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MicroRNA-409-5p Inhibits GIST Tumorigenesis and Improves Imatinib Resistance by Targeting KDM4D Expression
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作者 Cheng QIU Yong-dong FENG Xi YANG 《Current Medical Science》 SCIE CAS 2023年第5期935-946,共12页
Objective Gastrointestinal stromal tumors(GISTs)can rapidly proliferate through angiogenesis.Previous studies indicated the potential influence of microRNA on the progression of tumor immature angiogenesis.This study ... Objective Gastrointestinal stromal tumors(GISTs)can rapidly proliferate through angiogenesis.Previous studies indicated the potential influence of microRNA on the progression of tumor immature angiogenesis.This study aimed to explore the specific mechanism by which microRNA-409-5p(miR-409-5p)contributes to GIST.Methods To identify genes potentially involved in the development and progression of GIST,the differences of miR-409-5p between tumors and adjacent tissues were first analyzed.Following this analysis,target genes were predicted.To further investigate the function of miRNA in GIST cells,two GIST cell lines(GIST-T1 and GIST882)were transfected with lentiviruses that stably expressed miR-409-5p and scrambled miRNA(negative control).Later,the cells were subjected to Western blotting and ELSA to determine any differences in angiogenesis-related genes.Results In GISTs,there was a decrease in the expression levels of miR-409-5p compared to the adjacent tissues.It was observed that the upregulation of miR-409-5p in GIST cell lines effectively inhibited the proteins hypoxia-inducible transcription factor 1β(HIF1β)and vascular endothelial growth factor A(VEGF-A).Further investigations revealed that miR-409-5p acted as an inhibitor of angiogenesis by binding to the 3′-UTR of Lysine-specific demethylase 4D(KDM4D)mRNA.Moreover,the combination of miR-409-5p with imatinib enhanced its inhibitory effect on angiogenesis.Conclusion This study demonstrated that the miRNA-409-5p/KDM4D/HIF1β/VEGF-A signaling pathway could serve as a novel target for the development of therapeutic strategies for the treatment of imatinib-resistance in GIST patients. 展开更多
关键词 microRNA-409-5p kdm4d gastrointestinal stromal tumor
