目的:探讨与分析高通量测序平台研究非小细胞肺癌热点基因突变情况。方法:选择2019年11月-2020年11月在本院肿瘤科诊治的非小细胞肺癌患者110例作为肺癌组,同期选择健康体检者110例作为对照组,提取血浆组织,采用高通量测序平台分析基因...目的:探讨与分析高通量测序平台研究非小细胞肺癌热点基因突变情况。方法:选择2019年11月-2020年11月在本院肿瘤科诊治的非小细胞肺癌患者110例作为肺癌组,同期选择健康体检者110例作为对照组,提取血浆组织,采用高通量测序平台分析基因表达差异情况,重点检测热点基因突变情况。结果:两组所有入选者DNA提取体积>40μl,浓度>1ng/μl,总量>55ng,<200nt比例<5%,都符合质控要求,两组对比差异无统计学意义(P>0.05)。两组筛选出显著差异表达的基因共1245个,其中肺癌组表达上调652个,表达下调593个。基因测序与实时荧光定量PCR显示肺癌组的鼠肉瘤病毒致癌基因(Kirsten rat sarcoma viral oncogene,KRAS)、磷脂酰肌醇-3-激酶催化亚基α基因(Phosphoinositide-3-kinase,catalytic,alpha gene,PIK3CA)、肿瘤蛋白P53(Tumor protein P53,TP53)表达水平都高于对照组(P<0.05)。基因测序显示肺癌组的KRAS、PIK3CA、TP53基因突变率分别为30.0%、22.7%、17.3%,高于对照组的3.6%、1.8%和0.9%(P<0.05)。结论:高通量测序平台能有效检出非小细胞肺癌热点基因突变情况,具有很好的应用可行性,值得推广应用。展开更多
目的通过对中国人结肠癌染色体12p12-13杂合性丢失(loss of heterozygosity,LOH)分析,了解KRAS2基因与结肠癌发生发展的关系。方法从10例结肠癌手术切除标本中,提取肿瘤、癌旁及相应正常组织的DNA,用PCR-变性聚丙烯酰胺凝胶电泳-免疫荧...目的通过对中国人结肠癌染色体12p12-13杂合性丢失(loss of heterozygosity,LOH)分析,了解KRAS2基因与结肠癌发生发展的关系。方法从10例结肠癌手术切除标本中,提取肿瘤、癌旁及相应正常组织的DNA,用PCR-变性聚丙烯酰胺凝胶电泳-免疫荧光标记多重微卫星PCR法,对染色体12p12-13杂合性丢失进行分析。结果10例癌旁组织中有3例(30%)在12p12-13处至少有一个位点出现杂合性丢失,其中D12S1034出现频率最高,为28.57%(2/7);10例原发性结肠癌标本中6例(60%)在12p12-13处至少有一个位点出现有杂合性丢失,D12S1034和D12S1591是高频率丢失集中的区域,均占42.86%(3/7);癌旁组织、癌组织均发生LOH的标本有3例,占30%(3/10);仅在癌组织中发生LOH的标本有3例,占30%(3/10);仅在癌旁组织中发生LOH,癌组织无信号的标本1例;杂合性丢失的频率与肿瘤患者的年龄、性别、肿瘤大小、肿瘤部位及淋巴结转移均无关。结论KRAS2基因所在的12p12-13区域在结肠癌发生发展过程中出现基因组不稳定,该区域的高频杂合性丢失可能直接影响野生型KRAS2基因的转录与翻译。展开更多
文摘目的:探讨与分析高通量测序平台研究非小细胞肺癌热点基因突变情况。方法:选择2019年11月-2020年11月在本院肿瘤科诊治的非小细胞肺癌患者110例作为肺癌组,同期选择健康体检者110例作为对照组,提取血浆组织,采用高通量测序平台分析基因表达差异情况,重点检测热点基因突变情况。结果:两组所有入选者DNA提取体积>40μl,浓度>1ng/μl,总量>55ng,<200nt比例<5%,都符合质控要求,两组对比差异无统计学意义(P>0.05)。两组筛选出显著差异表达的基因共1245个,其中肺癌组表达上调652个,表达下调593个。基因测序与实时荧光定量PCR显示肺癌组的鼠肉瘤病毒致癌基因(Kirsten rat sarcoma viral oncogene,KRAS)、磷脂酰肌醇-3-激酶催化亚基α基因(Phosphoinositide-3-kinase,catalytic,alpha gene,PIK3CA)、肿瘤蛋白P53(Tumor protein P53,TP53)表达水平都高于对照组(P<0.05)。基因测序显示肺癌组的KRAS、PIK3CA、TP53基因突变率分别为30.0%、22.7%、17.3%,高于对照组的3.6%、1.8%和0.9%(P<0.05)。结论:高通量测序平台能有效检出非小细胞肺癌热点基因突变情况,具有很好的应用可行性,值得推广应用。
文摘目的通过对中国人结肠癌染色体12p12-13杂合性丢失(loss of heterozygosity,LOH)分析,了解KRAS2基因与结肠癌发生发展的关系。方法从10例结肠癌手术切除标本中,提取肿瘤、癌旁及相应正常组织的DNA,用PCR-变性聚丙烯酰胺凝胶电泳-免疫荧光标记多重微卫星PCR法,对染色体12p12-13杂合性丢失进行分析。结果10例癌旁组织中有3例(30%)在12p12-13处至少有一个位点出现杂合性丢失,其中D12S1034出现频率最高,为28.57%(2/7);10例原发性结肠癌标本中6例(60%)在12p12-13处至少有一个位点出现有杂合性丢失,D12S1034和D12S1591是高频率丢失集中的区域,均占42.86%(3/7);癌旁组织、癌组织均发生LOH的标本有3例,占30%(3/10);仅在癌组织中发生LOH的标本有3例,占30%(3/10);仅在癌旁组织中发生LOH,癌组织无信号的标本1例;杂合性丢失的频率与肿瘤患者的年龄、性别、肿瘤大小、肿瘤部位及淋巴结转移均无关。结论KRAS2基因所在的12p12-13区域在结肠癌发生发展过程中出现基因组不稳定,该区域的高频杂合性丢失可能直接影响野生型KRAS2基因的转录与翻译。
