制草乌肝毒性效应的代谢通路分析

目的基于代谢组学技术检测制草乌对大鼠肝功能指标及肝组织病理影响从而探究代谢通路分析。方法以制草乌为示例药物,以大鼠为研究对象,将大鼠按体重随机分成4组。根据预试验结果设定正常组、制草乌高剂量组、中剂量组、低剂量组。除正常组外,其余各给药组灌胃相应的药物溶液,1次/d,连续灌胃28 d,末次给药后收集血清样本,检测各组的血清生化指标及采用LC-MS非靶向代谢组学技术对血清内源性代谢产物变化进行分析。结果血清生化指标结果显示,与正常组比较,制草乌高剂量组ALT含量显著升高,有统计学意义(P<0.05);制草乌中和低剂量组指标差异无统计学意义(P>0.05);肝组织病理检测显示,正常组肝小叶结构清晰,肝细胞索和肝血窦大致呈放射状排列,肝细胞圆润、饱满,肝板排列规则、整齐。制草乌高剂量组肝细胞广泛水肿、空泡化、丧失结构完整性;制草乌中和低剂量组未见明显异常;从血清中共筛选出34个内源性差异代谢物,其中上调15个、下调19个,多数涉及烟酸和多种氨基酸代谢。结论明确制草乌具有一定的肝毒性;肝毒性机制主要与烟酰胺(NA)和1-甲基烟酰胺(MNA)代谢有关。

原发性肾病综合征患者血清异常代谢通路的代谢组学分析

目的通过液相色谱质谱联用的代谢组学方法,分析与原发性肾病综合征(PNS)相关的异常代谢通路,探讨PNS的发病机制。方法应用超高效液相色谱-高分辨质谱法方法对40例PNS患者(观察组)和40例健康体检者(对照组)血清样本中的代谢物进行检测,采用正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)法进行模式识别,构建PNS诊断模型,采用Met PA数据库进行代谢通路分析。结果 OPLS-DA模型的质量参数R2X=71.4%,Q2Y=0.517,观察组、对照组间的区分非常明显。代谢通路分析共筛选出有差异的代谢物相关通路9个,其中硫胺素代谢、嘧啶代谢、苯基丙氨酸代谢、柠檬酸循环4个代谢通路影响值均大于0.1。结论 PNS患者存在硫胺素代谢、嘧啶代谢、苯基丙氨酸代谢、柠檬酸循环代谢紊乱,可能与PNS的发生发展密切相关。

基于组学数据库整合工具的代谢通路分析应用

组学技术方法和工具研究系统生物学的发展产生海量的基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等组学数据。基于多平台组学数据整合的代谢通路分析为全面深刻了解生物医学系统提供了前提条件。本文综述了近年来基于组学数据库和整合工具的代谢通路分析方面的研究进展,包括新的数据整合方法和数据库分析平台。

龙岩鲜烟叶特征香气成分前体物代谢组学的通路分析

为了探讨龙岩鲜烟叶特征香气成分代谢前体物生物合成过程中的代谢组学通路,采用主成分分析和逐步回归分析双重筛选的方法,筛选龙岩鲜烟叶特征代谢谱;根据KEGG分析信号通路、分子注释、相关酶和生化反应等相关性质,利用Metabo Analyst网络软件可视化代谢产物路径。结果表明,5个代谢产物参与了11条代谢路径,其中类胡萝卜素生物合成和氨酰基t RNA生物合成通路的影响值(P<0.05)。因此,龙岩特征香气成分前体物的生物合成过程与类胡萝卜素生物合成和氨酰基t RNA生物合成通路密切相关。

基于非靶向代谢组学的药膳鱼汤代谢产物差异分析

药膳鱼汤是一道滋补价值高的佳肴,关于其化学组成特征的研究相对较少。因此,该研究以鱼汤、药膳鱼汤为研究对象,利用超高效液相色谱-质谱联用(ultra performance liquid chromatography-mass spectrometry,UPLC-MS/MS)代谢组学技术,结合主成分分析(principal components analysis,PCA)、正交偏最小二乘-判别分析(orthogonal partial least squares-discrimination analysis,OPLS-DA)等多元统计学方法,探究药膳鱼汤的差异代谢物。采用变量投影重要性VIP>1且P<0.05的标准,筛选差异显著的代谢物,并进行代谢通路分析。结果显示,共鉴定出20类176个差异代谢物,其中包括35个氨基酸及其衍生物,38个脂肪酰类,25个有机酸及其衍生物,17个核苷酸及其衍生物,10个碳水化合物及其衍生物,以及18个黄酮化合物。KEGG功能通路富集分析筛选出6条代谢通路,包括氨基酸的生物合成、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的生物合成、核苷酸糖的生物合成、ABC转运蛋白、咖啡因代谢以及半胱氨酸和蛋氨酸代谢。非靶向代谢组学从整体水平上揭示了药膳鱼汤的代谢差异,为其鉴别和品质评价提供了方向。

