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High level of soluble expression and purification of catalytically active native UDP-galactose 4-epimerase of <i>Aeromonas hydrophila</i>in <i>E. coli</i> 被引量:2
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作者 Keshav Gopal Shivani Agarwal Aparna Dixit 《Advances in Bioscience and Biotechnology》 2011年第6期397-403,共7页
The ubiquitous Aeromonas hydrophila is responsible for several pathological conditions in fish and human. Like most gram negative bacteria, its virulence relies on outer membrane lipopolysachharide (LPS). The Leloir p... The ubiquitous Aeromonas hydrophila is responsible for several pathological conditions in fish and human. Like most gram negative bacteria, its virulence relies on outer membrane lipopolysachharide (LPS). The Leloir pathway enzyme UDP-galactose 4-epimerase (GalE), plays an important role in the LPS biosynthesis, and therefore is a potential drug target. We have earlier carried out extensive biochemical and biophysical studies with histidine-tagged recombinant GalE. However, for effective drug design it is desirable to understand the structure-function relation of a protein in its native form without any additional sequences or tags. In the present study, we report the high level expression, purification and characterization of recombinant GalE (rGalE) of Aeromonas hydrophila in its native form in E coli. The rGalE expressed as a soluble protein was purified to near homogeneity. From 1 L of shake flask culture ~15 mg of purified rGalE was obtained. The purified protein was biologically active with Km and Kcat values of 0.7 mM and 28.8 s–1, respectively. The enzyme exhibited a temperature and pH optima of 37。C and 7 - 9, respectively. Thus, the present study employed for soluble expression and purification of functionally active rGalE without any tag bypasses the need for cumbersome strategies associated with removal of tag from purified protein. 展开更多
关键词 Tag-Less GalE AEROMONAS HYDROPHILA Recombinant Expression kcat
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a-淀粉酶Amy7C及其突变体催化常数的定量预测
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作者 黄纪民 师德强 +5 位作者 严少敏 吴光 谢能中 龙思宇 李检秀 黄艳燕 《广西科学院学报》 2014年第4期294-298,共5页
【目的】利用α-淀粉酶Amy7c及其突变体的氨基酸信息,预测该酶的催化常数(Kcat),并筛选出能预测α-淀粉酶Kcat最具效果的氨基酸属性。【方法】先以20-1前馈反向传播的神经网络为模型,完成535种氨基酸属性对α-淀粉酶Amy7C及其突变体催... 【目的】利用α-淀粉酶Amy7c及其突变体的氨基酸信息,预测该酶的催化常数(Kcat),并筛选出能预测α-淀粉酶Kcat最具效果的氨基酸属性。【方法】先以20-1前馈反向传播的神经网络为模型,完成535种氨基酸属性对α-淀粉酶Amy7C及其突变体催化常数的拟合。再将α-淀粉酶Amy7C及其54个突变体的数据分为2组,用35个酶作为训练组进行拟合,20个酶作为验证组进行检验。最后,对8种不同层次及神经元个数的模型进行比较。【结果】110个氨基酸属性可实现20-1神经网络模型收敛,表明这些氨基酸属性可用于预测α-淀粉酶的催化常数,不同指标的预测效果不同。多模型的分析结果显示,不同模型对训练组R值的结果具有显著性差异,而对训练组P值、验证组R值和验证组P值结果无显著性差异。【结论】氨基酸分布概率等属性可以用于预测α-淀粉酶催化常数。四层神经网络模型是预测α-淀粉酶催化常数的相对理想的模型。 展开更多
关键词 氨基酸属性 a-淀粉酶 催化常数 预测
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改进的光照法研究Cu(Gly-Gly)·H_2O催化O·_2^-歧化反应动力学
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作者 自俊青 《大理师专学报》 2001年第1期70-71,共2页
采用本组自行改进的NBT(氮蓝四唑)光照法对PH=7.8的磷酸盐缓冲夜体系中一水合甘氨酰甘氨酸铜Cu(Gly-Gly)·Ho催化超氧阴离子自由基O·_(2)^(-)歧化反应进行了研究,求得不同温度下的催化反应速率常数Kcat、反应级数n、... 采用本组自行改进的NBT(氮蓝四唑)光照法对PH=7.8的磷酸盐缓冲夜体系中一水合甘氨酰甘氨酸铜Cu(Gly-Gly)·Ho催化超氧阴离子自由基O·_(2)^(-)歧化反应进行了研究,求得不同温度下的催化反应速率常数Kcat、反应级数n、活化能Ea及指前因子A。同时,研究结果进一步表明:经我们改进后的光照法,在测量精度方面确有很大改观,并可进行不同温度下的测定,显示出其独特的优越性。 展开更多
关键词 水合甘氨酰甘氨酸铜 氮蓝四唑光照法 超氧化物歧化酶 超氧阴离子自由基 歧化反应 Cu(Gly-Gly)·H2O O·^-2 速率常数(kcat) 动力学
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原玻璃蝇节杆菌D-氨基酸氧化酶及突变体的酶学特性 被引量:3
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作者 冯利伟 郭姣洁 +3 位作者 李辉欣 徐书景 鞠建松 赵宝华 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第8期897-904,共8页
【目的】研究原玻璃蝇节杆菌(DSM 20168)中D-氨基酸氧化酶的酶学特性。【方法】通过PCR从原玻璃蝇节杆菌(DSM 15035,20168)中克隆获得D-氨基酸氧化酶基因apdaao-1和apdaao-2,构建原核表达载体,以表达质粒pET-ApDAAO-2为模板,采用QuickCh... 【目的】研究原玻璃蝇节杆菌(DSM 20168)中D-氨基酸氧化酶的酶学特性。【方法】通过PCR从原玻璃蝇节杆菌(DSM 15035,20168)中克隆获得D-氨基酸氧化酶基因apdaao-1和apdaao-2,构建原核表达载体,以表达质粒pET-ApDAAO-2为模板,采用QuickChange Site-Directed Mutagenesis技术构建定点突变体,经过原核表达及纯化获得重组型和突变体酶蛋白,分析其酶学特性。【结果】通过原核表达及纯化成功获得了2个重组蛋白和4个突变体酶蛋白,SDS-PAGE检测显示其分子量均约为36 kDa;酶学特性分析表明,ApDAAO-2和突变体蛋白的最适反应温度为30℃;ApDAAO-2和T286A的最适反应pH范围为7.0-11.0,其它突变体为8.0-11.0;ApDAAO-2和突变体都具有较广泛的底物特异性,除T256K的最适底物为D-Phe外,其余均为D-Met;动力学参数测定结果显示,以二级表观常数kcat/Km表示,对于底物D-Met或D-Phe,ApDAAO-2和4个突变体的kcat/Km值均比ApDAAO-1和pKDAAO高数倍以上。【结论】ApDAAO-2及突变体具有比ApDAAO-1和pKDAAO更广泛的底物特异性和较高的催化效率,有一定的商业应用价值。 展开更多
关键词 原玻璃蝇节杆菌 D-氨基酸氧化酶 定点突变 二级表观常数
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