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柯乐猪KRT10基因多态性及其与繁殖性状的关联分析
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作者 赵永 杨齐心 +6 位作者 李维 熊力 杨红文 王春源 吴燕 向进 张依裕 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期2508-2516,共9页
【目的】研究角蛋白10(keratin 10,KRT10)基因多态性对柯乐猪繁殖性状的影响,以提高柯乐猪的繁殖力。【方法】以255头柯乐猪为研究对象,采用PCR产物测序、DANMAN序列比对软件及人工校对相结合的方法鉴定KRT10基因单核苷酸多态性(single ... 【目的】研究角蛋白10(keratin 10,KRT10)基因多态性对柯乐猪繁殖性状的影响,以提高柯乐猪的繁殖力。【方法】以255头柯乐猪为研究对象,采用PCR产物测序、DANMAN序列比对软件及人工校对相结合的方法鉴定KRT10基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点,利用SHEsis在线软件分析SNP位点的群体遗传特性,通过RNAfold在线工具对SNP位点进行生物信息学分析,使用SPSS 22.0软件中的一般线性模型分析KRT10基因SNP位点与柯乐猪繁殖性状的关联性。【结果】在柯乐猪KRT10基因中共鉴定到3个SNPs位点:第4内含子的g.21643703 C>T和g.21643714 G>A;第5外显子的g.21643741 G>A。g.21643741 G>A突变导致密码子由AAG突变为AAA,编码氨基酸均为赖氨酸(K),为同义突变,引起编码的mRNA二级结构发生改变。3个SNPs位点均检测到3种基因型,g.21643703 C>T和g.21643741 G>A属于中度多态位点(0.25A)属于低度多态位点(PIC<0.25)。g.21643703 C>T和g.21643741 G>A位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),g.21643714 G>A位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05);3个SNPs位点间均不存在强连锁不平衡。KRT10基因3个SNPs位点共产生4种单倍型和10种双倍型。关联分析结果表明,g.21643703 C>T位点对柯乐猪初生窝重、断奶仔数和断奶窝重的影响均达到显著水平(P<0.05);g.21643714 G>A位点对柯乐猪总产仔数和断奶窝重的影响均达到显著水平(P<0.05);g.21643741 G>A位点对柯乐猪总产仔数、产活仔数、断奶仔数和断奶窝重的影响均达到显著水平(P<0.05)。双倍型H3H3对柯乐猪总产仔数、产活仔数、断奶仔数和断奶窝重的影响最明显。【结论】KRT10基因中存在的3个SNPs位点对柯乐猪繁殖性状有显著影响,其中H3H3为有利双倍型,可作为柯乐猪繁殖性状选择的遗传标记。 展开更多
关键词 柯乐猪 krt10基因 单核苷酸多态性(SNP) 繁殖性状
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先天性大疱性鱼鳞病样红皮病一例KRT1及KRT10基因突变检测 被引量:1
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作者 于学萍 孙勇虎 +3 位作者 施仲香 周桂芝 刘红 张福仁 《中国麻风皮肤病杂志》 2021年第3期140-142,共3页
目的:对先天性大疱性鱼鳞病样红皮病一例散发患者进行KRT1及KRT10基因的突变分析。方法:收集临床资料,提取外周血DNA,采用PCR技术扩增KRT1及KRT10基因的编码区及侧翼序列,用Sanger法测序检测潜在的基因突变,选取与患者无亲缘关系的100... 目的:对先天性大疱性鱼鳞病样红皮病一例散发患者进行KRT1及KRT10基因的突变分析。方法:收集临床资料,提取外周血DNA,采用PCR技术扩增KRT1及KRT10基因的编码区及侧翼序列,用Sanger法测序检测潜在的基因突变,选取与患者无亲缘关系的100名健康人作为对照。结果:该患者KRT10检测出第1号外显子中第467位碱基发生G→A杂合突变(c.467G>A),导致其编码的第156号氨基酸发生错义突变(p.R156H)。患者父母及正常对照均未发现该突变。KRT1基因未检测到突变。结论:KRT10基因的错义突变c.467G>A可能与该患者发病有关。 展开更多
关键词 先天性大疱性鱼鳞病样红皮病 krt10基因 突变
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ELISA检测KRT10_C和COL6A3_C短肽抗体的方法建立及作为RA诊断的应用价值 被引量:1