基于LC-MS代谢组学技术探究铅胁迫大麦苗粉代谢产物及通路分析

通过模拟Pb污染区大麦种植,本研究采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)代谢组学技术,结合主成分分析(PCA)、正交偏最小二乘法-判别分析(OPLS-DA)、层次聚类分析等多元统计学分析,探究Pb在大麦中的代谢通路及对大麦代谢物的动态变化影响。实验选用成苗期大麦(CMQ)和经Pb胁迫大麦(CMQPb)两组样本。共定性出84个代谢物,通过对显著代谢物进行筛选(p<0.05)共得到60个差异代谢物,发现Pb胁迫对大麦中有机酸及其衍生物、多酚类物质、多胺类物质、脂类及类脂质分子含量影响较大,说明Pb胁迫会对大麦苗营养成分产生一定影响。通过KEGG代谢通路分析,发现Pb胁迫对β-丙氨酸代谢影响最大。β-丙氨酸、二氢尿嘧啶、泛酸和尿嘧啶4个差异代谢物对大麦受Pb胁迫后的差异代谢分析具有重要意义。

刺梨不同提取物的非靶向代谢组学比较与分析

该文采用超高效液相色谱-高分辨质谱技术(ultra high performance liquid chromatography high resolution mass spectrometry,UPLC-HRMS)对刺梨不同提取物进行非靶向定性解析,通过数据库确认注释并鉴定代谢物,在二级质谱信息下共鉴定出316种代谢物。运用多元统计方法进行刺梨不同提取物数据分析并筛选出差异代谢物。主成分分析结果表明,刺梨不同提取物存在代谢物差异。依据正交偏最小二乘法判别分析模型的变量重要性投影(variable importance projection value,VIP,VIP>1.3)值、P<0.01和差异倍数(fold change,FC,FC≥3和FC≤0.1)可筛选出49种显著差异代谢物。通过MBRole 2.0通路分析功能,发现有11条代谢途径。其中类黄酮生物合成途径最为显著,共计4个代谢物参与类黄酮生物合成代谢通路。该文基于非靶向代谢组学分析表明,刺梨不同提取物之间的代谢物有一定差异,为进一步研究其功能提供了数据支持。

慢性再生障碍性贫血患者粪便非靶向代谢组学分析及与中医证型的相关性

【目的】分析慢性再生障碍性贫血(CAA)患者与正常人粪便非靶向代谢组学改变及CAA不同中医证型间差异性粪便代谢物谱,以揭示CAA中医证型的物质基础。【方法】纳入2018年7月至2021年6月南京中医药大学附属医院初治的CAA患者(CAA组)21例及健康体检者(正常人组)24例,根据中医辨证分型标准,将21例CAA患者分为肾阳虚组4例、肾阴虚组12例、肾阴阳两虚组5例。通过粪便采集、气相色谱-质谱分析(GC-MS)、多元统计分析等筛选差异代谢物,进行代谢通路富集分析。【结果】(1)38种代谢物在CAA组与正常人组之间有明显差异,其中3-羟基苯乙酸、腺嘌呤、异柠檬酸、L-谷氨酰胺、尿酸、鸟嘌呤等27种代谢物相对含量在CAA中呈现上调,3’-腺苷酸、花生酸、肌苷、N-乙酰鸟氨酸、去甲肾上腺素等11种代谢物则为下调。其差异代谢物富集的主要代谢通路包括:精氨酸生物合成、嘌呤代谢、癌症的中心碳代谢、乙醛酸和二羧酸代谢、GABA能突触、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢、D-谷氨酰胺和D-谷氨酸代谢等。(2)16种代谢物在CAA不同中医证型之间有显著性差异,包括5-甲氧基色胺、肾上腺素、熊果苷、β-丙氨酸、戊二胺、肌醇、丙酮酸、酪胺等,其差异代谢物富集的主要代谢通路包括:神经活性配体-受体相互作用、酪氨酸代谢、磷脂酰肌醇信号系统、泛酸和辅酶A生物合成、糖酵解/糖异生、初级胆汁酸生物合成、磷酸肌醇代谢、抗坏血酸和醛酸代谢、Ⅱ型糖尿病、心肌细胞中的肾上腺素能信号传导等。【结论】CAA患者的粪便代谢组学与正常人相比存在明显异常,这可能反映CAA肠道菌群改变介导免疫失调、造血衰竭发生的代谢变化;该研究首次从粪便代谢组学水平揭示了CAA不同肾虚证型的物质基础,可为中医证型的现代化研究提供新思路。

