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Successful treatment of invasive liver abscess syndrome caused by Klebsiella variicola with intracranial infection and septic shock:A case report 被引量:1
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作者 Pin-Jie Zhang Zhong-Hua Lu +2 位作者 Li-Jun Cao Hu Chen Yun Sun 《World Journal of Gastrointestinal Surgery》 SCIE 2023年第12期2938-2944,共7页
BACKGROUND Klebsiella variicola(K.variicola)is a member of the Klebsiella genus and is often misidentied as Klebsiella pneumoniae.In this report,we present a rare case of invasive liver abscess caused by K.variicola.C... BACKGROUND Klebsiella variicola(K.variicola)is a member of the Klebsiella genus and is often misidentied as Klebsiella pneumoniae.In this report,we present a rare case of invasive liver abscess caused by K.variicola.CASE SUMMARY We report a rare case of liver abscess due to K.variicola.A 57-year-old female patient presented with back pain for a month.She developed a high-grade fever associated with chills,and went into a coma and developed shock.The clinical examinations and tests after admission confirmed a diagnosis of primary liver abscess caused by K.variicola complicated by intracranial infection and septic shock.The patient successfully recovered following early percutaneous drainage of the abscess,prompt appropriate antibiotic administration,and timely open surgical drainage.CONCLUSION This is a case of successful treatment of invasive liver abscess syndrome caused by K.variicola,which has rarely been reported.The findings of this report point to the need for further study of this disease. 展开更多
关键词 klebsiella variicola Invasive liver abscess syndrome Intracranial infection Case report
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Colonization by Klebsiella variicola FH-1 stimulates soybean growth and alleviates the stress of Sclerotinia sclerotiorum
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作者 ZHAI Qian-hang PAN Ze-qun +6 位作者 ZHANG Cheng YU Hui-lin ZHANG Meng GU Xue-hu ZHANG Xiang-hui PAN Hong-yu ZHANG Hao 《Journal of Integrative Agriculture》 SCIE CAS CSCD 2023年第9期2729-2745,共17页
Sclerotinia stem rot,caused by Sclerotinia sclerotiorum,is a destructive soil-borne disease leading to huge yield loss.We previously reported that Klebsiella variicola FH-1 could degrade atrazine herbicides,and the ve... Sclerotinia stem rot,caused by Sclerotinia sclerotiorum,is a destructive soil-borne disease leading to huge yield loss.We previously reported that Klebsiella variicola FH-1 could degrade atrazine herbicides,and the vegetative growth of atrazine-sensitive crops(i.e.,soybean)was significantly increased in the FH-1-treated soil.Interestingly,we found that FH-1 could promote soybean growth and induce resistance to S.sclerotiorum.In our study,strain FH-1 could grow in a nitrogen-free environment,dissolve inorganic phosphorus and