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Channel assignment and power allocation for throughput improvement with PPO in B5G heterogeneous edge networks
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作者 Xiaoming He Yingchi Mao +3 位作者 Yinqiu Liu Ping Ping Yan Hong Han Hu 《Digital Communications and Networks》 SCIE CSCD 2024年第1期109-116,共8页
In Beyond the Fifth Generation(B5G)heterogeneous edge networks,numerous users are multiplexed on a channel or served on the same frequency resource block,in which case the transmitter applies coding and the receiver u... In Beyond the Fifth Generation(B5G)heterogeneous edge networks,numerous users are multiplexed on a channel or served on the same frequency resource block,in which case the transmitter applies coding and the receiver uses interference cancellation.Unfortunately,uncoordinated radio resource allocation can reduce system throughput and lead to user inequity,for this reason,in this paper,channel allocation and power allocation problems are formulated to maximize the system sum rate and minimum user achievable rate.Since the construction model is non-convex and the response variables are high-dimensional,a distributed Deep Reinforcement Learning(DRL)framework called distributed Proximal Policy Optimization(PPO)is proposed to allocate or assign resources.Specifically,several simulated agents are trained in a heterogeneous environment to find robust behaviors that perform well in channel assignment and power allocation.Moreover,agents in the collection stage slow down,which hinders the learning of other agents.Therefore,a preemption strategy is further proposed in this paper to optimize the distributed PPO,form DP-PPO and successfully mitigate the straggler problem.The experimental results show that our mechanism named DP-PPO improves the performance over other DRL methods. 展开更多
关键词 B5G Heterogeneous edge networks PPO Channel assignment Power allocation throughput
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Throughput Analysis of HARQ Scheme Based on Full-Duplex Two-Way AF SWIPT Relay
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作者 Xiaoye Shi Fei Ding +2 位作者 Haiting Zhu Zhaowei Zhang Lei Zhang 《Computers, Materials & Continua》 SCIE EI 2023年第3期4819-4830,共12页
The simultaneous wireless information and power transfer(SWIPT)relay system is one of the emerging technologies.Xiaomi Corporation and Motorola Inc.recently launched indoor wireless power transfer equipment is one of ... The simultaneous wireless information and power transfer(SWIPT)relay system is one of the emerging technologies.Xiaomi Corporation and Motorola Inc.recently launched indoor wireless power transfer equipment is one of the most promising applications.To tap the potential of the system,hybrid automatic repeat request(HARQ)is introduced into the SWIPT relay system.Firstly,the time slot structure of HARQ scheme based on full duplex two-way amplify and forward(AF)SWIPT relay