偏头痛相关酶和KEGG通路分析

搜集与偏头痛相关的编码酶的基因,利用KEGG通路分析目标基因的分布和功能,促进偏头痛遗传学研究和新药靶点研究。以"gene name"AND migraine检索PUBMED数据库,从原始文献中搜集并整理偏头痛相关酶基因数据,用DAVID在线分析工具对数据进行处理。搜索得到31个偏头痛酶基因,对7条KEGG代谢通路进行了分析:色氨酸代谢通路、酪氨酸代谢通路、精氨酸和脯氨酸代谢通路、叶酸一碳单位循环代谢通路、药物代谢通路、外源物质细胞色素P450代谢通路、肾素血管紧张素代谢通路。其中药物代谢通路包括9个药物,又以高选择性5-羟色胺重摄取抑制剂西酞普兰的应用前景最大。DDC、DBH、MTHFD1等6个偏头痛相关基因需要完善多态性研究。CYP450和单胺氧化酶在偏头痛的病理和治疗中都占有重要的地位。通过分析疾病相关酶基因的代谢通路,有助于了解疾病的分子病理基础,并为新药设计提供可靠靶点。

miR-223-3p在高糖诱导的H9c2细胞损伤中的靶基因预测及相关通路分析

[目的]通过生物信息学途径探究miR-223-3p在高糖环境下对H9c2细胞的影响,并结合转录组测序结果,分析其在糖尿病心肌病发病机制中的作用,旨在分子层面上发掘新的治疗靶点,探究miR-223-3p的具体作用机制。[方法]在高糖培养的H9c2细胞中分别转染miR-223-3p的抑制物及对照物,RT-qPCR检测两组细胞中miR-223-3p的表达差异;通过高通量测序对差异mRNA进行检测;用TopGO软件进行GO功能富集分析;DESeq2软件(v1.16.1)筛选差异表达基因,对检测结果的差异基因与miR-223-3p靶基因数据库共分析,预测miR-223-3p靶基因,并用RT-qPCR检测验证其表达变化。[结果]高糖处理的H9c2细胞活性明显降低,转录组测序结果提示对照组和miR-223-3p抑制剂组间的基因表达存在较为明显的差异。GO功能富集分析显示,预测靶基因集显著富集于G蛋白偶联受体活性、甘油基乙醚单加氧酶活性、细胞阴离子稳态和氯离子稳态等方面。KEGG通路富集分析显示,这些基因主要涉及TNF信号通路和IL-17信号通路。此外,它们还与1型糖尿病、细胞色素P450对外源性药物的代谢作用等相关疾病和生理过程有关。靶基因预测提示miR-223-3p可能与Cxcl10、Creb3l3、Mmp3和Bcl3等的表达变化有关。[结论]在高糖诱导的H9c2细胞损伤中miR-223-3p及其下游靶基因的预测可能为糖尿病心肌病的治疗提供新的靶点,对于揭示糖尿病心肌病的发病机制以及开发新的治疗策略具有重要意义。

嘎日迪-5对心脏毒性的代谢通路分析

目的:采用代谢组学方法分析嘎日迪-5心脏毒性机制。方法:以大鼠为研究对象,以嘎日迪-5为示例药物,将大鼠按体质量随机分为正常组,嘎日迪-5高、中、低剂量组。除正常组外,各给药组灌胃药物溶液,连续灌胃28 d,末次给药后收集血清样本,采用LC-MS非靶向代谢组学技术分析血清内源性代谢产物变化。结果:与正常组比较,嘎日迪-5高剂量组CK、CKMB含量显著升高(P<0.05),嘎日迪-5中剂量、嘎日迪-5低剂量组CKMB含量显著降低(P<0.05)。各给药组大鼠的心电图主要表现为嘎日迪-5高剂量组心动过缓,ST段压低;嘎日迪-5中剂量组室早,宽大畸形的QRS波(P<0.05);嘎日迪-5低剂量组ST段压低。心脏组织病理检测显示,正常组心肌纤维排列整齐规则,胞核呈蓝色,胞质呈淡粉色,细胞结构清晰。嘎日迪-5高剂量、嘎日迪-5中剂量组心肌纤维排列紊乱,胞质疏松淡染,部分细胞水肿。嘎日迪-5低剂量组心肌纤维排列略紊乱,胞质疏松淡染;嘎日迪-5高剂量(GG)组心脏样本中筛出121个差异代谢物。结论:嘎日迪-5心脏毒性机制与大鼠心脏内ABC转运蛋白、精氨酸和脯氨酸代谢、烟酸和烟酰胺代谢等通路有关。