potassium,and produce indoleacetic acid and a siderophore.The results of pot experiments showed that K.variicola FH-1 promoted soybean plant development,substantially improving plant height,fresh weight,and root length,and induced resistance against S.sclerotiorum infection in soybean leaves.The area under the disease progression curve(AUDPC)for treatment with strain FH-1 was significantly lower than the control and was reduced by up to 42.2%within 48 h(P<0.001).Moreover,strain FH-1 rcovered the activities of catalase,superoxide dismutase,peroxidase,phenylalanine ammonia lyase,and polyphenol oxidase,which are involved in plant protection,and reduced malondialdehyde accumulation in the leaves.The mechanism of induction of resistance appeared to be primarily resulted from the enhancement of transcript levels of PR10,PR12,AOS,CHS,and PDF1.2 genes.The colonization of FH-1 on soybean root,determined using CLSM and SEM,revealed that FH-1 colonized soybean root surfaces,root hairs,and exodermis to form biofilms.In summary,K.variicola FH-1 exhibited the biological control potential by inducing resistance in soybean against S.sclerotiorum infection,providing new suggestions for green prevention and control. 展开更多
关键词 sclerotinia stem rot of soybean klebsiella variicola FH-1 inducing resistance root colonization BIOFILM
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Nosocomial Klebsiella variicola Infection in Neonatal Intensive Care: A New Emerging Pathogen
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作者 Soraya Hani Abdessamad Lalaoui +3 位作者 Fatiha Bennaoui Nabila Soraa Nadia El Idrissi Slitine Fadl Mrabih Rabou Maoulainine 《Open Journal of Pediatrics》 CAS 2023年第3期450-458,共9页
Klebsiella variicola is a human pathogen that has been misidentified as K. pneumoniae. This misidentification has led to a lack of understanding of important clinical and biological aspects of this bacterial species. ... Klebsiella variicola is a human pathogen that has been misidentified as K. pneumoniae. This misidentification has led to a lack of understanding of important clinical and biological aspects of this bacterial species. It is responsible for serious and potentially fatal infections, with a prevalence of multi-resistance to routine antibiotics. We present through three clinical observations, the case of three newborns having been hospitalized in the neonatal intensive care unit and whose evolution was complicated by the occurrence of a nosocomial infection in front of which a blood culture was done on blood agar, with a manual antibiogram on antibiotic disks, isolated the germ Klebsiella variicola. The management of the newborns was initially centered on non-invasive ventilation with a bi-antibiotic therapy based on carbapenem and amikacin for two newborns and switched to colymicin for the third case. Newborn follow-up was based on assessment of general