is given,and its retransmission status is analyzed.Secondly,the equivalent signal-to-noise ratio and outage probability of various states are calculated by approximate simplification.Thirdly,the energy harvesting power in each state is calculated.Finally,the energy harvested-throughput sum function is constructed to characterize the performance of energy harvesting and data transmission.Simulation results show that the proposed HARQ scheme has better energy harvestedthroughput sum function than the traditional HARQ scheme.When P_(2)=22 dB,the maximum sum function is 54.86%(the proposed HARQ scheme)and 52.307%(the traditional HARQ scheme),respectively. 展开更多
关键词 SWIPT RELAY HARQ throughput full-duplex
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High-Throughput Growth of Hexagonal Boron Nitride Film Using Porous-Structure Isolation Layer
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作者 Ruitao Jia Fangzhu Qing Xuesong Li 《Journal of Materials Science and Chemical Engineering》 CAS 2023年第3期45-51,共7页
Chemical vapor deposition is considered as the most hopeful method for the synthesis of large-area high-quality hexagonal boron nitride on the substrate of catalytic metal. However, the size the hexagonal boron nitrid... Chemical vapor deposition is considered as the most hopeful method for the synthesis of large-area high-quality hexagonal boron nitride on the substrate of catalytic metal. However, the size the hexagonal boron nitride films are limited to the size of growth chamber, which indicates a lower production efficiency. In this paper, the utilization efficiency of growth chamber is highly improved by alternately stacking multiple pieces of Cu foils and carbon fiber surface felt with porous structure. Uniform and continuous hexagonal boron nitride films are prepared on Cu foils through chemical vapor deposition utilizing ammonia borane as the precursor. This work develops a simple and practicable method for high-throughput preparation of hexagonal boron nitride films, which could contribute to the industrial application of hexagonal boron nitride. . 展开更多
关键词 Hexagonal Boron Nitride Chemical Vapor Deposition Porous Structure Isolation Layer High throughput
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Design and Research of High-throughput Automation System for Food Testing Laboratory
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作者 Shuo YANG Lei WANG +3 位作者 Xuehua WANG Weian WANG Dawei WANG Ying WANG 《Agricultural Biotechnology》 CAS 2023年第3期116-118,共3页
