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佛山市南海区鼠类自然感染恙虫病东方体基因型分析
1
作者
罗琳
李鹏宾
+4 位作者
苏彦
张彦丽
柯志攀
张佳惠
邱宗耀
《医学动物防制》
2024年第2期130-134,共5页
目的 调查佛山市南海区鼠类自然感染恙虫病东方体(Orientia tsutsugamushi, Ot)的情况,了解当地Ot基因型的分布及特点,为防控恙虫病提供科学依据。方法 2017年7月利用鼠夹和鼠笼,在佛山市南海区恙虫病高发镇街采集鼠类动物样本,应用巢...
目的 调查佛山市南海区鼠类自然感染恙虫病东方体(Orientia tsutsugamushi, Ot)的情况,了解当地Ot基因型的分布及特点,为防控恙虫病提供科学依据。方法 2017年7月利用鼠夹和鼠笼,在佛山市南海区恙虫病高发镇街采集鼠类动物样本,应用巢式聚合酶链反应(nested polymearse chain reaction, nPCR)扩增技术检测Ot 56kDa型特异性抗原(type-specific antigen, TSA)基因核酸片段,通过核酸序列比对确定Ot基因分型。用MEGA 10.0.5、DNAStar 7.1、MegAlign等生物信息学软件进行同源性与遗传进化分析。结果 共捕获鼠类200只,褐家鼠检出56kDa TSA基因片段6份,黄胸鼠检出1份,阳性率为3.5%(7/200)。南海序列(L65、L68、L118、L119、L122、L150和L153)在核苷酸水平与Kawasaki、Gilliam、TA763、Kato、Kuroki、Karp基因型相似性为71.8%~100.0%,氨基酸水平相似性为54.9%~100.0%。同源性和系统进化分析表明,南海序列与Ot中的Karp型具有较高的同源性和较近的亲缘关系,与其他型同源性较低,亲缘关系较远。L65、L119、L150和L153与台湾TW45R株、云南TN16-28株的核苷酸同源性为100.0%。结论 佛山市南海区存在鼠类Ot自然感染,褐家鼠为其主要宿主,当地恙虫病病原体属于Karp型。
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关键词
恙虫病东方体
56kDa
型
特异性抗原
自然感染
系统进化分析
karp
基因
型
原文传递
新疆部分地区人群及动物感染恙虫病东方体调查
被引量:
5
2
作者
任立松
党荣理
+2 位作者
马德新
高金拽
刘小明
《热带医学杂志》
CAS
2012年第10期1249-1251,1257,共4页
目的调查新疆部分地区人群及动物感染恙虫病东方体(Ot)情况,并对媒介昆虫进行调查。方法采用多种方法捕获可能感染Ot动物取脾,当地牧民静脉取血,从野鼠体表捕获恙螨,用试剂盒提取DNA,应用巢式PCR(nPCR)检测Ot-Sta56基因;接种昆明小白鼠...
目的调查新疆部分地区人群及动物感染恙虫病东方体(Ot)情况,并对媒介昆虫进行调查。方法采用多种方法捕获可能感染Ot动物取脾,当地牧民静脉取血,从野鼠体表捕获恙螨,用试剂盒提取DNA,应用巢式PCR(nPCR)检测Ot-Sta56基因;接种昆明小白鼠进行Ot病原传代分离。结果共采取人群血液2430份,在6份血液中检测并分离到Ot;捕获动物13种5783个(只),从5种啮齿动物(小家鼠、灰仓鼠、大砂土鼠、草原兔尾鼠、灰旱獭)、2种鸟类(麻雀、灰腹鹡鸰)的脾中检测并分离到Ot,从绵羊血液中检测到Ot。其他动物体内未检测到Ot。从野鼠体表分离恙螨5种,从博乐纤恙螨体内检测分离到Ot。基因序列分析表明,新疆地区存在恙虫病东方体的基因型以Karp型为主,可能存在Saitama型。结论新疆地区存在人群及动物感染Ot,其基因型以Karp为主,可能存在Saitama型。
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关键词
恙虫病东方体
巢式PCR
karp型
原文传递
题名
佛山市南海区鼠类自然感染恙虫病东方体基因型分析
1
作者
罗琳
李鹏宾
苏彦
张彦丽
柯志攀
张佳惠
邱宗耀
机构
佛山市南海区疾病预防控制中心
出处
《医学动物防制》
2024年第2期130-134,共5页
基金