condition, clinical signs of infection, as well as a biological control made of a blood count, a c-reactive protein, a complete ionogram, and a blood culture, every four days or if signs of clinical call. The evolution was favorable for two cases with good clinical and biological improvement, and complicated by death due to alveolar hemorrhage in the third case. Given the high pathogenicity of this germ, and the frequency of misidentification, it is crucial to know the clinical spectrum of Klebsiella variicola infections in neonatal intensive care units, in order to adapt the antibiotic therapy and to mitigate the fulminant evolution of this germ. 展开更多
关键词 NEWBORN Nosocomial Infection klebsiella variicola Neonatal Resuscitation Antibiotic Therapy
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巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02的毒理性与固氮能力 被引量:5
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作者 林标声 陈意 +2 位作者 罗茂春 张浣星 林占熺 《江苏农业科学》 2019年第24期258-261,共4页
为了研究巨菌草内生固氮菌(Klebsiella variicola)GN02的毒理性与固氮能力,通过小鼠经口毒性和大鼠经皮毒性试验,并以克雷伯菌(K.pneumoniae)特异性引物对GN02菌株进行血清型分型。结果表明,GN02菌株无明显的经口毒性和经皮毒性,不是临... 为了研究巨菌草内生固氮菌(Klebsiella variicola)GN02的毒理性与固氮能力,通过小鼠经口毒性和大鼠经皮毒性试验,并以克雷伯菌(K.pneumoniae)特异性引物对GN02菌株进行血清型分型。结果表明,GN02菌株无明显的经口毒性和经皮毒性,不是临床上流行肺炎克雷伯氏菌已有分型的强毒力菌株;GN02菌株在不同生长时期巨菌草根茎叶中均具有一定的固氮能力,其在各成熟期固氮率可达15%~27.27%,与其他禾本科植物所报道的固氮菌固氮效率基本相当。总之,GN02菌株安全、无毒,具有一定的固氮能力,可在农业生产中使用。 展开更多
关键词 巨菌草 内生固氮菌 klebsiella variicola 毒理性 固氮
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氮对巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因表达的影响
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作者 林标声 吕正阳 +2 位作者 罗茂春 何玉琴 林占熺 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2020年第1期103-108,共6页
采用DNA电泳、qRT-PCR及Western blot技术分析了在无氮和含氮培养条件下,巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02菌株nifH基因序列长度、基因与蛋白表达量的差异.结果表明,GN02菌株在无氮及含氮条件下均有nifH基因表达,其克隆得到的... 采用DNA电泳、qRT-PCR及Western blot技术分析了在无氮和含氮培养条件下,巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02菌株nifH基因序列长度、基因与蛋白表达量的差异.结果表明,GN02菌株在无氮及含氮条件下均有nifH基因表达,其克隆得到的nifH基因与同属禾本科的甘蔗的nifH基因亲缘关系较近;无氮培养条件下nifH基因和蛋白表达量明显高于含氮条件下的表达量.表明无氮条件能诱导GN02菌株nifH基因表达量的增加,而氮源抑制nifH基因的表达. 展开更多
关键词 巨菌草 内生固氮菌 klebsiella variicola NIFH基因 差异表达
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甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E溶磷基因GDH和pqqE的克隆及溶磷特性分析 被引量:6
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作者 陈炯宇 覃英 +4 位作者 谢显秋 黄毓燕 董登峰 邢永秀 李杨瑞 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2021年第10期2819-2827,共9页