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作者 周莹 管晓龙 +2 位作者 李晓军 虞伟 管世鹤 《现代检验医学杂志》 CAS 2020年第1期1-4,12,共5页
目的建立角蛋白I型细胞骨架10[keratin type I cytoskeletal 10,KRT10)和VI型胶原蛋白A3[collagen alpha-3(VI)chain,COL6A3]短肽抗体的ELISA检测方法,并探讨两种瓜氨酸化短肽抗体在类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)实验室诊断中... 目的建立角蛋白I型细胞骨架10[keratin type I cytoskeletal 10,KRT10)和VI型胶原蛋白A3[collagen alpha-3(VI)chain,COL6A3]短肽抗体的ELISA检测方法,并探讨两种瓜氨酸化短肽抗体在类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)实验室诊断中的价值。方法以合成短肽为包被抗原,抗人IgA,IgG及IgM为二抗,检测100例抗瓜氨酸化蛋白抗体(anti-citrullinated protein antibodies,ACPA)阳性组、100例健康对照组和29例RA确诊患者血清中的KRT10,KRT10_C,COL6A3及COL6A3_C短肽抗体水平,比较不同短肽抗体与RA的相关性,采用ROC曲线分析KRT10_C和COL6A3_C短肽抗体对于RA的诊断价值,并对此ELISA方法进行精密度评价。结果与临床诊断相比,KRT10_C短肽抗体诊断RA的灵敏度为58.62%,特异度为52.17%,用于诊断抗CCP抗体阳性RA患者的ROC曲线下面积达0.895;COL6A3_C短肽抗体诊断RA的灵敏度为65.52%,特异度为78.95%,用于诊断抗CCP抗体阴性的RA患者的ROC曲线下面积可达0.956。ELISA检测值KRT10_C(以抗人IgG为二抗)的批内变异系数分别为11.2%(低值)、7.8%(中值)和6.7%(高值)。ELISA检测COL6A3_C(以抗人IgM为二抗)的批内变异系数分别为12.9%(低值)、8.4%(中值)和8.9%(高值)。结论KRT10_C和COL6A3_C短肽抗体对RA诊断具有重要意义,有望加入并完善实验室诊断体系,提高RA的早期诊断率。 展开更多
关键词 类风湿关节炎 角蛋白I型细胞骨架10(krt10)_C短肽抗体 VI型胶原蛋白A3(COL6A3)_C短肽抗体 酶联免疫吸附试验检测
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先天性大疱性鱼鳞病样红皮病角蛋白10的新发突变 被引量:2
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作者 王建才 林志淼 +3 位作者 马志红 谭燕红 马琳 杨勇 《中国麻风皮肤病杂志》 2010年第8期549-551,共3页
目的:检测1例先天性大疱性鱼鳞病样红皮病患者KRT1和KRT10基因突变。方法:提取患者及其家人外周血DNA,PCR扩增KRT1和KRT10基因编码区的全部外显子及其侧翼序列并测序,以100名正常人作对照。结果:该患者KRT10基因第1号外显子中的第466位... 目的:检测1例先天性大疱性鱼鳞病样红皮病患者KRT1和KRT10基因突变。方法:提取患者及其家人外周血DNA,PCR扩增KRT1和KRT10基因编码区的全部外显子及其侧翼序列并测序,以100名正常人作对照。结果:该患者KRT10基因第1号外显子中的第466位碱基发生C→T杂合突变(c.C466T),导致其编码第156位氨基酸发生错义突变(p.R156C),患者父母、妹妹及正常对照均未发现该突变,提示其为新发突变。结论:KRT10基因的c.C466T错义突变可能为引起该患者临床表型的病因。 展开更多
关键词 先天性大疱性鱼鳞病样红皮病 krt10基因 基因突变
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角蛋白10突变致先天性大疱性鱼鳞病样红皮病1例 被引量:1
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作者 甘奕传 张三泉 +4 位作者 黎小东 薛如君 傅怡丹 罗标益 李薇 《皮肤性病诊疗学杂志》 2022年第6期532-536,共5页
