1;5个下调关键基因:GABRG2、SYT1、SYN2、KCNC1、SLC32A1;⑤实验证实在阿尔茨海默病小鼠模型的海马组织中GABRG2、KCNC1、SLC32A1表达显著下调;⑥结果提示上述3个基因可以作为治疗和诊断阿尔茨海默病的潜在基因,为阿尔茨海默病的治疗提供重要的线索,亦可以作为阿尔茨海默病与癫痫的共治疗靶点。

KCN和NaN_3预处理对烟草愈伤组织抗氰呼吸的影响

用０．５ ｍ ｍ ｏｌ／Ｌ ＫＣＮ 或０．０１ ｍ ｍ ｏｌ／Ｌ ＮａＮ３ 预处理继代培养２５ ｄ 的“甘肃黄花烟草”（Ｎｉｃｏｔｉａｎａ ｒｕｓｔｉｃａ Ｌ． ｃｖ． Ｇａｎｓｕ ｙｅｌｌｏｗ ｆｌｏｗ ｅｒ）愈伤组织对其呼吸作用有明显的影响。ＫＣＮ 和ＮａＮ３ 预处理１２ ｈ 可分别使愈伤组织的总呼吸速率下降１２％ 和１７％ ，细胞色素途径的实际运行量分别下降２２％ 和２８％ ；抗氰交替途径在最大容量（Ｖａｌｔ）基本不变的情况下，实际运行量（ρ·Ｖａｌｔ）不但未随总呼吸速率和细胞色素途径运行量的下降而降低，反而还略有上升。结果导致细胞色素途径对总呼吸的贡献下降而抗氰交替途径对总呼吸的贡献上升。ＫＣＮ 预处理２４ ｈ，细胞色素途径的实际运行量虽略有回升，但仍低于对照；ＮａＮ３ 预处理２４ ｈ 则使细胞色素途径运行继续下降而交替途径运行持续上升。上述结果表明，在继代培养的烟草愈伤组织中，当细胞色素主路途径被部分抑制后交替途径的电子流量明显加强。

基于投影追踪回归的机床热误差建模技术

针对机床热误差建模温度变量多、非线性度高的问题,提出了一种基于投影追踪回归的建立数控机床热误差模型的新方法。与传统的回归建模方法相比,该方法具有模型简单、计算简便的优点。将该方法应用于一台数控车床的实验研究,建立了该车床的热误差模型。实验结果表明,新方法能够大幅提高所建模型的精度及鲁棒性,进而提高机床的加工精度。

基于TCGA数据库分析甲基化促进精原细胞瘤进程的作用机制

目的:通过生物信息学分析寻找甲基化促进精原细胞瘤进展的作用机制。方法:获取TCGA数据库精原细胞瘤数据,对Ⅱ期、Ⅲ期和Ⅰ期样本之间的差异甲基化位点、差异基因进行查找和关联分析,筛选精原细胞瘤Ⅱ期、Ⅲ期和Ⅰ期之间可能通过甲基化导致基因改变并影响精原细胞瘤的潜在机制。结果:分析显示KCNC1的表达与甲基化呈显著负相关,并显著影响精原细胞瘤患者的生存期。结论:利用生物信息学技术对不同分期的精原细胞瘤芯片数据分析,可发现高甲基化水平会导致基因KCNC1低表达,进而促进精原细胞瘤的进展,为靶向治疗精原细胞瘤提供精确方向。