In the process of food testing,human operation is an important variable affecting the experimental results.In order to reasonably avoid the influence of human subjective operation behavior on the accuracy of detection... In the process of food testing,human operation is an important variable affecting the experimental results.In order to reasonably avoid the influence of human subjective operation behavior on the accuracy of detection results,the laboratory information management system was used as the information platform to design a high-throughput laboratory automation pre-treatment system based on the deep integration of mechanical principles,visual analysis,high-speed conduction,intelligent storage and other technical systems.The experimental results showed that the system could shorten the sample circulation cycle,effectively improve the laboratory biosafety,and meet the requirements of high-throughput processing of samples. 展开更多
关键词 Food testing AUTOMATION Pre-treatment system High throughput
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High throughput screening of single atomic catalysts with optimized local structures for the electrochemical oxygen reduction by machine learning
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作者 Hao Sun Yizhe Li +7 位作者 Liyao Gao Mengyao Chang Xiangrong Jin Boyuan Li Qingzhen Xu Wen Liu Mingyue Zhou Xiaoming Sun 《Journal of Energy Chemistry》 SCIE EI CAS CSCD 2023年第6期349-357,I0009,共10页
Single atomic catalysts(SACs),especially metal-nitrogen doped carbon(M-NC)catalysts,have been extensively explored for the electrochemical oxygen reduction reaction(ORR),owing to their high activity and atomic utiliza... Single atomic catalysts(SACs),especially metal-nitrogen doped carbon(M-NC)catalysts,have been extensively explored for the electrochemical oxygen reduction reaction(ORR),owing to their high activity and atomic utilization efficiency.However,there is still a lack of systematic screening and optimization of local structures surrounding active centers of SACs for ORR as the local coordination has an essential impact on their electronic structures and catalytic performance.Herein,we systematic study the ORR catalytic performance of M-NC SACs with different central metals and environmental atoms in the first and second coordination sphere by using density functional theory(DFT)calculation and machine learning(ML).The geometric and electronic informed overpotential model(GEIOM)based on random forest algorithm showed the highest accuracy,and its R^(2) and root mean square errors(RMSE)were 0.96 and 0.21,respectively.30 potential high-performance catalysts were screened out by GEIOM,and the RMSE of the predicted result was only 0.12 V.This work not only helps us fast screen high-performance catalysts,but also provides a low-cost way to improve the accuracy of ML models. 展开更多
关键词 Single atomic catalysts Coordination sphere High throughput screening Machine learning Oxygen reduction reaction
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Energy Efficiency in ARQ-Based Multi-Hop Systems and the Tradeoff with Throughput
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作者 Ali Asghar Haghighi 《China Communications》 SCIE CSCD 2023年第6期60-71,共12页