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过表达Kdm4d对山羊孤雌胚胎基因组激活期Xist表达的影响
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作者 杨瑛楠 蔡玉 +4 位作者 刘孜斐 李东旭 万永杰 王锋 邓明田 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1227-1234,共8页
[目的]本试验旨在探究过表达赖氨酸特异去甲基化酶4D(Kdm4d)对山羊孤雌胚胎基因组激活期(8细胞期)Xist表达的影响。[方法]通过构建Kdm4d-IRES-EGFP重组质粒,体外转录Kdm4d mRNA,再利用显微注射、免疫荧光和亚硫酸氢盐测序等方法,分析过... [目的]本试验旨在探究过表达赖氨酸特异去甲基化酶4D(Kdm4d)对山羊孤雌胚胎基因组激活期(8细胞期)Xist表达的影响。[方法]通过构建Kdm4d-IRES-EGFP重组质粒,体外转录Kdm4d mRNA,再利用显微注射、免疫荧光和亚硫酸氢盐测序等方法,分析过表达Kdm4d对山羊孤雌胚胎基因组激活期(8细胞期)Xist表达的影响。[结果]与对照组相比,组蛋白H3K9甲基化(H3K9me3)水平在2~8细胞期和囊胚期过表达Kdm4d的山羊孤雌胚胎中均显著降低,过表达Kdm4d山羊的4、8细胞期胚胎和囊胚的发育潜能无显著变化;Xist表达水平在过表达Kdm4d的山羊8细胞期孤雌胚胎中显著升高,但Xist启动子仍维持高甲基化,与对照组相比无显著变化。[结论]Kdm4d能有效移除孤雌胚胎中H3K9me3修饰,促进Xist表达,但不影响Xist启动子DNA甲基化水平和山羊孤雌胚胎发育潜能。本研究为深入理解Kdm4d调控山羊早期胚胎X染色体失活的机制奠定了基础。 展开更多
关键词 kdm4d XIST 孤雌胚胎 胚胎基因组激活 山羊
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重组蛋白KDM4D对水牛成纤维细胞生长及组蛋白甲基化修饰的影响
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作者 俸云 李思佳 +5 位作者 陈莫斯楠 赵鑫 陆灿强 罗婵 陆凤花 石德顺 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期627-635,共9页
本研究旨在探讨重组蛋白赖氨酸特异性去甲基化酶4D(lysine K-specific demethylase 4D,KDM4D)对水牛成纤维细胞(buffalo fetal fibroblasts,BFFs)生长及组蛋白甲基化修饰的影响,为提高水牛体细胞重编程效率提供理论基础。首先,使用不同... 本研究旨在探讨重组蛋白赖氨酸特异性去甲基化酶4D(lysine K-specific demethylase 4D,KDM4D)对水牛成纤维细胞(buffalo fetal fibroblasts,BFFs)生长及组蛋白甲基化修饰的影响,为提高水牛体细胞重编程效率提供理论基础。首先,使用不同浓度的重组蛋白KDM4D处理BFFs,摸索出最适宜的处理浓度和处理时间。其次,采用实时定量PCR技术和EdU方法检测重组蛋白KDM4D对BFFs增殖凋亡的影响。最后,使用细胞免疫荧光和Western blot对组蛋白H3第9位赖氨酸三甲基化(histone 3 lysine 9 trimethylation,H3K9me3)修饰水平和异染色质蛋白1α(heterochromatin protein 1α,HP1α)基因的表达水平进行检测。结果发现,适宜浓度的重组蛋白KDM4D(0.10μg/mL)处理36 h对BFFs形态无明显影响,可以显著提高细胞活力(P<0.05)。实时定量PCR分析结果显示,与对照组相比,重组蛋白KDM4D可以显著提高细胞周期蛋白依赖性激酶4(cyclin dependent kinase 4,CDK4)和B淋巴细胞瘤2(B-cell lymphoma 2,BCL2)的mRNA相对表达水平,显著降低Bax(BCL2 associated X)的mRNA相对表达水平(P<0.05)。EdU细胞增殖检测结果表明,重组蛋白KDM4D处理后BFFs的增殖率显著高于对照组的(P<0.05)。细胞免疫荧光和Western blot结果显示,培养基中添加重组蛋白KDM4D后,BFFs的H3K9me3修饰水平和HP1α蛋白表达水平显著降低(P<0.05)。上述结果表明,适宜浓度的重组蛋白KDM4D(0.10μg/mL)处理36 h,可以促进BFFs的增殖,降低BFFs的H3K9me3修饰水平和HP1α蛋白的表达水平。本研究为进一步探讨重组蛋白KDM4D对水牛体细胞重编程的作用机制提供了理论依据。 展开更多
关键词 赖氨酸特异性去甲基化酶4D(kdm4d) 水牛成纤维细胞 细胞增殖 组蛋白甲基化修饰
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基于KDM4D受体研究隔药饼灸抑制结肠炎相关性结肠癌肿瘤生长的作用机制