广东省卫生计生委关于印发2018年省级财政补助疾病预防控制类项目实施方案和工作任务表的通知(粤卫函[2018]581号)
佛山市医学类科技攻关项目(2017AB000132)
佛山市南海区“十四五”医学特色专科建设项目(2022)。
文摘
目的 调查佛山市南海区鼠类自然感染恙虫病东方体(Orientia tsutsugamushi, Ot)的情况,了解当地Ot基因型的分布及特点,为防控恙虫病提供科学依据。方法 2017年7月利用鼠夹和鼠笼,在佛山市南海区恙虫病高发镇街采集鼠类动物样本,应用巢式聚合酶链反应(nested polymearse chain reaction, nPCR)扩增技术检测Ot 56kDa型特异性抗原(type-specific antigen, TSA)基因核酸片段,通过核酸序列比对确定Ot基因分型。用MEGA 10.0.5、DNAStar 7.1、MegAlign等生物信息学软件进行同源性与遗传进化分析。结果 共捕获鼠类200只,褐家鼠检出56kDa TSA基因片段6份,黄胸鼠检出1份,阳性率为3.5%(7/200)。南海序列(L65、L68、L118、L119、L122、L150和L153)在核苷酸水平与Kawasaki、Gilliam、TA763、Kato、Kuroki、Karp基因型相似性为71.8%~100.0%,氨基酸水平相似性为54.9%~100.0%。同源性和系统进化分析表明,南海序列与Ot中的Karp型具有较高的同源性和较近的亲缘关系,与其他型同源性较低,亲缘关系较远。L65、L119、L150和L153与台湾TW45R株、云南TN16-28株的核苷酸同源性为100.0%。结论 佛山市南海区存在鼠类Ot自然感染,褐家鼠为其主要宿主,当地恙虫病病原体属于Karp型。
关键词
恙虫病东方体
56kDa
型
特异性抗原
自然感染
系统进化分析
karp
基因
型
Keywords
Orientia tsutsugamushi
56kDa type-specific antigen
Natural infection
Phylogenetic analysis
karp
genotype
分类号
R513.2 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
新疆部分地区人群及动物感染恙虫病东方体调查
被引量:
5
2
作者
任立松
党荣理
马德新
高金拽
刘小明
机构
新疆军区疾病预防控制中心
出处
《热带医学杂志》
CAS
2012年第10期1249-1251,1257,共4页
基金
总后卫生部"十一五"第二批基金(08G014)
文摘
目的调查新疆部分地区人群及动物感染恙虫病东方体(Ot)情况,并对媒介昆虫进行调查。方法采用多种方法捕获可能感染Ot动物取脾,当地牧民静脉取血,从野鼠体表捕获恙螨,用试剂盒提取DNA,应用巢式PCR(nPCR)检测Ot-Sta56基因;接种昆明小白鼠进行Ot病原传代分离。结果共采取人群血液2430份,在6份血液中检测并分离到Ot;捕获动物13种5783个(只),从5种啮齿动物(小家鼠、灰仓鼠、大砂土鼠、草原兔尾鼠、灰旱獭)、2种鸟类(麻雀、灰腹鹡鸰)的脾中检测并分离到Ot,从绵羊血液中检测到Ot。其他动物体内未检测到Ot。从野鼠体表分离恙螨5种,从博乐纤恙螨体内检测分离到Ot。基因序列分析表明,新疆地区存在恙虫病东方体的基因型以Karp型为主,可能存在Saitama型。结论新疆地区存在人群及动物感染Ot,其基因型以Karp为主,可能存在Saitama型。
关键词
恙虫病东方体
巢式PCR
karp型
Keywords
Orientia tsutsugamushi
Nested polymerase chain reaction
karp
strain
分类号
R532.2 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
佛山市南海区鼠类自然感染恙虫病东方体基因型分析
罗琳
李鹏宾
苏彦
张彦丽
柯志攀
张佳惠
邱宗耀
《医学动物防制》
2024
0
原文传递
2
新疆部分地区人群及动物感染恙虫病东方体调查
任立松
党荣理
马德新
高金拽
刘小明
《热带医学杂志》
CAS
2012
5
原文传递
已选择
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