The minimum energy per bit(EPB)as the energy efficiency(EE)metric in an automatic retransmission request(ARQ)based multi-hop system is analyzed under power and throughput constraints.Two ARQ protocols including type-I... The minimum energy per bit(EPB)as the energy efficiency(EE)metric in an automatic retransmission request(ARQ)based multi-hop system is analyzed under power and throughput constraints.Two ARQ protocols including type-I(ARQ-I)and repetition redundancy(ARQ-RR)are considered and expressions for the optimal power allocation(PA)are obtained.Using the obtained optimal powers,the EE-throughput tradeoff(EETT)is analyzed and the EETT closed-form expressions for both ARQ protocols and in arbitrary average channel gain values are obtained.It is shown that how different throughput requirements,especially the high levels,affect the EE performance.Additionally,asymptotic analysis is made in the feasible high throughput values and lower and upper EETT bounds are derived for ARQ-I protocol.To evaluate the EE a distributed PA scenario,as a benchmark,is presented and the energy savinggain obtained from the optimal PA in comparison with the distributed PA for ARQ-I and ARQ-RR protocols is discussed in different throughput values and node locations. 展开更多
关键词 ARQ cooperative relaying energy efficiency green communication multi-hop systems routing algorithms throughput analysis
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Design of Raptor-Like LDPC Codes and High Throughput Decoder Towards 100 Gbit/s Throughput
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作者 LI Hanwen BI Ningjing SHA Jin 《ZTE Communications》 2023年第3期86-92,共7页
This paper proposes a raptor-like low-density parity-check(RL-LDPC)code design together with the corresponding decoder hardware architecture aiming at next-generation mobile communication.A new kind of protograph diff... This paper proposes a raptor-like low-density parity-check(RL-LDPC)code design together with the corresponding decoder hardware architecture aiming at next-generation mobile communication.A new kind of protograph different from the 5G new radio(NR)LDPC basic matrix is presented,and a code construction algorithm is proposed to improve the error-correcting performance.A multi-core layered decoder architecture that supports up to 100 Gbit/s throughput is designed based on the special protograph structure. 展开更多
关键词 RL-LDPC error floor high throughput protograph 5G NR
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抗虫转基因水稻及其杂交水稻对土壤微生物群落多样性与组成的影响 被引量:2
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作者 宋亚娜 陈在杰 +3 位作者 林艳 胡太蛟 吴明基 王锋 《中国生态农业学报(中英文)》 CSCD 北大核心 2024年第1期15-29,共15页
微生物是土壤物质循环与肥力演变的驱动者,其群落组成关系到土壤微生态系统的稳定与可持续性。对抗虫转基因水稻土壤微生物群落变化的研究是其环境安全性评价的重要内容。本研究基于细菌16S rRNA基因和真菌ITS基因的高通量测序,分析了... 微生物是土壤物质循环与肥力演变的驱动者,其群落组成关系到土壤微生态系统的稳定与可持续性。对抗虫转基因水稻土壤微生物群落变化的研究是其环境安全性评价的重要内容。本研究基于细菌16S rRNA基因和真菌ITS基因的高通量测序,分析了田间试验中抗虫转基因水稻‘MFB’及其转基因杂交水稻‘闽丰A/MFB’‘天丰A/MFB’和‘谷丰A/MFB’与非转基因常规水稻‘闽恢3301’及杂交水稻‘天优华占’的土壤微生物群落多样性与组成的差异,并得出以下结果。首先,与两个非转基因水稻品种相比,抗虫转基因水稻及转基因杂交水稻均能显著增产(P<0.05)。