葡萄糖脱氢酶(GDH)和吡咯喹啉醌(PQQ)对溶磷微生物溶解无机磷具有重要作用。本研究为了探讨甘蔗内生固氮菌变栖克雷伯菌(Klebsiella variicola)DX120E的溶磷机制,从该菌中克隆溶磷基因GDH和pqqE的ORF,并进行了生物信息学分析,同时还研... 葡萄糖脱氢酶(GDH)和吡咯喹啉醌(PQQ)对溶磷微生物溶解无机磷具有重要作用。本研究为了探讨甘蔗内生固氮菌变栖克雷伯菌(Klebsiella variicola)DX120E的溶磷机制,从该菌中克隆溶磷基因GDH和pqqE的ORF,并进行了生物信息学分析,同时还研究了该菌对不同磷源的利用能力。结果表明:克隆得到甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E GDH和pqqE基因的ORF分别为2373 bp和1143 bp,编码氨基酸分别为790个和380个。生物信息学分析结果表明,GDH蛋白为稳定蛋白,pqqE蛋白为不稳定蛋白。GDH蛋白是一个与细胞信号传导有关的膜受体蛋白,具有PQQ_membr_DH、PQQ_mGDH功能域和PQQ_DH_like超家族蛋白结构;pqqE基因编码的蛋白是胞内蛋白,含有1个PQQ_syn_pqqE功能域和Radical SAM超家族蛋白的结构。内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E对不同磷源的利用和GDH和pqqE基因在不同磷源培养时的qRT-PCR分析表明,该菌对不同磷源的溶磷能力表现为FePO_(4)>AlPO_(4)>Ca_(3)(PO_(4))_(2),且溶解FePO_(4)的能力与溶解Ca_(3)(PO_(4))_(2)、AlPO_(4)等难溶磷源的差异均显著(P<0.05)。在几种磷源条件下,GDH和pqqE基因相对表达量均增加,且2个基因的表达量变化趋势一致。GDH和pqqE基因在以FePO_(4)为磷源条件下的表达量与以Ca_(3)(PO_(4))_(2)为磷源的表达量差异显著(P<0.05)。本研究可为进一步研究内生固氮菌与甘蔗的互作和溶磷机制提供参考。 展开更多
关键词 甘蔗 klebsiella variicola DX120E GDH pqqE 溶磷特性
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甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E nifH基因的克隆与序列分析(英文) 被引量:5
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作者 张琨琨 牛俊奇 +3 位作者 魏春燕 邢永秀 杨丽涛 李杨瑞 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期1719-1725,共7页
【目的】了解甘蔗内生固氮菌变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola)DX120E nif H基因的生物信息学,为揭示甘蔗内生固氮菌DX120E的固氮分子机理提供理论依据。【方法】根据NCBI上其他固氮菌株的nif H序列设计引物,对内生固氮菌Klebsiel... 【目的】了解甘蔗内生固氮菌变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola)DX120E nif H基因的生物信息学,为揭示甘蔗内生固氮菌DX120E的固氮分子机理提供理论依据。【方法】根据NCBI上其他固氮菌株的nif H序列设计引物,对内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E菌进行PCR扩增;运用生物信息学方法对其核苷酸序列、编码的氨基酸序列进行分析,并对其蛋白结构进行预测。【结果】甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E nif H基因的ORF为882bp,Gen Bank登录号为KF732646.1,与Klebsiella pneumoniae 342、Klebsiella variicola At-22等6种固氮菌的nif H基因氨基酸序列同源性高达95.0%-99.0%。DX120E nifH蛋白与Klebsiella pneumoniae 342的亲缘关系最近,与非克雷伯氏菌固氮菌的亲缘关系较远。生物信息学分析显示,菌株DX120E的nif H基因编码293个氨基酸,起特别重要的氨基酸残基非常保守。该基因在N端有11个氨基酸残基即酪氨酸—甘氨酸—赖氨酸—甘氨酸—甘氨酸—异亮氨酸—甘氨酸—赖氨酸—丝氨酸—苏氨酸—苏氨酸,其属于典型结合ATP的基序结构。nif H蛋白分子量为32.07k D,pI为4.92,为酸性蛋白;其具有2个ASN糖基化位点,1个CAMP磷酸化位点,6个CK2磷酸化位点,6个PKC磷酸化位点。疏水性预测显示该蛋白为亲水性蛋白,无信号肽。【结论】变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola)DX120E nif H基因的推导氨基酸序列与克雷伯氏菌固氮菌属具有较高的同源性,该基因在甘蔗生物固氮过程中可能起重要作用。 展开更多
关键词 甘蔗 内生固氮菌 变栖克雷伯氏菌 NIFH基因 克隆
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巨菌草根内生固氮菌Klebsiella variicola的分离、鉴定及培养条件的优化 被引量:7
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作者 林标声 汪丽芳 +2 位作者 宋昭昭 贾雨雷 林占熺 《福建农林大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2019年第1期116-122,共7页
采用Ashby和Nfb无氮培养基从巨菌草成熟期根部分离得到1株具有高效固氮性能的内生固氮菌GN02,其在分离的菌落中所占比例最高,且酶活性较高.经16S rDNA序列鉴定,该菌株与克雷伯氏菌属各菌株同源性关系可达99%,结合其形态、生理生化特征,... 采用Ashby和Nfb无氮培养基从巨菌草成熟期根部分离得到1株具有高效固氮性能的内生固氮菌GN02,其在分离的菌落中所占比例最高,且酶活性较高.经16S rDNA序列鉴定,该菌株与克雷伯氏菌属各菌株同源性关系可达99%,结合其形态、生理生化特征,初步鉴定为变栖克雷伯氏菌(Klebsiella variicola).在含氮源的KP培养基中菌株GN02的生长情况明显优于无氮源的Ashby培养基.菌株GN02在KP培养基中的最优培养条件为:温度37.1℃,pH 5.6,蔗糖25.6 g·L^(-1),在此条件下其D_(600 nm)能达到1.48,比优化前提高了22.31%.响应面优化所得到的培养条件重复性好,准确、可靠. 展开更多
关键词 巨菌草 内生固氮菌 变栖克雷伯氏菌 响应面分析
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Fatal community-acquired bloodstream infection caused by Klebsiella variicola:A case report 被引量:1