目的检测1例先天性大疱性鱼鳞病样红皮病(BCIE)患者KRT1和KRT10基因突变。方法提取患者及其家人外周血DNA,PCR扩增KRT1和KRT10基因编码区的全部外显子及其侧翼序列并测序,检测潜在的基因突变。结果该患者KRT10基因第1号外显子中的第467... 目的检测1例先天性大疱性鱼鳞病样红皮病(BCIE)患者KRT1和KRT10基因突变。方法提取患者及其家人外周血DNA,PCR扩增KRT1和KRT10基因编码区的全部外显子及其侧翼序列并测序,检测潜在的基因突变。结果该患者KRT10基因第1号外显子中的第467位碱基发生G→A杂合突变(c.467G>A),导致其编码的第156号氨基酸发生错义突变(p.Arg156His),患者父亲、母亲、姐姐均未发现该突变。患者及其母亲第7号外显子中的1654~1683位点发生重复突变,即NM_000421.5:c.1654_1683dup,该突变导致其编码的556至565位的氨基酸发生甘氨酸重复(p.Gly556_Gly565dup),该突变呈杂合状态,患者父亲、姐姐均未发现该突变,提示其为新发突变。KRT1基因未检测到突变。结论KRT10基因的c.467G>A错义突变是本例BCIE的致病原因,NM_000421.5:c.1654_1683dup重复突变可能不会导致BCIE。 展开更多
关键词 先天性大疱性鱼鳞病样红皮病 krt10基因 基因突变
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表皮松解性角化过度鱼鳞病一例 被引量:1
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作者 盖晓磊 左亚刚 曾跃平 《实用皮肤病学杂志》 2020年第1期53-55,共3页
5岁女性患儿,全身皮肤潮红5年,出现干燥及角化增厚4年。皮损组织病理示:表皮显著角化过度,颗粒层细胞内见不规则的透明角质颗粒呈空泡样变性改变,棘层不规则增厚,真皮浅层血管周围少量炎性细胞浸润。基因突变检测示KRT10位点突变,基因... 5岁女性患儿,全身皮肤潮红5年,出现干燥及角化增厚4年。皮损组织病理示:表皮显著角化过度,颗粒层细胞内见不规则的透明角质颗粒呈空泡样变性改变,棘层不规则增厚,真皮浅层血管周围少量炎性细胞浸润。基因突变检测示KRT10位点突变,基因编码区478号碱基由T变为A。诊断:表皮松解性角化过度鱼鳞病。给予局部外用0.1%维A酸乳膏每日2次及皮肤保湿剂治疗,40 d复诊时皮损明显好转,全身皮肤基本正常。 展开更多
关键词 鱼鳞病 表皮松解性 角化过度 角蛋白10基因
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Clinical and genetic findings in 13 Chinese children with keratinopathic ichthyosis
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作者 Zhou Yang Zhe Xu +3 位作者 Rui He Xin Xiang Bin Zhang Lin Ma 《Pediatric Investigation》 CAS CSCD 2023年第3期168-176,共9页
Importance:Keratinopathic ichthyosis(KPI)represents a group of predominantly autosomal dominant genodermatoses resulting from mutations in the KRT1,KRT2,or KRT10 genes.In KPI,the relationship between genotype and phen... Importance:Keratinopathic ichthyosis(KPI)represents a group of predominantly autosomal dominant genodermatoses resulting from mutations in the KRT1,KRT2,or KRT10 genes.In KPI,the relationship between genotype and phenotype is complex.Objective:To analyze the clinical manifestations and gene mutations in Chinese patients with KPI.Methods:Clinical data were collected from 13 children diagnosed with KPI,and peripheral blood DNA samples were extracted from both the patients and their parents Next-generation sequencing was performed using a congenital ichthyosis multi-gene panel,and the selected variants in the patients and their parents were further validated using the Sanger sequencing method.Results:Genetic analysis identified missense mutations in either KRT1 or KRT10 in