同时,高通量测序结果表明,除水稻成熟期的土壤真菌群落外,与‘闽恢3301’相比‘MFB’的土壤细菌或真菌群落的α-多样性指数Chao1、Observed_species和Shannon均有所提高,且分别在水稻成熟期或分蘖期达到显著性水平(P<0.05);水稻齐穗期转基因杂交水稻‘闽丰A/MFB’‘天丰A/MFB’和‘谷丰A/MFB’的土壤细菌及真菌群落的多样性指数Shannon均介于‘MFB’与‘天优华占’之间;微生物群落β-多样性分析结果表明,本田间试验中不同品种水稻土壤细菌或真菌的群落组成均没有显著差异。但与‘闽恢3301’相比,稻田土壤细菌中丰度最高的变形菌门的相对丰度在‘MFB’土壤中明显增加,且在水稻分蘖期及成熟期达显著水平(P<0.05),而土壤真菌中丰度最高的子囊菌门的相对丰度在‘MFB’土壤中明显减少,且在水稻分蘖期及齐穗期差异显著(P<0.05);水稻齐穗期‘闽丰A/MFB’‘天丰A/MFB’和‘谷丰A/MFB’的土壤变形菌门或子囊菌门的相对丰度也均介于‘MFB’与‘天优华占’之间。此外,通过对微生物群落的功能组成预测可见,随水稻生长,‘MFB’与‘闽恢3301’的土壤细菌群落功能组成间差异存在增大的趋势。综上所述,本研究田间试验中,抗虫转基因水稻及其转基因杂交水稻在增产的同时提高了稻田土壤细菌或真菌群落的多样性,改变了主要细菌或真菌种类的相对丰度,但对细菌或真菌的群落及功能组成的影响不显著。 展开更多
关键词 抗虫转基因水稻 细菌群落 真菌群落 高通量测序
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区块链扩展技术现状与展望 被引量:1
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作者 陈晶 杨浩 +3 位作者 何琨 李凯 加梦 杜瑞颖 《软件学报》 EI CSCD 北大核心 2024年第2期828-851,共24页
近年来,区块链技术引起广泛关注,其作为一种分布式账本技术,由于具备开放性、透明性和不可篡改性,已经被应用到诸多领域.但随着用户数量和访问需求的大幅增加,现有区块链体系结构可扩展性不足导致的性能瓶颈,制约了区块链技术的应用和推... 近年来,区块链技术引起广泛关注,其作为一种分布式账本技术,由于具备开放性、透明性和不可篡改性,已经被应用到诸多领域.但随着用户数量和访问需求的大幅增加,现有区块链体系结构可扩展性不足导致的性能瓶颈,制约了区块链技术的应用和推广,如何解决可扩展性问题已成为学术界和工业界关注的热点.对已有的区块链扩展方案进行分析和总结.首先,介绍区块链基本概念和可扩展性问题的由来,定义可扩展性问题并提出衡量可扩展性的指标.其次,给出分类框架,将现有方案按网络扩展、链上扩展、链下扩展3大类进行介绍,通过对不同的区块链可扩展性方案进行分析,比较各自的技术特点并归纳优缺点.最后,对亟待解决的开放性问题进行讨论,展望区块链技术未来趋势. 展开更多
关键词 区块链 可扩展性 交易吞吐量 区块链体系结构 区块链共识
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间作黄芪对当归根际土壤微生物的影响 被引量:1
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作者 李媛媛 谢丰璞 +8 位作者 王楠 高静 黄文静 李铂 孙晓春 宋忠兴 唐志书 王二欢 马存德 《中国野生植物资源》 CSCD 2024年第1期79-86,92,共9页
目的:探讨根际土壤微生物对中药材种植模式的响应方式。方法:以间作黄芪及单作下当归根际土壤为研究对象,基于高通量测序技术,分析土壤微生物在不同季节及种植模式下群落组成及功能的差异。结果:间作下Chao1指数、ACE指数高于单作,变形... 目的:探讨根际土壤微生物对中药材种植模式的响应方式。方法:以间作黄芪及单作下当归根际土壤为研究对象,基于高通量测序技术,分析土壤微生物在不同季节及种植模式下群落组成及功能的差异。结果:间作下Chao1指数、ACE指数高于单作,变形菌门、放线菌门、酸杆菌门、绿弯菌门和芽单胞菌门为间作下的优势菌门,芽单胞菌门的相对丰度在间作下高于单作。11月间作下γ变形菌纲、7月间作下全噬菌纲的丰度显著高于单作。KEGG功能预测表明,在不同时间及间作下根际土壤细菌与细胞过程、环境信息处理、遗传信息处理、代谢功能下属的23类二级功能基因的相对丰度存在显著差异;参与氮循环的功能基因K00371(narH/narY/nxrB)、(K00374 narI/narV)等OTU数在间作下显著高于单作;不同门、纲在间作下的共生网络比单作下连接紧密且更复杂。结论:当归间作黄芪影响土壤细菌群落组成,增加其丰富度及功能的丰富性,影响土壤氮循环能力,促进土壤微生物间的交互作用。 展开更多
关键词 土壤微生物 根际 高通量测序 多样性 种植方式
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软骨细胞中SIRT1基因敲减后作用状态不明确信号通路及对相关疾病或功能的影响 被引量:1
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作者 叶海明 曾晖 +3 位作者 杨琪 张耕 翁鉴 于斐 《中国组织工程研究》 CAS 北大核心 2024年第20期3123-3129,共7页
背景:沉默信息调节因子1以去乙酰化的方式调控软骨细胞中相关蛋白的功能,参与软骨细胞增殖分化,促进软骨缺损修复。目的:利用高通量技术筛选软骨细胞中沉默信息调节因子1基因敲减后作用状态不明确的信号通路以及产生变化的疾病或功能。... 背景:沉默信息调节因子1以去乙酰化的方式调控软骨细胞中相关蛋白的功能,参与软骨细胞增殖分化,促进软骨缺损修复。目的:利用高通量技术筛选软骨细胞中沉默信息调节因子1基因敲减后作用状态不明确的信号通路以及产生变化的疾病或功能。方法:取处于对数生长期的小鼠ATDC5软骨细胞,分2组转染:对照组转染沉默信息调节因子1基因敲减阴性对照慢病毒,实验组转染沉默信息调节因子1基因敲减慢病毒。转染72 h后,利用小鼠基因表达谱芯片GeneChip®Mouse Genome 4302.0 Array检测mRNA的基因层面变化情况,应用生物信息学技术筛选激活或抑制不明确的信号通路以及这些信号通路相关因子,并分析疾病或功能模块的富集情况。结果与结论:①沉默信息调节因子1基因敲减后,小鼠ATDC5软骨细胞中激活或抑制状态不明确的信号通路有245条;②根据-log(P-value)排序选择排前20的激活或抑制状态不明确信号通路中的因子情况进行报道,包括IGFBP4、TGFBR1、CTGF、COL4A5、LHX2、IL1RL1、KLF6等;③根据-log(P-value)进行排序,细胞生长和增殖、生物体存活和细胞死亡与存活等14个疾病和功能密切相关模块明显变化;根据差异基因数量排序,生物体损伤和异常、癌症和细胞死亡与存活3个疾病和功能密切相关模块明显变化;根据-log(P-value)与差异基因数量综合排序,固有免疫应答这一疾病和功能模块被显著激活。 展开更多
