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非洲猪瘟病毒P22蛋白的生物信息学分析
1
作者
杨芸芸
蔡海情
+7 位作者
冯轶
刘馨
张黔东
袁阳
王微
张人俊
张霞
文明
《贵州畜牧兽医》
2023年第2期50-55,共6页
为了对靶向研制非洲猪瘟病毒(ASFV)疫苗提供理论参考依据,利用NCBI数据库及相关软件对该病毒KP177R基因编码的P22蛋白进行理化性质、疏水性、抗原性和抗原决定簇、信号肽和跨膜结构域、高级结构、磷酸化和糖基化位点进行分析和预测。结...
为了对靶向研制非洲猪瘟病毒(ASFV)疫苗提供理论参考依据,利用NCBI数据库及相关软件对该病毒KP177R基因编码的P22蛋白进行理化性质、疏水性、抗原性和抗原决定簇、信号肽和跨膜结构域、高级结构、磷酸化和糖基化位点进行分析和预测。结果:P22蛋白为亲水性不稳定蛋白,存在跨膜结构域,不含信号肽;P22蛋白的抗原指数为0.578 6,有7个B细胞优势抗原表位,具有良好的免疫原性;该基因表达蛋白的结构元件主要为α螺旋、β转角、延伸链和无规则卷曲等构成,抗原性及氨基酸表面可及性较好;取阈值0.481 6时位于113处的丝氨酸存在1个N-糖基化位点,阈值为0.5时第7、9、55、76、79、119、136位氨基酸处有磷酸化位点。结论:P22蛋白是不稳定、没有信号肽的跨膜亲水蛋白,为可能抗原且具有7个抗原决定簇,无规则卷曲在高级结构中含量最高,同时拥有多个磷酸化位点和1个糖基化位点。
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关键词
非洲猪瘟病毒
kp177r基因
P22蛋白
生物信息学分析
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职称材料
题名
非洲猪瘟病毒P22蛋白的生物信息学分析
1
作者
杨芸芸
蔡海情
冯轶
刘馨
张黔东
袁阳
王微
张人俊
张霞
文明
机构
贵州大学动物科学学院
贵州省动物疫病与兽医公共卫生重点实验室
贵州省动物疫病预防控制中心
出处
《贵州畜牧兽医》
2023年第2期50-55,共6页
基金
“基于蒙特卡洛技术的规模养殖场非洲猪瘟定量风险评估模型构建与示范应用”贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2021]YB163号)。
文摘
为了对靶向研制非洲猪瘟病毒(ASFV)疫苗提供理论参考依据,利用NCBI数据库及相关软件对该病毒KP177R基因编码的P22蛋白进行理化性质、疏水性、抗原性和抗原决定簇、信号肽和跨膜结构域、高级结构、磷酸化和糖基化位点进行分析和预测。结果:P22蛋白为亲水性不稳定蛋白,存在跨膜结构域,不含信号肽;P22蛋白的抗原指数为0.578 6,有7个B细胞优势抗原表位,具有良好的免疫原性;该基因表达蛋白的结构元件主要为α螺旋、β转角、延伸链和无规则卷曲等构成,抗原性及氨基酸表面可及性较好;取阈值0.481 6时位于113处的丝氨酸存在1个N-糖基化位点,阈值为0.5时第7、9、55、76、79、119、136位氨基酸处有磷酸化位点。结论:P22蛋白是不稳定、没有信号肽的跨膜亲水蛋白,为可能抗原且具有7个抗原决定簇,无规则卷曲在高级结构中含量最高,同时拥有多个磷酸化位点和1个糖基化位点。
关键词
非洲猪瘟病毒
kp177r基因
P22蛋白
生物信息学分析
分类号
S858.28 [农业科学—临床兽医学]
Q7 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
非洲猪瘟病毒P22蛋白的生物信息学分析
杨芸芸
蔡海情
冯轶
刘馨
张黔东
袁阳
王微
张人俊
张霞
文明
《贵州畜牧兽医》
2023
0
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