小鼠NFATc1相互作用蛋白功能及KEGG通路分析

目的:利用生物信息学方法对小鼠NFATc1及相关蛋白功能进行预测与分析,为探讨NFATc1生物学功能及作用机制提供借鉴。方法:利用在线数据库STRING,选取系统打分高于0.800的20种蛋白质与NFATc1构建蛋白相互作用网络图,并对该蛋白集合进行后续分析;采用DAVID在线分析工具对以上蛋白进行GO功能富集和KEGG信号通路分析。结果:GO富集分析显示,该蛋白集合参与CaN/NFAT信号通路、转录正调控、JUN蛋白磷酸化、基因表达正调控等生物学过程。具体分子功能主要是结合转录因子、钙依赖蛋白丝氨酸/苏氨酸磷酸酶活性、JUN蛋白激酶活性及RNA聚合酶Ⅱ核心启动子近端序列特异性结合DNA等;KEGG信号通路分析显示,该蛋白集合主要富集于破骨细胞分化代谢、Wnt信号通路、T细胞受体信号通路、B细胞受体信号通路等。结论:NFATc1及其相关蛋白生物学功能具有广泛性,其原因可能与参与多种细胞信号转导通路相关。

基于非靶向代谢组学的蜘蛛香不同部位差异代谢物分析

目的:研究蜘蛛香不同部位的代谢物差异,促进蜘蛛香资源的综合利用。方法:利用非靶向代谢组学技术,对蜘蛛香的根茎、根和叶3个部位的代谢物进行差异性比较分析。结果:从蜘蛛香的根茎、根和叶中共鉴定出491个代谢物,主要代谢物有挥发油、多糖、氨基酸等。蜘蛛香根茎、根和叶中的代谢物差异显著,根与叶、根茎与叶、根与根茎之间的差异代谢物分别为145、109、122个,根茎和叶中含莪术烯醇、4-羟基肉桂酸、芥子酸胆碱、5-羟基-1-四氢萘酮、4-乙基苯甲醛、松脂醇4-O-β-D-吡喃葡萄糖苷和5-胸苷酸二钠盐较少,而根中较多;根和根茎中含茶碱、芹菜素和阿尔泊酚酸较少,而叶中较多。根茎、根和叶的差异代谢物主要富集在类苯丙酸生物合成通路,氨酰tRNA生物合成通路和丙氨酸、天冬氨酸与谷氨酸代谢通路。结论:蜘蛛香的根茎、根和叶中含有挥发油、多糖、氨基酸等大量的差异代谢物,研究结果可为蜘蛛香不同部位关键代谢物的挖掘和充分利用提供参考。