关键词 高通量测序 沉默信息调节因子1 软骨缺损 信号通路 疾病或功能
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油梨根际土壤微生物群落及其共生网络对根腐病的响应 被引量:1
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作者 何应会 黄耀恒 +3 位作者 陆荣民 杨日升 韦燕妮 梁文汇 《中南林业科技大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期106-115,共10页
【目的】为研发根腐病绿色综合防控技术提供理论依据,有效推进油梨树种产业发展。【方法】本研究以百色市林业科学研究所的健康和根腐病发病油梨植株根际土壤为研究对象,并利用基于16S核糖体RNA(rRNA)和内部转录间隔区(ITS)扩增子高通... 【目的】为研发根腐病绿色综合防控技术提供理论依据,有效推进油梨树种产业发展。【方法】本研究以百色市林业科学研究所的健康和根腐病发病油梨植株根际土壤为研究对象,并利用基于16S核糖体RNA(rRNA)和内部转录间隔区(ITS)扩增子高通量测序技术,分析健康和染病植株根际细菌和真菌群落结构、组成及多样性差异,比较细菌和真菌群落结构及其相互作用,确定土壤病原菌和有益菌的变化。【结果】染病植株相对于健康植株,根际细菌和真菌群落结构和多样性均没有显著性变化。变形菌门Proteobacteria、酸杆菌门acidobacteria、放线菌门actinobacteria、拟杆菌门bacteroidetes和绿弯菌门chloroflexi是油梨根际土壤优势细菌类群,子囊菌门ascomycota和担子菌门basidiomycota是油梨根际土壤优势真菌类群。在门分类水平、纲分类水平以及属分类水平上,细菌和真菌群落组成有明显的变化,但随着分类水平降低,群落组成变化越明显。此外,健康和染病油梨根际细菌群落α多样性显著高于真菌群落,而健康与染病之间细菌群落结构差异小于真菌。细菌物种之间的相互作用比真菌网络物种间的相互作用更紧密,并且负连接百分比和关节类群数量更多,细菌网络的稳定性更高。同样,油梨根际土壤细菌群落相对于真菌群落表现出更高的生态位宽度和生态位重叠。对根腐病有反应的细菌和真菌,如芽孢杆菌Bacillus、假单胞杆菌pseudomonas和溶杆菌lysobacter和球囊菌纲glomeromycetes,由于其在染病油梨根际土壤中的相对丰度均高于健康土壤,可以被视为相关的生物防治菌。【结论】根腐病并不会使油梨根际细菌和真菌群落结构和多样性发生显著性变化,但会使得一些有益菌的相对丰度增加,并且细菌比真菌对根腐病具有更高的抵抗力。 展开更多
关键词 油梨 根腐病 高通量测序 根际细菌群落 根际真菌群落 共生网络
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不同制曲季节浓香型大曲真菌群落结构多样性的研究
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作者 刘孟华 陈仪 +3 位作者 樊科权 唐清兰 徐姿静 徐占成 《食品与发酵科技》 CAS 2024年第3期82-85,116,共5页
本文以不同制曲季节的剑南春大曲为研究对象,运用高通量测序技术分析其真菌群落多样性特征。结果表明:大曲真菌群落结构复杂,不同制曲季节的剑南春大曲中真菌群落结构在门水平下的优势真菌主要分布于子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Bas... 本文以不同制曲季节的剑南春大曲为研究对象,运用高通量测序技术分析其真菌群落多样性特征。结果表明:大曲真菌群落结构复杂,不同制曲季节的剑南春大曲中真菌群落结构在门水平下的优势真菌主要分布于子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)和毛霉菌门(Mucoromycota),其中子囊菌门(Ascomycota)是剑南春大曲的绝对优势真菌。属水平下的优势真菌为嗜热子囊菌属(Thermoascus)、嗜热真菌属(Thermomyces)、曲霉属(Aspergillus)、伊萨酵母属(Issatchenkia)、假丝酵母属(Candida)、复膜孢酵母属(Saccharomycopisis)、根霉属(Rhizopus)和红曲霉属(Monascus)。嗜热子囊菌属(Thermoascus)、假丝酵母属(Candida)等微生物随大曲入室温度的变化呈现出一定的分布规律,且不同季节大曲的理化性能存在显著差异(P<0.05),这为生产优质浓香型大曲提供了理论依据。 展开更多
关键词 浓香型大曲 高通量测序 真菌 多样性
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苯醚甲环唑胁迫下农田土壤微生物群落和多样性分析
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作者 敖静 李杨 +3 位作者 刘晓辉 高晓梅 孙玉禄 宋立群 《中国土壤与肥料》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期24-31,共8页
为研究三唑类杀菌剂苯醚甲环唑(dif)施用后土壤中微生物群落结构的响应变化,通过模拟生产中的施用剂量,监测35 d后土壤的理化性质并利用高通量测序技术分析土壤中细菌和真菌的群落组成变化,通过db-RDA分析建立环境因子与微生物群落响应... 为研究三唑类杀菌剂苯醚甲环唑(dif)施用后土壤中微生物群落结构的响应变化,通过模拟生产中的施用剂量,监测35 d后土壤的理化性质并利用高通量测序技术分析土壤中细菌和真菌的群落组成变化,通过db-RDA分析建立环境因子与微生物群落响应关系。研究结果显示,随着dif施用浓度的增加,土壤中有机质(SOM)、总氮(TN)、碱解氮(AN)均有所提高,有效磷(AP)呈下降趋势,Alpha多样性指数中细菌Chao1、ACE和Shannon指数均低于未处理土壤,真菌Shannon指数高于未处理土壤;所有样本中细菌共检出31门、91纲、206目、315科、553属,真菌共检测出11门、34纲、79目、174科、370属;苯醚甲环唑施用浓度为50 mg/kg时,土壤细菌中变形菌门和拟杆菌门的相对丰度分别提高了14.2%和1.81%,酸杆菌门和绿弯菌门相对丰度分别降低了8.28%和3.44%,绝对优势菌属节杆菌属相对丰度下降7.85%,真菌中赤霉属和被孢霉属逐渐成为优势菌群;细菌的优势菌群中变形菌门与TN呈显著正相关,真菌优势菌门中子囊菌门与AN、TN和dif呈显著正相关,被孢霉门与SOM呈显著负相关;TN和AN对细菌的Shannon指数影响较大。以上说明,高浓度苯醚甲环唑的施用对土壤的理化性质以及微生物的丰富度和群落结构均产生了影响。 展开更多