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作者 Da-Li Long Yu-Hui Wang +4 位作者 Jin-Long Wang Si-Jie Mu Li Chen Xian-Qing Shi Jian-Quan Li 《World Journal of Clinical Cases》 SCIE 2022年第8期2474-2483,共10页
BACKGROUND Klebsiella pneumoniae(K.pneumoniae)is an infective microorganism of worldwide concern because of its varied manifestations and life-threatening potential.Genetic analyses have revealed that subspecies of K.... BACKGROUND Klebsiella pneumoniae(K.pneumoniae)is an infective microorganism of worldwide concern because of its varied manifestations and life-threatening potential.Genetic analyses have revealed that subspecies of K.pneumoniae exhibit higher virulence and mortality.However,infections with Klebsiella subspecies are often misdiagnosed and underestimated in the clinic because of difficulties in distinguishing K.pneumoniae from its subspecies using routine tests.This case study reports the rapid and fatal effects of K.pneumoniae subspecies.CASE SUMMARY A 52-year-old male patient was febrile and admitted to hospital.Examinations excluded viral and fungal causes along with mycoplasma/chlamydia and parasitic infections.Bacterial cultures revealed blood-borne K.pneumoniae sensitive to carbapenem antibiotics,although corresponding treatment failed to improve the patient’s symptoms.His condition worsened and death occurred within 72 h of symptom onset from sepsis shock.Application of the PMseq-DNA Pro high throughput gene detection assay was implemented with results obtained after death showing a mixed infection of K.pneumoniae and Klebsiella variicola(K.variicola).Clinical evidence suggested that K.variicola rather than K.pneumoniae contributed to the patient’s poor prognosis.CONCLUSION This is the first case report to show patient death from Klebsiella subspecies infection within a short period of time.This case provides a timely reminder of the clinical hazards posed by Klebsiella subspecies and highlights the limitations of classical laboratory methods in guiding anti-infective therapies for complex cases.Moreover,this report serves as reference for physicians diagnosing similar diseases and provides a recommendation to employ early genetic detection to aid patient diagnosis and management. 展开更多
关键词 Community-acquired bloodstream infection Mixed infection klebsiella variicola klebsiella pneumoniae High throughput gene detection Case report
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巨菌草内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因的克隆及生物信息学分析
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作者 林标声 张浣星 +2 位作者 何玉琴 罗茂春 林占熺 《湖北农业科学》 2020年第3期147-153,共7页
研究巨菌草(Pennisetum giganteum)内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因的生物学信息,对GN02菌株nifH基因进行克隆及完整性验证,并采用多种生物学在线软件对其进行生物信息学预测和分析。结果表明,GN02菌株nifH基因具有完整的... 研究巨菌草(Pennisetum giganteum)内生固氮菌Klebsiella variicola GN02 nifH基因的生物学信息,对GN02菌株nifH基因进行克隆及完整性验证,并采用多种生物学在线软件对其进行生物信息学预测和分析。结果表明,GN02菌株nifH基因具有完整的ORF,长度882 bp,编码293个氨基酸,NCBI GenBank登录号为MK131264。生物信息学分析表明,GN02菌株nifH基因具有高度保守性,与其他物种来源的nifH基因核苷酸序列及氨基酸序列同源性均达到95%以上。nifH蛋白总相对分子量为31 970.73、理论等电点pI为4.72;跨膜模型倾向N-末端向外的由内到外的跨膜、整个多肽链表现为亲水性;有2个糖基化位点但无分泌信号肽,有可能存在螺旋卷曲结构;二级结构预测表明α-螺旋和无规则卷曲是其多肽链中的主要结构元件,延伸链散布于整个蛋白质中;在数据库中能对该蛋白进行三维同源建模。 展开更多