妊娠大鼠伴发脂质代谢紊乱的机制探讨及基因分析

目的:分析肠道菌群失调妊娠大鼠脂质代谢特征及可能机制。方法:将129只性成熟的雌性SD大鼠分为3组,未妊娠组(未经处理健康大鼠)、妊娠健康组(自然授精妊娠的大鼠)、妊娠菌群失调组(自然授精妊娠的大鼠经混合抗生素灌胃造模),每组43只。全自动生化分析仪检测甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-c)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-c)、总胆固醇(TC)含量。荧光定量PCR技术检测大鼠硬脂酰辅酶A去饱和酶1(SCD1)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ共激活因子1(PGC-1α)、磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(PEPCK)、载脂蛋白E(ApoE)、微粒体甘油三酸酯转移蛋白(MTTP)基因含量,比较3组各指标含量的统计学差异。回归分析的方法探索各基因对大鼠总胆固醇表达含量的综合影响,主成分分析的方法探索肠道菌群失调妊娠大鼠脂质代谢发生的内部机制。结果:各组大鼠进行TG、TC、LDL-c、HDL-c含量的比较,均有妊娠健康组>未妊娠组>妊娠菌群失调组,差异均有统计学意义(P<0.05)。各组大鼠相关基因(SCD1、PGC-1α、PEPCK、ApoE、MTTP)表达含量比较,差异均有统计学意义(P<0.05);两两组别比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。多元线性回归分析显示,各基因含量对TC含量的影响从大到小依次为:SCD1(OR=4.572)、PGC-1α(OR=3.387)、PEPCK(OR=3.935)、ApoE(OR=3.597)、MTTP(OR=3.096)。主成分分析显示,肠道菌群失调妊娠大鼠脂质代谢5个相关基因可提取3个主成分,分别是:SCD1/PEPCK通路(贡献率36.28%)、PGC-1α/ApoE通路(贡献率30.42%)、MTTP通路(贡献率15.37%)。结论:妊娠后大鼠血脂有明显升高,而肠道菌群失调则会导致血脂降低。肠道菌群失调妊娠大鼠发生脂质代谢紊乱主要与相关基因表达失常,进而影响SCD1/PEPCK、PGC-1α/ApoE、MTTP通路的功能有关。

非靶向代谢组学分析不同品种青花椒的化学成分差异

为深入探讨4个品种青花椒中代谢物的差异,本研究基于超高效液相色谱和质谱的非靶向代谢组学技术对其差异代谢物进行全面的鉴定,结合单变量统计分析和多元统计分析进行组间差异分析,筛选出差异代谢物,再通过聚类分析、相关性分析和KEGG数据库注释差异代谢物参与的代谢途径,从中筛选出关键代谢物。结果表明,共鉴定出正、负离子模式下差异显著的代谢物131个,其中正离子模式54种,负离子模式77种。对这些差异代谢物进行化学分类归属信息的统计后,发现占比最大的是有机酸及其衍生物(16.11%),其次是有机氧化合物(14.44%)。在正离子模式下,新舟青椒(Zb005)与峨眉山藤椒(Zb003)存在24种显著的差异代谢物,新舟青椒(Zb005)与遵义大木椒(Zb004)存在17种差异代谢物,新舟青椒(Zb005)与江口青椒(Zb0010)存在13种差异代谢物。对所有的差异代谢物进行筛选后,发现有7种共有的差异代谢物,分别为N-甲基酪胺、1-吲哚酮、茉莉内酯、樟脑、香叶木素、L-哌啶酸、半乳糖酸,这些代谢物的表达情况存在差异,显示与青花椒的品种密切相关。通过层次聚类热图对其进行分析,发现在3个比较组(Zb005 vs Zb003、Zb005 vs Zb004、Zb005 vs Zb0010)中,新舟青椒(Zb005)的含量表现出比其他几种青椒更高表达的化合物有4种(1-吲哚酮、樟脑、茉莉内酯和香叶木素),这可能是遵义本地青椒(新舟青椒)口感较其他几种青椒好的原因。

基于广泛靶向代谢组学的不同干燥方式丹参成分差异分析

为研究丹参不同干燥方式的代谢物差异及代谢机制,对新鲜丹参样品进行阴干、晒干、微波干燥、50℃烘干和70℃烘干等不同干燥处理,基于广泛靶向代谢组学方法,采用UPLC-MS/MS技术对丹参的代谢物进行系统分析。研究获得637种代谢物,不同干燥处理间总差异代谢物数量在142~237个,含量下调的代谢物在43~147个,含量上调的代谢物在50~118个,表明不同干燥方法间代谢物差异非常显著。对差异代谢物含量动态分布进行分析,筛选出了各组间含量变化最大的20个代谢物,利用KEGG数据库对其进行注释和通路富信分析,结果显示这些代谢物归属于代谢通路、次生代谢物合成、黄酮-黄酮醇合成等途径,这与丹参有效成分物质合成密切相关。从丹参中常见的几种水溶性成分(主要为酚酸类物质)含量变化情况看,阴干、晒干法和50℃烘干法丹酚酸含量高于微波干燥法;70℃烘干法丹酚酸含量高于晒干法;阴干、晒干和50℃烘干3种方法在丹酚酸含量方面无显著差异。