关键词 农田土壤 苯醚甲环唑 高通量测序 土壤微生物 多样性
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妊娠期高血压患者胎盘组织中circRNA 表达差异及其潜在作用机制
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作者 吕俊刚 翟莉 +4 位作者 刘金龙 张琳 王娜 逄瑷博 闫志风 《武警医学》 CAS 2024年第4期329-334,共6页
目的基于高通量测序检测妊娠期高血压患者与健康产妇胎盘中环状RNA(circRNA)表达差异,探讨妊娠期高血压发病机制。方法选取某三甲医院2018-02至2018-12期间收治的6例患有妊娠期高血压的产妇为研究对象(M组),选择同期的6例健康产妇作为... 目的基于高通量测序检测妊娠期高血压患者与健康产妇胎盘中环状RNA(circRNA)表达差异,探讨妊娠期高血压发病机制。方法选取某三甲医院2018-02至2018-12期间收治的6例患有妊娠期高血压的产妇为研究对象(M组),选择同期的6例健康产妇作为对照组(C组)。采用BWA-MEM将妊娠高血压组患者与健康对照组的胎盘组织质控后测序,使用CIRI2对circRNA鉴定,并确定circRNA来源。利用DEGseq进行circRNA差异表达分析。采用miRanda软件和该物种的miRBase序列来预测circRNA的靶标miRNA,再利用Targetscan数据库预测相应的mRNA。将差异circRNA靶基因进行GO和KEGG富集分析,并导入String在线数据库进行聚类分析,寻找处于网络核心的基因。结果两组共有31个circRNA存在差异,14个下调,17个上调,其中前5个上调circRNA分别是circRNA00809、circRNA00593、circRNA00166、circRNA00184、circRNA00028,前5个下调circRNA分别是circRNA00520、circRNA00714、circRNA02491、circRNA00841、circRNA01454。GO富集分析显示,主要富集的生物学过程为生殖过程;主要富集的细胞组分是胞外区;主要富集的分子功能是电子转移活性。KEGG通路富集中,新陈代谢方面涉及的最多。相互作用网络分析可见,NOTCH1/2处于核心位置。结论胎盘组织中31种circRNA的差异表达与妊娠期高血压相关,其可能主要通过调节物质代谢通路发挥作用,同时NOTCH1/2等基因处于调控网络中心。 展开更多
关键词 妊娠期高血压 高通量测序 circRNA 胎盘
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镉污染对滨海滩涂围垦区西兰花根际土壤细菌群落结构的影响
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作者 陈海生 陈韬略 +6 位作者 蔡林生 李若华 罗文 高永胜 李振宇 裴孝钟 王雪 《沈阳农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期21-28,共8页
研究镉(Cd)污染对滩涂湿地围垦区西兰花根际土壤细菌群落结构的影响,探求有益于Cd污染农田土壤修复的耐Cd细菌菌群。采用Illumina Miseq高通量测序技术,分析Cd浓度分别为0,3.5,60 mg·kg^(-1)时对台州湾滩涂湿地围垦区西兰花根际土... 研究镉(Cd)污染对滩涂湿地围垦区西兰花根际土壤细菌群落结构的影响,探求有益于Cd污染农田土壤修复的耐Cd细菌菌群。采用Illumina Miseq高通量测序技术,分析Cd浓度分别为0,3.5,60 mg·kg^(-1)时对台州湾滩涂湿地围垦区西兰花根际土壤细菌群落结构和多样性指数的影响。结果表明:所有样品中检测到的细菌菌群分属于35门、97纲、205目、315科、506属。低浓度Cd污染时,西兰花根际土壤细菌Chao 1指数和Shannon指数与对照相比大幅度升高,而高浓度Cd污染时,土壤细菌Chao 1指数和Shannon均大幅度下降。随着Cd污染程度的增加,西兰花根际土壤放线菌门和浮霉菌门相对丰度呈一直下降的趋势,拟杆菌门和芽单胞菌门相对丰度呈一直升高的趋势。土壤变形菌门和髌骨菌门相对丰度呈先下降后上升的趋势,而土壤酸杆菌门、棒状杆菌门、疣微菌门、硝化螺旋菌门和厚壁菌门相对丰度呈先上升后下降的趋势。变形菌门、拟杆菌门、髌骨菌门和芽单胞菌门在高浓度Cd污染下为农田土壤细菌群落的主体。土壤罗思河小杆菌属相对丰度在低浓度Cd污染时呈下降趋势,而在高浓度Cd污染时呈升高趋势,土壤鞘氨醇单胞菌属的相对丰度在低浓度Cd污染时呈上升趋势,在高浓度Cd污染时呈下降趋势。土壤罗思河小杆菌属、马赛菌属、黄杆菌属和杜擀氏菌属可以被认为是西兰花根际土壤高抗Cd污染的细菌菌属。研究结果可为滨海滩涂地西兰花重金属污染土壤微生物修复提供依据。 展开更多
关键词 镉污染 细菌群落结构 高通量测序 西兰花
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植物根系特征与根区土壤水分高通量监测管道机器人研制
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作者 颜小飞 王韵博 +3 位作者 宋晓波 向梓薇 杜太生 程强 《农业工程学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第6期192-202,共11页
研究水分胁迫下的根系特征对于节水农业的发展具有重大意义。针对现有根系观测与土壤水分监测方法难以满足野外条件下根系和根区水分的同步、原位、高通量监测的不足,该研究研制了一种基于STM32芯片的管道机器人系统。系统由管道机器人... 研究水分胁迫下的根系特征对于节水农业的发展具有重大意义。针对现有根系观测与土壤水分监测方法难以满足野外条件下根系和根区水分的同步、原位、高通量监测的不足,该研究研制了一种基于STM32芯片的管道机器人系统。系统由管道机器人、数据基站与PVC透明管道组成,通过在土壤中埋设管道机器人系统,控制机器人搭载的微距相机与土壤水分传感器在巡航时拍摄根系图像,并获取土壤水分数据。由根系图像识别分割与提取程序对图像进行畸变校正与根系识别,获取管道方向上植株的根系面积、长度与密度等特征参数。实验室条件下进行相机拍摄效果、图像畸变校正、识别与分割误差及里程轮测距误差测试,以及土壤水分传感器标定试验。测试结果表明:1)管道机器人能够清晰地拍摄到根系图像,图像畸变校正效果较好,单个像素点长度和面积分别为44μm和0.002 mm^(2),单张根系图像的拍摄范围为14.17 mm×10.60 mm;2)土壤水分传感器输出电压与土壤体积含水率之间呈现良好线性关系,决定系数R^(2)为0.990;3)自主巡航定位准确度较高,平均相对误差为1.47%。在田间条件下进行的根系生长动态监测、根系信息提取、土壤水分监测与电池续航试验表明:1)管道机器人系统能够在田间环境下高通量地拍摄根系图像,监测根系的生长动态,并进一步提取出根系长度、面积、根面积密度等特征参数;2)根区土壤水分监测较为准确,测量结果与烘干法结果平均相对误差为2.23%;3)在系统初始满电量状态下,管道机器人系统独立运行时长不少于7 d,最大巡航监测距离约为48 m。本文研制的管道机器人系统可在田间条件下实现根系特征以及根区土壤水分的原位、高通量测量,为节水灌溉与根系生长研究提供技术支持。 展开更多