关键词 巨菌草(Pennisetum giganteum) 内生固氮菌 klebsiella variicola NIFH基因 克隆 生物信息学
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甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E nifD基因的克隆、原核表达及纯化 被引量:2
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作者 张琨琨 邵敏 +3 位作者 吴朝兴 杨丽涛 李杨瑞 邢永秀 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期512-520,共9页
基于NCBI数据库中固氮菌nif D基因的核苷酸序列,设计并合成特异性引物,以甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E为模板,通过PCR方法获得了Klebsiella variicola DX120E nif D基因的ORF;以p ET30a(+)为原核表达载体,构建重组表达质... 基于NCBI数据库中固氮菌nif D基因的核苷酸序列,设计并合成特异性引物,以甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E为模板,通过PCR方法获得了Klebsiella variicola DX120E nif D基因的ORF;以p ET30a(+)为原核表达载体,构建重组表达质粒p ET30a-nif D。将正确的重组质粒转入原核表达菌株BL21(DE3),在28℃培养条件下经1 mmol/L的异丙基硫代半乳糖苷(isopro-ply-β-D-thiogalactopyranoside,IPTG)诱导表达;通过SDS-PAGE电泳检测融合蛋白表达情况。结果表明,本研究克隆得到甘蔗内生固氮菌Klebsiella variicola DX120E nif D基因的ORF为1 452 bp,编码483个氨基酸;原核诱导表达后经提纯和质谱鉴定,该蛋白等电点为5.90,分子量为53.87 k D,与预期大小一致。该蛋白在原核表达系统中以包涵体的形式成功表达。利用Ni柱亲和层析方法进一步获得了纯度较高的重组蛋白,为今后单克隆抗体的制备、蛋白质印记杂交检测(Western Bloting)等研究奠定了基础。 展开更多
关键词 甘蔗 klebsiella variicola DX120E nifD基因克隆 原核表达 蛋白纯化
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禽源Klebsiella variicola引起宿主血流感染的SNP筛选分析
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作者 尹磊 沈学怀 +5 位作者 张丹俊 赵瑞宏 戴银 胡晓苗 周学利 潘孝成 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第4期676-682,共7页
旨在筛选和分析禽源Klebsiella variicola引起宿主血流感染的转录组单核苷酸多态性(SNP)位点。采用转录组学测序(RNA-Seq)技术比较了Klebsiella variicola在LB肉汤培养基和SPF鸡血清中的转录组SNP,筛选出Klebsiella variicola在宿主血... 旨在筛选和分析禽源Klebsiella variicola引起宿主血流感染的转录组单核苷酸多态性(SNP)位点。采用转录组学测序(RNA-Seq)技术比较了Klebsiella variicola在LB肉汤培养基和SPF鸡血清中的转录组SNP,筛选出Klebsiella variicola在宿主血清中生存和发展相关的SNP位点,对筛选出的SNP的碱基变异类型和所在位置类型进行注释分析,同时对筛选出的SNP位点对应的基因进行GO富集和KEGG通路富集分析,进一步探究其功能和涉及的生物信号通路;此外,随机选取7个位于富集通路中的基因,通过荧光定量PCR比较LB组与SPF血清组各基因mRNA转录水平。结果显示,相较于LB培养条件下,在血清中的Klebsiella variicola共获得143682个SNP位点,其中检测到单个碱基的转换(transition)有100790个,颠换(transversion)42890个,转换类型总数极显著高于颠换类型总数(P<0.01)。此外,对获得的SNP位点所在区域进行统计发现SNP主要集中在外显子区域(131093个)。筛选出的SNP位点对应的基因主要富集在ABC转运蛋白,二元调控系统,群体感应系统,脂多糖的生物合成等通路。荧光定量PCR结果表明相较于LB组,SPF血清组中的基因mRNA转录水平显著上调(P<0.01)。结果表明,本研究对禽源Klebsiella variicola在宿主血液环境中生存和发展的分子机制进行了初步分析和探索,为进一步研究Klebsiella variicola的致病机制提供理论依据。 展开更多
关键词 klebsiella variicola 血流感染 RNA-SEQ SNP位点
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利用响应面优化Klebsiella variicola对麻疯树籽饼粕佛波酯的固态发酵降解 被引量:1
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作者 刘莹 张晓喻 +3 位作者 白艳林 文瑜 尹晶 唐琳 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期431-437,共7页