ten patients exhibiting varying degrees of severity and distinct features of epidermolytic ichthyosis.A missense hotspot mutation in KRT2 was identified in one patient with superficial epidermolytic ichthyosis.Additionally,two truncation mutations in KRT10 were detected,leading to the development of generalized ichthyosiform erythroderma.Ear malformation and ectropion at birth,scalp involvement,and palmoplantar hyperkeratosis were observed as early signs of ichthyosis with confetti.Interpretation:We analyzed the genotype-phenotype correlations in KPI,revealing that the types and locations of different mutations are associated with distinct phenotypic characteristics.Oral acitretin could be considered a treatment option for severe patients at an appropriate dosage and timing. 展开更多
关键词 Epidermolytic ichthyosis Ichthyosis with confetti Keratinopathic ichthyosis KRT1 krt10 KRT2
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先天性大疱性鱼鳞病样红皮病基因突变检测 被引量:1
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作者 张士德 刘晶晶 +2 位作者 田伟 赵正娟 赵敬军 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期421-423,共3页
目的研究1例先天性大疱性鱼鳞病样红皮病散发患者的基因突变情况,探讨基因型与表现型的相关性。方法应用聚合酶链反应扩增KRT1和KRT10基因的热点突变区,通过DNA直接测序的方法,对先天性大疱性鱼鳞病样红皮病患者、家系中的正常成员... 目的研究1例先天性大疱性鱼鳞病样红皮病散发患者的基因突变情况,探讨基因型与表现型的相关性。方法应用聚合酶链反应扩增KRT1和KRT10基因的热点突变区,通过DNA直接测序的方法,对先天性大疱性鱼鳞病样红皮病患者、家系中的正常成员和50名无亲缘关系的正常个体的KRT1和KRT10基因进行突变检测。结果在患者KRT10基因的第1外显子上发现了1个错义突变(467G→A),导致角蛋白10(KRT10)1A区的精氨酸由组氨酸替代(R156H),而家系正常成员和无亲缘关系的50名正常对照中均未发现该突变。结论KRT10基因第1外显子突变(467G→A)在该例先天性大疱性鱼鳞病样红皮病患病的分子机制中发挥重要作用。 展开更多
关键词 先天性大疱性鱼鳞病样红皮病 krt10基因 基因突变
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新一代测序技术确诊一例先天性大疱性鱼鳞病样红皮病
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作者 律玉强 史传奎 +2 位作者 张开慧 高敏 刘毅 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2018年第3期434-436,共3页
目的对1例疑诊为先天性大疱性鱼鳞病样红皮病的患儿进行临床及遗传学分析。方法对患儿进行临床检查,并应用新一代测序技术对其进行分析。结果患儿自出生即有躯干及四肢的红斑和水泡,之后发展为角化过度。基因测序发现其KRT10基因存在... 目的对1例疑诊为先天性大疱性鱼鳞病样红皮病的患儿进行临床及遗传学分析。方法对患儿进行临床检查,并应用新一代测序技术对其进行分析。结果患儿自出生即有躯干及四肢的红斑和水泡,之后发展为角化过度。基因测序发现其KRT10基因存在新生突变C.482T〉G(p.L161W),既往未见报道。结论确诊了1例由KRT10基因突变所致的先天性大疱性鱼鳞样红皮病。 展开更多
关键词 先天性大疱性鱼鳞样红皮病 krt10基因 新一代测序技术
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