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非洲猪瘟病毒P22蛋白的生物信息学分析
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作者 杨芸芸 蔡海情 +7 位作者 冯轶 刘馨 张黔东 袁阳 王微 张人俊 张霞 文明 《贵州畜牧兽医》 2023年第2期50-55,共6页
为了对靶向研制非洲猪瘟病毒(ASFV)疫苗提供理论参考依据,利用NCBI数据库及相关软件对该病毒KP177R基因编码的P22蛋白进行理化性质、疏水性、抗原性和抗原决定簇、信号肽和跨膜结构域、高级结构、磷酸化和糖基化位点进行分析和预测。结... 为了对靶向研制非洲猪瘟病毒(ASFV)疫苗提供理论参考依据,利用NCBI数据库及相关软件对该病毒KP177R基因编码的P22蛋白进行理化性质、疏水性、抗原性和抗原决定簇、信号肽和跨膜结构域、高级结构、磷酸化和糖基化位点进行分析和预测。结果:P22蛋白为亲水性不稳定蛋白,存在跨膜结构域,不含信号肽;P22蛋白的抗原指数为0.578 6,有7个B细胞优势抗原表位,具有良好的免疫原性;该基因表达蛋白的结构元件主要为α螺旋、β转角、延伸链和无规则卷曲等构成,抗原性及氨基酸表面可及性较好;取阈值0.481 6时位于113处的丝氨酸存在1个N-糖基化位点,阈值为0.5时第7、9、55、76、79、119、136位氨基酸处有磷酸化位点。结论:P22蛋白是不稳定、没有信号肽的跨膜亲水蛋白,为可能抗原且具有7个抗原决定簇,无规则卷曲在高级结构中含量最高,同时拥有多个磷酸化位点和1个糖基化位点。 展开更多
关键词 非洲猪瘟病毒 kp177r基因 P22蛋白 生物信息学分析
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