为降解麻疯树籽饼粕中的毒性成分佛波酯,利用Klebsiella variicola进行固态发酵.采用单因素实验法研究了发酵温度、接种量、初始加水量、发酵时间对佛波酯降解率的影响.在此实验结果基础上,利用Design Expert8.0软件进行分析建立了发酵... 为降解麻疯树籽饼粕中的毒性成分佛波酯,利用Klebsiella variicola进行固态发酵.采用单因素实验法研究了发酵温度、接种量、初始加水量、发酵时间对佛波酯降解率的影响.在此实验结果基础上,利用Design Expert8.0软件进行分析建立了发酵温度、接种量、初始加水量3个因素对佛波酯降解率影响的优化模型.该模型极显著(P<0.001),拟合度良好.经实验证实,在发酵温度为37℃、接种量33%(V/m)、初始加水量为105%(V/m)条件下发酵48 h,佛波酯降解率可达到84.30%,另一种毒性物质curcin的降解率可达63.21%.研究表明,利用响应面优化K.variicola固态发酵麻疯树籽饼粕过程,既可提高佛波酯降解率,也可降解curcin,具有生产指导意义. 展开更多
关键词 麻疯树籽饼粕 佛波酯 klebsiella variicola 固态发酵 CURCIN
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固氮菌Klebsiella variicola GN02基因序列及其分泌胞外多糖的相关特性
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作者 林标声 陈小红 +1 位作者 何玉琴 罗茂春 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期727-737,共11页
【背景】一些固氮菌能分泌胞外多糖,与宿主植物的关系密切,在提供氮素和促进植物生长有重要作用。【目的】进行固氮菌Klebsiella variicola GN02的基因序列分析,了解分泌胞外多糖的相关基因和其蛋白的结构特性。【方法】用二代和三代测... 【背景】一些固氮菌能分泌胞外多糖,与宿主植物的关系密切,在提供氮素和促进植物生长有重要作用。【目的】进行固氮菌Klebsiella variicola GN02的基因序列分析,了解分泌胞外多糖的相关基因和其蛋白的结构特性。【方法】用二代和三代测序技术相结合的方法对GN02菌株进行全基因组分析,并对其分泌的胞外多糖进行理化、结构特性解析。【结果】GN02菌株基因组中含有许多与氮代谢及多糖合成、分泌相关的基因及蛋白,该菌株培养后提取的胞外多糖得率为6.90 g/L、分子量1.8×10^3 Da、比旋度[α]25 D 75°、粘度[η]80.28;多糖组成为葡萄糖、半乳糖和甘露糖,为(1→3)及(1→6)糖苷键连接的β构型多糖,具有多糖的红外光谱特征吸收峰。【结论】提供了K.variicola GN02菌株基因组序列,解析了分泌胞外多糖的基因相关蛋白、理化性质及结构特性,有助于进一步了解该固氮菌分泌多糖的机理及为植物促生作用的相关性研究提供基础。 展开更多
关键词 固氮菌 klebsiella variicola 基因序列 胞外多糖 蛋白 结构特性
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一株自生固氮菌的分离鉴定及其对不同品种香蕉的促生特性
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作者 徐云龙 周游 +3 位作者 汪军 郭立佳 黄俊生 杨腊英 《热带作物学报》 CSCD 北大核心 2024年第5期936-943,共8页
为了筛选获得香蕉根际土壤中的高效固氮菌,本研究利用Ashby无氮培养基从海南省霸王岭野生香蕉(Musa nana Lour.sp)根际土壤中分离了一株固氮菌,并命名为BWLY3X-6,对其进行形态特征、生理生化、16S r RNA和gyr B序列分析、固氮特性及对... 为了筛选获得香蕉根际土壤中的高效固氮菌,本研究利用Ashby无氮培养基从海南省霸王岭野生香蕉(Musa nana Lour.sp)根际土壤中分离了一株固氮菌,并命名为BWLY3X-6,对其进行形态特征、生理生化、16S r RNA和gyr B序列分析、固氮特性及对不同香蕉品种的促生能力研究。结果表明:经鉴定,菌株BWLY3X-6属于固氮菌Klebsiella variicola,其胞外分泌氨态氮含量为(17.98±1.88)μg/m L,固氮酶活性为(220.51±8.21)ng/L;菌株对不同香蕉品种的促生长试验结果表明,与空白对照和0.5%尿素处理相比,在BWLY3X-6菌体10^(6)CFU/mL与10^(8)CFU/mL浓度下,南天黄与巴西蕉的各项生物量均有显著变化(P<0.05),其中根长变化量更加明显,分别增加43.5%和54.6%。本研究筛选获得了具有良好固氮能力的固氮菌,且该菌株对香蕉具有良好的促生作用,为其后续在农业生产中的实际应用提供理论基础。 展开更多
关键词 klebsiella variicola 胞外氨态氮 香蕉 促生长作用
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变栖克雷伯菌感染患者的临床特征
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作者 钟一鸣 罗昕怡 +4 位作者 李艳明 李虹玲 简子娟 晏群 刘文恩 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第1期38-43,共6页
目的研究变栖克雷伯菌感染患者的临床特征,为临床该病原菌的防控提供理论依据。方法回顾性收集2013年1月—2018年7月某医院临床分离经全基因组学测序鉴定为变栖克雷伯菌感染患者70例,随机选取同期肺炎克雷伯菌感染患者70例作为对照,分... 目的研究变栖克雷伯菌感染患者的临床特征,为临床该病原菌的防控提供理论依据。方法回顾性收集2013年1月—2018年7月某医院临床分离经全基因组学测序鉴定为变栖克雷伯菌感染患者70例,随机选取同期肺炎克雷伯菌感染患者70例作为对照,分析两组患者的临床资料。结果70例变栖克雷伯菌感染患者年龄1 d~95岁,中位年龄51岁,其中1岁以内的婴儿期患者6例(8.6%);基础疾病主要有心血管疾病(16例,22.9%),其次是糖尿病(11例,15.7%)和肿瘤(9例,12.6%);感染部位主要来自呼吸系统(34例,48.6%)、血流(8例,11.4%)和腹腔内(8例,11.4%);因接受过肿瘤放射和/或化学治疗、糖皮质激素和/或免疫抑制剂治疗而导致免疫力低下或抑制的患者20例(28.6%)。变栖克雷伯菌对常见抗菌药物耐药率较低(均<40%),变栖克雷伯菌对抗菌药物的耐药率均低于肺炎克雷伯菌(均P<0.001)。结论变栖克雷伯菌感染患者临床特征与肺炎克雷伯菌感染类似,但需警惕该菌在婴儿及免疫力低下人群的流行传播。变栖克雷伯菌目前耐药率较低,但仍需规范临床合理使用抗菌药物,以防耐药性菌株的产生。 展开更多