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作者 徐宏潇 王逸然 +11 位作者 徐静 黄艳 乔宇 李斐斐 李国娜 赵继梦 李峰 陈子怡 李昆珊 顾沐恩 吴焕淦 杨燕萍 《Journal of Acupuncture and Tuina Science》 CAS CSCD 2024年第1期1-11,共11页
目的:从组蛋白赖氨酸去甲基化酶4D(KDM4D)的角度探究隔药饼灸抑制结肠炎相关性结肠癌(CAC)肿瘤生长的效应机制。方法:将近交系雄性Sprague-Dawley大鼠随机分为正常组、CAC组、隔药饼灸组和抑制剂组。除正常组外,其余3组大鼠采用偶氮甲烷... 目的:从组蛋白赖氨酸去甲基化酶4D(KDM4D)的角度探究隔药饼灸抑制结肠炎相关性结肠癌(CAC)肿瘤生长的效应机制。方法:将近交系雄性Sprague-Dawley大鼠随机分为正常组、CAC组、隔药饼灸组和抑制剂组。除正常组外,其余3组大鼠采用偶氮甲烷(AOM)联合葡聚糖硫酸钠(DSS)制备CAC大鼠模型。正常组和CAC组不干预;隔药饼灸组大鼠取气海和双侧天枢,每次每穴灸2壮,每日1次,每周休息1 d,共30 d;抑制剂组予以KDM4D抑制剂5-氯-8-羟基喹啉(5-c-8HQ)腹腔注射,每日1次,共30 d。干预后观察各组大鼠的一般情况、结肠长度、瘤体数量和体积及结肠组织病理学变化。采用实时荧光定量聚合酶链反应法检测腺瘤样息肉病基因(APC)、体轴抑制因子(Axin)、细胞周期蛋白D1(cyclin D1)、基质金属蛋白酶(MMP)-7及MMP-9 mRNA的表达。免疫组化法检测结肠组织增殖细胞核抗原(PCNA)、cleaved caspase3、KDM4D、APC及Axin蛋白的表达。结果:与正常组相比,CAC组大鼠一般情况较差,结肠长度显著缩短(P<0.01),结肠组织瘤体数目增多、体积增大(P<0.01),可见腺管结构明显紊乱,出现“背靠背”及共壁现象,高级别腺癌形成;CAC组结肠组织PCNA及KDM4D蛋白表达水平显著升高(P<0.01),cleaved caspase3、APC及Axin蛋白表达水平显著降低(P<0.01),cyclin D1、MMP-7及MMP-9 mRNA表达水平显著升高(P<0.01),APC及Axin mRNA表达水平显著降低(P<0.01)。与CAC组相比,隔药饼灸组与抑制剂组大鼠的一般情况改善,结肠长度显著增加(P<0.01),结肠瘤体数目减少、体积缩小(P<0.05),大鼠的结肠组织可见结肠上皮细胞增生,核增大且深染,异型增生,炎性细胞浸润。隔药饼灸组与抑制剂组大鼠结肠组织PCNA及KDM4D蛋白表达水平显著降低(P<0.01),cleaved caspase3、APC及Axin蛋白表达水平显著升高(P<0.01),cyclin D1、MMP-7及MMP-9 mRNA表达降低(P<0.05),APC及Axin mRNA表达升高(P<0.05)。结论:隔药饼灸能调控CAC大鼠的KDM4D异常表达,激活Wnt/β-catenin通路上游APC和Axin分子,抑制Wnt/β-catenin通路下游分子的异常激活,这可能是隔药饼灸抑制CAC肿瘤生长的关键机制之一。 展开更多
关键词 气海 天枢 药饼灸疗法 结肠炎相关性肿瘤 结直肠肿瘤 组蛋白赖氨酸去甲基化酶4D Wnt/β-catenin信号通路 大鼠
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水牛KDM4D基因克隆分析及其真核表达载体的构建
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作者 俸云 赵鑫 +6 位作者 许洁 余庆 沈朋雷 王露露 吴飞 石德顺 陆凤花 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第10期2067-2074,共8页
旨在克隆水牛组蛋白去甲基化酶KDM4D (lysine K-specific demethylase 4D)基因,对其进行生物信息学分析,并构建KDM4D基因的真核表达载体,为研究KDM4D基因在水牛体细胞核移植(somatic cell nuclear transfer,SCNT)胚胎发育中的作用奠定... 旨在克隆水牛组蛋白去甲基化酶KDM4D (lysine K-specific demethylase 4D)基因,对其进行生物信息学分析,并构建KDM4D基因的真核表达载体,为研究KDM4D基因在水牛体细胞核移植(somatic cell nuclear transfer,SCNT)胚胎发育中的作用奠定基础。试验从水牛睾丸组织中提取总RNA,反转录cDNA后, RT-PCR技术克隆KDM4D基因片段,并运用生物信息学软件对序列进行分析;随后将KDM4D基因片段连接至真核表达载体pEGFP-C1,再把重组质粒转染进HEK293T细胞。结果表明,克隆所得的水牛KDM4D基因片段编码区全长1 155 bp,共编码384个氨基酸。