中国浙江地区儿童下呼吸道感染KI多瘤病毒的鉴定

KI polyomavirus,which was firstly discovered in 2007,is a new human polyomavirus belonging to Polyomaviridae and containing circular double-strand genomic DNA.This study was based on identification assay of KI polyomavirus reported.Total 2293 clinical sputum specimens from children under 3 years old were collected and screened from Wenzhou Medical College affiliated Wenling Hospital,Zhejiang Province.A KI polyomavirus was detected and identified,the positive rate was 0.04%.The sequences of PCR products was identical to that of the viral capsid protein(VP1) gene derived from KI polyomavirus.The results strongly suggested that the KI polyomavirus was found firstly in Chinese children with acute lower respiratory tract infections from Zhejiang region.This study provided new information for further investigation of etiopathogenisis and diagnosis in children with lower respiratory tract infections.

实时荧光PCR方法快速检测KI多瘤病毒

目的采用实时荧光PCR方法快速检测KI多瘤病毒(KIPy V),并与巢式PCR扩增法进行比较。方法收集2007年11月至2015年1月在福州市一家妇幼保健院因呼吸道感染住在儿科重症监护病房(PICU)的259例小儿鼻咽抽取物标本和另两家综合医院146例因严重急性呼吸道感染(SARI)住院的成年患者咽拭子标本,通过实时荧光PCR方法对KIPy V的调节区的基因片段进行检测。结果在小儿鼻咽抽取物标本中检测出3例KIPy V感染阳性病例,检测阳性率约为1.2%,而用巢式PCR扩增法只检测出1例,这例的Ct值较低,约为23,并且扩增曲线呈S型。其它两例的Ct值较高,分别约为33和35。在成年患者咽拭子标本中,用两种方法都未检测出KIPy V感染。在两例Ct值较高的小儿病例中,检测出混合有呼吸道合胞病毒(RSV)感染。结论确立的实时荧光PCR方法可以快速检测KIPy V,且特异性较高。

KI多瘤病毒全基因组序列测定和种系分析

目的了解KI多瘤病毒（karolinska institutet polyomavirus,KIPyV）在我国福州儿童呼吸道感染中的检出情况及与呼吸道疾病的关系,并对毒株进行全基因组序列测定和种系分析。方法收集2007年11月~2014年3月在福建省福州市妇幼保健院因呼吸道感染住院的重症监护病房（PICU）的235例小儿鼻咽抽取物样本,通过巢式PCR扩增法用2对特异引物对KIPyV的VP1基因片段进行检测。对检测出的1株KIPyV（FZ52）用4对全基因序列引物进行扩增和拼接,获得该株病毒的全基因组序列,上传GenBank并与基因库中国外其他8株KIPyV的全基因组序列和氨基酸序列进行比对,并做种系分析。结果从中发现1例KIPyV感染阳性病例,检测阳性率为0.4%,没有检测出KIPyV与其他呼吸道病毒的混合感染,如甲、乙型流感病毒（influenza type A or B virus,Flu A or B）、呼吸道合胞病毒（respiratory syncytial virus,RSV）、人偏肺病毒（human metapnumovirus,HMPV）、人博卡病毒（human bocavirus,HBoV）、WU多瘤病毒（WU polyomavirus,WUPyV）等。与参考株斯德哥尔摩的S60相比,有8个核苷酸不同,推导出的氨基酸序列有3处不同。同时,也将该序列与国内毒株的部分核苷酸序列进行比对分析。FZ52株与斯德哥尔摩的S380株关系较近,FZ52株、S380株与聚成一簇的S350株和布里斯班的B003株关系较近。结论种系分析显示中国福建福州的FZ52株与瑞典的S380株关系最近。

人类WU／KI多瘤病毒研究现状

WU／KI多瘤病毒于2007年首次在呼吸道分泌物中发现后，世界各地相继有检出阳性的报道，近年来我国浙江、深圳等地区亦有检出，但是国内关于这两种病毒的研究不多。WU／KI多瘤病毒均属于多瘤病毒属，感染多发生在儿童早期，其季节分布各地报道不一，临床多表现为发热、咳嗽、喘息等呼吸道症状，无特异性，且常同其他呼吸道病毒混合感染。WU／KI多瘤病毒在免疫缺陷患者中感染率较高，HIV患者感染后可能会导致重症疾病，但对于两种多瘤病毒的发病机制、致病特点等目前尚不清楚，故其是否是呼吸道致病原还存有争议。

天津地区KI和WU多瘤病毒在儿童急性呼吸道感染中的分子流行病学研究

目的了解KI和WU多瘤病毒(KIPy V和WUPy V)与天津地区儿童急性呼吸道感染的关系。方法采用PCR扩增方法对2011年1月至2013年12月收集的3 730份来自天津地区的急性呼吸道感染患儿鼻咽分泌物标本进行KIPy V和WUPy V基因检测,同时所有标本均用直接免疫荧光法检测7种常见呼吸道病毒。选取部分KIPy V和WUPy V PCR阳性产物进行测序,利用测序序列与已知序列比对并绘制进化树。再从中选取两株KIPy V VP1基因克隆到T载体上,进行序列测定和分析,并将核苷酸序列提交Gen Bank。结果 3 730份标本中,KIPy V阳性检出453份(12.14%),WUPy V阳性检出63份(1.69%)。KIPy V平均感染率在6~7月明显偏高,WUPy V平均感染率在2~3月达到一个小高峰。两种多瘤病毒感染的阳性患儿年龄主要集中在3岁以内。KIPy V和WUPy V与其他7种呼吸道病毒存在混合感染,混合感染率为2.31%(86/3 730);WUPy V和KIPy V混合感染9份。选取的35份KIPy V阳性PCR产物序列与Gen Bank已公布的KIPy V序列的同源性在94%~100%之间;选取的12份WUPy V阳性PCR产物序列与Gen Bank已公布的WUPy V序列的同源性在95%~100%之间。两株KIPy V VP1基因序列已被Gen Bank收录,登录号为KY465925和KY465926。结论天津地区部分儿童的急性呼吸道感染可能与WUPy V和KIPy V感染相关。KIPy V感染多发于夏季,WUPy V感染多发于春季。KIPy V和WUPy V与国内外流行株间差异较小,基因组相对稳定。