关键词 变栖克雷伯菌 肺炎克雷伯菌 临床感染特征 全基因组测序 药敏
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肺炎克雷伯菌临床分离株分子分群和流行病学特征 被引量:2
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作者 朱昱蓉 张丹 +5 位作者 贺雅星 李晶晶 黄晶 李婷 刘鹏 刘荣华 《检验医学》 CAS 2023年第5期435-440,共6页
目的分析临汾市中心医院肺炎克雷伯菌临床分离株的分子分群和流行病学特征(荚膜血清型、耐药基因和毒力基因),为临床诊疗提供参考。方法收集2021年1月—2022年1月临汾市中心医院143株肺炎克雷伯菌非重复临床分离株。采用基质辅助激光解... 目的分析临汾市中心医院肺炎克雷伯菌临床分离株的分子分群和流行病学特征(荚膜血清型、耐药基因和毒力基因),为临床诊疗提供参考。方法收集2021年1月—2022年1月临汾市中心医院143株肺炎克雷伯菌非重复临床分离株。采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱进行菌种鉴定,采用全自动微生物分析系统结合纸片扩散法检测菌株的耐药性,采用聚合酶链反应(PCR)结合基因测序技术分析Kp分子分群和荚膜血清型,采用PCR分析肺炎克雷伯菌耐药基因和毒力基因携带情况。结果143株肺炎克雷伯菌中有肺炎克雷伯菌(KpⅠ)135株、变栖克雷伯菌(KpⅢ)4株、类肺炎克雷伯菌(KpⅡ)4株。KpⅠ主要荚膜血清型为K1、K2和K57,KpⅡ主要为K1,KpⅢ无特定血清型。KpⅢ和KpⅡ仅携带SHV、OKP、LEN基因,KpⅠ携带多种耐药基因,耐药性较强。所有肺炎克雷伯菌菌株均检出毒力基因,3群菌株fimH、mrkD、ENT毒力基因携带率均>95%。KpⅡ和KpⅢ的KFU毒力基因携带率(100.00%)高于KpⅠ(73.33%),KpⅠ、KpⅡ、KpⅢ的YBT毒力基因携带率分别为54.81%、25.00%、0%。结论临汾市中心医院肺炎克雷伯菌临床分离株以KpⅠ为主,不同分子分群肺炎克雷伯菌菌株血清型分布、毒力基因和耐药基因携带情况存在差异。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 类肺炎克雷伯菌 变栖克雷伯菌 分子分群 毒力基因 耐药基因
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肺炎克雷伯菌、类肺炎克雷伯菌和变栖克雷伯菌的研究进展
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作者 朱昱蓉 刘荣华 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期983-989,共7页
肺炎克雷伯菌临床分离株是一种有荚膜的革兰阴性粗短杆菌,是临床上重要的机会致病菌。肺炎克雷伯菌临床分离株基因间存在差异,依据系统发育树可分为肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KpⅠ)、类肺炎克雷伯菌(Klebsiella quasipneumoni... 肺炎克雷伯菌临床分离株是一种有荚膜的革兰阴性粗短杆菌,是临床上重要的机会致病菌。肺炎克雷伯菌临床分离株基因间存在差异,依据系统发育树可分为肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KpⅠ)、类肺炎克雷伯菌(Klebsiella quasipneumoniae,KpⅡ)和变栖克雷伯菌(Klebsiella variicola,KpⅢ),三者生态分布、基因型、耐药性、毒力特征以及致病性存在显著差异,为感染性疾病精准治疗带来新的挑战。本文对KpⅠ、KpⅡ、KpⅢ的鉴定、流行特点及致病特点的最新研究进展进行综述。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯菌 类肺炎克雷伯菌 变栖克雷伯菌 耐药 毒力 致病性
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变栖克雷伯菌在石斛体内的定殖动态及其对石斛黑斑病的防效试验 被引量:8
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作者 赵明富 李梦娇 +6 位作者 张芬芬 孙媛 郭李川 宋爽 余代宏 文国松 徐绍忠 《西南林业大学学报(自然科学)》 CAS 北大核心 2015年第3期14-19,共6页
用抗利福平标记研究变栖克雷伯菌株SH-1在石斛苗中的定殖动态,通过温室盆栽和大棚试验,探讨其对石斛黑斑病的防治效果。结果表明:菌株能在石斛体内定殖,菌株定殖随接种时间的延长呈先增后减的变化趋势;根、茎、叶分别在接种第11、15、2... 用抗利福平标记研究变栖克雷伯菌株SH-1在石斛苗中的定殖动态,通过温室盆栽和大棚试验,探讨其对石斛黑斑病的防治效果。结果表明:菌株能在石斛体内定殖,菌株定殖随接种时间的延长呈先增后减的变化趋势;根、茎、叶分别在接种第11、15、20天时定殖量最高,随后呈下降趋势;35 d后分别处于4.3×104、2.32×104、1.84×104CFU/g的相对稳定状态。SH-1菌剂对石斛黑斑病有明显的防治效果,相对防效达到71.53%,与常规药剂菌核净(相对防效为72%)相当。 展开更多
关键词 变栖克雷伯 定殖动态 石斛黑斑病 防治
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石斛内生菌SH-1 PQQ基因的克隆与生物信息学分析
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作者 李梦娇 余玉莎 +6 位作者 黄菁 宋爽 李武琴 蒋朝英 徐绍忠 文国松 赵明富 《湖北农业科学》 2016年第2期490-492,514,共4页
从石斛内生菌变栖克雷伯菌(Klebsiella variicola)SH-1中PCR扩增得到吡咯喹啉醌(PQQ)基因,其大小为5 444 bp,包含了pqqABCDEF 6个基因,并对PQQ基因进行了生物信息学分析,为下一步构建高效基因工程菌,研究其生物合成途径奠定了基础。
关键词 PQQ基因 变栖克雷伯菌 生物信息学分析
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