水牛KDM4D基因与黄牛、山羊、绵羊、犬、猫、猪、人、小鼠、大鼠的同源性分别为98.4%,96.6%,96.3%,84.9%,84.1%,81.4%,80.4%,77.4%,77.3%。多重比较和进化树分析结果显示,KDM4D基因在不同物种及生物进化中具有较高的保守性。蛋白结构域分析显示,克隆所得的KDM4D蛋白结构特殊,只具有1个JmjN (Jumonji N)和1个JmjC (jumonji C)结构域,与KDM4家族其他成员相比缺少PHD (plant homeodomain)和Tud (tudor)功能域。KDM4D蛋白质三级结构预测结果显示,水牛、黄牛和人3种物种间具有较高的相似性。转染结果显示,构建的重组质粒可以在HEK293T细胞中表达。本试验成功克隆水牛KDM4D基因,对其进行生物信息学分析,构建了真核表达载体pEGFP-C1-KDM4D,并在HEK293T细胞中成功表达。 展开更多
关键词 水牛 kdm4d基因 基因克隆 生物信息学分析 载体构建
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过表达组蛋白H3K9me3去甲基化酶对猪克隆胚胎发育的影响
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作者 李亚楠 张贤君 +5 位作者 张宁 梁雅琳 张宇星 招华兴 李紫聪 黄思秀 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期67-77,共11页
组蛋白异常修饰是克隆胚胎发育的重要制约因素,组蛋白H3K9me3去甲基化酶KDM4家族的过表达可以有效提高克隆胚胎的发育效率。为探究过表达H3K9me3去甲基化酶对猪克隆胚胎发育的影响,本研究在猪克隆胚胎1-细胞期和2-细胞期分别注射KDM4A m... 组蛋白异常修饰是克隆胚胎发育的重要制约因素,组蛋白H3K9me3去甲基化酶KDM4家族的过表达可以有效提高克隆胚胎的发育效率。为探究过表达H3K9me3去甲基化酶对猪克隆胚胎发育的影响,本研究在猪克隆胚胎1-细胞期和2-细胞期分别注射KDM4A mRNA和KDM4D mRNA检测胚胎的囊胚率;收集1-细胞期注射KDM4A mRNA和胚胎注射水(对照组)的2-细胞期克隆胚胎检测H3K9me3表达水平;此外,收集1-细胞期注射KDM4A mRNA和胚胎注射水的4-细胞期克隆胚胎进行单细胞转录组测序,并对测序数据进行GO与KEGG富集分析。结果显示:在1-细胞期注射KDM4A mRNA的猪克隆胚胎囊胚率显著高于对照组(25.32±0.74%vs 14.78±0.87%),注射KDM4D mRNA对猪克隆胚胎囊胚率无明显作用(16.27±0.77%vs 14.78±0.87%);在2-细胞期注射KDM4A mRNA和KDM4D mRNA的克隆胚胎囊胚率与对照组相比均无显著差异(32.18±1.67%、30.04±0.91%vs 31.22±1.40%)。在1-细胞期注射KDM4A mRNA的克隆胚胎组蛋白H3K9me3表达水平低于对照组。通过测序,筛选出133个差异表达基因,其中上调基因52个、下调基因81个,GO分析主要富集到与蛋白质定位相关的通路,KEGG分析富集到细胞衰老和急性髓细胞白血病等相关通路。本研究结果表明,过表达组蛋白H3K9me3去甲基化酶KDM4A可以显著提高猪克隆胚胎的发育效率。 展开更多
关键词 克隆胚胎 H3K9me3 KDM4A kdm4d
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过表达H3K9me3去甲基化酶对猪克隆胚胎体外发育效率的影响 被引量:4
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作者 吴霄 李果 +5 位作者 敖政 石俊松 蔡更元 刘德武 吴珍芳 李紫聪 《广东农业科学》 CAS 2017年第10期96-101,176,共7页
为了探索过表达组蛋白H3K9me3去甲基化酶KDM4B/KDM4D对猪克隆胚胎体外发育效率的影响,研究构建了鼠源KDM4B/KDM4D表达载体,通过体外转录获得KDM4B/KDM4D mRNA并将其分别显微注射至猪克隆胚胎。结果显示两组注射的克隆胚胎的H3K9me3水平... 为了探索过表达组蛋白H3K9me3去甲基化酶KDM4B/KDM4D对猪克隆胚胎体外发育效率的影响,研究构建了鼠源KDM4B/KDM4D表达载体,通过体外转录获得KDM4B/KDM4D mRNA并将其分别显微注射至猪克隆胚胎。结果显示两组注射的克隆胚胎的H3K9me3水平、卵裂率和囊胚率与对照克隆胚胎无显著差异,但两组注射的克隆胚胎的H3K9me3去甲基化酶表达水平显著高于无注射的对照克隆胚胎,且注射KDM4B mRNA的克隆胚胎的囊胚细胞数显著高于注射KDM4D mRNA的克隆胚胎及对照克隆胚胎,表明过表达组蛋白H3K9me3去甲基化酶KDM4B可以显著提高猪克隆胚胎的体外发育效率。 展开更多
关键词 克隆胚胎 H3K9me3 KDM4B kdm4d
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