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真核基因起始与终止密码子旁侧序列特征分析
被引量:
6
1
作者
翁景然
张宏
+1 位作者
耿美英
张成岗
《生物信息学》
2004年第4期10-14,共5页
真核基因起始与终止密码子旁侧序列的特征对于确定cDNA开放阅读框架 (ORF)和预测基因组序列中的编码区 (CDS)非常重要。基于高质量RefSeq数据库 ,在较大数据规模下统计分析了起始密码子旁侧序列所具有的“Kozak规则” ,发现不同物种之...
真核基因起始与终止密码子旁侧序列的特征对于确定cDNA开放阅读框架 (ORF)和预测基因组序列中的编码区 (CDS)非常重要。基于高质量RefSeq数据库 ,在较大数据规模下统计分析了起始密码子旁侧序列所具有的“Kozak规则” ,发现不同物种之间存在差别。同时分析了不同终止密码子旁侧序列的统计学特征 ,给出了相应的正则表达式。由于发现多种基因中存在同相位起始、终止密码子串联使用的情况 ,亦对此进行了讨论。
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关键词
真核基因
CDNA序列
起始密码子
终止密码子
序列特征
kozak
规则
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职称材料
题名
真核基因起始与终止密码子旁侧序列特征分析
被引量:
6
1
作者
翁景然
张宏
耿美英
张成岗
机构
军事医学科学院放射医学研究所
北京工业大学应用数理学院
出处
《生物信息学》
2004年第4期10-14,共5页
基金
国家重点基础研究发展计划 (973计划 ) (2 0 0 3CB715 90 0 )
国家高技术研究发展计划 (863计划 ) (2 0 0 2AA2 3 40 2 1)资助。
文摘
真核基因起始与终止密码子旁侧序列的特征对于确定cDNA开放阅读框架 (ORF)和预测基因组序列中的编码区 (CDS)非常重要。基于高质量RefSeq数据库 ,在较大数据规模下统计分析了起始密码子旁侧序列所具有的“Kozak规则” ,发现不同物种之间存在差别。同时分析了不同终止密码子旁侧序列的统计学特征 ,给出了相应的正则表达式。由于发现多种基因中存在同相位起始、终止密码子串联使用的情况 ,亦对此进行了讨论。
关键词
真核基因
CDNA序列
起始密码子
终止密码子
序列特征
kozak
规则
Keywords
eukaryotic gene
cDNA sequence
start codon
stop codon
sequence character
kozak rule
分类号
Q756 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
真核基因起始与终止密码子旁侧序列特征分析
翁景然
张宏
耿美英
张成岗
《生物信息学》
2004
6
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参考文献
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