关键词 机器人 土壤水分 图像识别 根系特征 高通量
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不同产地烤烟细菌群落组成与结构研究
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作者 汪季涛 王浩军 +3 位作者 舒俊生 沈忱 朱英华 葛高飞 《安徽农业大学学报》 CAS CSCD 2024年第3期510-515,共6页
为研究不同产地C2F等级烤烟表面细菌微生物的组成和结构,利用高通量测序技术测试了6个不同产地的C2F等级烤烟在醇化初期烟叶表面可培养细菌的组成和结构。结果表明:6个不同产地的烟叶样品表面分别检测到55、39、33、26、24和15个OTU,其... 为研究不同产地C2F等级烤烟表面细菌微生物的组成和结构,利用高通量测序技术测试了6个不同产地的C2F等级烤烟在醇化初期烟叶表面可培养细菌的组成和结构。结果表明:6个不同产地的烟叶样品表面分别检测到55、39、33、26、24和15个OTU,其中6个烟叶样品共同的OTU为6个。在属分类水平上,大部分烟叶表面可培养的优势细菌微生物是芽孢杆菌属(Bacillus),部分烟叶表面活跃着肠杆菌属(Enterobacter),伯克霍尔德菌属(Burkholderia)和罗尔斯通菌属(Ralstonia)。不同品种和产地的烤烟表面细菌结构具有明显差异,同一品种不同产地的烤烟表面细菌结构也存在明显差异。研究结果为利用细菌微生物醇化不同产区烟叶,提高烟叶品质、优化烟叶醇化流程提供理论依据。 展开更多
关键词 烤烟 细菌群落结构 高通量测序
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无机卤化物钙钛矿迁移率的高通量计算
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作者 史力斌 李宁 《渤海大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第1期53-59,共7页
无机卤化物钙钛矿因其具有制备成本低、带隙适中和高迁移率等特点,为生产高效的太阳能电池提供了可能.实验测量材料的电输运特性会存在不确定性,因此有必要通过理论预测迁移率的上限.采用极化光学声子经验模型高效预测了立方相钙钛矿的... 无机卤化物钙钛矿因其具有制备成本低、带隙适中和高迁移率等特点,为生产高效的太阳能电池提供了可能.实验测量材料的电输运特性会存在不确定性,因此有必要通过理论预测迁移率的上限.采用极化光学声子经验模型高效预测了立方相钙钛矿的迁移率.文中对189种ABX_(3)构型的无机卤化物钙钛矿进行高通量筛查,找出了结构稳定、迁移率高的钙钛矿.首先,通过计算容忍因子和分解能,筛选出了稳定的立方相钙钛矿.然后,使用极化光学声子模型计算了51种立方相ABX_(3)构型的电子和空穴迁移率.经过筛选,找到了应变下迁移率最高的立方相钙钛矿.最后,发现在施加2%双轴压缩应变后,KPbI_(3)在平面内的电子迁移率高达μ=704cm^(2)V^(-1)s^(-1),这说明KPbI_(3)显示出优异的电子传输性能. 展开更多
关键词 钙钛矿 高通量计算 迁移率
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基于高通量测序技术分析不同窖龄窖泥真菌群落多样性与空间异质性
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作者 任海伟 李志娟 +7 位作者 刘美琪 蔡早宁 孙一帆 郭晓鹏 范文广 张丙云 李彦涛 尉军强 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2024年第2期178-187,共10页
利用Illumina NovaSeq高通量测序、冗余分析和FUNGuild等方法对甘肃金徽酒10a和50a窖龄窖池及其不同空间位置窖泥的真菌群落结构、真菌菌群与理化因子之间的关系以及真菌功能预测等进行研究。结果表明,随着窖池深度的增加,10 a窖池窖泥... 利用Illumina NovaSeq高通量测序、冗余分析和FUNGuild等方法对甘肃金徽酒10a和50a窖龄窖池及其不同空间位置窖泥的真菌群落结构、真菌菌群与理化因子之间的关系以及真菌功能预测等进行研究。结果表明,随着窖池深度的增加,10 a窖池窖泥的多样性和丰富度呈现降低趋势,50 a窖池窖泥的多样性整体呈现升高趋势,而丰富度则呈现先降低后升高趋势,其中10a窖池窖壁上层的多样性和丰富度均显著高于其他位置(P<0.05),而50a窖池窖底层的多样性和丰富度均显著高于其他位置(P<0.05)。10a窖池窖壁层的多样性和丰富度显著高于50a窖池(P<0.05),而50a窖底层的多样性和丰富度明显高于10a窖池(P<0.05)。所有窖泥样品共检测到21个真菌门和520个真菌属,其中子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)、被孢霉门(Mortierellomycota)和罗兹菌门(Rozellomycota)4个优势真菌门以及曲霉属(Aspergillus)和哈萨克斯坦酵母属(Kazachstania)等多数优势真菌属的相对丰度随窖池窖龄和空间位置的变化差异显著(P<0.05)。镰刀霉属(Fusarium)、Aspergillus、Kazachstania和红曲霉属(Monascus)与水分、腐殖质、K^(+)和Ca^(2+)含量呈正相关,枝孢菌属(Cladosporium)、维希尼克氏酵母属(Vishniacozyma)与pH值呈正相关。窖泥真菌营养类型主要有腐生营养型和病理-腐生-共生营养型等7种,功能类群包括4个单一功能群和7个混合功能群。通过系统分析不同窖龄窖池和空间位置的窖泥真菌群落多样性,为明确甘肃金徽酒窖泥的真菌群落结构及空间分布规律奠定了理论基础。 展开更多
关键词 窖泥 高通量测序 真菌群落 冗余分析 功能预测
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