基于通路扰动相似性建模的抗类风湿关节炎药对分子协同组合发现及机制分析

目的类风湿关节炎(Rheumatoid Arthritis,RA)是一种发生在滑膜关节及其他器官系统的慢性进行性自身免疫性疾病,中医药治疗类风湿关节炎历史悠久,积累了丰富的临床应用经验,药对是中医临床遣药组方常用的配伍形式,如何从分子机制角度深入探索和发现药对中的不同成分之间的协同组合机制,目前还没有较为有效的定量研究方法。方法通过GEO差异基因分析筛选RA关键基因,并整合已知RA疾病相关靶点信息,利用STRING构建RA疾病PPI网络;选取两种经典药对:独活-桑寄生、黄柏-苍术,使用TCMID、ETCM数据库收集并整理两种药对的主要化学成分,预测并识别出药对中所有成分作用的潜在RA靶点;同时,提出基于通络扰动相似性的建模方法,挖掘药对中具有协同治疗作用的中药小分子组合,并对所作用靶点集进行GO功能注释与KEGG通路富集分析。结果通过GEO差异基因分析及TTD、DrugBank数据库收集与整理,共得到555个与RA相关的靶点基因;通过靶点预测与识别,获得独活-桑寄生药对53个成分及其作用的52个潜在RA靶点,黄柏-苍术药对得到32个成分及28个靶点;利用基于通路扰动相似性的计算方法,发现了独活-桑寄生中15对、黄柏-苍术中17对具有协同性的小分子组合。结论本文提出的基于通路扰动相似性的计算方法,能够阐明有效中药成分在治疗RA中存在的通路协同组合特征,从一个全新角度揭示了中药药对配伍的内在机制和规律,为后续深入研究打下扎实的基础。

miR-221-3p在PTC中的表达及对BCPAP细胞增殖、凋亡的影响与KEGG、GO分析

目的:观察miR-221-3p在乳头状甲状腺癌(PTC)中的表达,分析其与分期、转移的关系,瞬时转染miR-221-3p inhibitor观察其对PTC细胞BCPAP的增殖和凋亡的影响,生物信息学方法分析miR-221-3p可能作用的靶基因、参与的通路及功能.方法:(1)原位杂交法(ISH)检测PTC、滤泡状甲状腺癌(FTC)与正常甲状腺组织中miR-221-3p的表达.(2)miR-221-3p inhibitor瞬时转染BCPAP细胞后与阴性对照组比较,实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)法、噻唑蓝(MTT)法、Annexin V-FITC/PI流式法分别检测两组细胞miR-221-3p表达、细胞增殖、凋亡情况.(3)软件预测miR-221-3p的靶基因,进行KEGG及GO富集分析.结果:(1)ISH显示PTC组织中miR-221-3p表达明显上调,与FTC、正常甲状腺组织相比差异有统计学意义(P<0.01);(2)miR-221-3p inhibitor转染细胞后,细胞miR-221-3p表达下降;细胞增殖减慢,细胞凋亡无明显改变.(3)在PTC中,KEGG分析显示miR-221-3p的靶基因参与了Wnt signaling pathway、Pathways in cancer等通路,GO分析显示miR-221-3p具有细胞代谢调控、基因表达调控、RNA代谢调控等生物功能.结论:miR-221-3p在PTC中表达明显上调,可能成为PTC的一种标志物,可能有影响PTC细胞增殖的作用,参与了Wnt signaling pathway、Pathways in cancer等通路,对PTC细胞的代谢、基因表达等功能具有重要影响.

奶牛分娩前后瘤胃代谢物变化规律及其代谢通路研究

本试验旨在阐明奶牛分娩前后瘤胃代谢物及其代谢通路的变化规律。选取10头体况和胎次相近的健康待产荷斯坦奶牛,分别于分娩前后晨饲前采集瘤胃液,采用UPLC-MS/MS代谢组学技术和MetaboAnanlyst 5.0中的通路分析方法研究奶牛分娩前后瘤胃发酵产物及其代谢通路的变化规律。结果表明,奶牛分娩后瘤胃中57种代谢物含量较分娩前发生了明显变化,其中34种代谢物含量显著降低,23种代谢物含量显著升高,9个代谢通路(牛磺酸和亚牛磺酸代谢、精氨酸和脯氨酸代谢、精氨酸的生物合成、D-谷氨酰胺和D-谷氨酸代谢、淀粉和蔗糖代谢、半乳糖代谢、丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢、嘌呤代谢和维生素B6代谢)发生了显著变化。本研究表明,奶牛在分娩前7~10 d与氨基酸、糖、核苷酸和维生素相关的瘤胃微生物菌群组成发生了应答性改变。